diff --git a/docs/index.html b/docs/index.html index d4baaa3..796c23a 100644 --- a/docs/index.html +++ b/docs/index.html @@ -131,10 +131,10 @@

Lista prezentacija

- tinytable_k6jj631i35064hy32ffd + tinytable_pd4tdj2yeii9ulh5ql29 @@ -152,7 +152,7 @@

Lista prezentacija

- +
@@ -182,17 +182,21 @@

Lista prezentacija

+ + + +
5 Populacija i uzorak
6Testiranje hipoteza o populacionim prosečnim vrednostima i proporcijama
diff --git a/docs/search.json b/docs/search.json index 0c7b1a6..9291608 100644 --- a/docs/search.json +++ b/docs/search.json @@ -4,28 +4,28 @@ "href": "slides/03_centralne_mere/prezentacija.html#koeficijenti-strukture", "title": "Mere centralne tendencije", "section": "Koeficijenti strukture", - "text": "Koeficijenti strukture\n\n\n \n\n \n \n \n tinytable_asb41ks4im0452sw6lwp\n \n \n \n \n \n\n \n \n \n \n \n \n Jedinica\n Bolnica A\n Bolnica B\n Ukupno\n \n \n \n \n \n Interno \n 70\n 80\n 150\n \n \n Ginekološko \n 40\n 140\n 180\n \n \n Hirurško \n 80\n 100\n 180\n \n \n Pedijatrijsko\n 50\n 160\n 210\n \n \n Ukupno \n 240\n 480\n 720" + "text": "Koeficijenti strukture\n\n\n \n\n \n \n \n tinytable_n2fu5wr63rx2gvvau8qx\n \n \n \n \n \n\n \n \n \n \n \n \n Jedinica\n Bolnica A\n Bolnica B\n Ukupno\n \n \n \n \n \n Interno \n 70\n 80\n 150\n \n \n Ginekološko \n 40\n 140\n 180\n \n \n Hirurško \n 80\n 100\n 180\n \n \n Pedijatrijsko\n 50\n 160\n 210\n \n \n Ukupno \n 240\n 480\n 720" }, { "objectID": "slides/03_centralne_mere/prezentacija.html#struktura-postelja-na-odeljenjima", "href": "slides/03_centralne_mere/prezentacija.html#struktura-postelja-na-odeljenjima", "title": "Mere centralne tendencije", "section": "Struktura postelja na odeljenjima?", - "text": "Struktura postelja na odeljenjima?\n\n\n \n\n \n \n \n tinytable_xgoo0l4tin1yuigkw4yg\n \n \n \n \n \n\n \n \n \n \n \n \n Jedinica\n Bolnica A\n Bolnica B\n Ukupno\n \n \n \n \n \n Interno \n 70\n 80\n 150\n \n \n Ginekološko \n 40\n 140\n 180\n \n \n Hirurško \n 80\n 100\n 180\n \n \n Pedijatrijsko\n 50\n 160\n 210\n \n \n Ukupno \n 240\n 480\n 720\n \n \n \n \n\n \n\n \n\n\n\n\n\\[ \\frac{70}{150} \\times 100 = 47 \\% \\]" + "text": "Struktura postelja na odeljenjima?\n\n\n \n\n \n \n \n tinytable_8fl0efbtqse6jrbmo24k\n \n \n \n \n \n\n \n \n \n \n \n \n Jedinica\n Bolnica A\n Bolnica B\n Ukupno\n \n \n \n \n \n Interno \n 70\n 80\n 150\n \n \n Ginekološko \n 40\n 140\n 180\n \n \n Hirurško \n 80\n 100\n 180\n \n \n Pedijatrijsko\n 50\n 160\n 210\n \n \n Ukupno \n 240\n 480\n 720\n \n \n \n \n\n \n\n \n\n\n\n\n\\[ \\frac{70}{150} \\times 100 = 47 \\% \\]" }, { "objectID": "slides/03_centralne_mere/prezentacija.html#struktura-odeljenja-u-bolnicama", "href": "slides/03_centralne_mere/prezentacija.html#struktura-odeljenja-u-bolnicama", "title": "Mere centralne tendencije", "section": "Struktura odeljenja u bolnicama?", - "text": "Struktura odeljenja u bolnicama?\n\n\n \n\n \n \n \n tinytable_xfp0ros1bb6n77ovc6s4\n \n \n \n \n \n\n \n \n \n \n \n \n Jedinica\n Bolnica A\n Bolnica B\n Ukupno\n \n \n \n \n \n Interno \n 70\n 80\n 150\n \n \n Ginekološko \n 40\n 140\n 180\n \n \n Hirurško \n 80\n 100\n 180\n \n \n Pedijatrijsko\n 50\n 160\n 210\n \n \n Ukupno \n 240\n 480\n 720\n \n \n \n \n\n \n\n \n\n\n\n\n\\[ \\frac{70}{240} \\times 100 = 29 \\% \\]" + "text": "Struktura odeljenja u bolnicama?\n\n\n \n\n \n \n \n tinytable_ntzk377tymy1kk1zoikj\n \n \n \n \n \n\n \n \n \n \n \n \n Jedinica\n Bolnica A\n Bolnica B\n Ukupno\n \n \n \n \n \n Interno \n 70\n 80\n 150\n \n \n Ginekološko \n 40\n 140\n 180\n \n \n Hirurško \n 80\n 100\n 180\n \n \n Pedijatrijsko\n 50\n 160\n 210\n \n \n Ukupno \n 240\n 480\n 720\n \n \n \n \n\n \n\n \n\n\n\n\n\\[ \\frac{70}{240} \\times 100 = 29 \\% \\]" }, { "objectID": "slides/03_centralne_mere/prezentacija.html#struktura-postelja-po-odeljenjima-i-bolnicama", "href": "slides/03_centralne_mere/prezentacija.html#struktura-postelja-po-odeljenjima-i-bolnicama", "title": "Mere centralne tendencije", "section": "Struktura postelja po odeljenjima i bolnicama?", - "text": "Struktura postelja po odeljenjima i bolnicama?\n\n\n \n\n \n \n \n tinytable_0el9shpjuj75cpy9mca7\n \n \n \n \n \n\n \n \n \n \n \n \n Jedinica\n Bolnica A\n Bolnica B\n Ukupno\n \n \n \n \n \n Interno \n 70\n 80\n 150\n \n \n Ginekološko \n 40\n 140\n 180\n \n \n Hirurško \n 80\n 100\n 180\n \n \n Pedijatrijsko\n 50\n 160\n 210\n \n \n Ukupno \n 240\n 480\n 720\n \n \n \n \n\n \n\n \n\n\n\n\n\\[ \\frac{70}{720} \\times 100 = 10 \\% \\]" + "text": "Struktura postelja po odeljenjima i bolnicama?\n\n\n \n\n \n \n \n tinytable_vzzf95oovca5do0aihlb\n \n \n \n \n \n\n \n \n \n \n \n \n Jedinica\n Bolnica A\n Bolnica B\n Ukupno\n \n \n \n \n \n Interno \n 70\n 80\n 150\n \n \n Ginekološko \n 40\n 140\n 180\n \n \n Hirurško \n 80\n 100\n 180\n \n \n Pedijatrijsko\n 50\n 160\n 210\n \n \n Ukupno \n 240\n 480\n 720\n \n \n \n \n\n \n\n \n\n\n\n\n\\[ \\frac{70}{720} \\times 100 = 10 \\% \\]" }, { "objectID": "slides/03_centralne_mere/prezentacija.html#relativni-brojevi-za-vremenske-serije", @@ -56,11 +56,11 @@ "text": "Praćenje LDL odgovora na statin (2)" }, { - "objectID": "slides/03_centralne_mere/prezentacija.html#porvršina-infarktnog-polja-miokarda", - "href": "slides/03_centralne_mere/prezentacija.html#porvršina-infarktnog-polja-miokarda", + "objectID": "slides/03_centralne_mere/prezentacija.html#površina-infarktnog-polja-miokarda", + "href": "slides/03_centralne_mere/prezentacija.html#površina-infarktnog-polja-miokarda", "title": "Mere centralne tendencije", - "section": "Porvršina infarktnog polja miokarda", - "text": "Porvršina infarktnog polja miokarda" + "section": "Površina infarktnog polja miokarda", + "text": "Površina infarktnog polja miokarda" }, { "objectID": "slides/03_centralne_mere/prezentacija.html#lančani-indeks-dinamike", @@ -105,18 +105,18 @@ "text": "Model je opis procesa\nMože biti korisno razmišljati o statističkim modelima kao o teorijama kako nastaju opservacije (podaci).\n\n\n\n\n\n\nModeli nisu tačni\n\n\nPoznati satističar Džordž Boks je izrekao citat: “Svi modeli su pogrešni, ali neki su korisni.”\n\n\n\nCilj je naći najefikasniji i najprecizniji način da se predstavi mehanizam kojim nastaju podaci." }, { - "objectID": "slides/03_centralne_mere/prezentacija.html#modeli-nisu-tačni", - "href": "slides/03_centralne_mere/prezentacija.html#modeli-nisu-tačni", + "objectID": "slides/03_centralne_mere/prezentacija.html#šta-je-greška-modela", + "href": "slides/03_centralne_mere/prezentacija.html#šta-je-greška-modela", "title": "Mere centralne tendencije", - "section": "Modeli nisu tačni", - "text": "Modeli nisu tačni\n\nAs the statistician George Box famously said: “All models are wrong but some are useful.”" + "section": "Šta je greška modela?", + "text": "Šta je greška modela?\n\\[ \\text{podaci} = \\text{model} + \\text{greška} \\]\nPreko modela možemo da dobijemo predviđanja.\n\\[ \\text{model} = \\widehat{\\text{podaci}} \\]\nGreška modela je razlika između predviđanja modela i stvarnih podataka.\n\\[ \\text{greška}_i = \\text{podaci}_i - \\widehat{\\text{podaci}} \\]\n\nThis expresses the idea that the data can be broken into two portions: one portion that is described by a statistical model, which expresses the values that we expect the data to take given our knowledge, and another portion that we refer to as the error that reflects the difference between the model’s predictions and the observed data." }, { - "objectID": "slides/03_centralne_mere/prezentacija.html#osnovna-sturuktura-modela", - "href": "slides/03_centralne_mere/prezentacija.html#osnovna-sturuktura-modela", + "objectID": "slides/03_centralne_mere/prezentacija.html#šta-je-dobar-model", + "href": "slides/03_centralne_mere/prezentacija.html#šta-je-dobar-model", "title": "Mere centralne tendencije", - "section": "Osnovna sturuktura modela", - "text": "Osnovna sturuktura modela\n\\[ \\text{podaci} = \\text{model} + \\text{greška} \\]\nPreko modela možemo da dobijemo predviđanja.\n\\[ \\text{model} = \\widehat{\\text{podaci}} \\]\nGreška modela je razlika između predviđanja modela i stvarnih podataka.\n\\[ \\text{greška}_i = \\text{podaci}_i - \\widehat{\\text{podaci}} \\]\n\nThis expresses the idea that the data can be broken into two portions: one portion that is described by a statistical model, which expresses the values that we expect the data to take given our knowledge, and another portion that we refer to as the error that reflects the difference between the model’s predictions and the observed data." + "section": "Šta je “dobar” model?", + "text": "Šta je “dobar” model?\nModel koji najmanje greši je najbolji model.\n\\[ \\text{greška}_i = \\text{podaci}_i - \\widehat{\\text{podaci}} \\]" }, { "objectID": "slides/03_centralne_mere/prezentacija.html#šta-je-najbolji-opis-podataka", @@ -140,11 +140,25 @@ "text": "Unimodalna i bimodalna raspodela\n\n\nGde su tipične vrednosti?" }, { - "objectID": "slides/03_centralne_mere/prezentacija.html#aritmetička-sredina", - "href": "slides/03_centralne_mere/prezentacija.html#aritmetička-sredina", + "objectID": "slides/03_centralne_mere/prezentacija.html#prosek-neonatalne-težine", + "href": "slides/03_centralne_mere/prezentacija.html#prosek-neonatalne-težine", + "title": "Mere centralne tendencije", + "section": "Prosek neonatalne težine", + "text": "Prosek neonatalne težine\n\n\\[ \\bar x = \\frac{\\sum_{i=1}^{n}x_i}{n} = \\frac{x_1 + x_2 + ... + x_n}{n} \\]\n\nAko koristimo aritmetičku sredinu kao opis podataka prosečna greska će biti nula, međutim svaka individualna procena će i dalje imati neku grešku!" + }, + { + "objectID": "slides/03_centralne_mere/prezentacija.html#karakteristike-artimetičke-sredine", + "href": "slides/03_centralne_mere/prezentacija.html#karakteristike-artimetičke-sredine", + "title": "Mere centralne tendencije", + "section": "Karakteristike artimetičke sredine", + "text": "Karakteristike artimetičke sredine\nAritmetička sredina ima prosečnu grešku od nula:\n\\[ \\text{prosečna greška} = \\frac{1}{n}\\sum_{i = n}^n (x_i - \\bar x) = 0 \\]\nAritmetička sredina ima najmanju moguću prosečnu kvadratnu grešku:\n\\[ \\text{prosečna kvadratna greška} = \\frac{1}{n}\\sum_{i = n}^n (x_i - \\bar x )^2 \\]" + }, + { + "objectID": "slides/03_centralne_mere/prezentacija.html#zbir-kvadrata-greške-aritmetičke-sredine-je-najmanji", + "href": "slides/03_centralne_mere/prezentacija.html#zbir-kvadrata-greške-aritmetičke-sredine-je-najmanji", "title": "Mere centralne tendencije", - "section": "Aritmetička sredina", - "text": "Aritmetička sredina\n\n\\[ \\bar x = \\frac{\\sum_{i=1}^{n}x_i}{n} = \\frac{x_1 + x_2 + ... + x_n}{n} \\]\n\nAko koristimo aritmetičku sredinu kao opis podataka prosečna greska će biti nula, međutim svaka individualna procena će i dalje imati neku grešku!" + "section": "Zbir kvadrata greške aritmetičke sredine je najmanji", + "text": "Zbir kvadrata greške aritmetičke sredine je najmanji\n\n\nIt turns out that if we use the arithmetic mean as our estimator then the average error will indeed be zero (see the simple proof at the end of the chapter if you are interested). Even though the average of errors from the mean is zero, each individual still has some degree of error; some are positive and some are negative, and those cancel each other out to give an average error of zero." }, { "objectID": "slides/03_centralne_mere/prezentacija.html#aritmetička-sredina-za-grupisane-podatke", @@ -167,27 +181,6 @@ "section": "Prednosti i mane aritmetičke sredine", "text": "Prednosti i mane aritmetičke sredine\n\nPredstavlja sve vrednosti\nJednostavna\nNe može da se koristi sa kategorijalnim podacima\nEkstremne vrednosti značajno utiču" }, - { - "objectID": "slides/03_centralne_mere/prezentacija.html#šta-je-dobar-model", - "href": "slides/03_centralne_mere/prezentacija.html#šta-je-dobar-model", - "title": "Mere centralne tendencije", - "section": "Šta je “dobar” model?", - "text": "Šta je “dobar” model?\nModel koji najmanje greši je najbolji model.\n\\[ \\text{greška}_i = \\text{podaci}_i - \\widehat{\\text{podaci}} \\]" - }, - { - "objectID": "slides/03_centralne_mere/prezentacija.html#primer-generalizacije", - "href": "slides/03_centralne_mere/prezentacija.html#primer-generalizacije", - "title": "Mere centralne tendencije", - "section": "Primer generalizacije", - "text": "Primer generalizacije" - }, - { - "objectID": "slides/03_centralne_mere/prezentacija.html#da-li-model-može-biti-previše-dobar", - "href": "slides/03_centralne_mere/prezentacija.html#da-li-model-može-biti-previše-dobar", - "title": "Mere centralne tendencije", - "section": "Da li model može biti previše “dobar”", - "text": "Da li model može biti previše “dobar”\nModel uči specifičnosti uzorka (šum)." - }, { "objectID": "slides/03_centralne_mere/prezentacija.html#ekstremne-vrednosti", "href": "slides/03_centralne_mere/prezentacija.html#ekstremne-vrednosti", @@ -286,6 +279,13 @@ "section": "Tablica očekivanog rasta", "text": "Tablica očekivanog rasta" }, + { + "objectID": "slides/03_centralne_mere/prezentacija.html#grafikon-kutije-box-and-whisker-plot", + "href": "slides/03_centralne_mere/prezentacija.html#grafikon-kutije-box-and-whisker-plot", + "title": "Mere centralne tendencije", + "section": "Grafikon kutije (Box-and-Whisker Plot)", + "text": "Grafikon kutije (Box-and-Whisker Plot)" + }, { "objectID": "slides/03_centralne_mere/prezentacija.html#definicija-varijanse", "href": "slides/03_centralne_mere/prezentacija.html#definicija-varijanse", @@ -294,18 +294,11 @@ "text": "Definicija varijanse\nVarijansa je srednje kvadratno odstupanje od aritmetičke sredine:\n\\[ \\text{Var} = \\frac{\\sum(x-\\bar x)^2}{n - 1} \\; \\text{grama}^2 \\]" }, { - "objectID": "slides/03_centralne_mere/prezentacija.html#poenta-varijanse", - "href": "slides/03_centralne_mere/prezentacija.html#poenta-varijanse", - "title": "Mere centralne tendencije", - "section": "Poenta varijanse", - "text": "Poenta varijanse" - }, - { - "objectID": "slides/03_centralne_mere/prezentacija.html#plot-showing-varience", - "href": "slides/03_centralne_mere/prezentacija.html#plot-showing-varience", + "objectID": "slides/03_centralne_mere/prezentacija.html#standardna-devijacija", + "href": "slides/03_centralne_mere/prezentacija.html#standardna-devijacija", "title": "Mere centralne tendencije", - "section": "Plot showing varience", - "text": "Plot showing varience" + "section": "Standardna devijacija", + "text": "Standardna devijacija" }, { "objectID": "slides/03_centralne_mere/prezentacija.html#definicija-standardne-devijacije", @@ -314,6 +307,13 @@ "section": "Definicija standardne devijacije", "text": "Definicija standardne devijacije\nStandardna devijacija je kvadratni koren iz srednjeg kvadratnog odstupanja od aritmetičke sredine:\n\\[ \\text{Var} = sd^{2} = \\frac{\\sum(x-\\bar x)^2}{n - 1} \\; \\text{grama}^{2} \\] \\[ sd = \\sqrt{\\frac{\\sum(x-\\bar x)^2}{n - 1} \\; } \\text{grama} \\]" }, + { + "objectID": "slides/03_centralne_mere/prezentacija.html#sumirani-pokušaji-pogodaka", + "href": "slides/03_centralne_mere/prezentacija.html#sumirani-pokušaji-pogodaka", + "title": "Mere centralne tendencije", + "section": "Sumirani pokušaji pogodaka", + "text": "Sumirani pokušaji pogodaka\n\n\n\n\n \n\n \n \n \n tinytable_uz9erzp7l753fupj68ja\n \n \n \n \n \n\n \n \n \n \n \n \n Mera\n Svi podaci\n \n \n \n \n \n Aritmetička sredina \n 2411 \n \n \n Medijana \n 1776 \n \n \n Mod \n 10000 \n \n \n Opseg \n 244 - 31337\n \n \n Interkvartilni opseg \n 1111 - 2600\n \n \n Standardna devijacija\n 2422 \n \n \n \n \n\n \n\n \n\n\n\n\n\nTačan broj je 1616.\n\n\n\n\n\n\nOpseg je osetljiv na ekstremne vrednosti, bizaran pokusaj od 31000.\nIQR nije osetljiv na ekstremne vrednosti. Pokazuje centralnu polovinu.\nSD je podlozna ekstremnim vrednostima, najbolja za simetricne podatke.\nMedijana je najbolja.\nMod je podlozan zaokruzivanju.\nDesno-iskosena pa artmeticka sredina nije pogodna." + }, { "objectID": "slides/03_centralne_mere/prezentacija.html#koeficijent-varijacije", "href": "slides/03_centralne_mere/prezentacija.html#koeficijent-varijacije", @@ -321,6 +321,13 @@ "section": "Koeficijent varijacije", "text": "Koeficijent varijacije\nJe korisna mera kada se porede varijacije između dva uzorka.\n\\[ CV = \\frac{sd}{\\bar x} \\times {100\\%} \\] \\(\\le 30\\%\\) homogeni podaci.\n\\(\\gt 30\\%\\) heterogeni podaci.\n\n\n\n\n\n\nBitno\n\n\nKoeficijent varijacije se izražava u procentima!\n\n\n\n\nThe coefficient of variation should be computed only for data measured on scales that have a meaningful zero (ratio scale) and hence allow relative comparison of two measurements (i.e., division of one measurement by the other). The coefficient of variation may not have any meaning for data on an interval scale." }, + { + "objectID": "slides/03_centralne_mere/prezentacija.html#homogeni-i-heterogeni-podaci", + "href": "slides/03_centralne_mere/prezentacija.html#homogeni-i-heterogeni-podaci", + "title": "Mere centralne tendencije", + "section": "Homogeni i heterogeni podaci", + "text": "Homogeni i heterogeni podaci" + }, { "objectID": "slides/03_centralne_mere/prezentacija.html#z-vrednost", "href": "slides/03_centralne_mere/prezentacija.html#z-vrednost", @@ -342,97 +349,6 @@ "section": "Struktura kursa", "text": "Struktura kursa\n\n\n \n\n \n \n \n tinytable_vp64snkkavmamzlrgexw\n \n \n \n \n \n\n \n \n \n \n \n \n Nedelja\n Tema\n \n \n \n \n \n 1\n Uvod u medicinsku statistiku \n \n \n 2\n Sređivanje podataka \n \n \n 3\n Statističko opisivanje podataka \n \n \n 4\n Verovatnoća i raspodele verovatnoća \n \n \n 5\n Populacija i uzorak \n \n \n 6\n Testiranje hipoteza o populacionim prosečnim vrednostima i proporcijama\n \n \n 7\n Testiranje hipoteza o učestalostima \n \n \n 8\n Testiranje hipoteza o rangovima \n \n \n 9\n Korelacija \n \n \n 10\n Regresija / Kolokvijum \n \n \n 11\n Podaci, informacije i znanje \n \n \n 12\n Zdravstveni informacioni sistem \n \n \n 13\n Mere dijagnostičke tačnosti \n \n \n 14\n Medicinsko odlučivanje \n \n \n 15\n Bioinformatika" }, - { - "objectID": "slides/03_centralne_mere/prezentacija.html#šta-su-prednosti-aritmetičke-sredine", - "href": "slides/03_centralne_mere/prezentacija.html#šta-su-prednosti-aritmetičke-sredine", - "title": "Mere centralne tendencije", - "section": "Šta su prednosti aritmetičke sredine?", - "text": "Šta su prednosti aritmetičke sredine?\nProsečna greška je nula, a zbir kvadrata greške je namanji mogući.\n\n\nIt turns out that if we use the arithmetic mean as our estimator then the average error will indeed be zero (see the simple proof at the end of the chapter if you are interested). Even though the average of errors from the mean is zero, each individual still has some degree of error; some are positive and some are negative, and those cancel each other out to give an average error of zero." - }, - { - "objectID": "slides/03_centralne_mere/prezentacija.html#homogeni-i-heterogeni-podaci", - "href": "slides/03_centralne_mere/prezentacija.html#homogeni-i-heterogeni-podaci", - "title": "Mere centralne tendencije", - "section": "Homogeni i heterogeni podaci", - "text": "Homogeni i heterogeni podaci" - }, - { - "objectID": "slides/03_centralne_mere/prezentacija.html#zbir-kvadrata-greške-aritmetičke-sredine-je-najmanji", - "href": "slides/03_centralne_mere/prezentacija.html#zbir-kvadrata-greške-aritmetičke-sredine-je-najmanji", - "title": "Mere centralne tendencije", - "section": "Zbir kvadrata greške aritmetičke sredine je najmanji", - "text": "Zbir kvadrata greške aritmetičke sredine je najmanji\n\n\nIt turns out that if we use the arithmetic mean as our estimator then the average error will indeed be zero (see the simple proof at the end of the chapter if you are interested). Even though the average of errors from the mean is zero, each individual still has some degree of error; some are positive and some are negative, and those cancel each other out to give an average error of zero." - }, - { - "objectID": "slides/03_centralne_mere/prezentacija.html#šta-je-greška-modela", - "href": "slides/03_centralne_mere/prezentacija.html#šta-je-greška-modela", - "title": "Mere centralne tendencije", - "section": "Šta je greška modela?", - "text": "Šta je greška modela?\n\\[ \\text{podaci} = \\text{model} + \\text{greška} \\]\nPreko modela možemo da dobijemo predviđanja.\n\\[ \\text{model} = \\widehat{\\text{podaci}} \\]\nGreška modela je razlika između predviđanja modela i stvarnih podataka.\n\\[ \\text{greška}_i = \\text{podaci}_i - \\widehat{\\text{podaci}} \\]\n\nThis expresses the idea that the data can be broken into two portions: one portion that is described by a statistical model, which expresses the values that we expect the data to take given our knowledge, and another portion that we refer to as the error that reflects the difference between the model’s predictions and the observed data." - }, - { - "objectID": "slides/03_centralne_mere/prezentacija.html#karakteristike-artimetičke-sredine", - "href": "slides/03_centralne_mere/prezentacija.html#karakteristike-artimetičke-sredine", - "title": "Mere centralne tendencije", - "section": "Karakteristike artimetičke sredine", - "text": "Karakteristike artimetičke sredine\nAritmetička sredina ima prosečnu grešku od nula:\n\\[ \\text{prosečna greška} = \\frac{1}{n}\\sum_{i = n}^n (x_i - \\bar x) = 0 \\]\nAritmetička sredina ima najmanju moguću prosečnu kvadratnu grešku:\n\\[ \\text{prosečna kvadratna greška} = \\frac{1}{n}\\sum_{i = n}^n (x_i - \\bar x )^2 \\]" - }, - { - "objectID": "slides/03_centralne_mere/prezentacija.html#aritmetička-sredina-neonatalne-težine", - "href": "slides/03_centralne_mere/prezentacija.html#aritmetička-sredina-neonatalne-težine", - "title": "Mere centralne tendencije", - "section": "Aritmetička sredina neonatalne težine", - "text": "Aritmetička sredina neonatalne težine\n\n\\[ \\bar x = \\frac{\\sum_{i=1}^{n}x_i}{n} = \\frac{x_1 + x_2 + ... + x_n}{n} \\]\n\nAko koristimo aritmetičku sredinu kao opis podataka prosečna greska će biti nula, međutim svaka individualna procena će i dalje imati neku grešku!" - }, - { - "objectID": "slides/03_centralne_mere/prezentacija.html#prosek-neonatalne-težine", - "href": "slides/03_centralne_mere/prezentacija.html#prosek-neonatalne-težine", - "title": "Mere centralne tendencije", - "section": "Prosek neonatalne težine", - "text": "Prosek neonatalne težine\n\n\\[ \\bar x = \\frac{\\sum_{i=1}^{n}x_i}{n} = \\frac{x_1 + x_2 + ... + x_n}{n} \\]\n\nAko koristimo aritmetičku sredinu kao opis podataka prosečna greska će biti nula, međutim svaka individualna procena će i dalje imati neku grešku!" - }, - { - "objectID": "slides/03_centralne_mere/prezentacija.html#standardna-devijacija", - "href": "slides/03_centralne_mere/prezentacija.html#standardna-devijacija", - "title": "Mere centralne tendencije", - "section": "Standardna devijacija", - "text": "Standardna devijacija" - }, - { - "objectID": "slides/03_centralne_mere/prezentacija.html#grafikon-kutije-box-and-whisker-plot", - "href": "slides/03_centralne_mere/prezentacija.html#grafikon-kutije-box-and-whisker-plot", - "title": "Mere centralne tendencije", - "section": "Grafikon kutije (Box-and-Whisker Plot)", - "text": "Grafikon kutije (Box-and-Whisker Plot)" - }, - { - "objectID": "slides/03_centralne_mere/prezentacija.html#površina-infarktnog-polja-miokarda", - "href": "slides/03_centralne_mere/prezentacija.html#površina-infarktnog-polja-miokarda", - "title": "Mere centralne tendencije", - "section": "Površina infarktnog polja miokarda", - "text": "Površina infarktnog polja miokarda" - }, - { - "objectID": "slides/03_centralne_mere/prezentacija.html#sumirani-pokušaji-pogodaka", - "href": "slides/03_centralne_mere/prezentacija.html#sumirani-pokušaji-pogodaka", - "title": "Mere centralne tendencije", - "section": "Sumirani pokušaji pogodaka", - "text": "Sumirani pokušaji pogodaka\n\n\n\n\n \n\n \n \n \n tinytable_uz9erzp7l753fupj68ja\n \n \n \n \n \n\n \n \n \n \n \n \n Mera\n Svi podaci\n \n \n \n \n \n Aritmetička sredina \n 2411 \n \n \n Medijana \n 1776 \n \n \n Mod \n 10000 \n \n \n Opseg \n 244 - 31337\n \n \n Interkvartilni opseg \n 1111 - 2600\n \n \n Standardna devijacija\n 2422 \n \n \n \n \n\n \n\n \n\n\n\n\n\nTačan broj je 1616.