Relatório Estatística Computacional

Autores:
Cristian Pessatti dos Anjos
Thor Marinho
Rafael Alisson Schipiura

23 fevereiro, 2023

O relatório é reproduzível usando o comando:

	make

Que chama, quando necessário, o script `extract_worms_data.R` para fazer o download da planilha em formato `.xlsx`, chamado `Nadolny_etal_Worms_Brazil_DRYAD_9.xlsx`. Se por algum motivo houver falha em conseguir os dados, uma cópia foi incluída com o nome `_Nadolny_etal_Worms_Brazil_DRYAD_9.xlsx`.

Em seguida, chama o script `limpeza.R` que faz o pré-processamento dos dados:
* Seleciona as colunas que queremos tratar;
* Renomeia as colunas para nomes mais fáceis de lidar;
* Converte as variáveis para o tipo adequado;
* Remove algumas observações que não entendemos (precisaríamos da ajuda do biólogo numa análise real);
* Padroniza uma variável que está com mistura de caixa alta e caixa baixa variada;
* Salva os dados limpos em csv (worms.csv) que será lido pelo script de Rmarkdown;
* Salva um arquivo em csv com descrições das variáveis (legenda.csv).

Estando prontos os arquivos worms.csv e legenda.csv, é chamado o script `makepdf.R` que compila o arquivo PDF à partir da fonte `relatorio.Rmd`.