Skip to content

Commit

Permalink
Create a perpendicular-flap tutorial case for Dune (#239)
Browse files Browse the repository at this point in the history
* Create Dune tutorial case for perpendicular flap

* reorder files

* Modify tutorial readme for dune-case

* Change to correct executable name

* Get executable name right
  • Loading branch information
maxfirmbach authored Dec 7, 2021
1 parent 5022a70 commit b7042a5
Show file tree
Hide file tree
Showing 5 changed files with 180 additions and 2 deletions.
4 changes: 3 additions & 1 deletion perpendicular-flap/README.md
Original file line number Diff line number Diff line change
@@ -1,7 +1,7 @@
---
title: Perpendicular flap
permalink: tutorials-perpendicular-flap.html
keywords: fluid-structure interaction, FSI, OpenFOAM, FEniCS, Nutils, deal.II, Calculix, SU2,
keywords: fluid-structure interaction, FSI, OpenFOAM, FEniCS, Nutils, deal.II, Calculix, SU2, Dune
summary: This tutorial describes how to run a fluid-structure interaction using preCICE and any fluid-solid solver combination of our <a href="adapters-overview.html">officially provided adapter codes</a>.
---

Expand Down Expand Up @@ -33,6 +33,8 @@ Solid participant:

* deal.II. For compatibility reasons, the solver reads `Force` data from other `Fluid` participants. Reading and applying `Force` data is currently only implemented in the linear elastic solid model (`Model = linear` in the parameter file). Thus, the default simulation setup is only compatible with the linear elastic solid model. If you want to apply the non-linear solid model, please use `Stress` data for your read data, which is supported by the OpenFOAM adapter as well (example given in Turek-Hron-FSI). The `./run.sh` script takes the compiled executable `elasticity` as input argument (`run.sh -e=/path/to/elasticity`) and is required in case the executable is not discoverable at runtime (e.g. has been added to the system `PATH`). For more information, have a look at the [deal.II adapter documentation](https://precice.org/adapter-dealii-overview.html).

* Dune. The structural model is limited to linear elasticity. The solver reads `Force` data and writes `Displacement` data. The `./run.sh` script needs the compiled executable `dune-perpendicular-flap` in the same directory, which can be obtained by building the dune-adapter.

