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2021 03 08 Roam Data Structure Query zh translation
layout: post title: 【译】深度解析 Roam 数据结构 —— 为什么 Roam 远不只是一个笔记应用 categories: [编程] tags: [Clojure, Datomic, Datalog, RoamCN, roamcult, 数据结构] published: True
随着 Roam Research 的大热,双向链接和基于 Block 的笔记软件层出不穷,而他们(葫芦笔记、logseq、Athens)无一例外都采用了 Clojure 技术栈的 Datomic/datascript Datalog 数据库,这不免让我感到好奇想要深入探索一番。本文就将硬核解析 Roam 背后原理,发掘 Roam 基于 Block 的深层技术优势,帮助你迎接 Roam API 时代的到来!
原文地址:Deep Dive Into Roam's Data Structure - Why Roam is Much More Than a Note Taking App —— Zsolt Viczián
你想不想知道以下问题的答案?
- 你的 Graph 笔记库中最长的段落是那一段?
- 上周你编辑或者创建了哪些页面?
- 你的笔记库中总共有多少段文字?
- 在某个给定的命名空间下你总共有哪些页面?(例如:
meetings/
)
(译注:问题 1 可通过 Roam Portal Chrome 插件 查看,问题 2 可查看 #Roam42 DB Stats,但本文将帮助你深入理解插件背后的原理。)
Roam Research 是一个全功能型数据库,相信你已经用上了 {``{query:}``}
的查询方法,但其实远不止如此,你还可以问它更多的问题。这篇文章会让你对 Roam 的底层数据结构基础有一个很好的理解。
上周我一直在深入研究 Roam 的数据结构,玩得非常开心,也学到了很多。这篇总结写给我自己,也分享给你,我尝试通过写作来加深我对 Roam 的理解程度。如果你发现这太过于技术向了,很抱歉,我会尽力用一种容易理解的方式来传达信息,从最基本的概念慢慢过渡到更为复杂的概念。
在我的探索过程中,我还构建了一组用于查询的 SmartBlocks,和相应的几个查询示例,你可以在这里找到它。虽然你不一定想要了解具体细节,但也会发现这些例子非常有趣。
随着我的深入,我对 Roam Research 的赞叹就更进一步,我也愈发相信 Roam 一定能够占领市场。在不久的将来,Roam 将以全文的形式保存你我所读到的一切:笔记、书籍和文章摘要等等,都将能够方便地追溯其原始出处,只需在一个系统中点击即可访问。“Roam” 未来可期!
我的文章也参考了很多极具价值的文章和参考资料。我特别想分享以下的几篇文章,如果你读了我的概述发现还想了解更多,那我强烈建议你继续探索:
- Learn Datalog Today! by Jonas Enlund
- Introduction to the Roam Alpha API - Put Your Left Foot
- Datalog Queries for Roam Research by David Bieber
- Datomic Queries and Rules - Datomic
- The Datomic Information Model (infoq.com) by Rich Hickey, the author of Clojure and designer of Datomic
- Roam42 Source Code, by @RoamHacker
- clojure.core namespace - ClojureDoc
- clojure.string namespace - ClojureDocs
而这篇文章,将会提到以上文章都没有涵盖的两个点:
- 对 Roam Research 数据结构的详细讨论,包括非常基础和复杂的介绍
- 一套基于 #42SmartBlocks 可以在 Roam 中执行高阶查询。如果你对基础部分不感兴趣,想要直接看 SmartBlock 部分的话,点击跳转。
让我们开始吧!期望你像我一样享受这次旅程!
Roam 基于 Datomic 数据库构建。简而言之,一个 Datom 是一个独立的 fact,它是一个带值的属性,包括四个元素:
- Entity ID 实体 ID
- Attribute 属性
- Value 值
- Transaction ID 交易 ID
你可以把 Roam 想象成一组扁平化的 Datoms 集合,看起来就像这样:
[<e-id> <attribute> <value> <tx-id> ]
...
