Merge pull request #264 from PrincetonUniversity/feature/viper

Feature/viper

SHARE/make_viper.inc

@@ -0,0 +1,172 @@
+#######################################################################
+#            Define Basic Utilities
+#######################################################################
+  SHELL = /bin/sh
+  PWD1 = `pwd`
+  MYHOME = $(HOME)/bin
+  PRECOMP:= fpp -C -P -DLINUX
+  COMPILE = ifort
+  COMPILE_FREE = ifort
+  LINK    = ifort -Bstatic -o
+  LINK_AR = ar -ruv
+  LINK_C  = icc -shared -Wl,-z-defs
+
+#######################################################################
+#            Define Compiler Flags
+#######################################################################
+  FLAGS_R = -I${MKLROOT}/include/intel64/lp64 -I$(MKL_HOME)/include \
+            -O2 -assume noold_unit_star \
+            -xCORE-AVX512 -qopt-zmm-usage=high -fp-model strict -ip
+  FLAGS_D = -I${MKLROOT}/include/intel64/lp64 -I$(MKL_HOME)/include \
+            -O0 -assume noold_unit_star \
+            -xCORE-AVX512 -qopt-zmm-usage=high -fp-model strict -ip \
+            -check all,noarg_temp_created -ftrapuv -g -traceback
+  LIBS    =  ${MKLROOT}/lib/intel64/libmkl_blas95_lp64.a \
+             ${MKLROOT}/lib/intel64/libmkl_lapack95_lp64.a \
+             ${MKLROOT}/lib/intel64/libmkl_scalapack_lp64.a \
+             -Wl,--start-group ${MKLROOT}/lib/intel64/libmkl_intel_lp64.a \
+             ${MKLROOT}/lib/intel64/libmkl_sequential.a \
+             ${MKLROOT}/lib/intel64/libmkl_core.a \
+             ${MKLROOT}/lib/intel64/libmkl_blacs_intelmpi_lp64.a \
+             -Wl,--end-group -lpthread -lm -ldl
+#######################################################################
+#            MPI Options
+#######################################################################
+  LMPI    = T
+  MPI_COMPILE = mpiifort
+  MPI_COMPILE_FREE = mpiifort
+  MPI_COMPILE_C = mpiifort
+  MPI_LINK = mpiifort
+  MPI_RUN  = srun
+  MPI_RUN_OPTS = --nodes=1 --ntasks-per-node=72 --time=0:30:00 -p express
+  MPI_RUN_OPTS_SM   = --nodes=1 --ntasks-per-node=72 --time=0:30:00 -p express
+  MPI_RUN_OPTS_MD   = --nodes=8 --ntasks-per-node=72 --time=0:30:00 -p express
+  MPI_RUN_OPTS_LG   = --nodes=32 --ntasks-per-node=72 --time=0:30:00 -p express
+
+#######################################################################
+#            NAG Options
+#######################################################################
+  LNAG = F
+  NAG_LIB = $(NAGFLIB) $(NAGMKLLIB)
+
+#######################################################################
+#            NETCDF Options
+#######################################################################
+  LNETCDF = T
+  NETCDF_INC = $(shell nc-config --fflags)
+  NETCDF_LIB = $(shell nc-config --flibs)
+
+#######################################################################
+#            HDF5 Options
+#######################################################################
+  LHDF5 = T
+  PRECOMP+= -DHDF5_PAR
+  HDF5_INC = -I$(HDF5_HOME)/include 
+  HDF5_LIB = -Wl,-rpath,$(HDF5_HOME)/lib -L$(HDF5_HOME)/lib \
+             -lhdf5 -lhdf5_fortran -lhdf5_hl -lhdf5hl_fortran 
+
+#######################################################################
+#            FFTW3 Options
+#######################################################################
+  LFFTW3 = T
+  FFTW3_INC = -I$(FFTW_HOME)/include
+  FFTW3_LIB = -L$(FFTW_HOME)/lib -lfftw3 -lfftw3f \
+              -Wl,-rpath,$(FFTW_HOME)/lib
+
+#######################################################################
+#             PGPLOT Options
+#######################################################################
+  LPGPLOT = F
+  PGPLOT_INC =
+  PGPLOT_LIB = 
+
+#######################################################################
+#             SILO Options
+#######################################################################