## Running the Simulation

All listed solvers can be used in order to run the simulation. Open two separate terminals and start the desired fluid and solid participant by calling the respective run script `run.sh` located in the participant directory. For example:
Expand Down
154 changes: 154 additions & 0 deletions perpendicular-flap/solid-dune/Solid.msh
Original file line number Diff line number Diff line change
@@ -0,0 +1,154 @@
$MeshFormat
2.2 0 8
$EndMeshFormat
$Nodes
64
1 -0.05 0 -0.5
2 -0.05 1 -0.5
3 0.05 1 -0.5
4 0.05 0 -0.5
5 -0.05 0.0666666666665325 -0.5
6 -0.05 0.1333333333330848 -0.5
7 -0.05 0.1999999999995569 -0.5
8 -0.05 0.266666666666029 -0.5
9 -0.05 0.3333333333325011 -0.5
10 -0.05 0.3999999999989731 -0.5
11 -0.05 0.4666666666654452 -0.5
12 -0.05 0.5333333333321025 -0.5
13 -0.05 0.599999999998945 -0.5
14 -0.05 0.6666666666657876 -0.5
15 -0.05 0.73333333333263 -0.5
16 -0.05 0.7999999999994725 -0.5
17 -0.05 0.8666666666663151 -0.5
18 -0.05 0.9333333333331575 -0.5
19 -0.0166666666667507 1 -0.5
20 0.01666666666657628 1 -0.5
21 0.05 0.9333333333330558 -0.5
22 0.05 0.866666666666204 -0.5
23 0.05 0.8 -0.5
24 0.05 0.7333333333337959 -0.5
25 0.05 0.6666666666675918 -0.5
26 0.05 0.6000000000013874 -0.5
27 0.05 0.5333333333351832 -0.5
28 0.05 0.466666666668609 -0.5
29 0.05 0.4000000000016649 -0.5
30 0.05 0.3333333333347207 -0.5
31 0.05 0.2666666666677765 -0.5
32 0.05 0.2000000000008324 -0.5
33 0.05 0.1333333333338883 -0.5
34 0.05 0.06666666666694399 -0.5
35 0.0166666666667507 0 -0.5
36 -0.01666666666657628 0 -0.5
37 -0.0166666666665879 0.06666666666666968 -0.5
38 0.01666666666673907 0.06666666666680683 -0.5
39 -0.01666666666659953 0.1333333333333527 -0.5
40 0.01666666666672744 0.1333333333336205 -0.5
41 -0.01666666666661116 0.1999999999999821 -0.5
42 0.01666666666671581 0.2000000000004072 -0.5
43 -0.01666666666662279 0.2666666666666115 -0.5
44 0.01666666666670419 0.266666666667194 -0.5
45 -0.01666666666663442 0.333333333333241 -0.5
46 0.01666666666669255 0.3333333333339808 -0.5
47 -0.01666666666664605 0.3999999999998704 -0.5
48 0.01666666666668092 0.4000000000007675 -0.5
49 -0.01666666666665767 0.4666666666664998 -0.5
50 0.01666666666666931 0.4666666666675544 -0.5
51 -0.01666666666666929 0.5333333333331293 -0.5
52 0.01666666666665767 0.5333333333341564 -0.5
53 -0.01666666666668093 0.5999999999997592 -0.5
54 0.01666666666664605 0.6000000000005733 -0.5
55 -0.01666666666669255 0.666666666666389 -0.5
56 0.01666666666663442 0.6666666666669904 -0.5
57 -0.01666666666670419 0.7333333333330185 -0.5
58 0.0166666666666228 0.7333333333334071 -0.5
59 -0.01666666666671581 0.7999999999996483 -0.5
60 0.01666666666661116 0.7999999999998242 -0.5
61 -0.01666666666672744 0.8666666666662781 -0.5
62 0.01666666666659953 0.8666666666662408 -0.5
63 -0.01666666666673907 0.9333333333331235 -0.5
64 0.0166666666665879 0.9333333333330895 -0.5
$EndNodes
$Elements
81
1 1 2 3 1 1 5
2 1 2 3 1 5 6
3 1 2 3 1 6 7
4 1 2 3 1 7 8
5 1 2 3 1 8 9
6 1 2 3 1 9 10
7 1 2 3 1 10 11
8 1 2 3 1 11 12
9 1 2 3 1 12 13
10 1 2 3 1 13 14
11 1 2 3 1 14 15
12 1 2 3 1 15 16
13 1 2 3 1 16 17
14 1 2 3 1 17 18
15 1 2 3 1 18 2
16 1 2 3 2 2 19
17 1 2 3 2 19 20
18 1 2 3 2 20 3
19 1 2 3 3 3 21
20 1 2 3 3 21 22
21 1 2 3 3 22 23
22 1 2 3 3 23 24
23 1 2 3 3 24 25
24 1 2 3 3 25 26
25 1 2 3 3 26 27
26 1 2 3 3 27 28
27 1 2 3 3 28 29
28 1 2 3 3 29 30
29 1 2 3 3 30 31
30 1 2 3 3 31 32
31 1 2 3 3 32 33
32 1 2 3 3 33 34
33 1 2 3 3 34 4
34 1 2 1 4 4 35
35 1 2 1 4 35 36
36 1 2 1 4 36 1
37 3 2 1 1 1 5 37 36
38 3 2 1 1 36 37 38 35
39 3 2 1 1 35 38 34 4
40 3 2 1 1 5 6 39 37
41 3 2 1 1 37 39 40 38
42 3 2 1 1 38 40 33 34
43 3 2 1 1 6 7 41 39
44 3 2 1 1 39 41 42 40
45 3 2 1 1 40 42 32 33
46 3 2 1 1 7 8 43 41
47 3 2 1 1 41 43 44 42
48 3 2 1 1 42 44 31 32
49 3 2 1 1 8 9 45 43
50 3 2 1 1 43 45 46 44
51 3 2 1 1 44 46 30 31
52 3 2 1 1 9 10 47 45
53 3 2 1 1 45 47 48 46
54 3 2 1 1 46 48 29 30
55 3 2 1 1 10 11 49 47
56 3 2 1 1 47 49 50 48
57 3 2 1 1 48 50 28 29
58 3 2 1 1 11 12 51 49
59 3 2 1 1 49 51 52 50
60 3 2 1 1 50 52 27 28
61 3 2 1 1 12 13 53 51
62 3 2 1 1 51 53 54 52
63 3 2 1 1 52 54 26 27
64 3 2 1 1 13 14 55 53
65 3 2 1 1 53 55 56 54
66 3 2 1 1 54 56 25 26
67 3 2 1 1 14 15 57 55
68 3 2 1 1 55 57 58 56
69 3 2 1 1 56 58 24 25
70 3 2 1 1 15 16 59 57
71 3 2 1 1 57 59 60 58
72 3 2 1 1 58 60 23 24
73 3 2 1 1 16 17 61 59
74 3 2 1 1 59 61 62 60
75 3 2 1 1 60 62 22 23
76 3 2 1 1 17 18 63 61
77 3 2 1 1 61 63 64 62
78 3 2 1 1 62 64 21 22
79 3 2 1 1 18 2 19 63
80 3 2 1 1 63 19 20 64
81 3 2 1 1 64 20 3 21
$EndElements
6 changes: 6 additions & 0 deletions perpendicular-flap/solid-dune/clean.sh
Original file line number Diff line number Diff line change
@@ -0,0 +1,6 @@
#!/bin/sh
set -e -u

. ../../tools/cleaning-tools.sh

clean_dune .
4 changes: 4 additions & 0 deletions perpendicular-flap/solid-dune/run.sh
Original file line number Diff line number Diff line change
@@ -0,0 +1,4 @@
#!/bin/sh
set -e -u

./dune-perpendicular-flap
14 changes: 13 additions & 1 deletion tools/cleaning-tools.sh
Original file line number Diff line number Diff line change
Expand Up @@ -73,7 +73,7 @@ clean_fenics() {
set -e -u
cd "$1"
echo "--- Cleaning up FEniCS case in $(pwd)"
rm -fv ./*.pvd spooles.out Solid/FSI-S/*
rm -fv ./*.pvd spooles.out FSI-S/*
rm -rfv ./out/
rm -rfv ./preCICE-output/
clean_precice_logs .
Expand Down Expand Up @@ -116,3 +116,15 @@ clean_su2() {
clean_precice_logs .
)
}

clean_dune() {
(
set -e -u
cd "$1"
echo "--- Cleaning up DUNE case in $(pwd)"
rm -fv ./*.pvd
rm -fv ./*.vtu
rm -rfv ./preCICE-output/
clean_precice_logs .
)
}

0 comments on commit b7042a5

Please sign in to comment.