Command: average_nucleotide_identity.py --workers 32 -i ./ -o test_output -g --gformat svg,png Current status running 'top': [szrzs212@nesh-bigmem01 ~]$ top -n 1 -b | grep szrzs212 1786013 szrzs212 20 0 22836 15504 2408 R 100.0 0.0 0:01.03 postnuc 1786019 szrzs212 20 0 75084 30216 1496 R 100.0 0.0 0:00.40 mummer 1783814 szrzs212 20 0 118332 114524 1816 R 94.1 0.0 0:09.41 mummer 1783828 szrzs212 20 0 125344 120800 1752 R 94.1 0.0 0:08.84 mummer 1783831 szrzs212 20 0 126644 122448 1724 R 94.1 0.0 0:08.76 mummer 1783944 szrzs212 20 0 114740 111272 1712 R 94.1 0.0 0:08.24 mummer 1784196 szrzs212 20 0 115132 111848 1744 R 94.1 0.0 0:07.79 mummer 1784302 szrzs212 20 0 114212 110524 1716 R 94.1 0.0 0:07.67 mummer 1784373 szrzs212 20 0 112036 108584 1748 R 94.1 0.0 0:07.25 mummer 1784395 szrzs212 20 0 113608 109668 1656 R 94.1 0.0 0:06.53 mummer 1784398 szrzs212 20 0 119688 115700 1780 R 94.1 0.0 0:06.54 mummer 1784910 szrzs212 20 0 118436 114848 1728 R 94.1 0.0 0:04.87 mummer 1784917 szrzs212 20 0 112376 109652 1772 R 94.1 0.0 0:04.70 mummer 1784922 szrzs212 20 0 114460 110988 1768 R 94.1 0.0 0:04.48 mummer 1784933 szrzs212 20 0 114060 110268 1768 R 94.1 0.0 0:04.21 mummer 1784936 szrzs212 20 0 115000 111644 1704 R 94.1 0.0 0:04.17 mummer 1785016 szrzs212 20 0 114136 110392 1704 R 94.1 0.0 0:03.85 mummer 1785077 szrzs212 20 0 42692 35576 2408 R 94.1 0.0 0:03.64 postnuc 1785206 szrzs212 20 0 36512 29092 2416 R 94.1 0.0 0:03.48 postnuc 1785471 szrzs212 20 0 104908 96168 1480 R 94.1 0.0 0:02.64 mummer 1785477 szrzs212 20 0 94184 86504 1476 R 94.1 0.0 0:02.18 mummer 1785721 szrzs212 20 0 20260 13156 2328 R 94.1 0.0 0:01.46 postnuc 1785743 szrzs212 20 0 80172 67244 1580 R 94.1 0.0 0:01.46 mummer 1786001 szrzs212 20 0 23860 16780 2332 R 94.1 0.0 0:01.19 postnuc 1786004 szrzs212 20 0 24452 17236 2384 R 94.1 0.0 0:01.16 postnuc 1786006 szrzs212 20 0 73936 56040 1584 R 94.1 0.0 0:01.10 mummer 1783979 szrzs212 20 0 112600 109776 1704 R 88.2 0.0 0:08.07 mummer 1784366 szrzs212 20 0 118744 114844 1776 R 88.2 0.0 0:07.33 mummer 1785465 szrzs212 20 0 114028 109576 1672 R 88.2 0.0 0:02.99 mummer 1786009 szrzs212 20 0 72780 50196 1580 R 88.2 0.0 0:01.00 mummer 1786018 szrzs212 20 0 23712 16508 2408 R 88.2 0.0 0:00.42 postnuc 1786022 szrzs212 20 0 39828 10048 4528 S 29.4 0.0 0:00.10 nucmer 1783996 szrzs212 20 0 39828 10140 4620 S 5.9 0.0 0:00.11 nucmer 1784383 szrzs212 20 0 39800 10100 4576 S 5.9 0.0 0:00.11 nucmer 1784400 szrzs212 20 0 10064 2816 2272 S 5.9 0.0 0:00.02 mgaps 1786028 szrzs212 20 0 62112 4660 3568 R 5.9 0.0 0:00.01 top 1786032 szrzs212 20 0 10900 5452 1476 R 5.9 0.0 0:00.01 mummer 3475837 szrzs212 20 0 9904 2888 2472 S 5.9 0.0 50:07.03 track.sh 1780659 szrzs212 20 0 161180 5168 3852 S 