Skip to content

HiSeqX Diversity Cohort

Jump to bottom
Mitch Bekritsky edited this page Oct 17, 2018 · 1 revision

Table of Contents

Summary

150 samples selected from the International Genome Sample Resource (formerly the 1000 Genomes Project) based on population diversity.

Links

ENA

SRA

BaseSpace

Sample information

CSV format

Sample ID Family ID Sex Population Superpopulation Repository Links References
HG03520 NG109 F ESN AFR NHGRI BaseSpace EU,ENA,Coriell 1;2
HG03521 NG109 M ESN AFR NHGRI BaseSpace EU,ENA,Coriell 1;2
HG02973 NG23 M ESN AFR NHGRI BaseSpace EU,ENA,Coriell 1;2
HG02974 NG23 F ESN AFR NHGRI BaseSpace EU,ENA,Coriell 1;2
HG03099 NG26 F ESN AFR NHGRI BaseSpace EU,ENA,Coriell 1;2
HG03100 NG26 M ESN AFR NHGRI BaseSpace EU,ENA,Coriell 1;2
HG03120 NG33 M ESN AFR NHGRI BaseSpace EU,ENA,Coriell 1;2
HG03121 NG33 F ESN AFR NHGRI BaseSpace EU,ENA,Coriell 1;2
HG03129 NG36 F ESN AFR NHGRI BaseSpace EU,ENA,Coriell 1;2
HG03130 NG36 M ESN AFR NHGRI BaseSpace EU,ENA,Coriell 1;2
HG03168 NG49 F ESN AFR NHGRI BaseSpace EU,ENA,Coriell 1;2
HG03169 NG49 M ESN AFR NHGRI BaseSpace EU,ENA,Coriell 1;2
HG03300 NG75 F ESN AFR NHGRI BaseSpace EU,ENA,Coriell 1;2
HG03301 NG75 M ESN AFR NHGRI BaseSpace EU,ENA,Coriell 1;2
HG03306 NG77 F ESN AFR NHGRI BaseSpace EU,ENA,Coriell 2
HG03307 NG77 M ESN AFR NHGRI BaseSpace EU,ENA,Coriell 2
HG03039 GB110 M GWD AFR NHGRI BaseSpace EU,ENA,Coriell 1;2
HG03040 GB110 F GWD AFR NHGRI BaseSpace EU,ENA,Coriell 1;2
HG03246 GB116 M GWD AFR NHGRI BaseSpace EU,ENA,Coriell 1;2
HG03247 GB116 F GWD AFR NHGRI BaseSpace EU,ENA,Coriell 1;2
HG02561 GB18 M GWD AFR NHGRI BaseSpace EU,ENA,Coriell 1;2
HG02562 GB18 F GWD AFR NHGRI BaseSpace EU,ENA,Coriell 1;2
HG02620 GB31 M GWD AFR NHGRI BaseSpace EU,ENA,Coriell 1;2
HG02621 GB31 F GWD AFR NHGRI BaseSpace EU,ENA,Coriell 1;2
HG02721 GB52 M GWD AFR NHGRI BaseSpace EU,ENA,Coriell 1;2
HG02722 GB52 F GWD AFR NHGRI BaseSpace EU,ENA,Coriell 1;2
HG02768 GB57 M GWD AFR NHGRI BaseSpace EU,ENA,Coriell 1;2
HG02769 GB57 F GWD AFR NHGRI BaseSpace EU,ENA,Coriell 1;2
HG02771 GB58 M GWD AFR NHGRI BaseSpace EU,ENA,Coriell 1;2
HG02772 GB58 F GWD AFR NHGRI BaseSpace EU,ENA,Coriell 1;2
HG02851 GB78 M GWD AFR NHGRI BaseSpace EU,ENA,Coriell 1;2
HG02852 GB78 F GWD AFR NHGRI BaseSpace EU,ENA,Coriell 1;2
HG02982 GB97 M GWD AFR NHGRI BaseSpace EU,ENA,Coriell 1;2
HG02983 GB97 F GWD AFR NHGRI BaseSpace EU,ENA,Coriell 1;2