[4 :block/children 5 536870917]
[4 :block/children 9 536870939]
[4 :block/uid "01-19-2021" 536870916]
[4 :node/title "January 19th, 2021" 536870916]
[5 :block/order 0 536870917]
[5 :block/page 4 536870918]
[5 :block/parents 4 536870918]
[5 :block/refs 6 536870920]
[5 :block/string "check Projects" 536870919]
[5 :block/uid "r61dfi2ZH" 536870917]
共享相同事务 id 的 Datoms 就是在同一个事务中添加的。其中,这种基于事务的方法使 Roam 能够将内容同步到不同的设备,并管理非常复杂的撤销操作。
具有相同 entity-id 的 Datoms 就是同一个 Block 的 facts。
如果你想基于块引用来查询一个 Block 的 entity-id,你就可以写:
[:find ?e-id
:where
[?e-id :block/uid "r61dfi2ZH"]]
从上面的数据可以看出,这个查询将返回值 5。
Roam 使用 :block/
属性来存储关于段落(paragraphs)和页面(pages)的 facts。页面和段落之间有一些细微的差别,我在一分钟内就会解释。但是,你必须理解的基本概念是,页面只是一种特殊类型的块(block)。大多数情况下,Roam 将**页面(page)和段落(paragraph)**一视同仁。两者都是 Blocks。
- Hidden ID 隐藏 ID:
这个 entity-id 才是真正的 block-id,即使它在 Roam 用户界面是看不到的。这是用于将数据库中的信息绑定在一起的 ID。Entity ID 标识了有关 Block 的 facts,描述了父子层级关系和对 Block 的引用。
- Public ID 公共 ID:
公共 ID 是段落(paragraph)的块引用,例如 GGv3cyL6Y
,或者是页面(pages) 的 Page Title(页面标题)。请注意,页面(pages)还有一个 UID,长度也为九个字符串 —— 非常类似于块引用。例如,你可以使用它们来构造指向 Graph 中特定页面的 URLs。
(译者注:比如现在这篇文章在 Roam Research URL 中的 /page/mdz6JIWDD
https://roamresearch.com/#/app/Note-Tasking/page/mdz6JIWDD)
每个块都有以下属性:
-
:block/uid
公共 ID,即 9 个字符长的块引用 -
:create/email
创建块的作者 Email 地址 -
:create/time
以毫秒为单位的时间,纪元计时(1970 年 1 月 1 日 UTC/GMT 午夜) -
:edit/email
编辑该块的作者 Email 地址 -
:edit/time
最新一次块的编辑时间
[10 :block/uid "p6qzzKa-u" 536870940]
[10 :create/email "[email protected]" 536870940]
[10 :create/time 1611058803997 536870940]
[10 :edit/email "[email protected]" 536870940]
[10 :edit/time 1611058996600 536870949]
Roam 数据库就像一片森林。每一页都是一棵树。树的根是页面(page),树的枝干是更高层次的段落(paragraphs);树的叶子(block)就是嵌套在页面(page)最深层次的段落(paragraphs)。
Page
* Branch
* Branch
* Leaf
* Leaf
* Leaf
* Branch
* Branch
* Leaf
* Branch
* Leaf
...
对于每个段落(paragraph),Roam 总是创建两个指针。 子级 Block 使用:block/parents
引用其父级的 entity-id,父级则使用: :block/children
引用其子级的 entity-id。
[4 :block/children 5 536870917]
[5 :block/parents 4 536870918]
父级会在 :block/children
属性中保留其子级的列表。这个列表**只会**包含其直系后代的 entity-id,而不包括隔代的孙辈。一个 Page 只会将 Page 顶层的段落(paragraphs)作为子段落列出来,而不会列出嵌套的段落(paragraphs)。类似地,段落将只列出嵌套在它下面的块(block),而不是嵌套在嵌套块下面的块。嵌套中最低层级的 Block 块(叶子)则没有 :block/children
属性。
子级同样会在 :block/parents
属性中保留其父级的列表。与 :block/children
