データ読み込み時に分析条件を自前のcsvファイルから読み込む

点分析データを読み込む

多くの場合は以下のコマンドで済む．

# 分析点のコメントを鉱物名として利用する場合
qnt <- read_qnt(wd = "点分析データの保存されたディレクトリのパス")

# 外部の csv ファイルから分析点の鉱物名を指定する場合
qnt <- read_qnt(wd = "点分析データの保存されたディレクトリのパス", phase_list = "csv ファイルのパス")

しかし機種依存により .cnd/elemw.cnd が存在しない場合や書式が異なる場合がある (参考)．

そのような場合，以下のように分析条件を表形式に纏めた csv ファイルを用意しておくとよい (ダウンロード)． Oxide は上から順に 1ルーチン目の1ch, 2ch, 3ch, ...; 2ルーチン目の1ch, 2ch, 3ch, ...といった順にすること．

Oxide	Element	Bg+ [mm]	Bg- [mm]	Peak [sec]	Bg [sec]
SiO2	Si	1	1	10	5
MgO	Mg	1	1	10	5

csv ファイルを例えば "conditions_qnt.csv" として保存しておくと，以下のコマンドにより機種依存性を回避した上で，点分析データを読み込むことができる．

qnt <- read_qnt(wd = ".qnt", conditions = "conditions_qnt.csv")
# phase_list は適宜指定

面分析データを読み込む

多くの場合は以下のコマンドで済む．

# 分析点のコメントを鉱物名として利用する場合
xmap <- read_xmap(
  wd = "面分析データの保存されたディレクトリのパス", # 例えば ".map/1"
  DT = 0 # 不感時間 [ナノ秒]
)

しかし，機種依存により面分析データのファイル名や分析条件の書式が異なり，うまく読み込めない場合がある． そのような場合，以下のように分析条件を表形式に纏めた csv ファイルを用意しておくとよい (ダウンロード)．

注: Instrument, Dwell [msec], Probe current [A], Start X [mm], Start Y [mm], Step size [um], Steps X, Steps Y, dead time [ns]については一行目の値のみが参照される．

Element	File path	Instrument	Dwell [msec]	Probe current [A]	Start X [mm]	Start Y [mm]	Step size [um]	Steps X	Steps Y	dead time [ns]
Si	.map/1/1_map.txt	JXA-DUMMY	100	1e-07	0	0	5	100	100	0
Mg	.map/1/2_map.txt

csv ファイルを例えば "conditions_xmap.csv" として保存しておくと，以下のコマンドにより機種依存性を回避した上で，面分析データを読み込むことができる．

xmap <- read_xmap(conditions = "conditions_xmap.csv")
# DT (dead time) は "conditions_xmap.csv" 中で指定