HG03069 NA M MSL AFR NHGRI BaseSpace EU,ENA,Coriell 1;2
HG03445 NA M MSL AFR NHGRI BaseSpace EU,ENA,Coriell 1;2
HG03096 SL16 M MSL AFR NHGRI BaseSpace EU,ENA,Coriell 1;2
HG03097 SL16 F MSL AFR NHGRI BaseSpace EU,ENA,Coriell 1;2
HG03063 SL5 M MSL AFR NHGRI BaseSpace EU,ENA,Coriell 1;2
HG03064 SL5 F MSL AFR NHGRI BaseSpace EU,ENA,Coriell 1;2
HG03451 SL50 M MSL AFR NHGRI BaseSpace EU,ENA,Coriell 1;2
HG03452 SL50 F MSL AFR NHGRI BaseSpace EU,ENA,Coriell 1;2
HG03484 SL61 M MSL AFR NHGRI BaseSpace EU,ENA,Coriell 1;2
HG03485 SL61 F MSL AFR NHGRI BaseSpace EU,ENA,Coriell 1;2
HG03574 SL71 M MSL AFR NHGRI BaseSpace EU,ENA,Coriell 2
HG03575 SL71 F MSL AFR NHGRI BaseSpace EU,ENA,Coriell 1;2
HG03577 SL72 M MSL AFR NHGRI BaseSpace EU,ENA,Coriell 1;2
HG03578 SL72 F MSL AFR NHGRI BaseSpace EU,ENA,Coriell 1;2
HG03582 SL73 M MSL AFR NHGRI BaseSpace EU,ENA,Coriell 1;2
HG03583 SL73 F MSL AFR NHGRI BaseSpace EU,ENA,Coriell 1;2
HG00844 NA M CDX EAS NHGRI BaseSpace EU,ENA,Coriell 1;2
HG00881 NA M CDX EAS NHGRI BaseSpace EU,ENA,Coriell 1;2
HG00982 NA M CDX EAS NHGRI BaseSpace EU,ENA,Coriell 1;2
HG02356 NA M CDX EAS NHGRI BaseSpace EU,ENA,Coriell 1;2
HG02372 NA M CDX EAS NHGRI BaseSpace EU,ENA,Coriell 1;2
HG02373 NA M CDX EAS NHGRI BaseSpace EU,ENA,Coriell 1;2
HG02374 NA M CDX EAS NHGRI BaseSpace EU,ENA,Coriell 1;2
HG02375 NA M CDX EAS NHGRI BaseSpace EU,ENA,Coriell 1;2
HG02381 NA M CDX EAS NHGRI BaseSpace EU,ENA,Coriell 1;2
HG02383 NA M CDX EAS NHGRI BaseSpace EU,ENA,Coriell 1;2
HG02384 NA M CDX EAS NHGRI BaseSpace EU,ENA,Coriell 1;2
HG02385 NA M CDX EAS NHGRI BaseSpace EU,ENA,Coriell 1;2
HG02386 NA M CDX EAS NHGRI BaseSpace EU,ENA,Coriell 1;2
HG02388 NA M CDX EAS NHGRI BaseSpace EU,ENA,Coriell 1;2
HG02391 NA M CDX EAS NHGRI BaseSpace EU,ENA,Coriell 1;2
HG02409 NA M CDX EAS NHGRI BaseSpace EU,ENA,Coriell 1;2
HG00448 SH016 M CHS EAS NHGRI BaseSpace EU,ENA,Coriell 1;2
HG00449 SH016 F CHS EAS NHGRI BaseSpace EU,ENA,Coriell 1;2
HG00583 SH054 M CHS EAS NHGRI BaseSpace EU,ENA,Coriell 1;2
HG00584 SH054 F CHS EAS NHGRI BaseSpace EU,ENA,Coriell 1;2
HG00595 SH058 M CHS EAS NHGRI BaseSpace EU,ENA,Coriell 1;2
HG00596 SH058 F CHS EAS NHGRI BaseSpace EU,ENA,Coriell 1;2
HG00610 SH063 M CHS EAS NHGRI BaseSpace EU,ENA,Coriell 1;2
HG00611 SH063 F CHS EAS NHGRI BaseSpace EU,ENA,Coriell 1;2
HG00613 SH064 M CHS EAS NHGRI BaseSpace EU,ENA,Coriell 1;2