\n\n\n\n\n\n\nOpseg je osetljiv na ekstremne vrednosti, bizaran pokusaj od 31000.\nIQR nije osetljiv na ekstremne vrednosti. Pokazuje centralnu polovinu.\nSD je podlozna ekstremnim vrednostima, najbolja za simetricne podatke.\nMedijana je najbolja.\nMod je podlozan zaokruzivanju.\nDesno-iskosena pa artmeticka sredina nije pogodna." - }, - { - "objectID": "slides/03_centralne_mere/prezentacija.html#quant", - "href": "slides/03_centralne_mere/prezentacija.html#quant", - "title": "Mere centralne tendencije", - "section": "Quant", - "text": "Quant" - }, - { - "objectID": "index.html", - "href": "index.html", - "title": "Osnovni kurs medicinske statistike i informatike", - "section": "", - "text": "Osnovni kurs medicinske statistike i informatike\n\n\n\n\n\n\n\n\n\nDobrodošli na kurs medicinske statistike i informatike! Sve informacije vezane za kurs i termine polaganja možete pronaći na sajtu instituta. Ova web stranica služi kao lični repozitorijum kako bi prezentacije sa vežbi bile uvek dostupne onima koji to žele.\nLista prezentacija\n\n\n \n\n \n \n \n tinytable_k6jj631i35064hy32ffd\n \n \n \n \n \n\n \n \n \n \n \n \n Nedelja\n Tema\n \n \n \n \n \n 1\n Uvod u medicinsku statistiku (eng)\n \n \n 2\n Sređivanje podataka\n \n \n 3\n Statističko opisivanje podataka\n \n \n 4\n Verovatnoća i raspodele verovatnoća (eng)\n \n \n 5\n Populacija i uzorak" - }, { "objectID": "slides/04_verovatnoca/prezentacija.html#de-méréov-problem", "href": "slides/04_verovatnoca/prezentacija.html#de-méréov-problem", @@ -735,18 +651,11 @@ "text": "Žašto randomizujemo?" }, { - "objectID": "slides/05_uzorak/prezentacija.html#mortalitet-sepse-i-randomizacija", - "href": "slides/05_uzorak/prezentacija.html#mortalitet-sepse-i-randomizacija", - "title": "Populacija i uzorak", - "section": "Mortalitet sepse i randomizacija", - "text": "Mortalitet sepse i randomizacija\n\n\nKako bi ste randomizovali pacijente u JIL-u?\n\n\n\n\nDobili smo rezultat:\n\n\n\n \n\n \n \n \n tinytable_ypow2ytsjjhlv2eqx5cw\n \n \n \n \n \n\n \n \n \n \n \n \n Intervencija\n Mortalitet\n Ukupno\n Stopa smrtnosti (%)\n \n \n \n \n \n Agresivna terapija \n 92\n 439\n 21.0\n \n \n Manje agresivna terapija\n 81\n 446\n 18.2\n \n \n \n \n\n \n\n \n\n\n\n\n\nDa li je ovo dobra procena mortaliteta?" - }, - { - "objectID": "slides/05_uzorak/prezentacija.html#uzorkovanje", - "href": "slides/05_uzorak/prezentacija.html#uzorkovanje", + "objectID": "slides/05_uzorak/prezentacija.html#vrste-uzoraka", + "href": "slides/05_uzorak/prezentacija.html#vrste-uzoraka", "title": "Populacija i uzorak", - "section": "Uzorkovanje", - "text": "Uzorkovanje\n\nUzorački okvir\n\nSpisak ili lista svih elemenata populacije koju želimo da uzorkujemo.\n\n\n\nSlučajni uzorak\n\nTačno znamo verovatnoću da neko bude izabran\n\nNeslučajni\n\nMože biti pristrasan" + "section": "Vrste uzoraka", + "text": "Vrste uzoraka\n\nUzorački okvir\n\nSpisak ili lista svih elemenata populacije koju želimo da uzorkujemo.\n\n\n\nSlučajni uzorak\n\nTačno znamo verovatnoću da neko bude izabran\n\nNeslučajni\n\nMože biti pristrasan" }, { "objectID": "slides/05_uzorak/prezentacija.html#slučajni-uzorci", @@ -790,6 +699,13 @@ "section": "Neslučajni uzorci", "text": "Neslučajni uzorci\n\nPrigodan\n\nPacijenti na odeljenju\n\nKvota\n\nKategorije → već određena kvota se ispunjava\n\nNamerni\n\nPilot studija (inovacije)" }, + { + "objectID": "slides/05_uzorak/prezentacija.html#vežba-uzorkovanje", + "href": "slides/05_uzorak/prezentacija.html#vežba-uzorkovanje", + "title": "Populacija i uzorak", + "section": "Vežba: uzorkovanje", + "text": "Vežba: uzorkovanje\nIz baze “Sistolni pritisak.xlsx” odrediti prost i sistematski uzorak veličine 10.\nProst:\n\nsample(1:99, 10, replace = F)\n\n [1] 80 23 38 47 21 98 92 12 61 3\n\n\nSistematski:\n\nsample(1:99, 1, replace = F)\n\n[1] 23\n\n\n\nOdrediti početnu jedinicu\n\nKorak \\(k = \\frac{N}{n} = \\frac{99}{10} \\approx 10\\)\nIzabrati svaku 10-tu jedinicu" + }, { "objectID": "slides/05_uzorak/prezentacija.html#problemi-neslučajnih-uzoraka", "href": "slides/05_uzorak/prezentacija.html#problemi-neslučajnih-uzoraka", @@ -802,14 +718,14 @@ "href": "slides/05_uzorak/prezentacija.html#terminologija-i-notacija", "title": "Populacija i uzorak", "section": "Terminologija (i notacija)", - "text": "Terminologija (i notacija)\n\n\n \n\n \n \n \n tinytable_74o9hloeotsqfwhxiypm\n \n \n \n \n \n\n \n \n \n \n \n \n \n Populacija (parametar)\n Uzorak (statistika)\n \n \n \n \n \n Aritmetička sredina \n $\\mu$ \n $\\bar x$\n \n \n Varijansa \n $\\sigma^2$\n $sd^2$ \n \n \n Standardna devijacija\n $\\sigma$ \n $sd$ \n \n \n Proporcija \n $\\pi$ \n $p$" + "text": "Terminologija (i notacija)\n\n\n \n\n \n \n \n tinytable_boe97jmorgyikj3v6s86\n \n \n \n \n \n\n \n \n \n \n \n \n \n Populacija (parametar)\n Uzorak (statistika)\n \n \n \n \n \n Aritmetička sredina \n $\\mu$ \n $\\bar x$\n \n \n Varijansa \n $\\sigma^2$\n $sd^2$ \n \n \n Standardna devijacija\n $\\sigma$ \n $sd$ \n \n \n Proporcija \n $\\pi$ \n $p$" }, { - "objectID": "slides/05_uzorak/prezentacija.html#vežba", - "href": "slides/05_uzorak/prezentacija.html#vežba", + "objectID": "slides/05_uzorak/prezentacija.html#mortalitet-sepse-i-randomizacija", + "href": "slides/05_uzorak/prezentacija.html#mortalitet-sepse-i-randomizacija", "title": "Populacija i uzorak", - "section": "Vežba", - "text": "Vežba\nIz baze “Sistolni pritisak.xlsx” odrediti prost i sistematski uzorak veličine 10.\nProst:\n\nsample(1:99, 10, replace = F)\n\n [1] 60 17 73 25 49 39 91 58 92 43\n\n\nSistematski:\n\nsample(1:99, 1, replace = F)\n\n[1] 40\n\n\n\nOdrediti početnu jedinicu\n\nKorak \\(k = \\frac{99}{10} \\approx 10\\)\nIzabrati svaku 10-tu jedinicu" + "section": "Mortalitet sepse i randomizacija", + "text": "Mortalitet sepse i randomizacija\n\n\nKako bi ste randomizovali pacijente u JIL-u?\n\n\n\n\nDobili smo rezultat:\n\n\n\n \n\n \n \n \n tinytable_dmg1m3485uqk1kub8lr3\n \n \n \n \n \n\n \n \n \n \n \n \n Intervencija\n Mortalitet\n Ukupno\n Stopa smrtnosti (%)\n \n \n \n \n \n Agresivna terapija \n 92\n 439\n 21.0\n \n \n Manje agresivna terapija\n 81\n 446\n 18.2\n \n \n \n \n\n \n\n \n\n\n\n\n\nDa li je ovo dobra procena mortaliteta?" }, { "objectID": "slides/05_uzorak/prezentacija.html#greška-uzorkovanja", @@ -818,6 +734,13 @@ "section": "Greška uzorkovanja", "text": "Greška uzorkovanja\n\nRazlika između statistike izračunate na uzorku i parametra populacije.\nPonavljanjim uzorkovanjem možemo da saznamo raspodelu greške (uzoračka raspodela) statistike.\n\n\nStandardna greška\n\nStandardna greška je standardna devijacija uzoračke raspodele." }, + { + "objectID": "slides/05_uzorak/prezentacija.html#standardna-greška-aritmetičke-sredine-i-proporcije", + "href": "slides/05_uzorak/prezentacija.html#standardna-greška-aritmetičke-sredine-i-proporcije", + "title": "Populacija i uzorak", + "section": "Standardna greška aritmetičke sredine i proporcije", + "text": "Standardna greška aritmetičke sredine i proporcije\nStandardna greška aritmetičke sredine:\n\\[ SE_{\\bar x} = \\frac{sd}{\\sqrt{n}} \\]\ngde je: \\(sd\\), standardna devijacija statistike u uzorku (populaciona nije dostupna); \\(n\\) broj opservacija.\nStandardna greška proporcije:\n\\[ SE_{p} = \\sqrt{\\frac{p(1-p)}{n}} \\] gde je: \\(p\\), proporcija događaja u uzorku; \\(n\\) broj opservacija." + }, { "objectID": "slides/05_uzorak/prezentacija.html#standardna-greška-aritmetičke-sredine", "href": "slides/05_uzorak/prezentacija.html#standardna-greška-aritmetičke-sredine", @@ -826,46 +749,39 @@ "text": "Standardna greška aritmetičke sredine" }, { - "objectID": "slides/05_uzorak/prezentacija.html#standardna-greška-definicija", - "href": "slides/05_uzorak/prezentacija.html#standardna-greška-definicija", - "title": "Populacija i uzorak", - "section": "Standardna greška definicija", - "text": "Standardna greška definicija\nStandardna greška je …\n\\[ SE_{\\bar x} = \\frac{sd}{\\sqrt{n}} \\]" - }, - { - "objectID": "slides/05_uzorak/prezentacija.html#centralna-granična-teorema", - "href": "slides/05_uzorak/prezentacija.html#centralna-granična-teorema", + "objectID": "slides/05_uzorak/prezentacija.html#primer-centralne-granične-teoreme", + "href": "slides/05_uzorak/prezentacija.html#primer-centralne-granične-teoreme", "title": "Populacija i uzorak", - "section": "Centralna granična teorema", - "text": "Centralna granična teorema" + "section": "Primer centralne granične teoreme", + "text": "Primer centralne granične teoreme\nBilo koja raspodela \\(\\rightarrow\\) arit. sred. uzorka \\(\\rightarrow\\) normalna raspodela arit. sredina" }, { - "objectID": "slides/05_uzorak/prezentacija.html#primer-clt", - "href": "slides/05_uzorak/prezentacija.html#primer-clt", + "objectID": "slides/05_uzorak/prezentacija.html#ocenjivanje-populacionih-parametara-na-osnovu-uzorka", + "href": "slides/05_uzorak/prezentacija.html#ocenjivanje-populacionih-parametara-na-osnovu-uzorka", "title": "Populacija i uzorak", - "section": "Primer CLT", - "text": "Primer CLT" + "section": "Ocenjivanje populacionih parametara na osnovu uzorka", + "text": "Ocenjivanje populacionih parametara na osnovu uzorka\nJedan od najvažnijih istraživačkih zadataka jeste ocena populacionih parametara, najčešće aritmetičke sredine ili proporcije." }, { - "objectID": "slides/05_uzorak/prezentacija.html#ciljna-grupa-throwback", - "href": "slides/05_uzorak/prezentacija.html#ciljna-grupa-throwback", + "objectID": "slides/05_uzorak/prezentacija.html#interval-poverenja-i-tačkasta-procena", + "href": "slides/05_uzorak/prezentacija.html#interval-poverenja-i-tačkasta-procena", "title": "Populacija i uzorak", - "section": "Ciljna grupa throwback", - "text": "Ciljna grupa throwback\nKako da saznam nesto o grupi pacijenata" + "section": "Interval poverenja i tačkasta procena", + "text": "Interval poverenja i tačkasta procena\n\\[ CI = \\bar x \\pm t \\times SE \\]\ngde je: \\(\\bar x\\), aritmetička sredina; \\(t\\), kritična vrednost; \\(SE\\), standardna greška." }, { - "objectID": "slides/05_uzorak/prezentacija.html#ocenjivanje-populacionih-parametara-na-osnovu-uzorka", - "href": "slides/05_uzorak/prezentacija.html#ocenjivanje-populacionih-parametara-na-osnovu-uzorka", + "objectID": "slides/05_uzorak/prezentacija.html#interval-poverenja", + "href": "slides/05_uzorak/prezentacija.html#interval-poverenja", "title": "Populacija i uzorak", - "section": "Ocenjivanje populacionih parametara na osnovu uzorka", - "text": "Ocenjivanje populacionih parametara na osnovu uzorka\nJedan od najvažnijih istraživačkih zadataka jeste ocena populacionih parametara, najčešće aritmetičke sredine ili proporcije." + "section": "95% interval poverenja", + "text": "95% interval poverenja" }, { - "objectID": "slides/05_uzorak/prezentacija.html#interval-poverenja-i-ponovljena-istraživanja", - "href": "slides/05_uzorak/prezentacija.html#interval-poverenja-i-ponovljena-istraživanja", + "objectID": "slides/05_uzorak/prezentacija.html#inverval-poverenja", + "href": "slides/05_uzorak/prezentacija.html#inverval-poverenja", "title": "Populacija i uzorak", - "section": "Interval poverenja i ponovljena istraživanja", - "text": "Interval poverenja i ponovljena istraživanja" + "section": "99% Inverval poverenja", + "text": "99% Inverval poverenja" }, { "objectID": "slides/05_uzorak/prezentacija.html#definicija", @@ -882,92 +798,967 @@ "text": "95% vs. 99%\n\n99% interval je sigurniji (ima manji\nrizik greške) ali je širi od 95%." }, { - "objectID": "slides/05_uzorak/prezentacija.html#inverval-poverenja", - "href": "slides/05_uzorak/prezentacija.html#inverval-poverenja", + "objectID": "slides/05_uzorak/prezentacija.html#generalizacija", + "href": "slides/05_uzorak/prezentacija.html#generalizacija", "title": "Populacija i uzorak", - "section": "99% Inverval poverenja", - "text": "99% Inverval poverenja" + "section": "Generalizacija", + "text": "Generalizacija\nSaznanje o celoj populaciji bez da smo ih videli.\n\n\n \n\n \n \n \n tinytable_ojo5xo0fzjyothms3d9m\n \n \n \n \n \n\n \n \n \n \n \n \n Intervencija\n Mortalitet\n Ukupno\n Stopa smrtnosti (%)\n 95% IP (%)\n \n \n \n \n \n Agresivna terapija \n 92\n 439\n 21.0\n 17.24 - 25.07\n \n \n Manje agresivna terapija\n 81\n 446\n 18.2\n 14.69 - 22.06\n \n \n \n \n\n \n\n \n\n\n\n\n\n\n\n\n\n%%{ init: { 'flowchart': { 'curve': 'monotoneX' } } }%%\n\nflowchart TD\n A[Ciljna populacija] --> B[\"Uzoračka populacija\"]\n B --> C[Uzorak]\n C --\"Zaključak\"--> A" }, { - "objectID": "slides/05_uzorak/prezentacija.html#zadatak-1", - "href": "slides/05_uzorak/prezentacija.html#zadatak-1", + "objectID": "slides/05_uzorak/prezentacija.html#vežba-interval-poverenja-za-kontinuirane-podatke", + "href": "slides/05_uzorak/prezentacija.html#vežba-interval-poverenja-za-kontinuirane-podatke", "title": "Populacija i uzorak", - "section": "Zadatak 1", - "text": "Zadatak 1\n\nKoristeći bazu podataka Sistolna TA.xlsx odrediti\n99% interval poverenja aritmetičke sredine\nsistolnog arterijskog pritiska ispitanika sa\nakutnim koronarnim sindromom.\n\n\n\n\n\n\n\nSavet\n\n\nStatistical analysis \\(\\rightarrow\\) Continuous variables \\(\\rightarrow\\) Single-sample t-test" + "section": "Vežba: interval poverenja za kontinuirane podatke", + "text": "Vežba: interval poverenja za kontinuirane podatke\n\nKoristeći bazu podataka Sistolna TA.xlsx odrediti\n99% interval poverenja aritmetičke sredine\nsistolnog arterijskog pritiska ispitanika sa\nakutnim koronarnim sindromom.\n\n\n\n\n\n\n\nKomande\n\n\nStatistical analysis \\(\\rightarrow\\) Continuous variables \\(\\rightarrow\\) Single-sample t-test" }, { - "objectID": "slides/05_uzorak/prezentacija.html#zadatak-2", - "href": "slides/05_uzorak/prezentacija.html#zadatak-2", + "objectID": "slides/05_uzorak/prezentacija.html#vežba-interval-poverenja-za-diskretne-podatke", + "href": "slides/05_uzorak/prezentacija.html#vežba-interval-poverenja-za-diskretne-podatke", "title": "Populacija i uzorak", - "section": "Zadatak 2", - "text": "Zadatak 2\n\nNa uzorku od 500 učenika u jednoj opštini nađena je\nanemija kod 25 učenika. Odrediti 95% interval\npoverenja proporcije učenika sa anemijom u toj\nopštini.\n\n\n\n\n\n\n\nSavet\n\n\nStatistical analysis \\(\\rightarrow\\) Discrete variables \\(\\rightarrow\\) Confidence interval for a proportion" + "section": "Vežba: interval poverenja za diskretne podatke", + "text": "Vežba: interval poverenja za diskretne podatke\n\nNa uzorku od 500 učenika u jednoj opštini nađena je\nanemija kod 25 učenika. Odrediti 95% interval\npoverenja proporcije učenika sa anemijom u toj\nopštini.\n\n\n\n\n\n\n\nKomande\n\n\nStatistical analysis \\(\\rightarrow\\) Discrete variables \\(\\rightarrow\\) Confidence interval for a proportion" }, { "objectID": "slides/05_uzorak/prezentacija.html#struktura-kursa", "href": "slides/05_uzorak/prezentacija.html#struktura-kursa", "title": "Populacija i uzorak", "section": "Struktura kursa", - "text": "Struktura kursa\n\n\n \n\n \n \n \n tinytable_fovahntwldza2hpn0vv0\n \n \n \n \n \n\n \n \n \n \n \n \n Nedelja\n Tema\n \n \n \n \n \n 1\n Uvod u medicinsku statistiku \n \n \n 2\n Sređivanje podataka \n \n \n 3\n Statističko opisivanje podataka \n \n \n 4\n Verovatnoća i raspodele verovatnoća \n \n \n 5\n Populacija i uzorak \n \n \n 6\n Testiranje hipoteza o populacionim prosečnim vrednostima i proporcijama\n \n \n 7\n Testiranje hipoteza o učestalostima \n \n \n 8\n Testiranje hipoteza o rangovima \n \n \n 9\n Korelacija \n \n \n 10\n Regresija / Kolokvijum \n \n \n 11\n Podaci, informacije i znanje \n \n \n 12\n Zdravstveni informacioni sistem \n \n \n 13\n Mere dijagnostičke tačnosti \n \n \n 14\n Medicinsko odlučivanje \n \n \n 15\n Bioinformatika" + "text": "Struktura kursa\n\n\n \n\n \n \n \n tinytable_3n2rwkad9ykj0vx8cxqa\n \n \n \n \n \n\n \n \n \n \n \n \n Nedelja\n Tema\n \n \n \n \n \n 1\n Uvod u medicinsku statistiku \n \n \n 2\n Sređivanje podataka \n \n \n 3\n Statističko opisivanje podataka \n \n \n 4\n Verovatnoća i raspodele verovatnoća \n \n \n 5\n Populacija i uzorak \n \n \n 6\n Testiranje hipoteza o populacionim prosečnim vrednostima i proporcijama\n \n \n 7\n Testiranje hipoteza o učestalostima \n \n \n 8\n Testiranje hipoteza o rangovima \n \n \n 9\n Korelacija \n \n \n 10\n Regresija / Kolokvijum \n \n \n 11\n Podaci, informacije i znanje \n \n \n 12\n Zdravstveni informacioni sistem \n \n \n 13\n Mere dijagnostičke tačnosti \n \n \n 14\n Medicinsko odlučivanje \n \n \n 15\n Bioinformatika" }, { - "objectID": "slides/04_verovatnoca/pres.html#de-mérés-problem", - "href": "slides/04_verovatnoca/pres.html#de-mérés-problem", - "title": "A short introduction to probability", - "section": "de Méré’s problem", - "text": "de Méré’s problem\n\n\n\n\n\nPierre de Fermat\n\n\n\n\n\n\nBlaise Pascal" + "objectID": "slides/01_uvod/prezentacija.html#čime-se-bavi-statistika-u-medicini", + "href": "slides/01_uvod/prezentacija.html#čime-se-bavi-statistika-u-medicini", + "title": "Uvod u Statistiku", + "section": "Čime se bavi statistika u medicini?", + "text": "Čime se bavi statistika u medicini?\n\nNaučnim metodom\nOtkrivanje veličine efekta terapije (lek, intervancija)\nPredviđanje rizika (npr. od tromboze)\nMedicinskim odlučivanjem (preciznost medicinskih testova)" }, { - "objectID": "slides/04_verovatnoca/pres.html#the-need-for-probability-theory", - "href": "slides/04_verovatnoca/pres.html#the-need-for-probability-theory", - "title": "A short introduction to probability", - "section": "The need for probability theory", - "text": "The need for probability theory\n\n\nProbability as an extension of Aristotle’s logic.\nWe get to talk about the (un)certainty of belief." + "objectID": "slides/01_uvod/prezentacija.html#efekat-terapije-pritiska", + "href": "slides/01_uvod/prezentacija.html#efekat-terapije-pritiska", + "title": "Uvod u Statistiku", + "section": "Efekat terapije pritiska", + "text": "Efekat terapije pritiska\n Na osnovu čega je preporuka postavljena? Da li ona ima smisla?\n\nAmong patients at high risk for cardiovascular events but without diabetes, targeting a systolic blood pressure of less than 120 mm Hg, as compared with less than 140 mm Hg, resulted in lower rates of fatal and nonfatal major cardiovascular events and death from any cause, although significantly higher rates of some adverse events were observed in the intensive-treatment group." }, { - "objectID": "slides/04_verovatnoca/pres.html#what-is-probability", - "href": "slides/04_verovatnoca/pres.html#what-is-probability", - "title": "A short introduction to probability", - "section": "What is probability", - "text": "What is probability\n\nExperiment\n\nAn activity that produces an outcome (choosing a new path to test if it is faster than the old one).\n\n\n\\[ \\text{Experiment} \\rightarrow \\text{Outcome} \\]\n\nSample space\n\nThe set of all possible outcomes of an experiment.\n\n\n\\[ \\text{Dice sample space:} \\; \\omega = \\{1,2,3,4,5,6\\} \\]\n\nEvent\n\nA subset of the outcome space.\n\n\n\\[ \\text{Dice roll event} \\; x = 6 \\]" + "objectID": "slides/01_uvod/prezentacija.html#predviđanje-rizika", + "href": "slides/01_uvod/prezentacija.html#predviđanje-rizika", + "title": "Uvod u Statistiku", + "section": "Predviđanje rizika", + "text": "Predviđanje rizika\n\nDa li je za najveći deo rizika hemoragičnog moždanog udara odgovoran pulsni pritisak ili sistolni pritisak?" }, { - "objectID": "slides/04_verovatnoca/pres.html#types-of-events", - "href": "slides/04_verovatnoca/pres.html#types-of-events", - "title": "A short introduction to probability", - "section": "Types of events", - "text": "Types of events\nAn event is a set of possible outcomes, and can be:\n\nDeterministic (e.g. Vitamin C deficiency \\(\\rightarrow\\) Scurvy)\nRandom (stochastic)\n\nThe sample space of (elementary) outcomes \\(\\omega\\) is a set of all possible outcomes.\n\\[ \\omega = \\{A, B\\, O, AB\\} \\; \\; \\; \\omega = \\{\\text{healthy}, \\text{sick}\\} \\]" + "objectID": "slides/01_uvod/prezentacija.html#koliko-je-ultrazvuk-bolji-u-otkrivanju-žučnog-kamenja-od-ct-a", + "href": "slides/01_uvod/prezentacija.html#koliko-je-ultrazvuk-bolji-u-otkrivanju-žučnog-kamenja-od-ct-a", + "title": "Uvod u Statistiku", + "section": "Koliko je ultrazvuk bolji u otkrivanju žučnog kamenja od CT-a?", + "text": "Koliko je ultrazvuk bolji u otkrivanju žučnog kamenja od CT-a?" }, { - "objectID": "slides/04_verovatnoca/pres.html#somatic-or-germline-mutations", - "href": "slides/04_verovatnoca/pres.html#somatic-or-germline-mutations", - "title": "A short introduction to probability", - "section": "Somatic or germline mutations", - "text": "Somatic or germline mutations" + "objectID": "slides/01_uvod/prezentacija.html#laboratorijske-vrednosti", + "href": "slides/01_uvod/prezentacija.html#laboratorijske-vrednosti", + "title": "Uvod u Statistiku", + "section": "Laboratorijske vrednosti", + "text": "Laboratorijske vrednosti\n\n\nDa li ovaj pacijent sa ovom laboratorijskom vrednošću ima rizik od bolesti koji zahteva dodatnu istragu?" }, { - "objectID": "slides/04_verovatnoca/pres.html#definition-of-probability", - "href": "slides/04_verovatnoca/pres.html#definition-of-probability", - "title": "A short introduction to probability", - "section": "Definition of probability", - "text": "Definition of probability\n\nProbability is a measure of expectation\nof some random event.\n\n\nA random event = the result of a process that we don’t know how it works. Measure, process by which I add a number to something (meter and distance, knowledge and grades)." + "objectID": "slides/01_uvod/prezentacija.html#kurs", + "href": "slides/01_uvod/prezentacija.html#kurs", + "title": "Uvod u Statistiku", + "section": "Kurs", + "text": "Kurs\n\nLekcija (\\(\\gt\\) 50% \\(\\rightarrow\\) otvara kviz)\n\\(\\text{Bodovi} = \\text{lekcija} + \\text{kviz (vremenski ograničen)} + \\text{kolokvijum} + \\text{ispit}\\)\nIspit (praktični i teorijski deo; u učionici na kompijuterima)" }, { - "objectID": "slides/04_verovatnoca/pres.html#expectation-is-more-general-than-the-mean", - "href": "slides/04_verovatnoca/pres.html#expectation-is-more-general-than-the-mean", - "title": "A short introduction to probability", - "section": "Expectation is more general than the mean", - "text": "Expectation is more general than the mean\n\n\n\n\n\n\n\n\n\n\n\n\n\n\nNote\n\n\nExpectations are everywhere in medicine: survival, time to recovery after taking the drug, lab. tests (markers, biochemical parameters, eGFR), etc.