Merge remote-tracking branch 'origin/master'

minor fixes

Update README.md

debug

ln -> log2

concordance -> new values

release-0412 (v1.0)

Merge branch 'development'

Release 0611

location: /home/abramov/RESULTS/release-1810/.

1) Теперь учитывается клет линия LoVo.
Таким образом теперь обсчитаны все имеющиеся датасеты.

2) Также теперь отображаются все хромосомы.

3) Обновлена аннотация пиков

4) BAD пересчитаны по модели Corrected-1,5 с коррекцией малоподдержанных сегментов

5) Таблицы с p-value имеют старый формат за исключением 3 колонок:
  - две новые колонки fdr_ref fdr_alt с поправленным значением p-value,
  - колонка ID теперь может иметь значение "." если снип не был проаннатирован с помощью dbSNP-common.
  подробности в README

6) В колонках maxdepth_ и mostsig_ теперь будут только снипы с перекосом в ту же сторону, что и агрегированное p-value

7) Появился json файл с информацией по снипам учавствующим в агрегации для SNP, прошедших FDR 5%
   Формат в README

8) Теперь есть 2 типа агрегаций: по транскрипционным факторам (TF) и по клеточным линиям (CL)

В globe:home/abramov/RESULTS/release-1810/ есть 4 папки TF_P-values, CL_P-values (где собственно лежат p-value) и TF_DICTS, CL_DICTS в которых есть информация о том, откуда пришел каждый SNP, прошедший FDR 0.05