HG00614 SH064 F CHS EAS NHGRI BaseSpace EU,ENA,Coriell 1;2
HG00650 SH072 M CHS EAS NHGRI BaseSpace EU,ENA,Coriell 1;2
HG00651 SH072 F CHS EAS NHGRI BaseSpace EU,ENA,Coriell 1;2
HG00656 SH074 M CHS EAS NHGRI BaseSpace EU,ENA,Coriell 1;2
HG00657 SH074 F CHS EAS NHGRI BaseSpace EU,ENA,Coriell 1;2
HG00662 SH076 M CHS EAS NHGRI BaseSpace EU,ENA,Coriell 1;2
HG00663 SH076 F CHS EAS NHGRI BaseSpace EU,ENA,Coriell 1;2
HG00683 SH083 M CHS EAS NHGRI BaseSpace EU,ENA,Coriell 1;2
HG00684 SH083 F CHS EAS NHGRI BaseSpace EU,ENA,Coriell 1;2
HG02016 VN46 F KHV EAS NHGRI BaseSpace EU,ENA,Coriell 1;2
HG02017 VN46 M KHV EAS NHGRI BaseSpace EU,ENA,Coriell 1;2
HG02069 VN64 F KHV EAS NHGRI BaseSpace EU,ENA,Coriell 1;2
HG02070 VN64 M KHV EAS NHGRI BaseSpace EU,ENA,Coriell 1;2
HG02072 VN65 F KHV EAS NHGRI BaseSpace EU,ENA,Coriell 1;2
HG02073 VN65 M KHV EAS NHGRI BaseSpace EU,ENA,Coriell 1;2
HG02075 VN66 F KHV EAS NHGRI BaseSpace EU,ENA,Coriell 1;2
HG02076 VN66 M KHV EAS NHGRI BaseSpace EU,ENA,Coriell 1;2
HG02130 VN79 F KHV EAS NHGRI BaseSpace EU,ENA,Coriell 1;2
HG02131 VN79 M KHV EAS NHGRI BaseSpace EU,ENA,Coriell 1;2
HG02512 VN87 M KHV EAS NHGRI BaseSpace EU,ENA,Coriell 1;2
HG02513 VN87 F KHV EAS NHGRI BaseSpace EU,ENA,Coriell 1;2
HG02521 VN90 M KHV EAS NHGRI BaseSpace EU,ENA,Coriell 1;2
HG02522 VN90 F KHV EAS NHGRI BaseSpace EU,ENA,Coriell 1;2
HG02524 VN91 M KHV EAS NHGRI BaseSpace EU,ENA,Coriell 2
HG02525 VN91 F KHV EAS NHGRI BaseSpace EU,ENA,Coriell 2
HG00181 NA M FIN EUR NHGRI BaseSpace EU,ENA,Coriell 1;2
HG00185 NA M FIN EUR NHGRI BaseSpace EU,ENA,Coriell 1;2
HG00190 NA M FIN EUR NHGRI BaseSpace EU,ENA,Coriell 1;2
HG00267 NA M FIN EUR NHGRI BaseSpace EU,ENA,Coriell 1;2
HG00273 NA M FIN EUR NHGRI BaseSpace EU,ENA,Coriell 1;2
HG00277 NA M FIN EUR NHGRI BaseSpace EU,ENA,Coriell 1;2
HG00280 NA M FIN EUR NHGRI BaseSpace EU,ENA,Coriell 1;2
HG00284 NA M FIN EUR NHGRI BaseSpace EU,ENA,Coriell 1;2
HG00351 NA M FIN EUR NHGRI BaseSpace EU,ENA,Coriell 1;2
HG00358 NA M FIN EUR NHGRI BaseSpace EU,ENA,Coriell 1;2
HG00366 NA M FIN EUR NHGRI BaseSpace EU,ENA,Coriell 1;2
HG00369 NA M FIN EUR NHGRI BaseSpace EU,ENA,Coriell 1;2
HG00371 NA M FIN EUR NHGRI BaseSpace EU,ENA,Coriell 1;2
HG00372 NA M FIN EUR NHGRI BaseSpace EU,ENA,Coriell 1;2
HG00096 NA M GBR EUR NHGRI BaseSpace EU,ENA,Coriell 1;2
HG00098 NA M GBR EUR NHGRI BaseSpace EU,ENA,Coriell 1;2