0.0 0.0 0:00.00 sshd 1780719 szrzs212 20 0 23764 7072 2940 S 0.0 0.0 0:00.06 bash 1782356 szrzs212 20 0 39832 10216 4672 S 0.0 0.0 0:00.13 nucmer 1782766 szrzs212 20 0 39828 10220 4672 S 0.0 0.0 0:00.12 nucmer 1783323 szrzs212 20 0 39824 10180 4636 S 0.0 0.0 0:00.13 nucmer 1783324 szrzs212 20 0 39824 10144 4604 S 0.0 0.0 0:00.14 nucmer 1783362 szrzs212 20 0 39808 10228 4676 S 0.0 0.0 0:00.13 nucmer 1783364 szrzs212 20 0 39824 10152 4608 S 0.0 0.0 0:00.13 nucmer 1783809 szrzs212 20 0 39808 10132 4608 S 0.0 0.0 0:00.10 nucmer 1783815 szrzs212 20 0 13712 2956 2680 S 0.0 0.0 0:00.00 sh 1783816 szrzs212 20 0 10500 3368 2344 S 0.0 0.0 0:00.00 mgaps 1783819 szrzs212 20 0 39824 10208 4688 S 0.0 0.0 0:00.12 nucmer 1783820 szrzs212 20 0 39832 10136 4596 S 0.0 0.0 0:00.12 nucmer 1783821 szrzs212 20 0 39832 10176 4648 S 0.0 0.0 0:00.12 nucmer 1783829 szrzs212 20 0 13712 3008 2732 S 0.0 0.0 0:00.00 sh 1783830 szrzs212 20 0 10500 3120 2356 S 0.0 0.0 0:00.00 mgaps 1783832 szrzs212 20 0 13712 3012 2740 S 0.0 0.0 0:00.00 sh 1783835 szrzs212 20 0 9844 2788 2348 S 0.0 0.0 0:00.01 mgaps 1783848 szrzs212 20 0 39828 10108 4576 S 0.0 0.0 0:00.09 nucmer 1783895 szrzs212 20 0 39832 10124 4600 S 0.0 0.0 0:00.10 nucmer 1783946 szrzs212 20 0 13712 2944 2672 S 0.0 0.0 0:00.00 sh 1783948 szrzs212 20 0 11376 3820 2356 S 0.0 0.0 0:00.00 mgaps 1783989 szrzs212 20 0 13712 2932 2656 S 0.0 0.0 0:00.00 sh 1783997 szrzs212 20 0 10064 2932 2388 S 0.0 0.0 0:00.02 mgaps 1784112 szrzs212 20 0 39808 10196 4672 S 0.0 0.0 0:00.13 nucmer 1784200 szrzs212 20 0 13712 2964 2692 S 0.0 0.0 0:00.00 sh 1784207 szrzs212 20 0 9844 2856 2420 S 0.0 0.0 0:00.01 mgaps 1784304 szrzs212 20 0 13712 2956 2680 S 0.0 0.0 0:00.00 sh 1784308 szrzs212 20 0 9844 2792 2352 S 0.0 0.0 0:00.03 mgaps 1784360 szrzs212 20 0 39824 10056 4532 S 0.0 0.0 0:00.11 nucmer 1784363 szrzs212 20 0 39836 10192 4668 S 0.0 0.0 0:00.10 nucmer 1784367 szrzs212 20 0 13712 2828 2556 S 0.0 0.0 0:00.00 sh 1784368 szrzs212 20 0 10064 2896 2352 S 0.0 0.0 0:00.04 mgaps 1784374 szrzs212 20 0 13712 3008 2732 S 0.0 0.0 0:00.00 sh 1784375 szrzs212 20 0 11376 3724 2264 S 0.0 0.0 0:00.00 mgaps 1784382 szrzs212 20 0 39832 10128 4612 S 0.0 0.0 0:00.10 nucmer 1784396 szrzs212 20 0 13712 3008 2736 S 0.0 0.0 0:00.00 sh 1784397 szrzs212 20 0 9520 1680 1520 S 0.0 0.0 0:00.00 mgaps 1784399 szrzs212 20 0 13712 2860 2588 S 0.0 0.0 0:00.00 sh 1784907 szrzs212 20 0 39832 10204 4688 S 0.0 0.0 0:00.12 nucmer 1784911 szrzs212 20 0 13712 2960 2684 S 0.0 0.0 0:00.00 sh 1784912 szrzs212 20 0 39832 10188 4668 S 0.0 0.0 0:00.11 nucmer 1784913 szrzs212 20 0 9844 2704 2264 S 0.0 0.0 0:00.00 mgaps 1784916 szrzs212 20 0 39828 10124 4600 S 0.0 0.0 0:00.09 nucmer 1784918 szrzs212 20 0 13712 2912 2636 S 0.0 