\n\n\n\n\n\nThe expected value does not have to be the most common (mode), nor does it does have to coincide with everyday use. It doesn’t even have to be a value that can happen to be 3.5 on a 6-sided die." + "objectID": "slides/01_uvod/prezentacija.html#struktura-kursa", + "href": "slides/01_uvod/prezentacija.html#struktura-kursa", + "title": "Uvod u Statistiku", + "section": "Struktura kursa", + "text": "Struktura kursa\n\n\n \n\n \n \n \n tinytable_sedtgt9aa0heqs3649oe\n \n \n \n \n \n\n \n \n \n \n \n \n Nedelja\n Tema\n \n \n \n \n \n 1\n Uvod u medicinsku statistiku \n \n \n 2\n Sređivanje podataka \n \n \n 3\n Statističko opisivanje podataka \n \n \n 4\n Verovatnoća i raspodele verovatnoća \n \n \n 5\n Populacija i uzorak \n \n \n 6\n Testiranje hipoteza o populacionim prosečnim vrednostima i proporcijama\n \n \n 7\n Testiranje hipoteza o učestalostima \n \n \n 8\n Testiranje hipoteza o rangovima \n \n \n 9\n Korelacija \n \n \n 10\n Regresija / Kolokvijum \n \n \n 11\n Podaci, informacije i znanje \n \n \n 12\n Zdravstveni informacioni sistem \n \n \n 13\n Mere dijagnostičke tačnosti \n \n \n 14\n Medicinsko odlučivanje \n \n \n 15\n Bioinformatika" }, { - "objectID": "slides/04_verovatnoca/pres.html#zakon-velikih-brojeva", - "href": "slides/04_verovatnoca/pres.html#zakon-velikih-brojeva", - "title": "A short introduction to probability", - "section": "Zakon velikih brojeva", - "text": "Zakon velikih brojeva" + "objectID": "slides/01_uvod/prezentacija.html#kritično-stanje-nauke-u-medicini", + "href": "slides/01_uvod/prezentacija.html#kritično-stanje-nauke-u-medicini", + "title": "Uvod u Statistiku", + "section": "Kritično stanje nauke u medicini", + "text": "Kritično stanje nauke u medicini\n\n\n\n\n\nRichard Horton, M.D., Lancet Editor-in-Chief\n\n\n\n\n“The case against science is straightforward: much of the scientific literature, perhaps half, may simply be untrue. Afflicted by studies with small sample sizes, tiny effects, invalid exploratory analyses, and flagrant conflicts of interest, together with an obsession for pursuing fashionable trends of dubious importance, science has taken a turn towards darkness.”\n\n\n\n1,693,059 publikacija na PubMed-u u 2023. god!" }, { - "objectID": "slides/04_verovatnoca/pres.html#how-do-we-determine-probability", - "href": "slides/04_verovatnoca/pres.html#how-do-we-determine-probability", + "objectID": "slides/01_uvod/prezentacija.html#koliko-često-se-replikuju-rezultati", + "href": "slides/01_uvod/prezentacija.html#koliko-često-se-replikuju-rezultati", + "title": "Uvod u Statistiku", + "section": "Koliko često se replikuju rezultati?", + "text": "Koliko često se replikuju rezultati?" + }, + { + "objectID": "slides/01_uvod/prezentacija.html#se-zahteva-preregistracija", + "href": "slides/01_uvod/prezentacija.html#se-zahteva-preregistracija", + "title": "Uvod u Statistiku", + "section": "2000. se zahteva preregistracija", + "text": "2000. se zahteva preregistracija" + }, + { + "objectID": "slides/01_uvod/prezentacija.html#definicija", + "href": "slides/01_uvod/prezentacija.html#definicija", + "title": "Uvod u Statistiku", + "section": "Definicija", + "text": "Definicija\n\nStatistika je nauka o odlučivanju\nu uslovima nesigurnosti" + }, + { + "objectID": "slides/01_uvod/prezentacija.html#osnovni-pojmovi", + "href": "slides/01_uvod/prezentacija.html#osnovni-pojmovi", + "title": "Uvod u Statistiku", + "section": "Osnovni pojmovi", + "text": "Osnovni pojmovi\n\n\n\n\n\n%%{ init: { 'flowchart': { 'curve': 'monotoneX' } } }%%\n%%| fig-align: center\n%%| fig-height: 10\n\nflowchart LR\n A[Osnovni skup] --> B[Uzorak]\n B --> C[Jedinica posmatranja]\n C --> D[Varijable]\n D --> E[Merenje]\n E <--> TT[\"Tačnost\\nPreciznost\\nPouzdanost\\nValjanost\"]\n TT <--> F\n E <--> TP[\"Tip podataka\"]\n TP <--> F\n E --> F[Podaci]\n F --> G[Analiza]\n G --> H[Zaključak]\n H -->|generalizacija|A" + }, + { + "objectID": "slides/01_uvod/prezentacija.html#istraživačko-pitanje", + "href": "slides/01_uvod/prezentacija.html#istraživačko-pitanje", + "title": "Uvod u Statistiku", + "section": "Istraživačko pitanje", + "text": "Istraživačko pitanje\n\n\nDefinisanje istraživačkog pitanja (engl. estimand) je nešto što je najviše zaboravlja kad se osmišlja rad.\n\n\n\n\n\n\n%%{ init: { 'flowchart': { 'curve': 'monotoneX' } } }%%\n%%| fig-align: center\n%%| fig-width: 4\n\nflowchart TD\n I[Istraživačko pitanje] -.-> A\n A[Osnovni skup] --> B[Uzorak]\n B --> C[Jedinica posmatranja]\n C --> D[Varijable]\n\n\n\n\n\n\n\n\nEstimand je tačna mera koju želimo na naučimo (rizik, učestalnost, prosek, prosečni kauzalni efekat terapije). Pretstavlja jos precizniju definiciju istraživačkog pitanja." + }, + { + "objectID": "slides/01_uvod/prezentacija.html#primer-istraživačko-pitanje", + "href": "slides/01_uvod/prezentacija.html#primer-istraživačko-pitanje", + "title": "Uvod u Statistiku", + "section": "Primer: istraživačko pitanje", + "text": "Primer: istraživačko pitanje\n\n\n\n\n\n\n\n%%{ init: { 'flowchart': { 'curve': 'monotoneX' } } }%%\n%%| fig-align: center\n%%| fig-width: 8\n\nflowchart TD\n I[Istraživačko pitanje] -.-> A\n A[Osnovni skup] --> B[Uzorak]\n B --> C[Jedinica posmatranja]\n C --> D[Varijable]\n\n\n\n\n\n\n\n\n\n\n\n\n%%{ init: { 'flowchart': { 'curve': 'monotoneX' } } }%%\n%%| fig-align: center\n\nflowchart TD\n I[\"Da li je stepen degeneracije\\nlumbosakruma na radiografiji\\npovezan sa bolom?\"] -.-> A\n A[Pacijenti sa lumboishialgijom] --> B[n pacijenata]\n B --> C[Pacijent]\n C --> D[\"Stepen degeneracije, bol\"]" + }, + { + "objectID": "slides/01_uvod/prezentacija.html#lind-id", + "href": "slides/01_uvod/prezentacija.html#lind-id", + "title": "Uvod u Statistiku", + "section": "", + "text": "The gingival swelling and dusky color just above two of the teeth indicate hemorrhage into the gums of this patient with poor dentition. The gingival abnormalities of scurvy occur only in the presence of teeth, which presumably provide portals of entry for microbes into the gums. One hypothesis suggests that vitamin C deficiency impairs neutrophil-mediated killing of bacteria, leading to chronic gingivitis, which is then complicated by bleeding from the fragile vessels characteristic of scurvy.\nIn this example, the perifollicular hyperkeratotic papules are quite prominent, with surrounding hemorrhage. These lesions have been misinterpreted as “palpable purpura,” leading to the mistaken clinical diagnosis of vasculitis." + }, + { + "objectID": "slides/01_uvod/prezentacija.html#james-lindovo-istraživanje", + "href": "slides/01_uvod/prezentacija.html#james-lindovo-istraživanje", + "title": "Uvod u Statistiku", + "section": "James Lindovo istraživanje", + "text": "James Lindovo istraživanje\n\n\n\n\n\n\n\n\n\nJames Lind (1716-1794)\n\n\n\n\n\n\n\nHMS Salisbury (1747)" + }, + { + "objectID": "slides/01_uvod/prezentacija.html#prva-medicinska-baza-podataka", + "href": "slides/01_uvod/prezentacija.html#prva-medicinska-baza-podataka", + "title": "Uvod u Statistiku", + "section": "Prva medicinska baza podataka", + "text": "Prva medicinska baza podataka\n\n\n \n\n \n \n \n tinytable_sw42sxeviudmqlcz6suf\n \n \n \n \n \n\n \n \n \n \n \n \n study_id\n treatment\n gum_rot_d6\n skin_sores_d6\n fit_for_duty_d6\n \n \n Beleške: Skraćena baza originalnih podataka prikupljenih od strane Džejms Linda; d6, na dan 6.\n \n \n 001\n cider \n 2_moderate\n 2_moderate\n 0_no \n \n \n 002\n cider \n 2_moderate\n 1_mild \n 0_no \n \n \n 003\n dilute_sulfuric_acid\n 1_mild \n 3_severe \n 0_no \n \n \n 004\n dilute_sulfuric_acid\n 2_moderate\n 3_severe \n 0_no \n \n \n 005\n vinegar \n 3_severe \n 3_severe \n 0_no \n \n \n 006\n vinegar \n 3_severe \n 3_severe \n 0_no \n \n \n 007\n sea_water \n 3_severe \n 3_severe \n 0_no \n \n \n 008\n sea_water \n 3_severe \n 3_severe \n 0_no \n \n \n 009\n citrus \n 1_mild \n 1_mild \n 0_no \n \n \n 010\n citrus \n 0_none \n 0_none \n 1_yes\n \n \n 011\n purgative_mixture \n 3_severe \n 3_severe \n 0_no \n \n \n 012\n purgative_mixture \n 3_severe \n 3_severe \n 0_no" + }, + { + "objectID": "slides/01_uvod/prezentacija.html#merenje", + "href": "slides/01_uvod/prezentacija.html#merenje", + "title": "Uvod u Statistiku", + "section": "Merenje", + "text": "Merenje\n\nNačin merenja je jako bitan\nPreciznost, pouzdanost, validnost, podaci koji nedostaju\n\n\nPikasov crtez psa.\nNama je ocigledan pas, ali kako izmeriti koliko je ovo pas? Treba nam neka skala. Primeri: koliko je teska neka bolest (DM, HTA, stadijum Ca), znanje (ocigledno losa mera), itd. Merenja mogu da budu i opasna: nekad smo merili lobanje (frenologija)." + }, + { + "objectID": "slides/01_uvod/prezentacija.html#odgovori-pacijenata-na-merenje-pritiska", + "href": "slides/01_uvod/prezentacija.html#odgovori-pacijenata-na-merenje-pritiska", + "title": "Uvod u Statistiku", + "section": "Odgovori pacijenata na merenje pritiska", + "text": "Odgovori pacijenata na merenje pritiska\n\n\nSPRINT trial ima ozbilje kritike.\nIn clinical practice, BP is often measured with little attention to quality control and may overestimate average SBP by as much as 10 to 15 mm Hg compared with values obtained using guideline recommended methods that have been employed in most landmark antihypertensive drug treatment trials." + }, + { + "objectID": "slides/01_uvod/prezentacija.html#vrste-podataka", + "href": "slides/01_uvod/prezentacija.html#vrste-podataka", + "title": "Uvod u Statistiku", + "section": "Vrste podataka", + "text": "Vrste podataka\nPodaci se sastoje od varijabli. Varijabla predstavlja meru neke pojave.\n\nKvalitativni (opisuju pojavu)\nKvantitativni (dodeljuju numeričku vrednost)\n\n\n\n\n\n\n\nBitno\n\n\n“Koja je vaša omiljena hrana?”, na šta su odgovori: grožđe, čokolada, karbonara, pica i mango. Ovi podaci nisu numerički; ali im često dodeljujemo brojeve (1 = grožđe, 2 = čokolada, itd.), međutim u ovom slučaju brojeve koristimo kao oznake, ne kao prave vrednosti.\n\n\n\n\nMera nije samo rec, ver pojam koji se odnosi na proces dodavanja vrednosti nekim opservacijama. Starost merimo vremenom, tezinu kilogramima, bol proizvoljnom skalom 0-10, antitela koncentracijom, rizik verovatnoćom, itd." + }, + { + "objectID": "slides/01_uvod/prezentacija.html#kvalitativni-podaci", + "href": "slides/01_uvod/prezentacija.html#kvalitativni-podaci", + "title": "Uvod u Statistiku", + "section": "Kvalitativni podaci", + "text": "Kvalitativni podaci\n\n\n \n\n \n \n \n tinytable_88wjmcxjn9ilkoduadvx\n \n \n \n \n \n\n \n \n \n \n \n \n Koji vam je omiljeni predmet?\n Broj učenika\n \n \n \n \n \n Patologija\n 105\n \n \n Statistika\n 20\n \n \n Patofiza \n 4\n \n \n \n \n\n \n\n \n\n\n\n\n\n\n\n\n\n\nBeleška\n\n\nPrimetiti da su odgovori studenata kvalitativni, ali smo ih sumiranjem pretvorili u kvantitativne." + }, + { + "objectID": "slides/01_uvod/prezentacija.html#tipovi-brojeva", + "href": "slides/01_uvod/prezentacija.html#tipovi-brojeva", + "title": "Uvod u Statistiku", + "section": "Tipovi brojeva", + "text": "Tipovi brojeva\n\nBinarni brojevi (Da/Ne; 1/0; TRUE/FALSE)\nCeli (\\(\\mathbb Z\\)) brojevi (“Koliko se slažete na skali od 1 do 7?”)\nRealni (\\(\\mathbb R\\)) brojevi (najčešći, \\(3.12...\\), \\(9.81...\\))" + }, + { + "objectID": "slides/01_uvod/prezentacija.html#diskontinuirana-diskretna-i-kontinuirana-merenja", + "href": "slides/01_uvod/prezentacija.html#diskontinuirana-diskretna-i-kontinuirana-merenja", + "title": "Uvod u Statistiku", + "section": "Diskontinuirana (diskretna) i kontinuirana merenja", + "text": "Diskontinuirana (diskretna) i kontinuirana merenja\n\nDiskontinuirano (diskretno) merenje (podatak) je ono koje je kvalitativno ili se može izraziti preko celog broja\n\n\nBroj porođaja: 3, nema nikakvog smisla pričati o 3.5 porođaja!\n\n\nKontinuirano merenje je ono koje se izražava pomoću realnog broja\n\n\nKada merimo težinu u \\(kg\\) obično zaokružujemo, ali ima smisla pričati o preciznijim merenjima (\\(70 \\; \\text{kg}\\), \\(70.3467 \\; \\text{kg}\\)).\n\n\nThe most important takeaway from this is that some kinds of statistics don’t make sense on some kinds of data. Zip code basically serves as a label for a different region. For this reason, it wouldn’t make sense to talk about the average zip code, for example." + }, + { + "objectID": "slides/01_uvod/prezentacija.html#merne-skale-1", + "href": "slides/01_uvod/prezentacija.html#merne-skale-1", + "title": "Uvod u Statistiku", + "section": "Merne skale (1)", + "text": "Merne skale (1)\nVarijable moraju da imaju barem dve vrednosti (inače bi bile konstante).\nVrednosti varijable imaju različite odnose:\n\nIdentitet: Svaka vrednost je jedinstvena.\nVeličina (magnituda): Neke vrednosti su veće od drugih.\nJednaki intervali: Razlika između 1 i 2 je iste veličine kao 19 i 20.\nApsolutna nula: Skala ima nulu koja znači nešto.\n\n\nZasto su bitne? Govore nam koje simplifikacije imaju smisla." + }, + { + "objectID": "slides/01_uvod/prezentacija.html#merne-skale-2", + "href": "slides/01_uvod/prezentacija.html#merne-skale-2", + "title": "Uvod u Statistiku", + "section": "Merne skale (2)", + "text": "Merne skale (2)\n\nNominalna skala (identitet; 1 - Dijabetes, 2 - Hipertenzija)\nOrdinalna skala (identitet i veličina; 1 - Primarno obrazovanje, 2 - Srednja škola)\nIntervalna skala (identitet, veličina, i jednaki intervali; Celsius, Fahrenheit)\nRatio skala (sve + apsolutna nula; Kelvin, visina, težina)\n\n\n\n \n\n \n \n \n tinytable_h8yr8lsxbmd2w0qalzvh\n \n \n \n \n \n\n \n \n \n \n Dozvoljene operacije u odnosu na skalu\n \n Skala\n Jednako/nije jednako\n >/<\n +/-\n Množenje/deljenje\n \n \n \n \n \n Nominalna \n OK\n \n \n \n \n \n Ordinalna \n OK\n OK\n \n \n \n \n Intervalna\n OK\n OK\n OK\n \n \n \n Ratio \n OK\n OK\n OK\n OK\n \n \n \n \n\n \n\n \n\n\n\n\n\nThese constraints imply certain kinds of statistics. Statistics that simply count values (mode), can be calculated on any of the variable types. Statistics based on ordering or ranking of values (median), require that the value at least be on an ordinal scale. Finally, statistics that involve adding up values (such as the average, or mean), require that the variables be at least on an interval scale." + }, + { + "objectID": "slides/01_uvod/prezentacija.html#nominalni-podaci", + "href": "slides/01_uvod/prezentacija.html#nominalni-podaci", + "title": "Uvod u Statistiku", + "section": "Nominalni podaci", + "text": "Nominalni podaci\n\n\nJedinstvene vrednosti\nNemaju minimum ni maksimum\nNemaju red" + }, + { + "objectID": "slides/01_uvod/prezentacija.html#ordinalni-podaci", + "href": "slides/01_uvod/prezentacija.html#ordinalni-podaci", + "title": "Uvod u Statistiku", + "section": "Ordinalni podaci", + "text": "Ordinalni podaci\n\n\nDiskretni (celi brojevi)\nDefinisan minimum i maksimum\nDefinisan red\n“Udaljenost” između kategorija je nepoznata\n\n\n“Ponekad” je veće od “Nikad”, ali koliko veće je ponekad od nikad? Koliko je 2 na skali bola veće od 1? Odgovor nije 1, nego neki subjektivna mera. Koliko neko voli ovaj čas, za 1-2 nije teško, ali 4-5 je teško." + }, + { + "objectID": "slides/01_uvod/prezentacija.html#numerički-podaci", + "href": "slides/01_uvod/prezentacija.html#numerički-podaci", + "title": "Uvod u Statistiku", + "section": "Numerički podaci", + "text": "Numerički podaci\n\n\nDiskontinuirani su samo celi brojevi\nKontinuirani mogu biti proizvoljno precizni\n\n\n\n\n\n\n\nUpozorenje\n\n\nOrdinalni i diskontinuirani podaci mogu da liče. Razlikuje ih to što su brojevi kod ordinalnih podataka samo obeležja, ne prave vrednosti. Kontinuirani i diskontinuirani podaci mogu da liče ako se zaokruže (50kg, 60kg, 75kg), ali uvek imamo opciju da ih prikažemo preciznije.\n\n\n\n\nTrombociti su prebrojivi, ali nekad se mere kontinuiranim merama kao npr. spektrometrijom. Vezbe iz biohemiije (kolorimetrija)." + }, + { + "objectID": "slides/01_uvod/prezentacija.html#ko-zna-zna-tip-podatka", + "href": "slides/01_uvod/prezentacija.html#ko-zna-zna-tip-podatka", + "title": "Uvod u Statistiku", + "section": "Ko zna zna (tip podatka)?", + "text": "Ko zna zna (tip podatka)?\n\n\n\nABO\nBol (NRS 0-10 skala)\nM/Ž\nStadijum (I-IV)\nTA (mmHg)\nSrčana fr (otk/min)\nStarost\n\n\n\nNominalni\nOrdinalni\nNominalni (binarni)\nOrdinalni\nNumerički (kont.)\nNumerički (diskretni)*\nNumerički (kont.)" + }, + { + "objectID": "slides/01_uvod/prezentacija.html#šta-ćemo-sa-vremenom", + "href": "slides/01_uvod/prezentacija.html#šta-ćemo-sa-vremenom", + "title": "Uvod u Statistiku", + "section": "Šta ćemo sa vremenom?", + "text": "Šta ćemo sa vremenom?\n\n\nUvek je bolje tretirati vreme kao kontinuirano (mada zavisi od pitanja, individualni efekti vs. trend)." + }, + { + "objectID": "slides/01_uvod/prezentacija.html#excel-se-koristi-za-unos-podataka", + "href": "slides/01_uvod/prezentacija.html#excel-se-koristi-za-unos-podataka", + "title": "Uvod u Statistiku", + "section": "Excel se koristi za unos podataka", + "text": "Excel se koristi za unos podataka" + }, + { + "objectID": "slides/01_uvod/prezentacija.html#principi-uredne-baze-tidydata", + "href": "slides/01_uvod/prezentacija.html#principi-uredne-baze-tidydata", + "title": "Uvod u Statistiku", + "section": "Principi uredne baze (tidydata)", + "text": "Principi uredne baze (tidydata)" + }, + { + "objectID": "slides/01_uvod/prezentacija.html#uh", + "href": "slides/01_uvod/prezentacija.html#uh", + "title": "Uvod u Statistiku", + "section": "uh…", + "text": "uh…" + }, + { + "objectID": "slides/01_uvod/prezentacija.html#učitavanje-gotove-baze-u-ezr", + "href": "slides/01_uvod/prezentacija.html#učitavanje-gotove-baze-u-ezr", + "title": "Uvod u Statistiku", + "section": "Učitavanje gotove baze u EZR", + "text": "Učitavanje gotove baze u EZR\nZadatak:\n\nUčitati zadovoljstvo zdravstvenom zaštitom.xlsx u EZR\nUčitati KVS.xlsx bez da se izgubi prethodna baza\n\n\n\n\n\n\n\nBitno\n\n\nIzabrati Sheet1 (obično se tu nalaze podaci) pri učitavanju baze. Pritiskom na View proveriti da je ispravna baza učitana!\n\n\n\nŠta je šifrarnik i čemu služi?\n\nIstraživačka baza podataka praćena je šifarnikom koji sadrži informacije o nazivu i redosledu varijabli, opisu varijabli, mernim jedinicama, i skali merenja (nominalni, ordinalni, numerički). Osim toga u šifarniku su, za kategorijalne varijable, date informacije o broju kategorija i kodovima tih kategorija." + }, + { + "objectID": "slides/01_uvod/prezentacija.html#granularni-podaci-razdvajanje", + "href": "slides/01_uvod/prezentacija.html#granularni-podaci-razdvajanje", + "title": "Uvod u Statistiku", + "section": "Granularni podaci (razdvajanje)", + "text": "Granularni podaci (razdvajanje)" + }, + { + "objectID": "slides/01_uvod/prezentacija.html#granularni-podaci-spajanje", + "href": "slides/01_uvod/prezentacija.html#granularni-podaci-spajanje", + "title": "Uvod u Statistiku", + "section": "Granularni podaci (spajanje)", + "text": "Granularni podaci (spajanje)" + }, + { + "objectID": "slides/01_uvod/prezentacija.html#ponovljenje-kolone-neprepoznate-varijable", + "href": "slides/01_uvod/prezentacija.html#ponovljenje-kolone-neprepoznate-varijable", + "title": "Uvod u Statistiku", + "section": "Ponovljenje kolone (neprepoznate varijable)", + "text": "Ponovljenje kolone (neprepoznate varijable)" + }, + { + "objectID": "slides/01_uvod/prezentacija.html#ponovljena-merenja-lakše-upisivanje", + "href": "slides/01_uvod/prezentacija.html#ponovljena-merenja-lakše-upisivanje", + "title": "Uvod u Statistiku", + "section": "Ponovljena merenja (lakše upisivanje)", + "text": "Ponovljena merenja (lakše upisivanje)" + }, + { + "objectID": "slides/01_uvod/prezentacija.html#zadatak-različite-baze", + "href": "slides/01_uvod/prezentacija.html#zadatak-različite-baze", + "title": "Uvod u Statistiku", + "section": "Zadatak: različite baze", + "text": "Zadatak: različite baze\n\nNapravi bazu kako bi:\n\nPoredili vrednosti sistolnog pritiska između dijabetičara i zdravih ljudi?\nPoredili vrednosti glukoze između istih pacijenata pre i posle terapije?\nUpisali CRP meren serijski u intervalu: 1h, 12h, 24h?\n\n\n\n\n\n\n\nTeško (opcionalno)\n\n\n\nPratili pacijente da saznamo ko je imao recidiv posle operacije?\nMerili vreme do tromboze između pacijenata koje lečimo agresivno i konzervativno.\nMerili vreme do tromboze ako pratimo vrednosti d-Dimera serijski 3 dana za redom." + }, + { + "objectID": "slides/01_uvod/prezentacija.html#rešenje-dijabetičari-i-zdravi-ljudi", + "href": "slides/01_uvod/prezentacija.html#rešenje-dijabetičari-i-zdravi-ljudi", + "title": "Uvod u Statistiku", + "section": "Rešenje: dijabetičari i zdravi ljudi", + "text": "Rešenje: dijabetičari i zdravi ljudi\n\n\n \n\n \n \n \n tinytable_blzzpqz5ricqjd2e1yfw\n \n \n \n \n \n\n \n \n \n \n \n \n Gluk\n Grupa\n \n \n \n \n \n 7.2\n DM \n \n \n 5.1\n Zdrav\n \n \n 5.9\n Zdrav\n \n \n 4.7\n Zdrav\n \n \n 11.1\n DM" + }, + { + "objectID": "slides/01_uvod/prezentacija.html#rešenje-pre-i-posle", + "href": "slides/01_uvod/prezentacija.html#rešenje-pre-i-posle", + "title": "Uvod u Statistiku", + "section": "Rešenje: pre i posle", + "text": "Rešenje: pre i posle\n\n\n \n\n \n \n \n tinytable_1s81ylkcrlqm06qg6h8u\n \n \n \n \n \n\n \n \n \n \n \n \n gluk_pre\n gluk_posle\n \n \n \n \n \n 7.2\n 6.1\n \n \n 5.1\n 5.1\n \n \n 5.9\n 5.5\n \n \n 4.7\n 5.9\n \n \n 11.1\n 7.1" + }, + { + "objectID": "slides/01_uvod/prezentacija.html#rešenje-serija-merenja", + "href": "slides/01_uvod/prezentacija.html#rešenje-serija-merenja", + "title": "Uvod u Statistiku", + "section": "Rešenje: serija merenja", + "text": "Rešenje: serija merenja\nVarijanta 1:\n\n\n \n\n \n \n \n tinytable_u1rwj6cwso8k1ep3y0l1\n \n \n \n \n \n\n \n \n \n \n \n \n ID\n CRP\n Vreme\n \n \n \n \n \n 1\n 0.62\n 1h \n \n \n 1\n 0.51\n 12h\n \n \n 1\n 0.56\n 24h\n \n \n 2\n 0.43\n 1h \n \n \n 2\n 0.42\n 12h\n \n \n \n \n\n \n\n \n\n\n\n\nVarijanta 2:\n\n\n \n\n \n \n \n tinytable_62i3292krumjnisqsx87\n \n \n \n \n \n\n \n \n \n \n \n \n ID\n CRP_1h\n CRP_12h\n CRP_24h\n \n \n \n \n \n 1\n 0.70\n 0.67\n 0.54\n \n \n 2\n 0.66\n 0.41\n 0.59\n \n \n 3\n 0.76\n 0.49\n 0.53" + }, + { + "objectID": "slides/01_uvod/prezentacija.html#podaci-koji-nedostaju", + "href": "slides/01_uvod/prezentacija.html#podaci-koji-nedostaju", + "title": "Uvod u Statistiku", + "section": "Podaci koji nedostaju", + "text": "Podaci koji nedostaju\n\n\n \n\n \n \n \n tinytable_wnkttp048lusrpp64oym\n \n \n \n \n \n\n \n \n \n \n \n \n pacijent\n intervencija\n ishod\n \n \n \n \n \n Petar Petrovic \n 1\n 7\n \n \n NA \n 2\n 10\n \n \n NA \n 3\n NA\n \n \n Katarina Katarinovic\n 1\n 4\n \n \n \n \n\n \n\n \n\n\n\n\n\n\nOstaviti prazno (moguće greške)\nUpisati NA" + }, + { + "objectID": "slides/07_hi_kvadrat/prezentacija.html#hi-kvardrat-simulacija", + "href": "slides/07_hi_kvadrat/prezentacija.html#hi-kvardrat-simulacija", + "title": "Testiranje hipoteza o proporcijama", + "section": "Hi-kvardrat simulacija", + "text": "Hi-kvardrat simulacija\n\n\n [,1] [,2] [,3]\n[1,] 63 41 54\n[2,] 106 107 129\n\n\n\n Pearson's Chi-squared test\n\ndata: simulated_data_matrix\nX-squared = 3.9314, df = 2, p-value = 0.1401" + }, + { + "objectID": "slides/07_hi_kvadrat/prezentacija.html#struktura-kursa", + "href": "slides/07_hi_kvadrat/prezentacija.html#struktura-kursa", + "title": "Testiranje hipoteza o proporcijama", + "section": "Struktura kursa", + "text": "Struktura kursa\n\n\n \n\n \n \n \n tinytable_ft57llugx3c4olovomyt\n \n \n \n \n \n\n \n \n \n \n \n \n Nedelja\n Tema\n \n \n \n \n \n 1\n Uvod u medicinsku statistiku \n \n \n 2\n Sređivanje podataka \n \n \n 3\n Statističko opisivanje podataka \n \n \n 4\n Verovatnoća i raspodele verovatnoća \n \n \n 5\n Populacija i uzorak \n \n \n 6\n Testiranje hipoteza o populacionim prosečnim vrednostima i proporcijama\n \n \n 7\n Testiranje hipoteza o učestalostima \n \n \n 8\n Testiranje hipoteza o rangovima \n \n \n 9\n Korelacija \n \n \n 10\n Regresija / Kolokvijum \n \n \n 11\n Podaci, informacije i znanje \n \n \n 12\n Zdravstveni informacioni sistem \n \n \n 13\n Mere dijagnostičke tačnosti \n \n \n 14\n Medicinsko odlučivanje \n \n \n 15\n Bioinformatika" + }, + { + "objectID": "index.html", + "href": "index.html", + "title": "Osnovni kurs medicinske statistike i informatike", + "section": "", + "text": "Osnovni kurs medicinske statistike i informatike\n\n\n\n\n\n\n\n\n\nDobrodošli na kurs medicinske statistike i informatike! Sve informacije vezane za kurs i termine polaganja možete pronaći na sajtu instituta. Ova web stranica služi kao lični repozitorijum kako bi prezentacije sa vežbi bile uvek dostupne onima koji to žele.