相反的是,父级列表包括**所有祖先的 entity-id,即祖父母、曾祖父母等。嵌套的段落(paragraphs)将包含对父段落(paragraphs)和页面(page)的引用。页面的顶层段落(paragraphs)在 :block/parents
属性中具有页面(page)的 entity-id,而嵌套在另一段落下的段落(paragraphs)将具有更高层级段落的 entity-id 和当前页面(page)**的 entity-id。
所有的页面都有标题属性,而没有任何段落会有标题。
如果要查找数据库中的所有页面,则需要查询 :node/title
,因为此属性只包含页面的值。通过执行以下查询,你将得到一个包含两列的表格:?p
参数下每个页面的 entity-id 和 ?title
参数下每个页面的标题。
[:find ?p ?title
:where [?p :node/title ?title]]
如果你还希望查到每个页面的九个字符的 UID,例如,要构造指向该页面的链接,则需要通过 :block/uid
属性来查找 ?p
entity-id。下面是 query 查询语句的样子。注意 ?p
是如何出现在 where
子句的两种模式中的。这告诉查询引擎查找同一实体的 title
和 uid
。
[:find ?p ?title ?uid
:where [?p :node/title ?title]
[?p :block/uid ?uid]]
每个段落都有以下属性:
-
:block/page
页面上的每个段落,不管它们的嵌套级别如何,都会引用他们的页面entity-id -
:block/order
这是页面中块的顺序,或者是段落下嵌套的级别。你需要对这个值进行排序,以便按照适当的顺序检索出现在文档中的段落 -
:block/string
块的内容 -
:block/parents
段落的祖先们。对于顶层段落,它就是当前的页面。对于嵌套的段落,该属性会列出通向(包括)页面的所有祖先。
Roam 只会在你改变特定块的默认值时才会设置这些属性(只存在于数据库中的段落),例如,你将块的文本对齐方式从左对齐改为居中。
-
:children/view-type
指定如何显示块的子元素。可识别的值是“列表”模式、“文档”模式、“编号”模式 -
:block/heading
你可以将块的标题级别设置为 H1、 H2 或 H3。允许的值是 1,2,3 -
:block/props
这是 Roam 存储图像或 iframe 的大小、slider(滑块)的位置、 Pomodoro 番茄计时器设置等信息的地方 -
:block/text-align
段落对齐的方式。值为“左”、“中间”、“右”、“对齐”
如果你想知道如何查找数据库中存在哪些属性,我有一个好消息!使用一个简单的查询,你就可以列出数据库中的所有属性:
[:find ?Namespace ?Attribute
:where [_ ?Attribute]
[(namespace ?Attribute) ?Namespace]]
以下就是所有属性的列表。说实话,上面的查询不会对值进行排序,也不会创建最后一列。我在可下载的 roam.json
文件中包含了稍微高级一点的查询版本,它将可用于排序。我在 clojure.core 文档中找到了namespace 函数。
Namespace | Attribute | :Namespace/Attribute |
---|---|---|
attrs | lookup | :attrs/lookup |
block | children | :block/children |
block | heading | :block/heading |
block | open | :block/open |
block | order | :block/order |
block | page | :block/page |
block | parents | :block/parents |
block | props | :block/props |
block | refs | :block/refs |
block | string | :block/string |
block | text-align | :block/text-align |
block | uid | :block/uid |
children | view-type | :children/view-type |
create | :create/email | |
create | time | :create/time |
edit | :edit/email | |
edit | seen-by | :edit/seen-by |
edit | time | :edit/time |
entity | attrs | :entity/attrs |
log | id | :log/id |
node | title | :node/title |
page | sidebar | :page/sidebar |
user | color | :user/color |
user | display-name | :user/display-name |
user | :user/email | |
user | photo-url | :user/photo-url |
user | settings | :user/settings |