HG00101 NA M GBR EUR NHGRI BaseSpace EU,ENA,Coriell 1;2
HG00103 NA M GBR EUR NHGRI BaseSpace EU,ENA,Coriell 1;2
HG00107 NA M GBR EUR NHGRI BaseSpace EU,ENA,Coriell 1;2
HG00108 NA M GBR EUR NHGRI BaseSpace EU,ENA,Coriell 1;2
HG00109 NA M GBR EUR NHGRI BaseSpace EU,ENA,Coriell 1;2
HG00115 NA M GBR EUR NHGRI BaseSpace EU,ENA,Coriell 1;2
HG00116 NA M GBR EUR NHGRI BaseSpace EU,ENA,Coriell 1;2
HG00117 NA M GBR EUR NHGRI BaseSpace EU,ENA,Coriell 1;2
HG00119 NA M GBR EUR NHGRI BaseSpace EU,ENA,Coriell 1;2
HG00131 NA M GBR EUR NHGRI BaseSpace EU,ENA,Coriell 1;2
HG00136 NA M GBR EUR NHGRI BaseSpace EU,ENA,Coriell 1;2
HG00139 NA M GBR EUR NHGRI BaseSpace EU,ENA,Coriell 1;2
HG00256 NA M GBR EUR NHGRI BaseSpace EU,ENA,Coriell 1;2
HG00264 NA M GBR EUR NHGRI BaseSpace EU,ENA,Coriell 1;2
HG01628 IBS015 F IBS EUR NHGRI BaseSpace EU,ENA,Coriell 1;2
HG01630 IBS015 M IBS EUR NHGRI BaseSpace EU,ENA,Coriell 1;2
HG01625 IBS016 M IBS EUR NHGRI BaseSpace EU,ENA,Coriell 1;2
HG01626 IBS016 F IBS EUR NHGRI BaseSpace EU,ENA,Coriell 1;2
HG01623 IBS017 F IBS EUR NHGRI BaseSpace EU,ENA,Coriell 1;2
HG01624 IBS017 M IBS EUR NHGRI BaseSpace EU,ENA,Coriell 1;2
HG01619 IBS018 M IBS EUR NHGRI BaseSpace EU,ENA,Coriell 1;2
HG01620 IBS018 F IBS EUR NHGRI BaseSpace EU,ENA,Coriell 1;2
HG01682 IBS030 M IBS EUR NHGRI BaseSpace EU,ENA,Coriell 1;2
HG01684 IBS030 F IBS EUR NHGRI BaseSpace EU,ENA,Coriell 1;2
HG01685 IBS031 F IBS EUR NHGRI BaseSpace EU,ENA,Coriell 1;2
HG01686 IBS031 M IBS EUR NHGRI BaseSpace EU,ENA,Coriell 1;2
HG01707 IBS038 F IBS EUR NHGRI BaseSpace EU,ENA,Coriell 1;2
HG01708 IBS038 M IBS EUR NHGRI BaseSpace EU,ENA,Coriell 1;2
HG01756 IBS044 M IBS EUR NHGRI BaseSpace EU,ENA,Coriell 1;2
HG01757 IBS044 F IBS EUR NHGRI BaseSpace EU,ENA,Coriell 1;2
HG01761 IBS046 M IBS EUR NHGRI BaseSpace EU,ENA,Coriell 1;2
HG01762 IBS046 F IBS EUR NHGRI BaseSpace EU,ENA,Coriell 1;2
HG01770 IBS049 F IBS EUR NHGRI BaseSpace EU,ENA,Coriell 1;2
HG01771 IBS049 M IBS EUR NHGRI BaseSpace EU,ENA,Coriell 1;2

References

  1. The 1000 Genomes Project Consortium (2015) A global reference for human genetic variation. Nature 526:68-74. doi:10.1038/nature15393
  2. Zheng-Bradley, et al (2017) Alignment of 1000 Genomes Project reads to reference assembly GRCh38. Gigascience 6(7):1-8. doi:10.1093/gigascience/gix038

Home

Sample Information

Methods

Polaris in BaseSpace

Input Data Sources

Clone this wiki locally