\nLista prezentacija\n\n\n \n\n \n \n \n tinytable_pd4tdj2yeii9ulh5ql29\n \n \n \n \n \n\n \n \n \n \n \n \n Nedelja\n Tema\n \n \n \n \n \n 1\n Uvod u medicinsku statistiku (eng)\n \n \n 2\n Sređivanje podataka\n \n \n 3\n Statističko opisivanje podataka\n \n \n 4\n Verovatnoća i raspodele verovatnoća (eng)\n \n \n 5\n Populacija i uzorak\n \n \n 6\n Testiranje hipoteza o populacionim prosečnim vrednostima i proporcijama" + }, + { + "objectID": "about.html", + "href": "about.html", + "title": "Dr Nikola N. Grubor", + "section": "", + "text": "Ja sam specijalizant radiologije, saradnik u nastavi na katedri medicinske statistike i informatike Medicinskog fakulteta u Beogradu, i doktorant na modulu Bioinformatika. Cilj mi je da medicinsku nauku učinim pristupačnijom javnosti i da pomognem istraživačima da odgovore na zanimljiva pitanja. Ukoliko imate neka pitanja e-mejl je najbolji način da me kontaktirate." + }, + { + "objectID": "slides/10_regresija/prezentacija.html#section", + "href": "slides/10_regresija/prezentacija.html#section", + "title": "Korelacija i regresija", + "section": "", + "text": "Stephen Jay Gould\n\n\n\n\nNetačna pretpostavka da korelacija podrazumeva uzročnu vezu je verovatno jedna od dve ili tri najveće greške u čovekovom zaključivanju." + }, + { + "objectID": "slides/10_regresija/prezentacija.html#section-1", + "href": "slides/10_regresija/prezentacija.html#section-1", + "title": "Korelacija i regresija", + "section": "", + "text": "Korelacija \\(\\color{darkgreen}{\\not =}\\) Kauzalnost" + }, + { + "objectID": "slides/10_regresija/prezentacija.html#struktura-kursa", + "href": "slides/10_regresija/prezentacija.html#struktura-kursa", + "title": "Korelacija i regresija", + "section": "Struktura kursa", + "text": "Struktura kursa\n\n\n \n\n \n \n \n tinytable_cumvh41pwy7fmvr4sas7\n \n \n \n \n \n\n \n \n \n \n \n \n Nedelja\n Tema\n \n \n \n \n \n 1\n Uvod u medicinsku statistiku \n \n \n 2\n Sređivanje podataka \n \n \n 3\n Statističko opisivanje podataka \n \n \n 4\n Verovatnoća i raspodele verovatnoća \n \n \n 5\n Populacija i uzorak \n \n \n 6\n Testiranje hipoteza o populacionim prosečnim vrednostima i proporcijama\n \n \n 7\n Testiranje hipoteza o učestalostima \n \n \n 8\n Testiranje hipoteza o rangovima \n \n \n 9\n Korelacija \n \n \n 10\n Regresija / Kolokvijum \n \n \n 11\n Podaci, informacije i znanje \n \n \n 12\n Zdravstveni informacioni sistem \n \n \n 13\n Mere dijagnostičke tačnosti \n \n \n 14\n Medicinsko odlučivanje \n \n \n 15\n Bioinformatika" + }, + { + "objectID": "slides/01_uvod/pres.html#what-is-statistics-for", + "href": "slides/01_uvod/pres.html#what-is-statistics-for", + "title": "Introduction to Statistics", + "section": "What is statistics for?", + "text": "What is statistics for?\n\nApplied scientific method\nDiscovery of treatment effect (drug, intervention)\nPredicting risk (e.g., thrombosis)\nMedical decision making (diagnostic test accuracy)" + }, + { + "objectID": "slides/01_uvod/pres.html#hypertension-treatment-effect", + "href": "slides/01_uvod/pres.html#hypertension-treatment-effect", + "title": "Introduction to Statistics", + "section": "Hypertension treatment effect", + "text": "Hypertension treatment effect\n What is the recommendation based on? Does it make sense?\n\nAmong patients at high risk for cardiovascular events but without diabetes, targeting a systolic blood pressure of less than 120 mm Hg, as compared with less than 140 mm Hg, resulted in lower rates of fatal and nonfatal major cardiovascular events and death from any cause, although significantly higher rates of some adverse events were observed in the intensive-treatment group." + }, + { + "objectID": "slides/01_uvod/pres.html#risk-prediction", + "href": "slides/01_uvod/pres.html#risk-prediction", + "title": "Introduction to Statistics", + "section": "Risk prediction", + "text": "Risk prediction\n\nIs pulse pressure or systolic pressure responsible for most of the risk of hemorrhagic stroke?" + }, + { + "objectID": "slides/01_uvod/pres.html#how-much-better-is-ultrasound-at-detecting-gallstones-than-ct", + "href": "slides/01_uvod/pres.html#how-much-better-is-ultrasound-at-detecting-gallstones-than-ct", + "title": "Introduction to Statistics", + "section": "How much better is ultrasound at detecting gallstones than CT?", + "text": "How much better is ultrasound at detecting gallstones than CT?" + }, + { + "objectID": "slides/01_uvod/pres.html#laboratory-values", + "href": "slides/01_uvod/pres.html#laboratory-values", + "title": "Introduction to Statistics", + "section": "Laboratory values", + "text": "Laboratory values\n\n\nDoes this patient with this lab value have a disease risk that requires further investigation?" + }, + { + "objectID": "slides/01_uvod/pres.html#course", + "href": "slides/01_uvod/pres.html#course", + "title": "Introduction to Statistics", + "section": "Course", + "text": "Course\n\nLesson (\\(\\gt\\) 50% \\(\\rightarrow\\) opens quiz)\n\\(\\text{Points} = \\text{lesson} + \\text{quiz (time limited)} + \\text{colloquium} + \\text{exam}\\)\nExam (practical and theoretical part; computer-based assessment in the classroom)" + }, + { + "objectID": "slides/01_uvod/pres.html#course-structure", + "href": "slides/01_uvod/pres.html#course-structure", + "title": "Introduction to Statistics", + "section": "Course structure", + "text": "Course structure\n\n\n \n\n \n \n \n tinytable_73e5d3o1vjyta4o5ltmq\n \n \n \n \n \n\n \n \n \n \n \n \n Nedelja\n Tema\n \n \n \n \n \n 1\n Introduction to Medical Statistics \n \n \n 2\n Data Sorting \n \n \n 3\n Statistical description of data \n \n \n 4\n Probability and probability distributions \n \n \n 5\n Population and Sample \n \n \n 6\n Testing Hypotheses About Population Means and Proportions\n \n \n 7\n Frequency Hypothesis Testing \n \n \n 8\n Rank Hypothesis Testing \n \n \n 9\n Correlation \n \n \n 10\n Regression / Colloquium \n \n \n 11\n Data, information and knowledge \n \n \n 12\n Health information system \n \n \n 13\n Diagnostic accuracy measures \n \n \n 14\n Medical decision-making \n \n \n 15\n Bioinformatics" + }, + { + "objectID": "slides/01_uvod/pres.html#critical-state-of-science-in-medicine", + "href": "slides/01_uvod/pres.html#critical-state-of-science-in-medicine", + "title": "Introduction to Statistics", + "section": "Critical state of science in medicine", + "text": "Critical state of science in medicine\n\n\n\n\n\nRichard Horton, M.D., Lancet Editor-in-Chief\n\n\n\n\n“The case against science is straightforward: much of the scientific literature, perhaps half, may simply be untrue. Afflicted by studies with small sample sizes, tiny effects, invalid exploratory analyses, and flagrant conflicts of interest, together with an obsession for pursuing fashionable trends of dubious importance, science has taken a turn towards darkness.”\n\n\n\n1,693,059 publications on PubMed in 2023!" + }, + { + "objectID": "slides/01_uvod/pres.html#how-often-do-results-replicate", + "href": "slides/01_uvod/pres.html#how-often-do-results-replicate", + "title": "Introduction to Statistics", + "section": "How often do results replicate?", + "text": "How often do results replicate?" + }, + { + "objectID": "slides/01_uvod/pres.html#after-2000-the-fda-requires-preregistration", + "href": "slides/01_uvod/pres.html#after-2000-the-fda-requires-preregistration", + "title": "Introduction to Statistics", + "section": "After 2000 the FDA requires preregistration", + "text": "After 2000 the FDA requires preregistration" + }, + { + "objectID": "slides/01_uvod/pres.html#definition", + "href": "slides/01_uvod/pres.html#definition", + "title": "Introduction to Statistics", + "section": "Definition", + "text": "Definition\n\nStatistics is the science of decision making\nin conditions of uncertainty" + }, + { + "objectID": "slides/01_uvod/pres.html#basic-terms", + "href": "slides/01_uvod/pres.html#basic-terms", + "title": "Introduction to Statistics", + "section": "Basic terms", + "text": "Basic terms\n\n\n\n\n\n%%{ init: { 'flowchart': { 'curve': 'monotoneX' } } }%%\n%%| fig-align: center\n%%| fig-height: 10\n\nflowchart LR\n A[Base Set] --> B[Sample]\n B --> C[Unit of observation]\n C --> D[Variables]\n D --> E[Measurement]\n E <--> TT[\"Accuracy\\nPrecision\\nReliability\\nValidity\"]\n TT <--> F\n E <--> TP[\"Data Type\"]\n TP <--> F\n E --> F[Data]\n F --> G[Analysis]\n G --> H[Conclusion]\n H -->|generalization|A" + }, + { + "objectID": "slides/01_uvod/pres.html#the-research-question", + "href": "slides/01_uvod/pres.html#the-research-question", + "title": "Introduction to Statistics", + "section": "The research question", + "text": "The research question\n\n\nDefining the research question (estimand) is something that is mostly forgotten when designing a study.\n\n\n\n\n\n\n%%{ init: { 'flowchart': { 'curve': 'monotoneX' } } }%%\n%%| fig-align: center\n%%| fig-width: 4\n\nflowchart TD\n I[Reseach question] -.-> A\n A[Basic set] --> B[Sample]\n B --> C[Unit of observation]\n C --> D[Variable]\n\n\n\n\n\n\n\n\nEstimand je tačna mera koju želimo na naučimo (rizik, učestalnost, prosek, prosečni kauzalni efekat terapije). Pretstavlja jos precizniju definiciju istraživačkog pitanja." + }, + { + "objectID": "slides/01_uvod/pres.html#example-research-question", + "href": "slides/01_uvod/pres.html#example-research-question", + "title": "Introduction to Statistics", + "section": "Example: research question", + "text": "Example: research question\n\n\n\n\n\n\n\n%%{ init: { 'flowchart': { 'curve': 'monotoneX' } } }%%\n%%| fig-align: center\n%%| fig-width: 8\n\nflowchart TD\n I[Reseach question] -.-> A\n A[Basic set] --> B[Sample]\n B --> C[Unit of observation]\n C --> D[Variable]\n\n\n\n\n\n\n\n\n\n\n\n\n%%{ init: { 'flowchart': { 'curve': 'monotoneX' } } }%%\n%%| fig-align: center\n\nflowchart TD\n I[\"Is the degree of degeneration\\nof the lumbosacrum on X-ray\\nassociated with pain?\"] -.-> A\n A[Patients with lumboischialgia] --> B[n patients]\n B --> C[Patient]\n C --> D[\"Degree of degeneration, pain\"]" + }, + { + "objectID": "slides/01_uvod/pres.html#lind-id", + "href": "slides/01_uvod/pres.html#lind-id", + "title": "Introduction to Statistics", + "section": "", + "text": "The gingival swelling and dusky color just above two of the teeth indicate hemorrhage into the gums of this patient with poor dentition. The gingival abnormalities of scurvy occur only in the presence of teeth, which presumably provide portals of entry for microbes into the gums. One hypothesis suggests that vitamin C deficiency impairs neutrophil-mediated killing of bacteria, leading to chronic gingivitis, which is then complicated by bleeding from the fragile vessels characteristic of scurvy.\nIn this example, the perifollicular hyperkeratotic papules are quite prominent, with surrounding hemorrhage. These lesions have been misinterpreted as “palpable purpura,” leading to the mistaken clinical diagnosis of vasculitis." + }, + { + "objectID": "slides/01_uvod/pres.html#james-linds-research", + "href": "slides/01_uvod/pres.html#james-linds-research", + "title": "Introduction to Statistics", + "section": "James Lind’s research", + "text": "James Lind’s research\n\n\n\n\n\n\n\n\n\nJames Lind (1716-1794)\n\n\n\n\n\n\n\nHMS Salisbury (1747)" + }, + { + "objectID": "slides/01_uvod/pres.html#the-first-medical-database", + "href": "slides/01_uvod/pres.html#the-first-medical-database", + "title": "Introduction to Statistics", + "section": "The first medical database", + "text": "The first medical database\n\n\n \n\n \n \n \n tinytable_ib13qj9elqf0n6fmcjh1\n \n \n \n \n \n\n \n \n \n \n \n \n study_id\n treatment\n gum_rot_d6\n skin_sores_d6\n fit_for_duty_d6\n \n \n Notes: Abridged database of original data collected by James Lind; d6, on day 6.\n \n \n 001\n cider \n 2_moderate\n 2_moderate\n 0_no \n \n \n 002\n cider \n 2_moderate\n 1_mild \n 0_no \n \n \n 003\n dilute_sulfuric_acid\n 1_mild \n 3_severe \n 0_no \n \n \n 004\n dilute_sulfuric_acid\n 2_moderate\n 3_severe \n 0_no \n \n \n 005\n vinegar \n 3_severe \n 3_severe \n 0_no \n \n \n 006\n vinegar \n 3_severe \n 3_severe \n 0_no \n \n \n 007\n sea_water \n 3_severe \n 3_severe \n 0_no \n \n \n 008\n sea_water \n 3_severe \n 3_severe \n 0_no \n \n \n 009\n citrus \n 1_mild \n 1_mild \n 0_no \n \n \n 010\n citrus \n 0_none \n 0_none \n 1_yes\n \n \n 011\n purgative_mixture \n 3_severe \n 3_severe \n 0_no \n \n \n 012\n purgative_mixture \n 3_severe \n 3_severe \n 0_no" + }, + { + "objectID": "slides/01_uvod/pres.html#measurement", + "href": "slides/01_uvod/pres.html#measurement", + "title": "Introduction to Statistics", + "section": "Measurement", + "text": "Measurement\n\nThe method of measurement is very important\nAccuracy, reliability, validity, missing data\n\n\nPicasso’s drawing of a dog.\nNama je ocigledan pas, ali kako izmeriti koliko je ovo pas? Treba nam neka skala. Primeri: koliko je teska neka bolest (DM, HTA, stadijum Ca), znanje (ocigledno losa mera), itd. Merenja mogu da budu i opasna: nekad smo merili lobanje (frenologija)." + }, + { + "objectID": "slides/01_uvod/pres.html#patient-responses-to-blood-pressure-measurement", + "href": "slides/01_uvod/pres.html#patient-responses-to-blood-pressure-measurement", + "title": "Introduction to Statistics", + "section": "Patient responses to blood pressure measurement", + "text": "Patient responses to blood pressure measurement\n\n\nSPRINT trial ima ozbilje kritike.\nIn clinical practice, BP is often measured with little attention to quality control and may overestimate average SBP by as much as 10 to 15 mm Hg compared with values obtained using guideline recommended methods that have been employed in most landmark antihypertensive drug treatment trials." + }, + { + "objectID": "slides/01_uvod/pres.html#data-types", + "href": "slides/01_uvod/pres.html#data-types", + "title": "Introduction to Statistics", + "section": "Data types", + "text": "Data types\nData consists of variables. Variables represent a measure of some phenomenon.\n\nQualitative (describe the phenomenon)\nQuantitative (assign a numerical value)\n\n\n\n\n\n\n\nImportant\n\n\n“What is your favorite food?”, to which the answers are: grapes, chocolate, carbonara, pizza and mango. This data is not numerical; but we often assign it numbers (1 = grapes, 2 = chocolate, etc.), however in this case the numbers serve as labels, not real values.\n\n\n\n\nMera nije samo rec, ver pojam koji se odnosi na proces dodavanja vrednosti nekim opservacijama. Starost merimo vremenom, tezinu kilogramima, bol proizvoljnom skalom 0-10, antitela koncentracijom, rizik verovatnoćom, itd." + }, + { + "objectID": "slides/01_uvod/pres.html#qualitative-data", + "href": "slides/01_uvod/pres.html#qualitative-data", + "title": "Introduction to Statistics", + "section": "Qualitative data", + "text": "Qualitative data\n\n\n \n\n \n \n \n tinytable_a31l1a10ppxhjkvtb14v\n \n \n \n \n \n\n \n \n \n \n \n \n What is your favorite subject?\n Number of students\n \n \n \n \n \n Pathology \n 105\n \n \n Statistics \n 20\n \n \n Pathophysiology\n 4\n \n \n \n \n\n \n\n \n\n\n\n\n\n\n\n\n\n\nNote\n\n\nThe students’ answers are qualitative, but they can be turned quantitative by summarizing." + }, + { + "objectID": "slides/01_uvod/pres.html#number-types-lead-to-data-types", + "href": "slides/01_uvod/pres.html#number-types-lead-to-data-types", + "title": "Introduction to Statistics", + "section": "Number types lead to data types", + "text": "Number types lead to data types\n\nBinary numbers (Yes/No; 1/0; TRUE/FALSE)\nIntegers (\\(\\mathbb Z\\)) (“Agreement on a scale of 1 to 7?”)\nReals (\\(\\mathbb R\\)) (most common, \\(3.12...\\), \\(9.81...\\))" + }, + { + "objectID": "slides/01_uvod/pres.html#discontinuous-discrete-and-continuous-measurements", + "href": "slides/01_uvod/pres.html#discontinuous-discrete-and-continuous-measurements", + "title": "Introduction to Statistics", + "section": "Discontinuous (discrete) and continuous measurements", + "text": "Discontinuous (discrete) and continuous measurements\nDiscontinuous (discrete) measurements are qualitative or can be expressed with integers (whole numbers)\n\n\n\n\n\n\nExample\n\n\nNumber of births: 3, no sense in talking about 3.5 births!\n\n\n\nContinuous measurements are expressed by real numbers\n\n\n\n\n\n\nExample\n\n\nWhen we measure weight in \\(kg\\) we usually round the numbers so they look whole, but it sill makes sense to talk about more precise measurements (\\(70 \\; \\text{kg}\\), \\(70.3467 \\; \\text{kg}\\)).\n\n\n\n\nThe most important takeaway from this is that some kinds of statistics don’t make sense on some kinds of data. Zip code basically serves as a label for a different region. For this reason, it wouldn’t make sense to talk about the average zip code, for example." + }, + { + "objectID": "slides/01_uvod/pres.html#measurement-scales-1", + "href": "slides/01_uvod/pres.html#measurement-scales-1", + "title": "Introduction to Statistics", + "section": "Measurement scales (1)", + "text": "Measurement scales (1)\nVariables must have at least two values (otherwise they would be constants).\nVariable values have different relationships:\n\nIdentity: Each value is unique.\nSize (magnitude): Some values are larger than others.\nEqual intervals: The difference between 1 and 2 is the same size as between 19 and 20.\nAbsolute zero: The scale has a zero that is meaningful.\n\n\nZasto su bitne? Govore nam koje simplifikacije imaju smisla." + }, + { + "objectID": "slides/01_uvod/pres.html#measurement-scales-2", + "href": "slides/01_uvod/pres.html#measurement-scales-2", + "title": "Introduction to Statistics", + "section": "Measurement scales (2)", + "text": "Measurement scales (2)\n\nNominal scale (identity; 1 - Diabetes, 2 - Hypertension)\nOrdinal scale (identity and size; 1 - Primary education, 2 - Secondary school)\nInterval scale (identity, magnitude, and equal intervals; Celsius, Fahrenheit)\nRatio scale (all + absolute zero; Kelvin, height, weight)\n\n\n\n \n\n \n \n \n tinytable_d1hfsbasgqlpkwxk4afs\n \n \n \n \n \n\n \n \n \n \n Allowed operations based on data scale\n \n Scale\n Equal/Not Equal\n >/<\n +/-\n Multiplication/Division\n \n \n \n \n \n Nominal \n OK\n \n \n \n \n \n Ordinal \n OK\n OK\n \n \n \n \n Interval\n OK\n OK\n OK\n \n \n \n Ratio \n OK\n OK\n OK\n OK\n \n \n \n \n\n \n\n \n\n\n\n\n\nThese constraints imply certain kinds of statistics. Statistics that simply count values (mode), can be calculated on any of the variable types. Statistics based on ordering or ranking of values (median), require that the value at least be on an ordinal scale. Finally, statistics that involve adding up values (such as the average, or mean), require that the variables be at least on an interval scale." + }, + { + "objectID": "slides/01_uvod/pres.html#nominal-data", + "href": "slides/01_uvod/pres.html#nominal-data", + "title": "Introduction to Statistics", + "section": "Nominal data", + "text": "Nominal data\n\n\nUnique values\nThey have no minimum or maximum\nNo natural ordering" + }, + { + "objectID": "slides/01_uvod/pres.html#ordinal-data", + "href": "slides/01_uvod/pres.html#ordinal-data", + "title": "Introduction to Statistics", + "section": "Ordinal data", + "text": "Ordinal data\n\n\nDiscrete (integers)\nDefined minimum and maximum\nDefined order\nThe “distance” between the categories is unknown\n\n\n“Ponekad” je veće od “Nikad”, ali koliko veće je ponekad od nikad? Koliko je 2 na skali bola veće od 1? Odgovor nije 1, nego neki subjektivna mera. Koliko neko voli ovaj čas, za 1-2 nije teško, ali 4-5 je teško." + }, + { + "objectID": "slides/01_uvod/pres.html#numerical-data", + "href": "slides/01_uvod/pres.html#numerical-data", + "title": "Introduction to Statistics", + "section": "Numerical data", + "text": "Numerical data\n\n\nWhole numbers are discontinuous\nContinuous data can be arbitrarily precise\n\n\n\n\n\n\n\nWarning\n\n\nOrdinal and discrete numerical data can look similar. The difference between them is that the numbers in ordinal data are only labels, not real values. Continuous and discontinuous data may look similar if rounded (50kg, 60kg, 75kg), but we always have the option to display them more precisely.\n\n\n\n\nTrombociti su prebrojivi, ali nekad se mere kontinuiranim merama kao npr. spektrometrijom. Vezbe iz biohemiije (kolorimetrija)." + }, + { + "objectID": "slides/01_uvod/pres.html#guess-the-data-type", + "href": "slides/01_uvod/pres.html#guess-the-data-type", + "title": "Introduction to Statistics", + "section": "Guess the data type?", + "text": "Guess the data type?\n\n\n\nABO\nPain (NRS 0-10 scale)\nM/F\nStage (I-IV)\nTA (mmHg)\nHeart rate (bpm)\nAge\n\n\n\nNominal\nOrdinal\nNominal (binary)\nOrdinal\nNumerical (cont.)\nNumerical (discrete)*\nNumerical (cont.)" + }, + { + "objectID": "slides/01_uvod/pres.html#what-about-time", + "href": "slides/01_uvod/pres.html#what-about-time", + "title": "Introduction to Statistics", + "section": "What about time?", + "text": "What about time?\n\n\nUvek je bolje tretirati vreme kao kontinuirano (mada zavisi od pitanja, individualni efekti vs. trend)." + }, + { + "objectID": "slides/01_uvod/pres.html#excel-for-data-entry", + "href": "slides/01_uvod/pres.html#excel-for-data-entry", + "title": "Introduction to Statistics", + "section": "Excel for data entry", + "text": "Excel for data entry" + }, + { + "objectID": "slides/01_uvod/pres.html#tidy-data-principles-tidydata", + "href": "slides/01_uvod/pres.html#tidy-data-principles-tidydata", + "title": "Introduction to Statistics", + "section": "Tidy data principles (tidydata)", + "text": "Tidy data principles (tidydata)" + }, + { + "objectID": "slides/01_uvod/pres.html#ugh", + "href": "slides/01_uvod/pres.html#ugh", + "title": "Introduction to Statistics", + "section": "ugh…", + "text": "ugh…" + }, + { + "objectID": "slides/01_uvod/pres.html#importing-a-database-into-the-ezr", + "href": "slides/01_uvod/pres.html#importing-a-database-into-the-ezr", + "title": "Introduction to Statistics", + "section": "Importing a database into the EZR", + "text": "Importing a database into the EZR\n\nDownload and import satisfaction with health care.xlsx into EZR\nLoad KVS.xlsx without overwriting the previous database\n\n\n\n\n\n\n\nImportant\n\n\nSelect Sheet1 (this is where the data is usually located) when importing the database. Click View to check that the correct database is loaded!\n\n\n\nWhat is a code book and what is it for?