+  LSILO = F
+  SILO_INC = -I$(SILO_DIR)/include
+  SILO_LIB = -L$(SILO_DIR)/lib -lsilo
+
+#######################################################################
+#            DKES/NEO Options
+#######################################################################
+  LDKES = T
+  LNEO  = T
+
+#######################################################################
+#            GENE Options
+#######################################################################
+  LGENE = F
+  GENE_DIR = $(GENE_PATH)/bin/obj_cobra
+  FUTILS_DIR = $(GENE_PATH)/external/cobra/futils-gene-mod/src
+  LIB_GENE = libgene.a
+  LIB_FUTILS = libfutils.a
+  GENE_INC = -I$(GENE_DIR) \
+             -I$(FUTILS_DIR)
+  GENE_LIB = $(GENE_DIR)/$(LIB_GENE) \
+             $(FUTILS_DIR)/$(LIB_FUTILS)
+
+#######################################################################
+#            COILOPT++ Options
+#######################################################################
+  LCOILOPT = F
+  COILOPT_INC = -I$(COILOPT_PATH)
+  COILOPTPP_DIR = $(COILOPT_PATH)
+  LIB_COILOPTPP = libcoilopt++.a
+  COILOPT_LIB = $(COILOPT_PATH)/$(LIB_COILOPTPP) 
+
+#######################################################################
+#            TERPSICHORE Options
+#######################################################################
+  LTERPSICHORE= F
+  TERPSICHORE_INC = -I$(TERPSICHORE_PATH)
+  TERPSICHORE_DIR = $(TERPSICHORE_PATH)
+  LIB_TERPSICHORE = libterpsichore.a
+  TERPSICHORE_LIB = $(TERPSICHORE_DIR)/$(LIB_TERPSICHORE)
+
+#######################################################################
+#            TRAVIS Options
+#######################################################################
+  LTRAVIS= F
+  TRAVIS_DIR = $(TRAVIS_PATH)
+  LIB_TRAVIS = libtravis64_sopt.a
+  LIB_MCONF  = libmconf64.a
+  LIB_FADDEEVA = libfaddeeva64.a
+  TRAVIS_LIB = $(TRAVIS_DIR)/lib/$(LIB_TRAVIS) \
+               $(TRAVIS_DIR)/faddeeva_package/lib/$(LIB_FADDEEVA) \
+               $(TRAVIS_DIR)/magconf/lib/$(LIB_MCONF) -lstdc++
+
+#######################################################################
+#            SFINCS Options
+#######################################################################
+  LSFINCS = F
+  SFINCS_INC = -I$(SFINCS_DIR)
+  LIB_SFINCS = libsfincs.a
+
+  SFINCS_LIB = $(SFINCS_DIR)/$(LIB_SFINCS)
+
+#######################################################################
+#            REGCOIL Options
+#######################################################################
+  LREGCOIL= F
+  REGCOIL_DIR = $(REGCOIL_PATH)
+  REGCOIL_INC = -I$(REGCOIL_DIR) 
+  LIB_REGCOIL = libregcoil.a
+  REGCOIL_LIB = $(REGCOIL_DIR)/$(LIB_REGCOIL) -fopenmp
+
+#######################################################################
+#            Available Energy Options
+#######################################################################
+  LAEOPT= F
+  AEOPT_DIR = $(AEOPT_PATH)
+  AEOPT_INC = -I$(AEOPT_DIR) 
+  LIB_AEOPT = libtrapAE.a
+  AEOPT_LIB = $(AEOPT_PATH)/$(LIB_AEOPT)
+
+#######################################################################
+#            LIBSTELL Shared Options
+#######################################################################
+  LIB_SHARE = $(LIBS) $(NETCDF_LIB) $(HDF5_LIB) \
+             -lifport -lifcoremt -limf -lm -lc \
+             -lpthread 
+

make.inc

@@ -1,4 +1,4 @@
-# Shamelessly stolen from ASCOT4
+# Shamelessly adopted from ASCOT4
 MACHINE ?= $(shell uname -n | \
 	awk '/dion-ubuntu/{print "ubuntu"}\
 	     /Lazersons-Air/{print "macports"}\
@@ -13,7 +13,8 @@ MACHINE ?= $(shell uname -n | \
 	     /Matts-MacBook-Pro/{print "macports_landreman"}\
 	     /raven/{print "raven"}\
 	     /cobra/{print "cobra"}\
-	     /draco/{print "draco"}')
+	     /draco/{print "draco"}\
+	     /viper/{print "viper"}')
 
 ifneq ($(strip $(MACHINE)),)
 	include $(STELLOPT_PATH)/SHARE/make_$(MACHINE).inc