user | uid | :user/uid |
vc | blocks | :vc/blocks |
version | id | :version/id |
version | nonce | :version/nonce |
version | upgraded-nonce | :version/upgraded-nonce |
window | filters | :window/filters |
window | id | :window/id |
如果你对如何编写 Roam 查询语句感兴趣,那么你应该仔细阅读 Learn Datalog Today 的九个章节。它的内容非常有趣,且包含对应的练习。
接下来,我将几乎逐字逐句地引用教程中的几段话,当然会改变例子以适用于 Roam。其余的内容,请访问上面的教程。
我还推荐以下 Stuart Halloway 的 YouTube 视频,它在 11 分钟内总结了 Datomic Datalog 查询语言的关键特性。
<iframe width="560" height="315" src="https://www.youtube.com/embed/bAilFQdaiHk" frameborder="0" allow="accelerometer; autoplay; clipboard-write; encrypted-media; gyroscope; picture-in-picture" allowfullscreen></iframe>查询是一个以 :find
关键字开头的矢量,后面跟着一个或多个模式变量(以 ? 符号开头,e.g. ?title
)。find
子句之后是 :where
子句,它将查询限制在与给定的数据模式(data patterns)相匹配的 datoms 上。而使用 _
符号作为通配符,则表示你希望忽略的数据模式部分。
例如,如果你想根据一个段落的块引用来查找文本,你需要这样写:
[:find ?string
:where [?b :block/uid "r61dfi2ZH"]
[?b :block/string ?string]]
根据本文章开头表格里面的例子,这个查询将返回 "Check Projects"
这里需要注意的是,模式变量?b
在两个数据模式中都会使用。当一个模式变量在多个地方使用时,查询引擎要求它在每个地方都绑定为相同的值。因此,这个查询只会找到具有 uid r61dfi2ZH
的块的字符串。
一个实体的 datoms 可能出现在不同命名空间的属性中。例如,如果我想找到包含r61dfi2ZH
段落的页面的标题,我会编写以下查询。请注意,我首先读取页面的 entity-id 的 ?block/page
属性,并将其存储在 ?p
当中。 然后,我用它来定位页面的 ?note/title
和 ?block/uid
。
[:find ?title ?uid
:where [?b :block/uid "r61dfi2ZH"]
[?b :block/page ?p]
[?p :node/title ?title]
[?p :block/uid ?uid]]
考虑到上面的例子,这将返回 "January 19th, 2021" 和 "01-19-2021"。
:in
子句为查询提供了输入参数,这与编程语言中的函数或方法参数的作用非常相似。以下是上一个查询的样子,注意其中有一个用于 block_reference
的输入参数。
[:find ?title ?uid
:in $ ?block_ref
:where [?b :block/uid ?block_ref]
[?b :block/page ?p]
[?p :node/title ?title]
[?p :block/uid ?uid]]
这个查询需要两个参数。$
就是当前数据库本身(隐含值,如果没有指定:in
子句),block_ref
则可能是段落的块引用。
你可以使用 window.roamAlphaAPI.q(query,block_ref);
执行上述操作。如果没有为 $
提供值,则查询引擎将隐式假定的是默认数据库。因为你将只查询你自己的 Roam 数据库,所以没有必要声明数据库。也许一旦 Roam 提供了跨数据库的链接,这将会变得非常有趣!
现在我将跳过本教程,以涵盖在 Roam 中稍有不同的几个主题。如果你对你错过了什么感兴趣,请阅读我跳过的详细教程。有一个关于元组、集合和关系(Tuples, Collections, and Relations)非常有用的讨论,它们提供了执行逻辑 OR 和 AND 操作的方法。
断言子句可以过滤结果集,只包括断言返回 true 的结果。在 Datalog 中,你可以使用任何 Clojure 函数或 Java 方法作为谓词函数。根据我的经验,在 Roam JavaScript 的实现中,Java 函数是不可用的,只有少数 Clojure 函数可以使用。
除了clojure.core
命名空间之外,Clojure 函数必须是完全命名空间限定的。遗憾的是,在核心命名空间之外,我只找到了几个在 Roam 中能用的函数。这些函数包括clojure.string/includes?
、clojure.string/starts-with?
和clojure.string/ends-with?