\n\nIstraživačka baza podataka praćena je šifarnikom koji sadrži informacije o nazivu i redosledu varijabli, opisu varijabli, mernim jedinicama, i skali merenja (nominalni, ordinalni, numerički). Osim toga u šifarniku su, za kategorijalne varijable, date informacije o broju kategorija i kodovima tih kategorija." + }, + { + "objectID": "slides/01_uvod/pres.html#granular-data-disaggregation", + "href": "slides/01_uvod/pres.html#granular-data-disaggregation", + "title": "Introduction to Statistics", + "section": "Granular data (disaggregation)", + "text": "Granular data (disaggregation)" + }, + { + "objectID": "slides/01_uvod/pres.html#granular-data-merging", + "href": "slides/01_uvod/pres.html#granular-data-merging", + "title": "Introduction to Statistics", + "section": "Granular Data (merging)", + "text": "Granular Data (merging)" + }, + { + "objectID": "slides/01_uvod/pres.html#column-repetition-unrecognized-variables", + "href": "slides/01_uvod/pres.html#column-repetition-unrecognized-variables", + "title": "Introduction to Statistics", + "section": "Column repetition (unrecognized variables)", + "text": "Column repetition (unrecognized variables)" + }, + { + "objectID": "slides/01_uvod/pres.html#repeated-measurements-easier-typing", + "href": "slides/01_uvod/pres.html#repeated-measurements-easier-typing", + "title": "Introduction to Statistics", + "section": "Repeated measurements (easier typing)", + "text": "Repeated measurements (easier typing)" + }, + { + "objectID": "slides/01_uvod/pres.html#exercise-different-bases", + "href": "slides/01_uvod/pres.html#exercise-different-bases", + "title": "Introduction to Statistics", + "section": "Exercise: different bases", + "text": "Exercise: different bases\n\nDesign a database for:\n\nComparing the values of systolic pressure between diabetics and healthy people?\nComparing glucose values between the same patients before and after therapy?\nRecording CRP measured serially at the following times: 1h, 12h, 24h?\n\n\n\n\n\n\n\nHard (optional)\n\n\n\nFollow-up patients to find out who had a relapse after surgery?\nMeasure time to thrombosis between patients treated aggressively and conservatively.\nMeasure time to thrombosis while monitoring d-Dimer values serially for 3 days in a row." + }, + { + "objectID": "slides/01_uvod/pres.html#solution-diabetics-and-healthy-people", + "href": "slides/01_uvod/pres.html#solution-diabetics-and-healthy-people", + "title": "Introduction to Statistics", + "section": "Solution: diabetics and healthy people", + "text": "Solution: diabetics and healthy people\n\n\n \n\n \n \n \n tinytable_awnqmmxybhlb3tswdo7q\n \n \n \n \n \n\n \n \n \n \n \n \n Gluc\n Group\n \n \n \n \n \n 7.2\n DM \n \n \n 5.1\n Healthy\n \n \n 5.9\n Healthy\n \n \n 4.7\n Healthy\n \n \n 11.1\n DM" + }, + { + "objectID": "slides/01_uvod/pres.html#solution-before-and-after", + "href": "slides/01_uvod/pres.html#solution-before-and-after", + "title": "Introduction to Statistics", + "section": "Solution: before and after", + "text": "Solution: before and after\n\n\n \n\n \n \n \n tinytable_0duqiqexugsgoosgpgmr\n \n \n \n \n \n\n \n \n \n \n \n \n gluc_pre\n gluc_post\n \n \n \n \n \n 7.2\n 6.1\n \n \n 5.1\n 5.1\n \n \n 5.9\n 5.5\n \n \n 4.7\n 5.9\n \n \n 11.1\n 7.1" + }, + { + "objectID": "slides/01_uvod/pres.html#solution-measurement-series", + "href": "slides/01_uvod/pres.html#solution-measurement-series", + "title": "Introduction to Statistics", + "section": "Solution: measurement series", + "text": "Solution: measurement series\nVariant 1:\n\n\n \n\n \n \n \n tinytable_eipoe94xpr3evcau67tu\n \n \n \n \n \n\n \n \n \n \n \n \n ID\n CRP\n Time\n \n \n \n \n \n 1\n 0.62\n 1h \n \n \n 1\n 0.51\n 12h\n \n \n 1\n 0.56\n 24h\n \n \n 2\n 0.43\n 1h \n \n \n 2\n 0.42\n 12h\n \n \n \n \n\n \n\n \n\n\n\n\nVariant 2:\n\n\n \n\n \n \n \n tinytable_qn56ewilg4ht0ye3lz5t\n \n \n \n \n \n\n \n \n \n \n \n \n ID\n CRP_1h\n CRP_12h\n CRP_24h\n \n \n \n \n \n 1\n 0.70\n 0.67\n 0.54\n \n \n 2\n 0.66\n 0.41\n 0.59\n \n \n 3\n 0.76\n 0.49\n 0.53" + }, + { + "objectID": "slides/01_uvod/pres.html#missing-data", + "href": "slides/01_uvod/pres.html#missing-data", + "title": "Introduction to Statistics", + "section": "Missing data", + "text": "Missing data\n\n\n \n\n \n \n \n tinytable_nglif5ht8zz3fubll4v9\n \n \n \n \n \n\n \n \n \n \n \n \n patient\n intervention\n outcome\n \n \n \n \n \n Doe Jones \n 1\n 7\n \n \n NA \n 2\n 10\n \n \n NA \n 3\n NA\n \n \n Mary Smith\n 1\n 4\n \n \n \n \n\n \n\n \n\n\n\n\n\nLeave blank (possible errors)\nEnter NA" + }, + { + "objectID": "slides/06_hipoteze/prezentacija.html#tri-cilja-statistike", + "href": "slides/06_hipoteze/prezentacija.html#tri-cilja-statistike", + "title": "Testiranje hipoteza o populacionim prosečnim vrednosima i proporcijama", + "section": "Tri cilja statistike", + "text": "Tri cilja statistike\n\nOpis podataka\nObjašnjenje (uzroka) podataka\n\nOdlučivanje\n\nPredviđanje" + }, + { + "objectID": "slides/06_hipoteze/prezentacija.html#statističko-testiranje-nultih-hipoteza", + "href": "slides/06_hipoteze/prezentacija.html#statističko-testiranje-nultih-hipoteza", + "title": "Testiranje hipoteza o populacionim prosečnim vrednosima i proporcijama", + "section": "Statističko testiranje nultih hipoteza", + "text": "Statističko testiranje nultih hipoteza\n\nBitno za razumevanje naučnih radova\nNeintuitivno je \\(\\rightarrow\\) neshvaćeno\nKorisno u kontekstu" + }, + { + "objectID": "slides/06_hipoteze/prezentacija.html#načinite-svoje-teorije-složenim", + "href": "slides/06_hipoteze/prezentacija.html#načinite-svoje-teorije-složenim", + "title": "Testiranje hipoteza o populacionim prosečnim vrednosima i proporcijama", + "section": "Načinite svoje teorije složenim", + "text": "Načinite svoje teorije složenim\n\n\n\n“Ukoliko naučna tvrdnja govori o realnosti, onda mora biti opovrgljiva: a ukoliko nije opovrgljiva, ona onda ne govori o stvarnosti.\n\n― Karl R. Popper, Logika naučnog otkrića (1934)\n\n\n\n\nKarl Popper" + }, + { + "objectID": "slides/06_hipoteze/prezentacija.html#kako-naučnici-razmisljaju", + "href": "slides/06_hipoteze/prezentacija.html#kako-naučnici-razmisljaju", + "title": "Testiranje hipoteza o populacionim prosečnim vrednosima i proporcijama", + "section": "Kako naučnici razmisljaju?", + "text": "Kako naučnici razmisljaju?\n\n\\(H\\): Da li su više vrednosti serumske glukoze povezane sa brojem akni?\n\n\nIzmerimo glukozu i prebrojimo akne.\nDa li su akne češće (verovatnije) sa višim vrednostima glukoze i ostalim infomacijma koje posedujemo?" + }, + { + "objectID": "slides/06_hipoteze/prezentacija.html#a-statističari", + "href": "slides/06_hipoteze/prezentacija.html#a-statističari", + "title": "Testiranje hipoteza o populacionim prosečnim vrednosima i proporcijama", + "section": "…a statističari?", + "text": "…a statističari?\n\nMeđutim, zbog istorijskih razloga…\n\n\nIzvrnemo našu hipotezu: Više vrednosti serumske glukoze nisu povezane sa brojem akni.\nPretpostavimo da je izvrnuta hipoteza (1) istinita.\nProcenimo koliko su podaci koje smo dobili verovatni ako je (2) tačno.\nAko su podaci malo verovatni, zaključimo da je (2) pogrešno; ali ako su podaci verovatni, zadržimo (2)." + }, + { + "objectID": "slides/06_hipoteze/prezentacija.html#recept-za-testiranje-nulte-hipoteze", + "href": "slides/06_hipoteze/prezentacija.html#recept-za-testiranje-nulte-hipoteze", + "title": "Testiranje hipoteza o populacionim prosečnim vrednosima i proporcijama", + "section": "Recept za testiranje nulte hipoteze", + "text": "Recept za testiranje nulte hipoteze\n\nFormiranje hipoteze koja predstavlja naše mišljenje (pre nego što smo videli podatke)\nOdređivanje nulte i alternativne hipoteze\nPrikupljanje podataka relevantnih za našu hipotezu\nNapraviti model koji predstavlja podatke i izračunati test statistiku\nIzračunati verovatnoću da naši podaci daju dobijenu test statistiku ako je nulta hipoteza tačna\nProceniti “statističku značajnost”" + }, + { + "objectID": "slides/06_hipoteze/prezentacija.html#da-li-je-bmi-povezan-sa-fizičkom-aktivnošću", + "href": "slides/06_hipoteze/prezentacija.html#da-li-je-bmi-povezan-sa-fizičkom-aktivnošću", + "title": "Testiranje hipoteza o populacionim prosečnim vrednosima i proporcijama", + "section": "Da li je BMI povezan sa fizičkom aktivnošću?", + "text": "Da li je BMI povezan sa fizičkom aktivnošću?\n\n\n \n\n \n \n \n tinytable_c88d3pmi7w8ppj6bopih\n \n \n \n \n \n\n \n \n \n \n \n \n Pol\n Starost\n Masa\n Visina\n BMI\n Aktivan\n \n \n \n \n \n male \n 34\n 87.4\n 164.7\n 32.22\n No \n \n \n male \n 34\n 87.4\n 164.7\n 32.22\n No \n \n \n male \n 34\n 87.4\n 164.7\n 32.22\n No \n \n \n female\n 49\n 86.7\n 168.4\n 30.57\n No \n \n \n female\n 45\n 75.7\n 166.7\n 27.24\n Yes\n \n \n female\n 45\n 75.7\n 166.7\n 27.24\n Yes\n \n \n \n \n\n \n\n \n\n\n\n\n\\[ BMI = \\frac{masa(kg)}{visina(m)^2} \\]" + }, + { + "objectID": "slides/06_hipoteze/prezentacija.html#korak-1-formulisanje-hipoteze", + "href": "slides/06_hipoteze/prezentacija.html#korak-1-formulisanje-hipoteze", + "title": "Testiranje hipoteza o populacionim prosečnim vrednosima i proporcijama", + "section": "Korak 1: Formulisanje hipoteze", + "text": "Korak 1: Formulisanje hipoteze\nPretpostavljamo da je \\(BMI\\) veći kod ljudi koji se ne bave fizičkom aktivnošću, u poređenju sa onima koji to rade." + }, + { + "objectID": "slides/06_hipoteze/prezentacija.html#korak-2-definisanje-nulte-i-alternativne-hipoteze", + "href": "slides/06_hipoteze/prezentacija.html#korak-2-definisanje-nulte-i-alternativne-hipoteze", + "title": "Testiranje hipoteza o populacionim prosečnim vrednosima i proporcijama", + "section": "Korak 2: Definisanje nulte i alternativne hipoteze", + "text": "Korak 2: Definisanje nulte i alternativne hipoteze\nKako očekujemo da će izgledati podaci ako nema nikakvog efekta.\n\\[ H_0: BMI_{aktivni} = BMI_{neaktivni} \\]\nOdgovarajuća alternativna hipoteza je onda:\n\\[ H_1: BMI_{aktivni} \\not = BMI_{neaktivni} \\]" + }, + { + "objectID": "slides/06_hipoteze/prezentacija.html#korak-3-prikupiti-podatke", + "href": "slides/06_hipoteze/prezentacija.html#korak-3-prikupiti-podatke", + "title": "Testiranje hipoteza o populacionim prosečnim vrednosima i proporcijama", + "section": "Korak 3: Prikupiti podatke", + "text": "Korak 3: Prikupiti podatke\n\n\n \n\n \n \n \n tinytable_qxfynxks18dw26xx4hmm\n \n \n \n \n \n\n \n \n \n \n \n \n Aktivan\n N\n Aritmetička sredina\n sd\n \n \n \n \n \n No \n 3631\n 29.43\n 7.27\n \n \n Yes\n 4619\n 27.10\n 6.18" + }, + { + "objectID": "slides/06_hipoteze/prezentacija.html#korak-4-opisati-podatke-modelom-i-izračunati-test-statistiku", + "href": "slides/06_hipoteze/prezentacija.html#korak-4-opisati-podatke-modelom-i-izračunati-test-statistiku", + "title": "Testiranje hipoteza o populacionim prosečnim vrednosima i proporcijama", + "section": "Korak 4: Opisati podatke modelom i izračunati test-statistiku", + "text": "Korak 4: Opisati podatke modelom i izračunati test-statistiku\nOdređivanje da li imamo dovoljno dokaza za \\(H1\\) kada poredimo aritmetičke sredine se radi uz pomoć Studentovog t-testa.\n\n\\[ t = \\frac{\\bar x_1 - \\bar x_2}{ SE(\\bar x_1 - \\bar x_2) } \\] gde je: \\(x\\) aritmetička sredina; \\(SE\\), standardna greška razlike arit. sredine." + }, + { + "objectID": "slides/06_hipoteze/prezentacija.html#section-2", + "href": "slides/06_hipoteze/prezentacija.html#section-2", + "title": "Testiranje hipoteza o populacionim prosečnim vrednosima i proporcijama", + "section": "", + "text": "William Sealy Gosset (1876-1937)" + }, + { + "objectID": "slides/06_hipoteze/prezentacija.html#korak-5-odrediti-verovatnoću-opserviranih-podataka-ako-je-nulta-tačna", + "href": "slides/06_hipoteze/prezentacija.html#korak-5-odrediti-verovatnoću-opserviranih-podataka-ako-je-nulta-tačna", + "title": "Testiranje hipoteza o populacionim prosečnim vrednosima i proporcijama", + "section": "Korak 5: Odrediti verovatnoću opserviranih podataka ako je nulta tačna", + "text": "Korak 5: Odrediti verovatnoću opserviranih podataka ako je nulta tačna\n\nt.test(BMI ~ Aktivan, data = nhanes)\n\n\n Welch Two Sample t-test\n\ndata: BMI by Aktivan\nt = 15.427, df = 7121.5, p-value < 2.2e-16\nalternative hypothesis: true difference in means between group No and group Yes is not equal to 0\n95 percent confidence interval:\n 2.035247 2.627778\nsample estimates:\n mean in group No mean in group Yes \n 29.43069 27.09918" + }, + { + "objectID": "slides/06_hipoteze/prezentacija.html#studentova-t-distribucija", + "href": "slides/06_hipoteze/prezentacija.html#studentova-t-distribucija", + "title": "Testiranje hipoteza o populacionim prosečnim vrednosima i proporcijama", + "section": "Studentova t-distribucija", + "text": "Studentova t-distribucija" + }, + { + "objectID": "slides/06_hipoteze/prezentacija.html#korak-6-proceniti-statističku-značajnost", + "href": "slides/06_hipoteze/prezentacija.html#korak-6-proceniti-statističku-značajnost", + "title": "Testiranje hipoteza o populacionim prosečnim vrednosima i proporcijama", + "section": "Korak 6: Proceniti “statističku značajnost”", + "text": "Korak 6: Proceniti “statističku značajnost”\nKoliko dokaza nam treba da budemo ubeđeni da razlika postoji?\n\nPoslednji korak\nKontroverzan\nNema “tačan” odgovor\n\nKonvencionalna vrednost od \\(p<0.05\\) je istorijski artefakt koji garantuje da ćemo pogrešno zaključiti u 5% slučajeva." + }, + { + "objectID": "slides/06_hipoteze/prezentacija.html#testiranje-hipoteza-kao-odlučivanje-neyman-pearsonov-pristup", + "href": "slides/06_hipoteze/prezentacija.html#testiranje-hipoteza-kao-odlučivanje-neyman-pearsonov-pristup", + "title": "Testiranje hipoteza o populacionim prosečnim vrednosima i proporcijama", + "section": "Testiranje hipoteza kao odlučivanje: Neyman-Pearsonov pristup", + "text": "Testiranje hipoteza kao odlučivanje: Neyman-Pearsonov pristup\n\n\n \n\n \n \n \n tinytable_a3x1yubug5xhcra9ksma\n \n \n \n \n \n\n \n \n \n \n \n \n Odluka\n $H_0$ istina\n $H_0$ neistina\n \n \n \n \n \n Odbacivanje \\(H_0\\)\n Greška prvog tipa ($\\alpha$)\n Ispravan zakljucak\n($1-\\alpha =$ nivo poverenja)\n \n \n Neodbacivanje \\(H_0\\)\n Ispravan zakljucak\n($1-\\beta =$ snaga testa)\n Greska drugog tipa ($\\beta$)" + }, + { + "objectID": "slides/06_hipoteze/prezentacija.html#snaga-testa-1-beta", + "href": "slides/06_hipoteze/prezentacija.html#snaga-testa-1-beta", + "title": "Testiranje hipoteza o populacionim prosečnim vrednosima i proporcijama", + "section": "Snaga testa (\\(1-\\beta\\))", + "text": "Snaga testa (\\(1-\\beta\\))" + }, + { + "objectID": "slides/06_hipoteze/prezentacija.html#da-li-to-znači-da-je-verovatnoća-da-je-h_0-tačna-0.01", + "href": "slides/06_hipoteze/prezentacija.html#da-li-to-znači-da-je-verovatnoća-da-je-h_0-tačna-0.01", + "title": "Testiranje hipoteza o populacionim prosečnim vrednosima i proporcijama", + "section": "Da li to znači da je verovatnoća da je \\(H_0\\) tačna 0.01?", + "text": "Da li to znači da je verovatnoća da je \\(H_0\\) tačna 0.01?\n\nNe. P-vrednost je verovatnoća podataka ako pretpostavimo da je nulta hipoteza tačna (\\(P(podaci|H_0)\\)). Nema nikakve veze sa obrnutom tvrdjom tačnosti nulte ako opserviramo podatke (\\(P(H_0|podaci)\\))." + }, + { + "objectID": "slides/06_hipoteze/prezentacija.html#da-li-je-to-verovatnoća-da-ćemo-napraviti-grešku-u-zaključivanju-od-0.01-1", + "href": "slides/06_hipoteze/prezentacija.html#da-li-je-to-verovatnoća-da-ćemo-napraviti-grešku-u-zaključivanju-od-0.01-1", + "title": "Testiranje hipoteza o populacionim prosečnim vrednosima i proporcijama", + "section": "Da li je to verovatnoća da ćemo napraviti grešku u zaključivanju od 0.01 (1%)?", + "text": "Da li je to verovatnoća da ćemo napraviti grešku u zaključivanju od 0.01 (1%)?\n\nNe. To je opet \\(P(H_0|podaci)\\), p-vrednosti se odnose na verovatnoću podataka, ne na verovatnoće hipoteza." + }, + { + "objectID": "slides/06_hipoteze/prezentacija.html#da-li-to-znači-da-ako-ponovimo-studiju-šansa-da-dobijmo-isti-rezultat-je-99", + "href": "slides/06_hipoteze/prezentacija.html#da-li-to-znači-da-ako-ponovimo-studiju-šansa-da-dobijmo-isti-rezultat-je-99", + "title": "Testiranje hipoteza o populacionim prosečnim vrednosima i proporcijama", + "section": "Da li to znači da ako ponovimo studiju šansa da dobijmo isti rezultat je 99%?", + "text": "Da li to znači da ako ponovimo studiju šansa da dobijmo isti rezultat je 99%?\n\nNe. P-vrednost je tvrdnja verovatnosti trenutnih podataka ako uzmemo da je nulta hipoteza tačna. Ne dozvoljava nam da pravimo tvrdnje o budućim replikacijama." + }, + { + "objectID": "slides/06_hipoteze/prezentacija.html#da-li-niska-p-vrednost-znači-da-smo-našli-klinički-bitan-efekat", + "href": "slides/06_hipoteze/prezentacija.html#da-li-niska-p-vrednost-znači-da-smo-našli-klinički-bitan-efekat", + "title": "Testiranje hipoteza o populacionim prosečnim vrednosima i proporcijama", + "section": "Da li niska p-vrednost znači da smo našli klinički bitan efekat?", + "text": "Da li niska p-vrednost znači da smo našli klinički bitan efekat?\n\nNe. To što je nešto statistički značajno nam ne govori ništa o jačini efekta. Sa dovoljno velikim uzorkom lako je otkriti statistički značajne, ali sitne efekte." + }, + { + "objectID": "slides/06_hipoteze/prezentacija.html#formalan-prikaz-odnosa-grešaka", + "href": "slides/06_hipoteze/prezentacija.html#formalan-prikaz-odnosa-grešaka", + "title": "Testiranje hipoteza o populacionim prosečnim vrednosima i proporcijama", + "section": "Formalan prikaz odnosa grešaka", + "text": "Formalan prikaz odnosa grešaka" + }, + { + "objectID": "slides/06_hipoteze/prezentacija.html#šta-utiče-na-snagu", + "href": "slides/06_hipoteze/prezentacija.html#šta-utiče-na-snagu", + "title": "Testiranje hipoteza o populacionim prosečnim vrednosima i proporcijama", + "section": "Šta utiče na snagu?", + "text": "Šta utiče na snagu?\nSnaga zavisi od:\n\nOdabranog nivoa značajnosti (α nivo)\nVeličine uzorka\nFormulacije \\(H_1\\) kao dvosmerne ili jednosmerne\nStvarne razlike ispitivane pojave (effect size)" + }, + { + "objectID": "slides/06_hipoteze/prezentacija.html#uslovi-primene-t-testa", + "href": "slides/06_hipoteze/prezentacija.html#uslovi-primene-t-testa", + "title": "Testiranje hipoteza o populacionim prosečnim vrednosima i proporcijama", + "section": "Uslovi primene t-testa", + "text": "Uslovi primene t-testa\n\nSlučajno biran uzorak\nNumerički podaci\nNormalna raspodela u populaciji" + }, + { + "objectID": "slides/06_hipoteze/prezentacija.html#izbor-statističkog-testa-1", + "href": "slides/06_hipoteze/prezentacija.html#izbor-statističkog-testa-1", + "title": "Testiranje hipoteza o populacionim prosečnim vrednosima i proporcijama", + "section": "Izbor statističkog testa (1)", + "text": "Izbor statističkog testa (1)\n\n\nStatistički testovi su:\n\nKao roboti\nMoćni\nNisu mudri\nOpasni\nUske kontekstualne primene" + }, + { + "objectID": "slides/06_hipoteze/prezentacija.html#izbor-statističkog-testa-2", + "href": "slides/06_hipoteze/prezentacija.html#izbor-statističkog-testa-2", + "title": "Testiranje hipoteza o populacionim prosečnim vrednosima i proporcijama", + "section": "Izbor statističkog testa (2)", + "text": "Izbor statističkog testa (2)\n\n\nIzbor statističkog testa zavisi od:\n\nTipa podataka\nDizajna studije\n\nNezavisni ili zavisni\n\nBroja uzoraka\nRaspodele podataka\n\nParametarski (neparametarski)" + }, + { + "objectID": "slides/06_hipoteze/prezentacija.html#verzije-studentovog-t-testa", + "href": "slides/06_hipoteze/prezentacija.html#verzije-studentovog-t-testa", + "title": "Testiranje hipoteza o populacionim prosečnim vrednosima i proporcijama", + "section": "Verzije Studentovog t-testa", + "text": "Verzije Studentovog t-testa\n\nStudentov t-test za jedan uzorak\nStudentov t-test za dva nezavisna uzorka\nStudentov t-test za dva zavisna uzorka" + }, + { + "objectID": "slides/06_hipoteze/prezentacija.html#vežba-studentov-t-test-za-jedan-uzorak", + "href": "slides/06_hipoteze/prezentacija.html#vežba-studentov-t-test-za-jedan-uzorak", + "title": "Testiranje hipoteza o populacionim prosečnim vrednosima i proporcijama", + "section": "Vežba: Studentov t-test za jedan uzorak", + "text": "Vežba: Studentov t-test za jedan uzorak\n\nNa osnovu prethodnih istraživanja očekivana\naritmetička sredina iznosi 145 mmHg.\nDa li populacija iz koje potiče uzorak u\nbazi Sistolna TA.xlsx ima\naritmetičku sredinu jednaku očekivanoj?\nTestirati na nivou značajnosti od 0.05." + }, + { + "objectID": "slides/06_hipoteze/prezentacija.html#vežba-studentov-t-test-za-dva-nezavisna-uzorka", + "href": "slides/06_hipoteze/prezentacija.html#vežba-studentov-t-test-za-dva-nezavisna-uzorka", + "title": "Testiranje hipoteza o populacionim prosečnim vrednosima i proporcijama", + "section": "Vežba: Studentov t-test za dva nezavisna uzorka", + "text": "Vežba: Studentov t-test za dva nezavisna uzorka\n\nDa li se ukupan holesterol u bazi DZ.xlsx\nrazlikuje kod pušača i nepušača? Testirati na\nnivou značajnosti od 0.01." + }, + { + "objectID": "slides/06_hipoteze/prezentacija.html#nameštanje-p-vrednosti", + "href": "slides/06_hipoteze/prezentacija.html#nameštanje-p-vrednosti", + "title": "Testiranje hipoteza o populacionim prosečnim vrednosima i proporcijama", + "section": "Nameštanje p-vrednosti", + "text": "Nameštanje p-vrednosti\n\n\n\nInstitucionalni problem\nManjak edukacije\nProblem višestrukog testiranja\n“Vidi da li ima značajne razlike…”\n“Smislićemo hipotezu kad vidimo kakva je baza…”" + }, + { + "objectID": "slides/06_hipoteze/prezentacija.html#možemo-da-pročitamo-rad", + "href": "slides/06_hipoteze/prezentacija.html#možemo-da-pročitamo-rad", + "title": "Testiranje hipoteza o populacionim prosečnim vrednosima i proporcijama", + "section": "Možemo da pročitamo rad", + "text": "Možemo da pročitamo rad" + }, + { + "objectID": "slides/06_hipoteze/prezentacija.html#struktura-kursa", + "href": "slides/06_hipoteze/prezentacija.html#struktura-kursa", + "title": "Testiranje hipoteza o populacionim prosečnim vrednosima i proporcijama", + "section": "Struktura kursa", + "text": "Struktura kursa\n\n\n \n\n \n \n \n tinytable_9dsg0cq6qpkictti60t7\n \n \n \n \n \n\n \n \n \n \n \n \n Nedelja\n Tema\n \n \n \n \n \n 1\n Uvod u medicinsku statistiku \n \n \n 2\n Sređivanje podataka \n \n \n 3\n Statističko opisivanje podataka \n \n \n 4\n Verovatnoća i raspodele verovatnoća \n \n \n 5\n Populacija i uzorak \n \n \n 6\n Testiranje hipoteza o populacionim prosečnim vrednostima i proporcijama\n \n \n 7\n Testiranje hipoteza o učestalostima \n \n \n 8\n Testiranje hipoteza o rangovima \n \n \n 9\n Korelacija \n \n \n 10\n Regresija / Kolokvijum \n \n \n 11\n Podaci, informacije i znanje \n \n \n 12\n Zdravstveni informacioni sistem \n \n \n 13\n Mere dijagnostičke tačnosti \n \n \n 14\n Medicinsko odlučivanje \n \n \n 15\n Bioinformatika" + }, + { + "objectID": "slides/04_verovatnoca/pres.html#de-mérés-problem", + "href": "slides/04_verovatnoca/pres.html#de-mérés-problem", + "title": "A short introduction to probability", + "section": "de Méré’s problem", + "text": "de Méré’s problem\n\n\n\n\n\nPierre de Fermat\n\n\n\n\n\n\nBlaise Pascal" + }, + { + "objectID": "slides/04_verovatnoca/pres.html#the-need-for-probability-theory", + "href": "slides/04_verovatnoca/pres.html#the-need-for-probability-theory", + "title": "A short introduction to probability", + "section": "The need for probability theory", + "text": "The need for probability theory\n\n\nProbability as an extension of Aristotle’s logic.\nWe get to talk about the (un)certainty of belief." + }, + { + "objectID": "slides/04_verovatnoca/pres.html#basic-terms-in-probability-theory", + "href": "slides/04_verovatnoca/pres.html#basic-terms-in-probability-theory", + "title": "A short introduction to probability", + "section": "Basic terms in probability theory", + "text": "Basic terms in probability theory\n\nExperiment\n\nAn activity that produces an outcome (choosing a new path to test if it is faster than the old one).\n\n\n\\[ \\text{Experiment} \\rightarrow \\text{Outcome} \\]\n\nSample space\n\nThe set of all possible outcomes of an experiment.