0.0 0:00.00 sh 1784919 szrzs212 20 0 10508 3208 2416 S 0.0 0.0 0:00.01 mgaps 1784923 szrzs212 20 0 13712 2916 2640 S 0.0 0.0 0:00.00 sh 1784924 szrzs212 20 0 9684 1748 1588 S 0.0 0.0 0:00.00 mgaps 1784927 szrzs212 20 0 39828 10136 4612 S 0.0 0.0 0:00.11 nucmer 1784928 szrzs212 20 0 39828 10216 4688 S 0.0 0.0 0:00.12 nucmer 1784934 szrzs212 20 0 13712 2900 2624 S 0.0 0.0 0:00.00 sh 1784935 szrzs212 20 0 9676 1776 1620 S 0.0 0.0 0:00.00 mgaps 1784937 szrzs212 20 0 13712 2880 2608 S 0.0 0.0 0:00.00 sh 1784943 szrzs212 20 0 9676 1768 1612 S 0.0 0.0 0:00.00 mgaps 1784944 szrzs212 20 0 39832 10248 4716 S 0.0 0.0 0:00.10 nucmer 1785018 szrzs212 20 0 13712 2996 2724 S 0.0 0.0 0:00.00 sh 1785024 szrzs212 20 0 9844 2804 2364 S 0.0 0.0 0:00.00 mgaps 1785073 szrzs212 20 0 13712 2936 2664 S 0.0 0.0 0:00.00 sh 1785205 szrzs212 20 0 13712 3012 2740 S 0.0 0.0 0:00.00 sh 1785400 szrzs212 20 0 39832 10120 4600 S 0.0 0.0 0:00.10 nucmer 1785466 szrzs212 20 0 13712 2944 2668 S 0.0 0.0 0:00.00 sh 1785467 szrzs212 20 0 9520 1688 1532 S 0.0 0.0 0:00.00 mgaps 1785468 szrzs212 20 0 39836 10140 4608 S 0.0 0.0 0:00.09 nucmer 1785472 szrzs212 20 0 13712 2892 2620 S 0.0 0.0 0:00.00 sh 1785473 szrzs212 20 0 9520 1688 1532 S 0.0 0.0 0:00.00 mgaps 1785474 szrzs212 20 0 39828 10108 4592 S 0.0 0.0 0:00.10 nucmer 1785478 szrzs212 20 0 13712 2920 2644 S 0.0 0.0 0:00.00 sh 1785479 szrzs212 20 0 9520 1688 1532 S 0.0 0.0 0:00.00 mgaps 1785582 szrzs212 20 0 39824 10120 4600 S 0.0 0.0 0:00.12 nucmer 1785717 szrzs212 20 0 13712 2884 2612 S 0.0 0.0 0:00.00 sh 1785744 szrzs212 20 0 13712 2860 2588 S 0.0 0.0 0:00.00 sh 1785758 szrzs212 20 0 9520 1744 1588 S 0.0 0.0 0:00.00 mgaps 1785833 szrzs212 20 0 39808 10152 4632 S 0.0 0.0 0:00.10 nucmer 1785849 szrzs212 20 0 39812 10200 4668 S 0.0 0.0 0:00.10 nucmer 1786000 szrzs212 20 0 13712 2928 2656 S 0.0 0.0 0:00.00 sh 1786002 szrzs212 20 0 13712 2912 2636 S 0.0 0.0 0:00.00 sh 1786007 szrzs212 20 0 13712 3000 2724 S 0.0 0.0 0:00.00 sh 1786008 szrzs212 20 0 9520 1728 1572 S 0.0 0.0 0:00.00 mgaps 1786010 szrzs212 20 0 13712 2836 2564 S 0.0 0.0 0:00.00 sh 1786011 szrzs212 20 0 13712 2960 2684 S 0.0 0.0 0:00.00 sh 1786012 szrzs212 20 0 9520 1784 1628 S 0.0 0.0 0:00.00 mgaps 1786014 szrzs212 20 0 39828 10092 4564 S 0.0 0.0 0:00.10 nucmer 1786017 szrzs212 20 0 13712 2912 2636 S 0.0 0.0 0:00.00 sh 1786020 szrzs212 20 0 13712 2816 2540 S 0.0 0.0 0:00.00 sh 1786021 szrzs212 20 0 9520 1752 1596 S 0.0 0.0 0:00.00 mgaps 1786029 szrzs212 20 0 9184 968 876 S 0.0 0.0 0:00.00 grep 1786033 szrzs212 20 0 13712 2888 2612 S 0.0 0.0 0:00.00 sh 1786037 szrzs212 20 0 13712 276 0 R 0.0 0.0 0:00.00 sh 3475294 szrzs212 20 0 9896 2872 2420 S 0.0 0.0 0:00.00 slurm_script 3475335 szrzs212 20 0 510.6g 505.3g 