。另外一些来自核心命名空间的有用函数包括,返回属性命名空间的 namespace
和返回字符串长度的 count
。一些无处不在的断言,也可以在没有命名空间限定的情况下使用,比如<, >, <=, >=, =, not=, !=
等等。
这里有两个使用断言的例子。第一个函数指的是根据 block_reference
计算段落中的字符数。
[:find ?string ?size
:in $ ?block_ref
:where [?b :block/uid ?block_ref]
[?b :block/string ?string]
[(count ?string) ?size]]
第二个列出了在给定日期之后修改的所有 Blocks。
[:find ?block_ref ?string
:in $ ?start_of_day
:where [?b :edit/time ?time]
[(> ?time ?start_of_day)]
[?b :block/uid ?block_ref]
[?b :block/string ?string]]
遗憾的是,我无法让转换功能在 JavaScript 中工作。只有当您在桌面上安装了 Datalog 数据库,并加载 Roam.EDN 进行进一步的操作时,这些功能才有可能工作。
唯一可用的变通方法是在查询后对结果进行后处理。下面的例子将过滤页面标题,以大小写不敏感的方式查找文本片段 ("temp"),然后按字母顺序对结果进行排序。此查询将返回包括 "Template"、"template"、"Temporary"、"attempt "等词的页面。
let query = `[:find ?title ?uid
:where [?page :node/title ?title]
[?page :block/uid ?uid]]`;
let results = window.roamAlphaAPI.q(query)
.filter((item,index) => item[0].toLowerCase().indexOf('temp') > 0)
.sorta,b) => a[0].localeCompare(b[0];;
Aggregates,则可以像预期的那样工作。有许多可用的 Aggregates,包括sum、max、min、avg、count
。你可以在这里阅读更多关于 Aggregates 的信息。
例如,如果你不知道某个属性的用途,或者不知道允许使用哪些值,只需查询数据库就可以找到现有的值。下一个例子列出了:children/view-type
的值。需要注意的是,如果你只在 Graph 中使用 bullet 列表模式,查询将只返回一个值:"bullet"。我使用了独特的 Aggregates 函数,如果没有这个函数,我将得到一个可能有数千个值的列表,每个指定了视图类型的块都有一行。
[:find (distinct ?type)
:where
[_ :children/view-type ?type]]
你可以将查询的可重用部分抽象为规则,给它们起有意义的名称,然后忘记其实现细节,就像你可以使用自己喜欢的编程语言编写函数一样。
Roam 中一个典型的规则例子是祖先规则。这些规则利用:block/children
来遍历嵌套块的树。一个简单的祖先规则是这样的。这条规则基于 ?parent
entity-id 来寻找 ?child
。
[[(ancestor ?child ?parent)
[?parent :block/children ?child]]]
第一个矢量称为规则的 head,其中第一个符号就是规则的名称。规则的其余部分称为 body。
你可以用(...)
或[...]
将其括起来,但常规的做法是用(...)
来帮助你的眼睛区分 head 和 body 的规则,也可以区分规则调用(rule invocations)和正常的数据模式(data patterns),我们将在下面看到示例。
你可以将规则看作一种函数,但请记住,这是逻辑编程,因此我们可以使用相同的规则,根据子 entity-id 找到父实体,根据父 entity-id 找到子实体。
换句话说,你可以在 (ancestor ?child ?parent)
中使用?parent
和?child
作为输入和输出。如果你既不提供值,你将得到数据库中所有可能的组合。如果你为其中一个或两个都提供值,它将如你所期望的那样限制查询返回的结果。
[:find ?uid ?string
:in $ ?parent
:where [?parent :block/children ?c]
[?c :block/uid ?uid]
[?c :block/string ?string]]
现在就变成了:
[:find ?uid ?string
:in $ ?parent %
:where (ancestor ?c ?parent)
[?c :block/uid ?uid]
[?c :block/string ?string]]
:in
子句中的%
符号代表规则。
乍一看,这似乎并不是一个巨大的成就。但是,规则是可以嵌套的。通过扩展上面的规则,你可以使它不仅返回子树,而且返回?parent
下的整个子树。规则可以包含其他规则,也可以自己递归调用。
[[(ancestor ?child ?parent)
[?parent :block/children ?child]]
[(ancestor ?child ?grand_parent)
[?parent :block/children ?child]
(ancestor ?parent ?grand_parent)]]]
例如,我们现在可以使用这条规则来计算一个给定块的所有子孙数量。
window.roamAlphaAPI.q(`
[:find ?ancestor (count ?block)
:in $ ?ancestor_uid %
:where [?ancestor :block/uid ?ancestor_uid]
[?ancestor :block/string]
[?block :block/string]
(ancestor ?block ?ancestor)]`
,"hAfIHN6Gi",rule);
当然,在这个例子中,我们最好使用:block/parent
属性,这样可以使查询更加简单。
[:find ?ancestor (count ?block)
:where [?ancestor :block/uid "hAfIHN6Gi"]
[?ancestor :block/string]
[?block :block/parents ?ancestor]]
这篇文章已经太长,而且技术性太强。出于这个原因,我完全省略了关于(pull ) requests 的讨论 —— 尽管在 roam.json 中的例子中,我将会提到一部分。(pull ?e [*])
是一种强大的从数据库中获取数据的方法。如果你想了解更多,这里有两个值得阅读的参考文献。
Datomic Pull in the Datomic On-Prem Documentation
Introduction to the Roam Alpha API on Put Your Left Foot.