\n\n\n\\[ \\text{Dice sample space:} \\; \\omega = \\{1,2,3,4,5,6\\} \\]\n\nEvent\n\nA subset of the outcome space.\n\n\n\\[ \\text{Dice roll event} \\; x = 6 \\]" + }, + { + "objectID": "slides/04_verovatnoca/pres.html#types-of-events", + "href": "slides/04_verovatnoca/pres.html#types-of-events", + "title": "A short introduction to probability", + "section": "Types of events", + "text": "Types of events\nAn event is a set of possible outcomes, and can be:\n\nDeterministic (e.g. Vitamin C deficiency \\(\\rightarrow\\) Scurvy)\nRandom (stochastic)\n\nThe sample space of (elementary) outcomes \\(\\omega\\) is a set of all possible outcomes.\n\\[ \\omega = \\{A, B\\, O, AB\\} \\; \\; \\; \\omega = \\{\\text{healthy}, \\text{sick}\\} \\]" + }, + { + "objectID": "slides/04_verovatnoca/pres.html#somatic-or-germline-mutations", + "href": "slides/04_verovatnoca/pres.html#somatic-or-germline-mutations", + "title": "A short introduction to probability", + "section": "Somatic or germline mutations", + "text": "Somatic or germline mutations" + }, + { + "objectID": "slides/04_verovatnoca/pres.html#definition-of-probability", + "href": "slides/04_verovatnoca/pres.html#definition-of-probability", + "title": "A short introduction to probability", + "section": "Definition of probability", + "text": "Definition of probability\n\nProbability is a measure of expectation\nof some random event.\n\n\nA random event = the result of a process that we don’t know how it works. Measure, process by which I add a number to something (meter and distance, knowledge and grades)." + }, + { + "objectID": "slides/04_verovatnoca/pres.html#expectation-is-more-general-than-the-mean", + "href": "slides/04_verovatnoca/pres.html#expectation-is-more-general-than-the-mean", + "title": "A short introduction to probability", + "section": "Expectation is more general than the mean", + "text": "Expectation is more general than the mean\n\n\n\n\n\n\n\n\n\n\n\n\n\n\nNote\n\n\nExpectations are everywhere in medicine: survival, time to recovery after taking the drug, lab. tests (markers, biochemical parameters, eGFR), etc.\n\n\n\n\n\nThe expected value does not have to be the most common (mode), nor does it does have to coincide with everyday use. It doesn’t even have to be a value that can happen to be 3.5 on a 6-sided die." + }, + { + "objectID": "slides/04_verovatnoca/pres.html#law-of-large-numbers", + "href": "slides/04_verovatnoca/pres.html#law-of-large-numbers", + "title": "A short introduction to probability", + "section": "Law of large numbers", + "text": "Law of large numbers" + }, + { + "objectID": "slides/04_verovatnoca/pres.html#how-do-we-determine-probability", + "href": "slides/04_verovatnoca/pres.html#how-do-we-determine-probability", "title": "A short introduction to probability", "section": "How do we determine probability?", "text": "How do we determine probability?\n\nObjective\n\nTheoretical (mathematical)\nEmpirical (statistical)\n\nSubjective\n\nBelief" @@ -1029,11 +1820,11 @@ "text": "Laws of probability: multiplication\nMultiplication of exclusive events.\n\n\\[ P(A \\cap B) = P(A) \\times P(B) \\]" }, { - "objectID": "slides/04_verovatnoca/pres.html#probability-of-dependent-conditional-events", - "href": "slides/04_verovatnoca/pres.html#probability-of-dependent-conditional-events", + "objectID": "slides/04_verovatnoca/pres.html#conditional-probability", + "href": "slides/04_verovatnoca/pres.html#conditional-probability", "title": "A short introduction to probability", - "section": "Probability of dependent (conditional) events", - "text": "Probability of dependent (conditional) events\n\n\\[ P(A \\cap B) = P(A) \\times P(B|A) = P(B) \\times P(A|B) \\]" + "section": "Conditional probability", + "text": "Conditional probability\n\n\\[ P(A \\cap B) = P(A) \\times P(B|A) = P(B) \\times P(A|B) \\]" }, { "objectID": "slides/04_verovatnoca/pres.html#probability-in-diagnostics", @@ -1078,11 +1869,11 @@ "text": "Binomial distribution\n\n\nConditions:\n\nExclusive events\nConstant probability\nIndependent\n\n\nThe binomial probability is given by:\n\\[ P(X = x) = \\frac{n!}{x!(n-x)!}p^{x}q^{n-x} \\]" }, { - "objectID": "slides/04_verovatnoca/pres.html#task-1", - "href": "slides/04_verovatnoca/pres.html#task-1", + "objectID": "slides/04_verovatnoca/pres.html#exercise-1", + "href": "slides/04_verovatnoca/pres.html#exercise-1", "title": "A short introduction to probability", - "section": "Task 1", - "text": "Task 1\n\nThe frequency of hypertension in the population over 65 years old is 42%.\nWhat is the probability that in a random sample of size 7 people,\nchosen from that same population, two people have hypertension?" + "section": "Exercise 1", + "text": "Exercise 1\n\nThe frequency of hypertension in the population over 65 years old is 42%.\nWhat is the probability that two people with hypertension will be in a\nrandom sample of 7 people chosen from that same population?" }, { "objectID": "slides/04_verovatnoca/pres.html#why-is-the-normal-distribution-frequent", @@ -1120,11 +1911,11 @@ "text": "Student’s t-distribution\n\n\n100 god stara.Varijabilitet populacije nespoznat, pa cemo uzeti iz uzorka, sto dodaje jos nesigurnosti. Za svaki stepen slobode (koliko informacija smo iskoristili da procenimo variabilitet) postoji posebna t-distribucija. t-dist se priblizava z-dist za beskonacno stepena slobode." }, { - "objectID": "slides/04_verovatnoca/pres.html#hi-kvadratna-distribucija", - "href": "slides/04_verovatnoca/pres.html#hi-kvadratna-distribucija", + "objectID": "slides/04_verovatnoca/pres.html#chi-square-distribution", + "href": "slides/04_verovatnoca/pres.html#chi-square-distribution", "title": "A short introduction to probability", - "section": "Hi-kvadratna distribucija", - "text": "Hi-kvadratna distribucija\n\n\nUzorci iz Z-dist2 (postaju pozitivni) i to postane hi-kvadrat. (sum of square deviations) / (pop. variance) -> kako idu df inf hi postaje z. F dist. (dist of ratio of two variances)" + "section": "Chi-square distribution", + "text": "Chi-square distribution\n\n\nUzorci iz Z-dist2 (postaju pozitivni) i to postane hi-kvadrat. (sum of square deviations) / (pop. variance) -> kako idu df inf hi postaje z. F dist. (dist of ratio of two variances)" }, { "objectID": "slides/04_verovatnoca/pres.html#section", @@ -1148,368 +1939,304 @@ "text": "Probability calculation: normal distribution" }, { - "objectID": "slides/04_verovatnoca/pres.html#basic-terms-in-probability-theory", - "href": "slides/04_verovatnoca/pres.html#basic-terms-in-probability-theory", - "title": "A short introduction to probability", - "section": "Basic terms in probability theory", - "text": "Basic terms in probability theory\n\nExperiment\n\nAn activity that produces an outcome (choosing a new path to test if it is faster than the old one).\n\n\n\\[ \\text{Experiment} \\rightarrow \\text{Outcome} \\]\n\nSample space\n\nThe set of all possible outcomes of an experiment.\n\n\n\\[ \\text{Dice sample space:} \\; \\omega = \\{1,2,3,4,5,6\\} \\]\n\nEvent\n\nA subset of the outcome space.\n\n\n\\[ \\text{Dice roll event} \\; x = 6 \\]" - }, - { - "objectID": "slides/04_verovatnoca/pres.html#law-of-large-numbers", - "href": "slides/04_verovatnoca/pres.html#law-of-large-numbers", - "title": "A short introduction to probability", - "section": "Law of large numbers", - "text": "Law of large numbers" - }, - { - "objectID": "slides/04_verovatnoca/pres.html#conditional-probability", - "href": "slides/04_verovatnoca/pres.html#conditional-probability", - "title": "A short introduction to probability", - "section": "Conditional probability", - "text": "Conditional probability\n\n\\[ P(A \\cap B) = P(A) \\times P(B|A) = P(B) \\times P(A|B) \\]" - }, - { - "objectID": "slides/04_verovatnoca/pres.html#exercise-1", - "href": "slides/04_verovatnoca/pres.html#exercise-1", - "title": "A short introduction to probability", - "section": "Exercise 1", - "text": "Exercise 1\n\nThe frequency of hypertension in the population over 65 years old is 42%.\nWhat is the probability that two people with hypertension will be in a\nrandom sample of 7 people chosen from that same population?" - }, - { - "objectID": "slides/04_verovatnoca/pres.html#chi-square-distribution", - "href": "slides/04_verovatnoca/pres.html#chi-square-distribution", - "title": "A short introduction to probability", - "section": "Chi-square distribution", - "text": "Chi-square distribution\n\n\nUzorci iz Z-dist2 (postaju pozitivni) i to postane hi-kvadrat. (sum of square deviations) / (pop. variance) -> kako idu df inf hi postaje z. F dist. (dist of ratio of two variances)" - }, - { - "objectID": "slides/05_uzorak/prezentacija.html#section", - "href": "slides/05_uzorak/prezentacija.html#section", - "title": "Populacija i uzorak", + "objectID": "slides/02_sredjivanje/prezentacija.html#section", + "href": "slides/02_sredjivanje/prezentacija.html#section", + "title": "Sređivanje podataka", "section": "", - "text": "The Central Limit Theorem is important for statistics because it allows us to safely assume that the sampling distribution of the mean will be normal in most cases. This means that we can take advantage of statistical techniques that assume a normal distribution" - }, - { - "objectID": "slides/05_uzorak/prezentacija.html#title", - "href": "slides/05_uzorak/prezentacija.html#title", - "title": "Populacija i uzorak", - "section": "Title", - "text": "Title\n\nThe Central Limit Theorem is important for statistics because it allows us to safely assume that the sampling distribution of the mean will be normal in most cases. This means that we can take advantage of statistical techniques that assume a normal distribution" - }, - { - "objectID": "slides/05_uzorak/prezentacija.html#generalizacija", - "href": "slides/05_uzorak/prezentacija.html#generalizacija", - "title": "Populacija i uzorak", - "section": "Generalizacija", - "text": "Generalizacija\nSaznanje o celoj populaciji bez da smo ih videli.\n\n\n \n\n \n \n \n tinytable_u2089o5pdku3mq3sxdjm\n \n \n \n \n \n\n \n \n \n \n \n \n Intervencija\n Mortalitet\n Ukupno\n Stopa smrtnosti (%)\n 95% IP (%)\n \n \n \n \n \n Agresivna terapija \n 92\n 439\n 21.0\n 17.24 - 25.07\n \n \n Manje agresivna terapija\n 81\n 446\n 18.2\n 14.69 - 22.06\n \n \n \n \n\n \n\n \n\n\n\n\n\n\n\n\n\n%%{ init: { 'flowchart': { 'curve': 'monotoneX' } } }%%\n\nflowchart TD\n A[Ciljna populacija] --> B[\"Uzoračka populacija\"]\n B --> C[Uzorak]\n C --\"Zaključak\"--> A" - }, - { - "objectID": "slides/05_uzorak/prezentacija.html#interval-poverenja-i-tačkasta-procena", - "href": "slides/05_uzorak/prezentacija.html#interval-poverenja-i-tačkasta-procena", - "title": "Populacija i uzorak", - "section": "Interval poverenja i tačkasta procena", - "text": "Interval poverenja i tačkasta procena\n\\[ CI = \\bar x \\pm t \\times SE \\]\ngde je: \\(\\bar x\\), aritmetička sredina; \\(t\\), kritična vrednost; \\(SE\\), standardna greška." + "text": "Grupisanje je proces organizovanja podataka." }, { - "objectID": "slides/05_uzorak/prezentacija.html#interval-poverenja", - "href": "slides/05_uzorak/prezentacija.html#interval-poverenja", - "title": "Populacija i uzorak", - "section": "95% interval poverenja", - "text": "95% interval poverenja" + "objectID": "slides/02_sredjivanje/prezentacija.html#formalna-definicija", + "href": "slides/02_sredjivanje/prezentacija.html#formalna-definicija", + "title": "Sređivanje podataka", + "section": "Formalna definicija", + "text": "Formalna definicija\n\n\\(f_{abs} = \\frac{\\#n}{\\text{interval}}\\)\n\\(f_{rel} = \\frac{f_{abs}}{\\text{Ukupan broj podataka}} \\%\\)" }, { - "objectID": "slides/05_uzorak/prezentacija.html#vežba-uzorkovanje", - "href": "slides/05_uzorak/prezentacija.html#vežba-uzorkovanje", - "title": "Populacija i uzorak", - "section": "Vežba: uzorkovanje", - "text": "Vežba: uzorkovanje\nIz baze “Sistolni pritisak.xlsx” odrediti prost i sistematski uzorak veličine 10.\nProst:\n\nsample(1:99, 10, replace = F)\n\n [1] 55 56 82 68 3 59 78 31 7 88\n\n\nSistematski:\n\nsample(1:99, 1, replace = F)\n\n[1] 47\n\n\n\nOdrediti početnu jedinicu\n\nKorak \\(k = \\frac{N}{n} = \\frac{99}{10} \\approx 10\\)\nIzabrati svaku 10-tu jedinicu" + "objectID": "slides/02_sredjivanje/prezentacija.html#tabelarno-prikazivanje-aps.-i-rel.-podataka", + "href": "slides/02_sredjivanje/prezentacija.html#tabelarno-prikazivanje-aps.-i-rel.-podataka", + "title": "Sređivanje podataka", + "section": "Tabelarno prikazivanje aps. i rel. podataka", + "text": "Tabelarno prikazivanje aps. i rel. podataka\n\n\n\n\n\nVarijabla\nN = 100\n\n\n\n\nNavika\n\n\n\nNepusac\n54 (54%)\n\n\nPusač\n46 (46%)\n\n\n\n1 n (%)" }, { - "objectID": "slides/05_uzorak/prezentacija.html#vežba-interval-poverenja-za-kontinuirane-podatke", - "href": "slides/05_uzorak/prezentacija.html#vežba-interval-poverenja-za-kontinuirane-podatke", - "title": "Populacija i uzorak", - "section": "Vežba: interval poverenja za kontinuirane podatke", - "text": "Vežba: interval poverenja za kontinuirane podatke\n\nKoristeći bazu podataka Sistolna TA.xlsx odrediti\n99% interval poverenja aritmetičke sredine\nsistolnog arterijskog pritiska ispitanika sa\nakutnim koronarnim sindromom.\n\n\n\n\n\n\n\nKomande\n\n\nStatistical analysis \\(\\rightarrow\\) Continuous variables \\(\\rightarrow\\) Single-sample t-test" + "objectID": "slides/02_sredjivanje/prezentacija.html#apsolutni-jeleni-i-relativne-ajkule", + "href": "slides/02_sredjivanje/prezentacija.html#apsolutni-jeleni-i-relativne-ajkule", + "title": "Sređivanje podataka", + "section": "Apsolutni jeleni i relativne ajkule", + "text": "Apsolutni jeleni i relativne ajkule\n\nRelativni brojevi mogu prenaglasiti rizik (bitnost) neke pojave\nDobri za plašenje drugih, publikacije\nLoši za javno zdravlje, naučni progres\nAli potrebni za kauzalno tumačenje\n\n\n\n\n\n\n\n\n\n\nApsolutni jelen\n\n\n\n\n\n\n\nRelativna ajkula\n\n\n\n\n\n\nRetke bolesti mogu da imaju rizike od 300% (RR 3.00), ali ako niko u populaciji ne dobije tu bolest onda to nije od javnozdravstvenog znacaja." }, { - "objectID": "slides/05_uzorak/prezentacija.html#vežba-interval-poverenja-za-diskretne-podatke", - "href": "slides/05_uzorak/prezentacija.html#vežba-interval-poverenja-za-diskretne-podatke", - "title": "Populacija i uzorak", - "section": "Vežba: interval poverenja za diskretne podatke", - "text": "Vežba: interval poverenja za diskretne podatke\n\nNa uzorku od 500 učenika u jednoj opštini nađena je\nanemija kod 25 učenika. Odrediti 95% interval\npoverenja proporcije učenika sa anemijom u toj\nopštini.\n\n\n\n\n\n\n\nKomande\n\n\nStatistical analysis \\(\\rightarrow\\) Discrete variables \\(\\rightarrow\\) Confidence interval for a proportion" + "objectID": "slides/02_sredjivanje/prezentacija.html#opasnost-zavisi-od-izloženosti", + "href": "slides/02_sredjivanje/prezentacija.html#opasnost-zavisi-od-izloženosti", + "title": "Sređivanje podataka", + "section": "Opasnost zavisi od izloženosti", + "text": "Opasnost zavisi od izloženosti" }, { - "objectID": "slides/05_uzorak/prezentacija.html#primer-centralne-granične-teoreme", - "href": "slides/05_uzorak/prezentacija.html#primer-centralne-granične-teoreme", - "title": "Populacija i uzorak", - "section": "Primer centralne granične teoreme", - "text": "Primer centralne granične teoreme\nBilo koja raspodela \\(\\rightarrow\\) arit. sred. uzorka \\(\\rightarrow\\) normalna raspodela arit. sredina" + "objectID": "slides/02_sredjivanje/prezentacija.html#komunikacija-rizika", + "href": "slides/02_sredjivanje/prezentacija.html#komunikacija-rizika", + "title": "Sređivanje podataka", + "section": "Komunikacija rizika", + "text": "Komunikacija rizika\n\n\nMnogi ljudi mešaju relativni i apsolutni rizik.\n\n1 od 10,000 žena ima trombozu\n3 od 10,000 žena na kontraceptivnim pilulama ima trombozu\n\n\\(RR = \\frac{3/10,000}{1/10,000} = 3.00\\)\n\n\\(\\uparrow\\) 200% u trombozama!\nPromena verovatnoće je samo 0.0002 (2 žene u 10,000)\nTrudnoća povećava verovatnoću tromboze mnogo više (1-2 od 1000 ima DVT)\n\n\n\n\n\nTromboza je retka u opstoj populaciji, ALI su mnogo češći na piluli. Ima kauzalnih razloga za to. Cost/benefit je težak. Zbog članka mnogo žena prestalo pije KP i dobilo tromboze zbog trudnoće!" }, { - "objectID": "slides/05_uzorak/prezentacija.html#vrste-uzoraka", - "href": "slides/05_uzorak/prezentacija.html#vrste-uzoraka", - "title": "Populacija i uzorak", - "section": "Vrste uzoraka", - "text": "Vrste uzoraka\n\nUzorački okvir\n\nSpisak ili lista svih elemenata populacije koju želimo da uzorkujemo.\n\n\n\nSlučajni uzorak\n\nTačno znamo verovatnoću da neko bude izabran\n\nNeslučajni\n\nMože biti pristrasan" + "objectID": "slides/02_sredjivanje/prezentacija.html#relatini-efekat-statina", + "href": "slides/02_sredjivanje/prezentacija.html#relatini-efekat-statina", + "title": "Sređivanje podataka", + "section": "Relatini efekat statina", + "text": "Relatini efekat statina\n\nRedukcija LDL-a u odnosu na vrstu statina." }, { - "objectID": "slides/05_uzorak/prezentacija.html#standardna-greška-aritmetičke-sredine-i-proporcije", - "href": "slides/05_uzorak/prezentacija.html#standardna-greška-aritmetičke-sredine-i-proporcije", - "title": "Populacija i uzorak", - "section": "Standardna greška aritmetičke sredine i proporcije", - "text": "Standardna greška aritmetičke sredine i proporcije\nStandardna greška aritmetičke sredine:\n\\[ SE_{\\bar x} = \\frac{sd}{\\sqrt{n}} \\]\ngde je: \\(sd\\), standardna devijacija statistike u uzorku (populaciona nije dostupna); \\(n\\) broj opservacija.\nStandardna greška proporcije:\n\\[ SE_{p} = \\sqrt{\\frac{p(1-p)}{n}} \\] gde je: \\(p\\), proporcija događaja u uzorku; \\(n\\) broj opservacija." + "objectID": "slides/02_sredjivanje/prezentacija.html#različiti-efekti-u-studijama", + "href": "slides/02_sredjivanje/prezentacija.html#različiti-efekti-u-studijama", + "title": "Sređivanje podataka", + "section": "Različiti efekti u studijama", + "text": "Različiti efekti u studijama\nEfikasnost (50-65 god):\n\nMortalitet (\\(RR = 0.86; ARR = 0.40\\%; NNT = 250\\))\nCVD (\\(RR = 0.69; ARR = 0.43\\%; NNT = 233\\))\nCVI (\\(RR = 0.71; ARR = 0.38\\%; NNT = 263\\))\nMI (\\(RR = 0.64; ARR = 0.81\\%; NNT = 123\\))\n\n\n\nRR je velik, dok je ARD sitan jer je mortalitet redak. U naucnoj komunikaciji RR su bitni, ali svakodnevno mogu da zavaraju. Sta moze da bude problem sa NNT? Sta ako terapija nekog osteti? Ovo su proseci, varijabilitet je isto bitan." }, { -<<<<<<< Updated upstream - "objectID": "slides/10_regresija/prezentacija.html#struktura-kursa", - "href": "slides/10_regresija/prezentacija.html#struktura-kursa", - "title": "Korelacija i regresija", - "section": "Struktura kursa", - "text": "Struktura kursa\n\n\n \n\n \n \n \n tinytable_s5b1xftrrkt479rxflf9\n \n \n \n \n \n\n \n \n \n \n \n \n Nedelja\n Tema\n \n \n \n \n \n 1\n Uvod u medicinsku statistiku \n \n \n 2\n Sređivanje podataka \n \n \n 3\n Statističko opisivanje podataka \n \n \n 4\n Verovatnoća i raspodele verovatnoća \n \n \n 5\n Populacija i uzorak \n \n \n 6\n Testiranje hipoteza o populacionim prosečnim vrednostima i proporcijama\n \n \n 7\n Testiranje hipoteza o učestalostima \n \n \n 8\n Testiranje hipoteza o rangovima \n \n \n 9\n Korelacija \n \n \n 10\n Regresija / Kolokvijum \n \n \n 11\n Podaci, informacije i znanje \n \n \n 12\n Zdravstveni informacioni sistem \n \n \n 13\n Mere dijagnostičke tačnosti \n \n \n 14\n Medicinsko odlučivanje \n \n \n 15\n Bioinformatika" + "objectID": "slides/02_sredjivanje/prezentacija.html#dodatak-definicija-relativnog-rizka", + "href": "slides/02_sredjivanje/prezentacija.html#dodatak-definicija-relativnog-rizka", + "title": "Sređivanje podataka", + "section": "Dodatak: definicija relativnog rizka", + "text": "Dodatak: definicija relativnog rizka\n\nRizik\n\nJe proporcija.\n\n\n\\[ R = \\frac{\\text{broj infarkta}}{\\text{ukupan broj pacijenata}} \\]\n\nRelativni rizik\n\nJe odnos proporcija.\n\n\n\\[ RR = \\frac{\\text{rizik sa statinom}}{\\text{rizik bez statina}} \\]\nAko je RR \\(\\lt1\\) rizik je manji kod grupe koja je uzimala statin. Relativni rizik meri koje su šanse da se dogadjaj desi u grupi koja je uzimala lek u odnosu na onu koja nije." }, { - "objectID": "slides/10_regresija/prezentacija.html#section-1", - "href": "slides/10_regresija/prezentacija.html#section-1", - "title": "Korelacija i regresija", - "section": "", - "text": "Korelacija \\(\\color{darkgreen}{\\not =}\\) Kauzalnost" -======= - "objectID": "slides/06_hipoteze/prezentacija.html#background-image-slikearc.jpg", - "href": "slides/06_hipoteze/prezentacija.html#background-image-slikearc.jpg", - "title": "Testiranje hipoteza o populacionim prosečnim vrednosima i proporcijama", - "section": "{background-image = “slike/arc.jpg”}", - "text": "{background-image = “slike/arc.jpg”}" + "objectID": "slides/02_sredjivanje/prezentacija.html#dodatak-definicija-apsolutnog-rizika", + "href": "slides/02_sredjivanje/prezentacija.html#dodatak-definicija-apsolutnog-rizika", + "title": "Sređivanje podataka", + "section": "Dodatak: definicija apsolutnog rizika", + "text": "Dodatak: definicija apsolutnog rizika\n\nApsolutna redukcija rizika (ARR)\n\nRazlika (ne odnos proporcija) između broja događaja kod pacijenata koji su pili statin i onih koji nisu.\n\n\n\\[ ARR = \\text{rizik bez statina} - \\text{rizik sa statinom} \\]\n\nBroj potreban za lečenje (NNT)\n\nBroj pacijenata koji moramo da lečimo (engl. NNT, number needed to treat) da bi sprečili jedan neželjen događaj.\n\n\n\\[ NNT = 1/ARR \\]" }, { - "objectID": "slides/06_hipoteze/prezentacija.html#načinite-svoje-teorije-složenim", - "href": "slides/06_hipoteze/prezentacija.html#načinite-svoje-teorije-složenim", - "title": "Testiranje hipoteza o populacionim prosečnim vrednosima i proporcijama", - "section": "Načinite svoje teorije složenim", - "text": "Načinite svoje teorije složenim" + "objectID": "slides/02_sredjivanje/prezentacija.html#grafički-prikaz-relativne-redukcije-rizika", + "href": "slides/02_sredjivanje/prezentacija.html#grafički-prikaz-relativne-redukcije-rizika", + "title": "Sređivanje podataka", + "section": "Grafički prikaz relativne redukcije rizika", + "text": "Grafički prikaz relativne redukcije rizika" }, { - "objectID": "slides/06_hipoteze/prezentacija.html#struktura-kursa", - "href": "slides/06_hipoteze/prezentacija.html#struktura-kursa", - "title": "Testiranje hipoteza o populacionim prosečnim vrednosima i proporcijama", - "section": "Struktura kursa", - "text": "Struktura kursa\n\n\n \n\n \n \n \n tinytable_w7sozsmdaebtdna8vl3i\n \n \n \n \n \n\n \n \n \n \n \n \n Nedelja\n Tema\n \n \n \n \n \n 1\n Uvod u medicinsku statistiku \n \n \n 2\n Sređivanje podataka \n \n \n 3\n Statističko opisivanje podataka \n \n \n 4\n Verovatnoća i raspodele verovatnoća \n \n \n 5\n Populacija i uzorak \n \n \n 6\n Testiranje hipoteza o populacionim prosečnim vrednostima i proporcijama\n \n \n 7\n Testiranje hipoteza o učestalostima \n \n \n 8\n Testiranje hipoteza o rangovima \n \n \n 9\n Korelacija \n \n \n 10\n Regresija / Kolokvijum \n \n \n 11\n Podaci, informacije i znanje \n \n \n 12\n Zdravstveni informacioni sistem \n \n \n 13\n Mere dijagnostičke tačnosti \n \n \n 14\n Medicinsko odlučivanje \n \n \n 15\n Bioinformatika" + "objectID": "slides/02_sredjivanje/prezentacija.html#kako-smanjenje-1-mmhg-pritiska-utiče-na-kardiovaskularni-rizik", + "href": "slides/02_sredjivanje/prezentacija.html#kako-smanjenje-1-mmhg-pritiska-utiče-na-kardiovaskularni-rizik", + "title": "Sređivanje podataka", + "section": "Kako smanjenje 1 mmHg pritiska utiče na kardiovaskularni rizik?", + "text": "Kako smanjenje 1 mmHg pritiska utiče na kardiovaskularni rizik?" }, { - "objectID": "slides/06_hipoteze/prezentacija.html#background-image-httpswww.worldhistory.orguploadsimages14751.jpgv1718105765-0", - "href": "slides/06_hipoteze/prezentacija.html#background-image-httpswww.worldhistory.orguploadsimages14751.jpgv1718105765-0", - "title": "Testiranje hipoteza o populacionim prosečnim vrednosima i proporcijama", - "section": "{background-image = “https://www.worldhistory.org/uploads/images/14751.jpg?v=1718105765-0”}", - "text": "{background-image = “https://www.worldhistory.org/uploads/images/14751.jpg?v=1718105765-0”}" + "objectID": "slides/02_sredjivanje/prezentacija.html#greška-osnovne-stope", + "href": "slides/02_sredjivanje/prezentacija.html#greška-osnovne-stope", + "title": "Sređivanje podataka", + "section": "Greška osnovne stope", + "text": "Greška osnovne stope" }, { - "objectID": "slides/06_hipoteze/prezentacija.html#background-image-httpswww.worldhistory.orguploadsimages14751.jpg", - "href": "slides/06_hipoteze/prezentacija.html#background-image-httpswww.worldhistory.orguploadsimages14751.jpg", - "title": "Testiranje hipoteza o populacionim prosečnim vrednosima i proporcijama", - "section": "{background-image = “https://www.worldhistory.org/uploads/images/14751.jpg”}", - "text": "{background-image = “https://www.worldhistory.org/uploads/images/14751.jpg”}" + "objectID": "slides/02_sredjivanje/prezentacija.html#apsolutni-antibiotik-relativni-statin", + "href": "slides/02_sredjivanje/prezentacija.html#apsolutni-antibiotik-relativni-statin", + "title": "Sređivanje podataka", + "section": "Apsolutni antibiotik, relativni statin", + "text": "Apsolutni antibiotik, relativni statin\n\nApsolutni rizik je informativniji (koliko loših događaja sprečeno?)