23012 S 0.0 33.5 49:42.26 average_nucleot 3475542 szrzs212 20 0 93816 9560 8064 S 0.0 0.0 0:22.14 systemd 3475546 szrzs212 20 0 398424 3308 36 S 0.0 0.0 0:00.00 (sd-pam) 3475694 szrzs212 20 0 40984 2796 2052 S 0.0 0.0 0:00.00 screen 3475695 szrzs212 20 0 20756 3836 2968 S 0.0 0.0 0:00.01 bash 3480766 szrzs212 20 0 8926804 3.4g 21184 S 0.0 0.2 31:59.20 average_nucleot 3480767 szrzs212 20 0 8940056 3.5g 21116 S 0.0 0.2 29:33.52 average_nucleot 3480768 szrzs212 20 0 8946084 3.5g 21124 S 0.0 0.2 31:51.99 average_nucleot 3480789 szrzs212 20 0 8935492 3.4g 21148 S 0.0 0.2 31:01.57 average_nucleot 3480822 szrzs212 20 0 8946008 3.5g 21184 S 0.0 0.2 31:25.45 average_nucleot 3480823 szrzs212 20 0 8938392 3.4g 21184 S 0.0 0.2 31:15.01 average_nucleot 3480824 szrzs212 20 0 8943136 3.5g 21184 S 0.0 0.2 29:55.28 average_nucleot 3480825 szrzs212 20 0 8944804 3.5g 21184 S 0.0 0.2 32:27.59 average_nucleot 3480826 szrzs212 20 0 8941328 3.4g 21184 S 0.0 0.2 31:31.37 average_nucleot 3480827 szrzs212 20 0 8932576 3.4g 21184 S 0.0 0.2 32:14.98 average_nucleot 3480828 szrzs212 20 0 8939852 3.5g 21172 S 0.0 0.2 30:46.39 average_nucleot 3480829 szrzs212 20 0 8945832 3.5g 21164 S 0.0 0.2 31:49.51 average_nucleot 3480830 szrzs212 20 0 8939780 3.5g 21184 S 0.0 0.2 31:47.53 average_nucleot 3480831 szrzs212 20 0 8943140 3.5g 21184 S 0.0 0.2 31:07.67 average_nucleot 3480832 szrzs212 20 0 8942688 3.5g 21184 S 0.0 0.2 30:29.41 average_nucleot 3480833 szrzs212 20 0 8939032 3.4g 21184 S 0.0 0.2 29:46.79 average_nucleot 3480834 szrzs212 20 0 8946344 3.5g 21112 S 0.0 0.2 31:28.61 average_nucleot 3480835 szrzs212 20 0 8931216 3.4g 21120 S 0.0 0.2 30:39.06 average_nucleot 3480836 szrzs212 20 0 8942340 3.5g 21184 S 0.0 0.2 29:45.68 average_nucleot 3480837 szrzs212 20 0 8944704 3.5g 21184 S 0.0 0.2 30:02.88 average_nucleot 3480838 szrzs212 20 0 8940020 3.4g 21184 S 0.0 0.2 32:11.79 average_nucleot 3480839 szrzs212 20 0 8931416 3.4g 21184 S 0.0 0.2 29:37.63 average_nucleot 3480840 szrzs212 20 0 8939560 3.4g 21184 S 0.0 0.2 31:26.49 average_nucleot 3480841 szrzs212 20 0 8888304 3.4g 21184 S 0.0 0.2 29:40.39 average_nucleot 3480842 szrzs212 20 0 8938356 3.4g 21184 S 0.0 0.2 31:07.40 average_nucleot 3480843 szrzs212 20 0 8940116 3.4g 21184 S 0.0 0.2 29:04.94 average_nucleot 3480844 szrzs212 20 0 8937624 3.4g 21184 S 0.0 0.2 30:52.30 average_nucleot 3480845 szrzs212 20 0 8942208 3.5g 21184 S 0.0 0.2 31:35.86 average_nucleot 3480851 szrzs212 20 0 8936132 3.4g 21184 S 0.0 0.2 31:45.87 average_nucleot 3480852 szrzs212 20 0 8945888 3.5g 21184 S 0.0 0.2 29:53.34 average_nucleot 3480853 szrzs212 20 0 8926124 3.4g 21184 S 0.0 0.2 31:19.34 average_nucleot 3480854 szrzs212 20 0 8942044 3.5g 21184 S 0.0 0.2 31:25.42 average_nucleot