<iframe width="560" height="315" src="https://www.youtube.com/embed/wjIMRD-JKfU" frameborder="0" allow="accelerometer; autoplay; clipboard-write; encrypted-media; gyroscope; picture-in-picture" allowfullscreen></iframe>我们可以在 SmartBlocks 内和浏览器中的开发者工具控制台中运行查询。然而,结果很难查看,因为它们是以嵌套的 JSONs 等晦涩的数据结构返回的。
2021 年 1 月 28 日更新:
同时我了解到,你也可以在 Roam 中使用块中的 :q
命令原生运行简单的查询。试试下面的命令:
:q [:find(count ?t):where[_ :node/title ?t]]
它不会像我的 SmartBlock 一样显示拉动或有页面链接,但仍然非常酷......
2021 年 2 月 22 日进一步更新:
我使用 :q
创建了一个长长的统计查询样本清单。你可以在这里找到它们。
我想让查询体验更加方便,并将其集成到 Roam 中。因此,我创建了一组 SmartBlocks,它们可以帮助将查询嵌入到你的 Roam 页面中,就像你在文档中包含的任何其他组件一样。
这里是可以导入到 Roam Graph 中的 DatomicQuery.JSON 文件链接。包括两个页面,SmartBlocks 和大量查询示例。继续阅读,可以了解如何使用它们。
你可以选择简单查询和高级查询。简单查询不接受输入参数,也不能包含规则。当然,你可以直接在查询中包含输入参数,你可以在下面的例子中看到。而高级查询则可以给你更充分的灵活性。
我做的 SmartBlock 可以把 query 查询结果格式化变成表格。它使用::hiccup
在单个 Block 中返回结果,这样就可以避免在 Graph 中创建不必要的 Block。还有个额外的好处是,我加上了一些简单的显示逻辑,将页面标题(page titles)转换为可点击的页面链接(URL),可以将时间转成相对应的 Daily Notes 页面的链接。
要使用页面链接功能,你需要以一种特殊的方式生成查询:
- 通过在字段名后面添加
:name
来指定标题字段,例如:?title:name
。 - 将 uid 放在紧跟
?title:name
字段的后面,并在字段名的末尾加上**:uid**,指定相应的 uid。例如:?title:uid
- 在字段末尾添加**:date**,指定一个你想转换为 Daily Notes 页面链接的字段,例如:
?time:date
[:find ?title:name ?title:uid ?time:date
:where [?page :node/title ?title:name]
[?page :block/uid ?title:uid]
[?page :edit/time ?time:date]
[(clojure.string/starts-with? ?title:name "roam/")]]
SmartBlock 还会将嵌套的结果显示为一个表格,在表格里显示得更整齐。当你执行包含(pull )
语句的查询时,它的结果其实是一棵树,而不是一张表。所以我按照下面的逻辑来呈现查询结果。
- 我会把结果集的顶层显示为表格的行,值为列。
- 结果集中的嵌套层会交替以列或行的方式呈现。
- 为了避免结果集过大,MAXROWS 默认设置为 40。在高级查询中,你可以更改这个数字。
- 在嵌套层,我使用 MAXROWS/4 来限制显示的行数。即使这样设置,生成的表格也可以达到数百行。(40x10x10x...)
这是一个 (pull )
结果所显示的表格。只拉取 1 个层级的深度:
拉取 2 个层级的深度:
要为你的查询生成模板,请运行相应的 Roam42 SmartBlock。
- Datomic simple-template 简单模板
- Datomic advanced-template 高级模板
一旦准备好你的查询,只需按下嵌套在查询下的按钮即可执行。
经过一周的时间,我还没有成为这方面的专家。如果我写的东西很傻,比如我的查询或 SmartBlock 有错误的话,请告诉我。你可以在下面的评论中联系我,或者在 Twitter 上@zsviczian。
另外,我很想了解你是如何使用从这篇文章中学到的知识,以及如何使用 SmartBlock 的。请分享你的想法和成果。谢谢你!