\nRelativni rizik je bitan kada umemo da procenimo osnovni rizik (ko će imati najveću korist od terapije?)\nVakcinacija (100% velike boginje)\nAntibiotici\n\n\nDa li procedure/intervencije mogu da se mere ovako, smanjenjem rizika? Sta je zapravo rizik?" }, { - "objectID": "slides/06_hipoteze/prezentacija.html#background-imagehttpswww.worldhistory.orguploadsimages14751.jpg-background-size-contain-background-repeat-no-repeat", - "href": "slides/06_hipoteze/prezentacija.html#background-imagehttpswww.worldhistory.orguploadsimages14751.jpg-background-size-contain-background-repeat-no-repeat", - "title": "Testiranje hipoteza o populacionim prosečnim vrednosima i proporcijama", - "section": "{background-image=“https://www.worldhistory.org/uploads/images/14751.jpg” background-size: contain; background-repeat: no-repeat}", - "text": "{background-image=“https://www.worldhistory.org/uploads/images/14751.jpg” background-size: contain; background-repeat: no-repeat}" + "objectID": "slides/02_sredjivanje/prezentacija.html#vizualizacije-su-bitne-u-komunikaciji", + "href": "slides/02_sredjivanje/prezentacija.html#vizualizacije-su-bitne-u-komunikaciji", + "title": "Sređivanje podataka", + "section": "Vizualizacije su bitne u komunikaciji", + "text": "Vizualizacije su bitne u komunikaciji\n\n\n1986, shatl challenger je eksplodirao nesto vise od 1 min nakon uzletanja. Uzrok je iznenadno hladno vreme koje su inzinjeri predvideli. Deo je nesto vise od 130 satl misija u svemir. Da su napravili grafikom mozda su mogli da ih ubede." }, { - "objectID": "slides/06_hipoteze/prezentacija.html#tri-cilja-statistike", - "href": "slides/06_hipoteze/prezentacija.html#tri-cilja-statistike", - "title": "Testiranje hipoteza o populacionim prosečnim vrednosima i proporcijama", - "section": "Tri cilja statistike", - "text": "Tri cilja statistike\n\nOpis podataka\nOdlučivanje\n\nObjašnjenje (uzroka) podataka\n\nPredviđanje" + "objectID": "slides/02_sredjivanje/prezentacija.html#šta-nije-u-redu-sa-ovim-srcem", + "href": "slides/02_sredjivanje/prezentacija.html#šta-nije-u-redu-sa-ovim-srcem", + "title": "Sređivanje podataka", + "section": "Šta nije u redu sa ovim srcem?", + "text": "Šta nije u redu sa ovim srcem?\n\n\n\n\n\nTranspozicija velikih arterija. Uvod o specijalizovanim hirurskim centrima." }, { - "objectID": "slides/06_hipoteze/prezentacija.html#intuicija-za-testiranje-hipoteza", - "href": "slides/06_hipoteze/prezentacija.html#intuicija-za-testiranje-hipoteza", - "title": "Testiranje hipoteza o populacionim prosečnim vrednosima i proporcijama", - "section": "Intuicija za testiranje hipoteza", - "text": "Intuicija za testiranje hipoteza" + "objectID": "slides/02_sredjivanje/prezentacija.html#definisanje-podataka-za-prikupljanje", + "href": "slides/02_sredjivanje/prezentacija.html#definisanje-podataka-za-prikupljanje", + "title": "Sređivanje podataka", + "section": "Definisanje podataka za prikupljanje", + "text": "Definisanje podataka za prikupljanje\n\nDete\n\nČovek sa \\(\\lt16\\) godina života.\n\nVelika (otvorena) hirurgija\n\nZaustavljanje srca + kardiopulmonalni bajpas.\n\nMortalitet\n\nSmrt koja se desila \\(\\le30\\) dana od operacije.\n\n\nZašto ovako definisan mortalitet nije dobra mera kvaliteta hirurgije?" }, { - "objectID": "slides/06_hipoteze/prezentacija.html#nulta-hipoteza", - "href": "slides/06_hipoteze/prezentacija.html#nulta-hipoteza", - "title": "Testiranje hipoteza o populacionim prosečnim vrednosima i proporcijama", - "section": "Nulta hipoteza", - "text": "Nulta hipoteza" + "objectID": "slides/02_sredjivanje/prezentacija.html#tabelarno-prikazivanje-podataka", + "href": "slides/02_sredjivanje/prezentacija.html#tabelarno-prikazivanje-podataka", + "title": "Sređivanje podataka", + "section": "Tabelarno prikazivanje podataka", + "text": "Tabelarno prikazivanje podataka\n\n\n \n\n \n \n \n tinytable_rc7h8qrvdvctw8kl4wyl\n \n \n \n \n \n\n \n \n \n \n \n \n Bolnica\n Operacije\n Prezivelo\n Umrlo\n Preživljavanje\n Smrtnost\n \n \n \n \n \n Newcastle Freeman Hospital \n 511\n 497\n 14\n 97.3%\n 2.7%\n \n \n Leicester Glenfield Hospital \n 578\n 572\n 6\n 99% \n 1% \n \n \n Bristol Royal Hospital For Children \n 710\n 697\n 13\n 98.2%\n 1.8%\n \n \n Southampton Wessex Cardiothoracic Centre \n 720\n 708\n 12\n 98.3%\n 1.7%\n \n \n Dublin Our Lady's Children's Hospital \n 963\n 935\n 28\n 97.1%\n 2.9%\n \n \n Liverpool Alder Hey Hospital \n 974\n 955\n 19\n 98.1%\n 1.9%\n \n \n Leeds General Infirmary \n 920\n 904\n 16\n 98.3%\n 1.7%\n \n \n London Royal Brompton Hospital \n 661\n 653\n 8\n 98.8%\n 1.2%\n \n \n London Evelina London Children's Hospital \n 932\n 913\n 19\n 98% \n 2% \n \n \n Birmingham Children's Hospital \n 1141\n 1118\n 23\n 98% \n 2% \n \n \n London Great Ormond Street Hospital for Children\n 1476\n 1469\n 7\n 99.5%\n 0.5%" }, { - "objectID": "slides/06_hipoteze/prezentacija.html#alternativna-hipoteza", - "href": "slides/06_hipoteze/prezentacija.html#alternativna-hipoteza", - "title": "Testiranje hipoteza o populacionim prosečnim vrednosima i proporcijama", - "section": "Alternativna hipoteza", - "text": "Alternativna hipoteza" + "objectID": "slides/02_sredjivanje/prezentacija.html#hirurški-mortalitet-kod-transpozicije", + "href": "slides/02_sredjivanje/prezentacija.html#hirurški-mortalitet-kod-transpozicije", + "title": "Sređivanje podataka", + "section": "Hirurški mortalitet kod transpozicije", + "text": "Hirurški mortalitet kod transpozicije\n\n\n\n\n\n\n\n\n\n\n\n\n\n\n\n\n\n\n\n\n\n\n\n\nKako definisemo i merimo: dete, operaciju, kada je za smrt odgovorna hirurgija.\n< 16, bilo je vise operacije ali mereno sve kao jedan dogadjaj, smrt <30 dana usled hirurgije.\nDa li je smrt dobra mera kvaliteta operacije? Zašto?\nKako mogu drugačije da se prikažu podaci i da drugačije deluju? (red prikazivanja, mortalitet/preživaljvanje), komunikacija rizika kao 1 u 100 dece itd.\nGde da počne y-osa, 86% izabrano jer je pre 20 godina toliki bio mortalitet u Bristolu.\n“1984-1995”" }, { - "objectID": "slides/06_hipoteze/prezentacija.html#sumirano", - "href": "slides/06_hipoteze/prezentacija.html#sumirano", - "title": "Testiranje hipoteza o populacionim prosečnim vrednosima i proporcijama", - "section": "Sumirano", - "text": "Sumirano\nKad prihvatam, kad ne mogu da odbacim" + "objectID": "slides/02_sredjivanje/prezentacija.html#grafikon-pisa-testiranja", + "href": "slides/02_sredjivanje/prezentacija.html#grafikon-pisa-testiranja", + "title": "Sređivanje podataka", + "section": "Grafikon PISA testiranja", + "text": "Grafikon PISA testiranja" }, { - "objectID": "slides/06_hipoteze/prezentacija.html#notacija-nultih-hipoteza", - "href": "slides/06_hipoteze/prezentacija.html#notacija-nultih-hipoteza", - "title": "Testiranje hipoteza o populacionim prosečnim vrednosima i proporcijama", - "section": "Notacija nultih hipoteza", - "text": "Notacija nultih hipoteza\narit lek A = arit leb B\nproporcija vakinisanih = prop" + "objectID": "slides/02_sredjivanje/prezentacija.html#stubičasti-dijagram", + "href": "slides/02_sredjivanje/prezentacija.html#stubičasti-dijagram", + "title": "Sređivanje podataka", + "section": "Stubičasti dijagram", + "text": "Stubičasti dijagram" }, { - "objectID": "slides/06_hipoteze/prezentacija.html#zena-koja-pije-čaj", - "href": "slides/06_hipoteze/prezentacija.html#zena-koja-pije-čaj", - "title": "Testiranje hipoteza o populacionim prosečnim vrednosima i proporcijama", - "section": "Zena koja pije čaj", - "text": "Zena koja pije čaj\nŠta je nulta ovde? Kako da budemo još sigurniji?\nTea.png" + "objectID": "slides/02_sredjivanje/prezentacija.html#kružni-dijagram", + "href": "slides/02_sredjivanje/prezentacija.html#kružni-dijagram", + "title": "Sređivanje podataka", + "section": "Kružni dijagram", + "text": "Kružni dijagram" }, { - "objectID": "slides/06_hipoteze/prezentacija.html#greške-u-zaključivanju", - "href": "slides/06_hipoteze/prezentacija.html#greške-u-zaključivanju", - "title": "Testiranje hipoteza o populacionim prosečnim vrednosima i proporcijama", - "section": "Greške u zaključivanju", - "text": "Greške u zaključivanju\nmeme.png" + "objectID": "slides/02_sredjivanje/prezentacija.html#kružni-dijagram-najzastupljenijih-religija-u-sad", + "href": "slides/02_sredjivanje/prezentacija.html#kružni-dijagram-najzastupljenijih-religija-u-sad", + "title": "Sređivanje podataka", + "section": "Kružni dijagram najzastupljenijih religija u SAD", + "text": "Kružni dijagram najzastupljenijih religija u SAD" }, { - "objectID": "slides/06_hipoteze/prezentacija.html#greške-tabela", - "href": "slides/06_hipoteze/prezentacija.html#greške-tabela", - "title": "Testiranje hipoteza o populacionim prosečnim vrednosima i proporcijama", - "section": "Greške tabela", - "text": "Greške tabela" + "objectID": "slides/02_sredjivanje/prezentacija.html#stubičasti-dijagram-najzastupljenijih-religija-u-sad", + "href": "slides/02_sredjivanje/prezentacija.html#stubičasti-dijagram-najzastupljenijih-religija-u-sad", + "title": "Sređivanje podataka", + "section": "Stubičasti dijagram najzastupljenijih religija u SAD", + "text": "Stubičasti dijagram najzastupljenijih religija u SAD" }, { - "objectID": "slides/06_hipoteze/prezentacija.html#snaga-statističkog-testa", - "href": "slides/06_hipoteze/prezentacija.html#snaga-statističkog-testa", - "title": "Testiranje hipoteza o populacionim prosečnim vrednosima i proporcijama", - "section": "Snaga statističkog testa", - "text": "Snaga statističkog testa\nres.png\ngalileo.png saturn" + "objectID": "slides/02_sredjivanje/prezentacija.html#kružni-dijagram-udela-bolnica-u-operacijama-transpozicije", + "href": "slides/02_sredjivanje/prezentacija.html#kružni-dijagram-udela-bolnica-u-operacijama-transpozicije", + "title": "Sređivanje podataka", + "section": "Kružni dijagram udela bolnica u operacijama transpozicije", + "text": "Kružni dijagram udela bolnica u operacijama transpozicije" }, { - "objectID": "slides/06_hipoteze/prezentacija.html#formalan-prikaz", - "href": "slides/06_hipoteze/prezentacija.html#formalan-prikaz", - "title": "Testiranje hipoteza o populacionim prosečnim vrednosima i proporcijama", - "section": "Formalan prikaz", - "text": "Formalan prikaz\nDve distribucije i regioni greške" + "objectID": "slides/02_sredjivanje/prezentacija.html#stubičasti-dijagram-udela-bolnica-u-operacijama-transpozicije", + "href": "slides/02_sredjivanje/prezentacija.html#stubičasti-dijagram-udela-bolnica-u-operacijama-transpozicije", + "title": "Sređivanje podataka", + "section": "Stubičasti dijagram udela bolnica u operacijama transpozicije", + "text": "Stubičasti dijagram udela bolnica u operacijama transpozicije" }, { - "objectID": "slides/06_hipoteze/prezentacija.html#šta-utiče-na-snagu", - "href": "slides/06_hipoteze/prezentacija.html#šta-utiče-na-snagu", - "title": "Testiranje hipoteza o populacionim prosečnim vrednosima i proporcijama", - "section": "Šta utiče na snagu?", - "text": "Šta utiče na snagu?" + "objectID": "slides/02_sredjivanje/prezentacija.html#prikazivanje-nominalnih-podataka", + "href": "slides/02_sredjivanje/prezentacija.html#prikazivanje-nominalnih-podataka", + "title": "Sređivanje podataka", + "section": "Prikazivanje nominalnih podataka", + "text": "Prikazivanje nominalnih podataka\nGrupišu se po kategorijama\n\nOdrediti apsolutne i relativne učestalosti za pol i pušenje\nGrafički prikaz\n\nstubičasti dijagram (bar chart)\nkružni dijagram (pie chart)\nsačuvati grafikon\n\n\n\n\n\n\n\n\nSavet\n\n\nStatistical analysis \\(\\rightarrow\\) Discrete variables \\(\\rightarrow\\) Frequency distributions" }, { - "objectID": "slides/06_hipoteze/prezentacija.html#praški-golem", - "href": "slides/06_hipoteze/prezentacija.html#praški-golem", - "title": "Testiranje hipoteza o populacionim prosečnim vrednosima i proporcijama", - "section": "Praški golem", - "text": "Praški golem" + "objectID": "slides/02_sredjivanje/prezentacija.html#prikazivanje-ordinalnih-podataka", + "href": "slides/02_sredjivanje/prezentacija.html#prikazivanje-ordinalnih-podataka", + "title": "Sređivanje podataka", + "section": "Prikazivanje ordinalnih podataka", + "text": "Prikazivanje ordinalnih podataka\nGrupišu se po kategorijama\n\nOdrediti apsolutne i relativne učestalosti za zadovoljstvo_zz\nGrafički prikaz\n\nstubičasti dijagram (bar chart)\nkružni dijagram (pie chart)\nsačuvati grafikon" }, { - "objectID": "slides/06_hipoteze/prezentacija.html#izbor-statističkog-testa", - "href": "slides/06_hipoteze/prezentacija.html#izbor-statističkog-testa", - "title": "Testiranje hipoteza o populacionim prosečnim vrednosima i proporcijama", - "section": "Izbor statističkog testa", - "text": "Izbor statističkog testa\nIzbor statističkog testa • Kao roboti • Moćni • Nisu mudri • Opasni su • Uske upotrebe\nflowchart.png" + "objectID": "slides/02_sredjivanje/prezentacija.html#prikazivanje-diskontinuiranih-podataka", + "href": "slides/02_sredjivanje/prezentacija.html#prikazivanje-diskontinuiranih-podataka", + "title": "Sređivanje podataka", + "section": "Prikazivanje diskontinuiranih podataka", + "text": "Prikazivanje diskontinuiranih podataka\nGrupišu se po diskretnim vrednostima ili klasnim intervalima\n\nApsolutne i relativne učestalosti za hr_bronhitis\nGrafički prikaz\n\nstubičasti dijagram (bar chart)\nkružni dijagram (pie chart)\nsačuvati grafikon" }, { - "objectID": "slides/06_hipoteze/prezentacija.html#izbor-statističkog-testa-2", - "href": "slides/06_hipoteze/prezentacija.html#izbor-statističkog-testa-2", - "title": "Testiranje hipoteza o populacionim prosečnim vrednosima i proporcijama", - "section": "Izbor statističkog testa 2", - "text": "Izbor statističkog testa 2\nTip podataka • Dizajn studije • Broj uzoraka • Nezavisni ili Zavisni • Parametarski • Zahtevaju norm. raspodelu • Neparametarski\nflowchart.png" + "objectID": "slides/02_sredjivanje/prezentacija.html#diskretne-vrednosti-bronhitisa", + "href": "slides/02_sredjivanje/prezentacija.html#diskretne-vrednosti-bronhitisa", + "title": "Sređivanje podataka", + "section": "Diskretne vrednosti bronhitisa", + "text": "Diskretne vrednosti bronhitisa\n\n\n \n\n \n \n \n tinytable_3c4olovomytbutydsv62\n \n \n \n \n \n\n \n \n \n \n \n \n Broj resp. infekcija\n n\n %\n \n \n \n \n \n 0\n 4\n 13\n \n \n 1\n 8\n 27\n \n \n 2\n 8\n 27\n \n \n 3\n 4\n 13\n \n \n 4\n 2\n 7\n \n \n 5\n 4\n 13" }, { - "objectID": "slides/06_hipoteze/prezentacija.html#statistički-zaključak-i-kritične-vrednosti", - "href": "slides/06_hipoteze/prezentacija.html#statistički-zaključak-i-kritične-vrednosti", - "title": "Testiranje hipoteza o populacionim prosečnim vrednosima i proporcijama", - "section": "Statistički zaključak i kritične vrednosti", - "text": "Statistički zaključak i kritične vrednosti\nRegion odbacivanja, granične vrednosti zed testa" + "objectID": "slides/02_sredjivanje/prezentacija.html#stubičasti-dijagram-bronhitisa", + "href": "slides/02_sredjivanje/prezentacija.html#stubičasti-dijagram-bronhitisa", + "title": "Sređivanje podataka", + "section": "Stubičasti dijagram bronhitisa", + "text": "Stubičasti dijagram bronhitisa" }, { - "objectID": "slides/06_hipoteze/prezentacija.html#william-sealz-gosstet-1876---1937", - "href": "slides/06_hipoteze/prezentacija.html#william-sealz-gosstet-1876---1937", - "title": "Testiranje hipoteza o populacionim prosečnim vrednosima i proporcijama", - "section": "William Sealz Gosstet (1876 - 1937)", - "text": "William Sealz Gosstet (1876 - 1937)\nbeer.png" + "objectID": "slides/02_sredjivanje/prezentacija.html#kako-prikazati-numeričke-podatke", + "href": "slides/02_sredjivanje/prezentacija.html#kako-prikazati-numeričke-podatke", + "title": "Sređivanje podataka", + "section": "Kako prikazati numeričke podatke?", + "text": "Kako prikazati numeričke podatke?" }, { - "objectID": "slides/06_hipoteze/prezentacija.html#r-output-studentovog-t-testa", - "href": "slides/06_hipoteze/prezentacija.html#r-output-studentovog-t-testa", - "title": "Testiranje hipoteza o populacionim prosečnim vrednosima i proporcijama", - "section": "R output Studentovog t-testa", - "text": "R output Studentovog t-testa" + "objectID": "slides/02_sredjivanje/prezentacija.html#široki-intervali-nisu-korisni", + "href": "slides/02_sredjivanje/prezentacija.html#široki-intervali-nisu-korisni", + "title": "Sređivanje podataka", + "section": "Široki intervali nisu korisni", + "text": "Široki intervali nisu korisni" }, { - "objectID": "slides/06_hipoteze/prezentacija.html#studentov-t-test", - "href": "slides/06_hipoteze/prezentacija.html#studentov-t-test", - "title": "Testiranje hipoteza o populacionim prosečnim vrednosima i proporcijama", - "section": "Studentov t-test", - "text": "Studentov t-test\nGolem.png\nUslovi\n\nSlučajno biran uzorak\nNumerički podaci\nNormalna raspodela u populaciji" + "objectID": "slides/02_sredjivanje/prezentacija.html#uski-intervali-nisu-korisni", + "href": "slides/02_sredjivanje/prezentacija.html#uski-intervali-nisu-korisni", + "title": "Sređivanje podataka", + "section": "Uski intervali nisu korisni", + "text": "Uski intervali nisu korisni" }, { - "objectID": "slides/06_hipoteze/prezentacija.html#t-raspodela", - "href": "slides/06_hipoteze/prezentacija.html#t-raspodela", - "title": "Testiranje hipoteza o populacionim prosečnim vrednosima i proporcijama", - "section": "t-raspodela", - "text": "t-raspodela\nKritična vrednost" + "objectID": "slides/02_sredjivanje/prezentacija.html#broj-intervala-je-proizvoljan", + "href": "slides/02_sredjivanje/prezentacija.html#broj-intervala-je-proizvoljan", + "title": "Sređivanje podataka", + "section": "Broj intervala je proizvoljan", + "text": "Broj intervala je proizvoljan" }, { - "objectID": "slides/06_hipoteze/prezentacija.html#studentov-t-test-golem", - "href": "slides/06_hipoteze/prezentacija.html#studentov-t-test-golem", - "title": "Testiranje hipoteza o populacionim prosečnim vrednosima i proporcijama", - "section": "Studentov t-test golem", - "text": "Studentov t-test golem\nFlags p < .001" + "objectID": "slides/02_sredjivanje/prezentacija.html#histogram", + "href": "slides/02_sredjivanje/prezentacija.html#histogram", + "title": "Sređivanje podataka", + "section": "Histogram", + "text": "Histogram" }, { - "objectID": "slides/06_hipoteze/prezentacija.html#vežba-interpretacija", - "href": "slides/06_hipoteze/prezentacija.html#vežba-interpretacija", - "title": "Testiranje hipoteza o populacionim prosečnim vrednosima i proporcijama", - "section": "Vežba: interpretacija", - "text": "Vežba: interpretacija\nDa li se pritisak razlikuje kod pacijenata koji su preležali infarkt?\nH0 : μzdrav = μinfarkt p = 0.00242\n120 mmHg 145 mmHg\nH0 : μzdrav = μinfarkt p = 0.82\n120 mmHg 145 mmHg" + "objectID": "slides/02_sredjivanje/prezentacija.html#informacije-sažete-distribucijom", + "href": "slides/02_sredjivanje/prezentacija.html#informacije-sažete-distribucijom", + "title": "Sređivanje podataka", + "section": "Informacije sažete distribucijom", + "text": "Informacije sažete distribucijom" }, { - "objectID": "slides/06_hipoteze/prezentacija.html#verzije-studentovog-t-testa", - "href": "slides/06_hipoteze/prezentacija.html#verzije-studentovog-t-testa", - "title": "Testiranje hipoteza o populacionim prosečnim vrednosima i proporcijama", - "section": "Verzije Studentovog t-testa", - "text": "Verzije Studentovog t-testa" + "objectID": "slides/02_sredjivanje/prezentacija.html#prikazivanje-kontinuiranih-podataka", + "href": "slides/02_sredjivanje/prezentacija.html#prikazivanje-kontinuiranih-podataka", + "title": "Sređivanje podataka", + "section": "Prikazivanje kontinuiranih podataka", + "text": "Prikazivanje kontinuiranih podataka\nGrupišu se po klasnim intervalima\n\nOdrediti apsolutne i relativne učestalosti za starost\nGrafički prikaz\n\nhistogram\npoligon frekvencija" }, { - "objectID": "slides/06_hipoteze/prezentacija.html#vežba-studentov-t-test-za-jedan-uzorak", - "href": "slides/06_hipoteze/prezentacija.html#vežba-studentov-t-test-za-jedan-uzorak", - "title": "Testiranje hipoteza o populacionim prosečnim vrednosima i proporcijama", - "section": "Vežba: Studentov t-test za jedan uzorak", - "text": "Vežba: Studentov t-test za jedan uzorak\nNa osnovu prethodnih istraživanja očekivana aritmetička sredina iznosi 145 mmHg. Da li populacija iz koje potiče uzorak u bazi Sistolna TA.xlsx ima aritmetičku sredinu jednaku očekivanoj? Testirati na nivou značajnosti od 0.05." + "objectID": "slides/02_sredjivanje/prezentacija.html#poligon-frekvencija", + "href": "slides/02_sredjivanje/prezentacija.html#poligon-frekvencija", + "title": "Sređivanje podataka", + "section": "Poligon frekvencija", + "text": "Poligon frekvencija" }, { - "objectID": "slides/06_hipoteze/prezentacija.html#vežba-studentov-t-test-za-dva-nezavisna-uzorka", - "href": "slides/06_hipoteze/prezentacija.html#vežba-studentov-t-test-za-dva-nezavisna-uzorka", - "title": "Testiranje hipoteza o populacionim prosečnim vrednosima i proporcijama", - "section": "Vežba: Studentov t-test za dva nezavisna uzorka", - "text": "Vežba: Studentov t-test za dva nezavisna uzorka\n\ntestiranje normalnosti\n\nDa li se ukupan holesterol u bazi DZ.xlsx razlikuje kod pušača i nepušača? Testirati na nivou značajnosti od 0.01." + "objectID": "slides/02_sredjivanje/prezentacija.html#ponekad-možemo-prekršiti-pravila", + "href": "slides/02_sredjivanje/prezentacija.html#ponekad-možemo-prekršiti-pravila", + "title": "Sređivanje podataka", + "section": "Ponekad možemo prekršiti pravila", + "text": "Ponekad možemo prekršiti pravila" }, { - "objectID": "slides/06_hipoteze/prezentacija.html#vežba-studentov-t-test-za-dva-zavisna-uzorka", - "href": "slides/06_hipoteze/prezentacija.html#vežba-studentov-t-test-za-dva-zavisna-uzorka", - "title": "Testiranje hipoteza o populacionim prosečnim vrednosima i proporcijama", - "section": "Vežba: Studentov t-test za dva zavisna uzorka", - "text": "Vežba: Studentov t-test za dva zavisna uzorka" + "objectID": "slides/02_sredjivanje/prezentacija.html#vežbanje", + "href": "slides/02_sredjivanje/prezentacija.html#vežbanje", + "title": "Sređivanje podataka", + "section": "Vežbanje", + "text": "Vežbanje\nIz baze baza DZ.xlsx tabelarno i grafički prikazati:\n\nhipertenziju\nuhranjenost\nstarost" }, { - "objectID": "slides/06_hipoteze/prezentacija.html#nameštanje-p-vrednosti", - "href": "slides/06_hipoteze/prezentacija.html#nameštanje-p-vrednosti", - "title": "Testiranje hipoteza o populacionim prosečnim vrednosima i proporcijama", - "section": "Nameštanje p-vrednosti", - "text": "Nameštanje p-vrednosti\npvrednost.png xkcd\nNapredovanje uslovljeno radovima Problem višestrukog testiranja “Vidi da li ima značajne razlike…”" + "objectID": "slides/02_sredjivanje/prezentacija.html#zaključak", + "href": "slides/02_sredjivanje/prezentacija.html#zaključak", + "title": "Sređivanje podataka", + "section": "Zaključak", + "text": "Zaključak\n\nRelativni rizici deluju bitnije nego što jesu; apsolutni rizici pojašnjavaju\nOčekivane frekvencije (1 od 100) su jasnije za interpretaciju\nGrafikoni se moraju pažljivo praviti i tumačiti\nNačin prikazivanja podataka zavisi od njihovog tipa*" }, { - "objectID": "slides/06_hipoteze/prezentacija.html#možemo-da-pročitamo-rad", - "href": "slides/06_hipoteze/prezentacija.html#možemo-da-pročitamo-rad", - "title": "Testiranje hipoteza o populacionim prosečnim vrednosima i proporcijama", - "section": "Možemo da pročitamo rad", - "text": "Možemo da pročitamo rad\nOseltamivir treatment for influenza in adults" ->>>>>>> Stashed changes + "objectID": "slides/02_sredjivanje/prezentacija.html#struktura-kursa", + "href": "slides/02_sredjivanje/prezentacija.html#struktura-kursa", + "title": "Sređivanje podataka", + "section": "Struktura kursa", + "text": "Struktura kursa\n\n\n \n\n \n \n \n tinytable_2mek79x9lbjgytenm6se\n \n \n \n \n \n\n \n \n \n \n \n \n Nedelja\n Tema\n \n \n \n \n \n 1\n Uvod u medicinsku statistiku \n \n \n 2\n Sređivanje podataka \n \n \n 3\n Statističko opisivanje podataka \n \n \n 4\n Verovatnoća i raspodele verovatnoća \n \n \n 5\n Populacija i uzorak \n \n \n 6\n Testiranje hipoteza o populacionim prosečnim vrednostima i proporcijama\n \n \n 7\n Testiranje hipoteza o učestalostima \n \n \n 8\n Testiranje hipoteza o rangovima \n \n \n 9\n Korelacija \n \n \n 10\n Regresija / Kolokvijum \n \n \n 11\n Podaci, informacije i znanje \n \n \n 12\n Zdravstveni informacioni sistem \n \n \n 13\n Mere dijagnostičke tačnosti \n \n \n 14\n Medicinsko odlučivanje \n \n \n 15\n Bioinformatika" } ] \ No newline at end of file diff --git a/docs/site_libs/revealjs/dist/theme/quarto.css b/docs/site_libs/revealjs/dist/theme/quarto.css index 92a2d5a..c4d62f4 100644 --- a/docs/site_libs/revealjs/dist/theme/quarto.css +++ b/docs/site_libs/revealjs/dist/theme/quarto.css @@ -1,8 +1,8 @@ -@import"https://fonts.googleapis.com/css2?family=Roboto:ital,wght@0,100;0,300;0,400;0,500;0,700;0,900;1,100;1,300;1,400;1,500;1,700;1,900&display=swap";@import"./fonts/source-sans-pro/source-sans-pro.css";:root{--r-background-color: #01364C;--r-main-font: Roboto, sans-serif;--r-main-font-size: 40px;--r-main-color: #F7F8F9;--r-block-margin: 12px;--r-heading-margin: 0 0 12px 0;--r-heading-font: Roboto, serif;--r-heading-color: #d2eef0;--r-heading-line-height: 1.2;--r-heading-letter-spacing: normal;--r-heading-text-transform: none;--r-heading-text-shadow: none;--r-heading-font-weight: 600;--r-heading1-text-shadow: none;--r-heading1-size: 2.5em;--r-heading2-size: 1.6em;--r-heading3-size: 1.3em;--r-heading4-size: 1em;--r-code-font: SFMono-Regular, Menlo, Monaco, Consolas, Liberation Mono, Courier New, monospace;--r-link-color: #99D9DD;--r-link-color-dark: #60c4ca;--r-link-color-hover: #bfe7ea;--r-selection-background-color: #f9fdfd;--r-selection-color: #01364C}.reveal-viewport{background:#01364c;background-color:var(--r-background-color)}.reveal{font-family:var(--r-main-font);font-size:var(--r-main-font-size);font-weight:normal;color:var(--r-main-color)}.reveal ::selection{color:var(--r-selection-color);background:var(--r-selection-background-color);text-shadow:none}.reveal ::-moz-selection{color:var(--r-selection-color);background:var(--r-selection-background-color);text-shadow:none}.reveal .slides section,.reveal .slides section>section{line-height:1.3;font-weight:inherit}.reveal h1,.reveal h2,.reveal h3,.reveal h4,.reveal h5,.reveal h6{margin:var(--r-heading-margin);color:var(--r-heading-color);font-family:var(--r-heading-font);font-weight:var(--r-heading-font-weight);line-height:var(--r-heading-line-height);letter-spacing:var(--r-heading-letter-spacing);text-transform:var(--r-heading-text-transform);text-shadow:var(--r-heading-text-shadow);word-wrap:break-word}.reveal h1{font-size:var(--r-heading1-size)}.reveal h2{font-size:var(--r-heading2-size)}.reveal h3{font-size:var(--r-heading3-size)}.reveal h4{font-size:var(--r-heading4-size)}.reveal h1{text-shadow:var(--r-heading1-text-shadow)}.reveal p{margin:var(--r-block-margin) 0;line-height:1.3}.reveal h1:last-child,.reveal h2:last-child,.reveal h3:last-child,.reveal h4:last-child,.reveal h5:last-child,.reveal h6:last-child{margin-bottom:0}.reveal img,.reveal video,.reveal iframe{max-width:95%;max-height:95%}.reveal strong,.reveal b{font-weight:bold}.reveal em{font-style:italic}.reveal ol,.reveal dl,.reveal ul{display:inline-block;text-align:left;margin:0 0 0 1em}.reveal ol{list-style-type:decimal}.reveal ul{list-style-type:disc}.reveal ul ul{list-style-type:square}.reveal ul ul ul{list-style-type:circle}.reveal ul ul,.reveal ul ol,.reveal ol ol,.reveal ol ul{display:block;margin-left:40px}.reveal dt{font-weight:bold}.reveal dd{margin-left:40px}.reveal blockquote{display:block;position:relative;width:70%;margin:var(--r-block-margin) auto;padding:5px;font-style:italic;background:rgba(255,255,255,.05);box-shadow:0px 0px 2px rgba(0,0,0,.2)}.reveal blockquote p:first-child,.reveal blockquote p:last-child{display:inline-block}.reveal q{font-style:italic}.reveal pre{display:block;position:relative;width:90%;margin:var(--r-block-margin) auto;text-align:left;font-size:.55em;font-family:var(--r-code-font);line-height:1.2em;word-wrap:break-word;box-shadow:0px 5px 15px rgba(0,0,0,.15)}.reveal code{font-family:var(--r-code-font);text-transform:none;tab-size:2}.reveal pre code{display:block;padding:5px;overflow:auto;max-height:400px;word-wrap:normal}.reveal .code-wrapper{white-space:normal}.reveal .code-wrapper code{white-space:pre}.reveal table{margin:auto;border-collapse:collapse;border-spacing:0}.reveal table th{font-weight:bold}.reveal table th,.reveal table td{text-align:left;padding:.2em .5em .2em .5em;border-bottom:1px solid}.reveal table th[align=center],.reveal table td[align=center]{text-align:center}.reveal table th[align=right],.reveal table td[align=right]{text-align:right}.reveal table tbody tr:last-child th,.reveal table tbody tr:last-child td{border-bottom:none}.reveal sup{vertical-align:super;font-size:smaller}.reveal sub{vertical-align:sub;font-size:smaller}.reveal small{display:inline-block;font-size:.6em;line-height:1.2em;vertical-align:top}.reveal small *{vertical-align:top}.reveal img{margin:var(--r-block-margin) 0}.reveal a{color:var(--r-link-color);text-decoration:none;transition:color .15s ease}.reveal a:hover{color:var(--r-link-color-hover);text-shadow:none;border:none}.reveal .roll span:after{color:#fff;background:var(--r-link-color-dark)}.reveal .r-frame{border:4px solid var(--r-main-color);box-shadow:0 0 10px rgba(0,0,0,.15)}.reveal a .r-frame{transition:all .15s linear}.reveal a:hover .r-frame{border-color:var(--r-link-color);box-shadow:0 0 20px rgba(0,0,0,.55)}.reveal .controls{color:var(--r-link-color)}.reveal .progress{background:rgba(0,0,0,.2);color:var(--r-link-color)}@media print{.backgrounds{background-color:var(--r-background-color)}}.top-right{position:absolute;top:1em;right:1em}.visually-hidden{border:0;clip:rect(0 0 0 0);height:auto;margin:0;overflow:hidden;padding:0;position:absolute;width:1px;white-space:nowrap}.hidden{display:none !important}.zindex-bottom{z-index:-1 !important}figure.figure{display:block}.quarto-layout-panel{margin-bottom:1em}.quarto-layout-panel>figure{width:100%}.quarto-layout-panel>figure>figcaption,.quarto-layout-panel>.panel-caption{margin-top:10pt}.quarto-layout-panel>.table-caption{margin-top:0px}.table-caption p{margin-bottom:.5em}.quarto-layout-row{display:flex;flex-direction:row;align-items:flex-start}.quarto-layout-valign-top{align-items:flex-start}.quarto-layout-valign-bottom{align-items:flex-end}.quarto-layout-valign-center{align-items:center}.quarto-layout-cell{position:relative;margin-right:20px}.quarto-layout-cell:last-child{margin-right:0}.quarto-layout-cell figure,.quarto-layout-cell>p{margin:.2em}.quarto-layout-cell img{max-width:100%}.quarto-layout-cell .html-widget{width:100% !important}.quarto-layout-cell div figure p{margin:0}.quarto-layout-cell figure{display:block;margin-inline-start:0;margin-inline-end:0}.quarto-layout-cell table{display:inline-table}.quarto-layout-cell-subref figcaption,figure .quarto-layout-row figure figcaption{text-align:center;font-style:italic}.quarto-figure{position:relative;margin-bottom:1em}.quarto-figure>figure{width:100%;margin-bottom:0}.quarto-figure-left>figure>p,.quarto-figure-left>figure>div{text-align:left}.quarto-figure-center>figure>p,.quarto-figure-center>figure>div{text-align:center}.quarto-figure-right>figure>p,.quarto-figure-right>figure>div{text-align:right}.quarto-figure>figure>div.cell-annotation,.quarto-figure>figure>div code{text-align:left}figure>p:empty{display:none}figure>p:first-child{margin-top:0;margin-bottom:0}figure>figcaption.quarto-float-caption-bottom{margin-bottom:.5em}figure>figcaption.quarto-float-caption-top{margin-top:.5em}div[id^=tbl-]{position:relative}.quarto-figure>.anchorjs-link{position:absolute;top:.6em;right:.5em}div[id^=tbl-]>.anchorjs-link{position:absolute;top:.7em;right:.3em}.quarto-figure:hover>.anchorjs-link,div[id^=tbl-]:hover>.anchorjs-link,h2:hover>.anchorjs-link,h3:hover>.anchorjs-link,h4:hover>.anchorjs-link,h5:hover>.anchorjs-link,h6:hover>.anchorjs-link,.reveal-anchorjs-link>.anchorjs-link{opacity:1}#title-block-header{margin-block-end:1rem;position:relative;margin-top:-1px}#title-block-header .abstract{margin-block-start:1rem}#title-block-header .abstract .abstract-title{font-weight:600}#title-block-header a{text-decoration:none}#title-block-header .author,#title-block-header .date,#title-block-header .doi{margin-block-end:.2rem}#title-block-header .quarto-title-block>div{display:flex}#title-block-header .quarto-title-block>div>h1{flex-grow:1}#title-block-header .quarto-title-block>div>button{flex-shrink:0;height:2.25rem;margin-top:0}tr.header>th>p:last-of-type{margin-bottom:0px}table,table.table{margin-top:.5rem;margin-bottom:.5rem}caption,.table-caption{padding-top:.5rem;padding-bottom:.5rem;text-align:center}figure.quarto-float-tbl figcaption.quarto-float-caption-top{margin-top:.5rem;margin-bottom:.25rem;text-align:center}figure.quarto-float-tbl figcaption.quarto-float-caption-bottom{padding-top:.25rem;margin-bottom:.5rem;text-align:center}.utterances{max-width:none;margin-left:-8px}iframe{margin-bottom:1em}details{margin-bottom:1em}details[show]{margin-bottom:0}details>summary{color:#fff}details>summary>p:only-child{display:inline}pre.sourceCode,code.sourceCode{position:relative}p code:not(.sourceCode){white-space:pre-wrap}code{white-space:pre}@media print{code{white-space:pre-wrap}}pre>code{display:block}pre>code.sourceCode{white-space:pre}pre>code.sourceCode>span>a:first-child::before{text-decoration:none}pre.code-overflow-wrap>code.sourceCode{white-space:pre-wrap}pre.code-overflow-scroll>code.sourceCode{white-space:pre}code a:any-link{color:inherit;text-decoration:none}code a:hover{color:inherit;text-decoration:underline}ul.task-list{padding-left:1em}[data-tippy-root]{display:inline-block}.tippy-content .footnote-back{display:none}.footnote-back{margin-left:.2em}.tippy-content{overflow-x:auto}.quarto-embedded-source-code{display:none}.quarto-unresolved-ref{font-weight:600}.quarto-cover-image{max-width:35%;float:right;margin-left:30px}.cell-output-display .widget-subarea{margin-bottom:1em}.cell-output-display:not(.no-overflow-x),.knitsql-table:not(.no-overflow-x){overflow-x:auto}.panel-input{margin-bottom:1em}.panel-input>div,.panel-input>div>div{display:inline-block;vertical-align:top;padding-right:12px}.panel-input>p:last-child{margin-bottom:0}.layout-sidebar{margin-bottom:1em}.layout-sidebar .tab-content{border:none}.tab-content>.page-columns.active{display:grid}div.sourceCode>iframe{width:100%;height:300px;margin-bottom:-0.5em}a{text-underline-offset:3px}div.ansi-escaped-output{font-family:monospace;display:block}/*! +@import"https://fonts.googleapis.com/css2?family=Roboto:ital,wght@0,100;0,300;0,400;0,500;0,700;0,900;1,100;1,300;1,400;1,500;1,700;1,900&display=swap";@import"./fonts/source-sans-pro/source-sans-pro.css";:root{--r-background-color: #01364C;--r-main-font: Roboto, sans-serif;--r-main-font-size: 40px;--r-main-color: #F7F8F9;--r-block-margin: 12px;--r-heading-margin: 0 0 12px 0;--r-heading-font: Roboto, serif;--r-heading-color: #d2eef0;--r-heading-line-height: 1.2;--r-heading-letter-spacing: normal;--r-heading-text-transform: none;--r-heading-text-shadow: none;--r-heading-font-weight: 600;--r-heading1-text-shadow: none;--r-heading1-size: 2.5em;--r-heading2-size: 1.6em;--r-heading3-size: 1.3em;--r-heading4-size: 1em;--r-code-font: SFMono-Regular, Menlo, Monaco, Consolas, Liberation Mono, Courier New, monospace;--r-link-color: #99D9DD;--r-link-color-dark: #60c4ca;--r-link-color-hover: #bfe7ea;--r-selection-background-color: #f9fdfd;--r-selection-color: #01364C}.reveal-viewport{background:#01364c;background-color:var(--r-background-color)}.reveal{font-family:var(--r-main-font);font-size:var(--r-main-font-size);font-weight:normal;color:var(--r-main-color)}.reveal ::selection{color:var(--r-selection-color);background:var(--r-selection-background-color);text-shadow:none}.reveal ::-moz-selection{color:var(--r-selection-color);background:var(--r-selection-background-color);text-shadow:none}.reveal .slides section,.reveal .slides section>section{line-height:1.3;font-weight:inherit}.reveal h1,.reveal h2,.reveal h3,.reveal h4,.reveal h5,.reveal h6{margin:var(--r-heading-margin);color:var(--r-heading-color);font-family:var(--r-heading-font);font-weight:var(--r-heading-font-weight);line-height:var(--r-heading-line-height);letter-spacing:var(--r-heading-letter-spacing);text-transform:var(--r-heading-text-transform);text-shadow:var(--r-heading-text-shadow);word-wrap:break-word}.reveal h1{font-size:var(--r-heading1-size)}.reveal h2{font-size:var(--r-heading2-size)}.reveal h3{font-size:var(--r-heading3-size)}.reveal h4{font-size:var(--r-heading4-size)}.reveal h1{text-shadow:var(--r-heading1-text-shadow)}.reveal p{margin:var(--r-block-margin) 0;line-height:1.3}.reveal h1:last-child,.reveal h2:last-child,.reveal h3:last-child,.reveal h4:last-child,.reveal h5:last-child,.reveal h6:last-child{margin-bottom:0}.reveal img,.reveal video,.reveal iframe{max-width:95%;max-height:95%}.reveal strong,.reveal b{font-weight:bold}.reveal em{font-style:italic}.reveal ol,.reveal dl,.reveal ul{display:inline-block;text-align:left;margin:0 0 0 1em}.reveal ol{list-style-type:decimal}.reveal ul{list-style-type:disc}.reveal ul ul{list-style-type:square}.reveal ul ul ul{list-style-type:circle}.reveal ul ul,.reveal ul ol,.reveal ol ol,.reveal ol ul{display:block;margin-left:40px}.reveal dt{font-weight:bold}.reveal dd{margin-left:40px}.reveal blockquote{display:block;position:relative;width:70%;margin:var(--r-block-margin) auto;padding:5px;font-style:italic;background:rgba(255,255,255,.05);box-shadow:0px 0px 2px rgba(0,0,0,.2)}.reveal blockquote p:first-child,.reveal blockquote p:last-child{display:inline-block}.reveal q{font-style:italic}.reveal pre{display:block;position:relative;width:90%;margin:var(--r-block-margin) auto;text-align:left;font-size:.55em;font-family:var(--r-code-font);line-height:1.2em;word-wrap:break-word;box-shadow:0px 5px 15px rgba(0,0,0,.15)}.reveal code{font-family:var(--r-code-font);text-transform:none;tab-size:2}.reveal pre code{display:block;padding:5px;overflow:auto;max-height:400px;word-wrap:normal}.reveal .code-wrapper{white-space:normal}.reveal .code-wrapper code{white-space:pre}.reveal table{margin:auto;border-collapse:collapse;border-spacing:0}.reveal table th{font-weight:bold}.reveal table th,.reveal table td{text-align:left;padding:.2em .5em .2em .5em;border-bottom:1px solid}.reveal table th[align=center],.reveal table td[align=center]{text-align:center}.reveal table th[align=right],.reveal table td[align=right]{text-align:right}.reveal table tbody tr:last-child th,.reveal table tbody tr:last-child td{border-bottom:none}.reveal sup{vertical-align:super;font-size:smaller}.reveal sub{vertical-align:sub;font-size:smaller}.reveal small{display:inline-block;font-size:.6em;line-height:1.2em;vertical-align:top}.reveal small *{vertical-align:top}.reveal img{margin:var(--r-block-margin) 0}.reveal a{color:var(--r-link-color);text-decoration:none;transition:color .15s ease}.reveal a:hover{color:var(--r-link-color-hover);text-shadow:none;border:none}.reveal .roll span:after{color:#fff;background:var(--r-link-color-dark)}.reveal .r-frame{border:4px solid var(--r-main-color);box-shadow:0 0 10px rgba(0,0,0,.15)}.reveal a .r-frame{transition:all .15s linear}.reveal a:hover .r-frame{border-color:var(--r-link-color);box-shadow:0 0 20px rgba(0,0,0,.55)}.reveal .controls{color:var(--r-link-color)}.reveal .progress{background:rgba(0,0,0,.2);color:var(--r-link-color)}@media print{.backgrounds{background-color:var(--r-background-color)}}.top-right{position:absolute;top:1em;right:1em}.visually-hidden{border:0;clip:rect(0 0 0 0);height:auto;margin:0;overflow:hidden;padding:0;position:absolute;width:1px;white-space:nowrap}.hidden{display:none !important}.zindex-bottom{z-index:-1 !important}figure.figure{display:block}.quarto-layout-panel{margin-bottom:1em}.quarto-layout-panel>figure{width:100%}.quarto-layout-panel>figure>figcaption,.quarto-layout-panel>.panel-caption{margin-top:10pt}.quarto-layout-panel>.table-caption{margin-top:0px}.table-caption p{margin-bottom:.5em}.quarto-layout-row{display:flex;flex-direction:row;align-items:flex-start}.quarto-layout-valign-top{align-items:flex-start}.quarto-layout-valign-bottom{align-items:flex-end}.quarto-layout-valign-center{align-items:center}.quarto-layout-cell{position:relative;margin-right:20px}.quarto-layout-cell:last-child{margin-right:0}.quarto-layout-cell figure,.quarto-layout-cell>p{margin:.2em}.quarto-layout-cell img{max-width:100%}.quarto-layout-cell .html-widget{width:100% !important}.quarto-layout-cell div figure p{margin:0}.quarto-layout-cell figure{display:block;margin-inline-start:0;margin-inline-end:0}.quarto-layout-cell table{display:inline-table}.quarto-layout-cell-subref figcaption,figure .quarto-layout-row figure figcaption{text-align:center;font-style:italic}.quarto-figure{position:relative;margin-bottom:1em}.quarto-figure>figure{width:100%;margin-bottom:0}.quarto-figure-left>figure>p,.quarto-figure-left>figure>div{text-align:left}.quarto-figure-center>figure>p,.quarto-figure-center>figure>div{text-align:center}.quarto-figure-right>figure>p,.quarto-figure-right>figure>div{text-align:right}.quarto-figure>figure>div.cell-annotation,.quarto-figure>figure>div code{text-align:left}figure>p:empty{display:none}figure>p:first-child{margin-top:0;margin-bottom:0}figure>figcaption.quarto-float-caption-bottom{margin-bottom:.5em}figure>figcaption.quarto-float-caption-top{margin-top:.5em}div[id^=tbl-]{position:relative}.quarto-figure>.anchorjs-link{position:absolute;top:.6em;right:.5em}div[id^=tbl-]>.anchorjs-link{position:absolute;top:.7em;right:.3em}.quarto-figure:hover>.anchorjs-link,div[id^=tbl-]:hover>.anchorjs-link,h2:hover>.anchorjs-link,h3:hover>.anchorjs-link,h4:hover>.anchorjs-link,h5:hover>.anchorjs-link,h6:hover>.anchorjs-link,.reveal-anchorjs-link>.anchorjs-link{opacity:1}#title-block-header{margin-block-end:1rem;position:relative;margin-top:-1px}#title-block-header .abstract{margin-block-start:1rem}#title-block-header .abstract .abstract-title{font-weight:600}#title-block-header a{text-decoration:none}#title-block-header .author,#title-block-header .date,#title-block-header .doi{margin-block-end:.2rem}#title-block-header .quarto-title-block>div{display:flex}#title-block-header .quarto-title-block>div>h1{flex-grow:1}#title-block-header .quarto-title-block>div>button{flex-shrink:0;height:2.25rem;margin-top:0}tr.header>th>p:last-of-type{margin-bottom:0px}table,table.table{margin-top:.5rem;margin-bottom:.5rem}caption,.table-caption{padding-top:.5rem;padding-bottom:.5rem;text-align:center}figure.quarto-float-tbl figcaption.quarto-float-caption-top{margin-top:.5rem;margin-bottom:.25rem;text-align:center}figure.quarto-float-tbl figcaption.quarto-float-caption-bottom{padding-top:.25rem;margin-bottom:.5rem;text-align:center}.utterances{max-width:none;margin-left:-8px}iframe{margin-bottom:1em}details{margin-bottom:1em}details[show]{margin-bottom:0}details>summary{color:#fff}details>summary>p:only-child{display:inline}pre.sourceCode,code.sourceCode{position:relative}dd code:not(.sourceCode),p code:not(.sourceCode){white-space:pre-wrap}code{white-space:pre}@media print{code{white-space:pre-wrap}}pre>code{display:block}pre>code.sourceCode{white-space:pre}pre>code.sourceCode>span>a:first-child::before{text-decoration:none}pre.code-overflow-wrap>code.sourceCode{white-space:pre-wrap}pre.code-overflow-scroll>code.sourceCode{white-space:pre}code a:any-link{color:inherit;text-decoration:none}code a:hover{color:inherit;text-decoration:underline}ul.task-list{padding-left:1em}[data-tippy-root]{display:inline-block}.tippy-content .footnote-back{display:none}.footnote-back{margin-left:.2em}.tippy-content{overflow-x:auto}.quarto-embedded-source-code{display:none}.quarto-unresolved-ref{font-weight:600}.quarto-cover-image{max-width:35%;float:right;margin-left:30px}.cell-output-display .widget-subarea{margin-bottom:1em}.cell-output-display:not(.no-overflow-x),.knitsql-table:not(.no-overflow-x){overflow-x:auto}.panel-input{margin-bottom:1em}.panel-input>div,.panel-input>div>div{display:inline-block;vertical-align:top;padding-right:12px}.panel-input>p:last-child{margin-bottom:0}.layout-sidebar{margin-bottom:1em}.layout-sidebar .tab-content{border:none}.tab-content>.page-columns.active{display:grid}div.sourceCode>iframe{width:100%;height:300px;margin-bottom:-0.5em}a{text-underline-offset:3px}div.ansi-escaped-output{font-family:monospace;display:block}/*! * * ansi colors from IPython notebook's * * we also add `bright-[color]-` synonyms for the `-[color]-intense` classes since * that seems to be what ansi_up emits * -*/.ansi-black-fg{color:#3e424d}.ansi-black-bg{background-color:#3e424d}.ansi-black-intense-black,.ansi-bright-black-fg{color:#282c36}.ansi-black-intense-black,.ansi-bright-black-bg{background-color:#282c36}.ansi-red-fg{color:#e75c58}.ansi-red-bg{background-color:#e75c58}.ansi-red-intense-red,.ansi-bright-red-fg{color:#b22b31}.ansi-red-intense-red,.ansi-bright-red-bg{background-color:#b22b31}.ansi-green-fg{color:#00a250}.ansi-green-bg{background-color:#00a250}.ansi-green-intense-green,.ansi-bright-green-fg{color:#007427}.ansi-green-intense-green,.ansi-bright-green-bg{background-color:#007427}.ansi-yellow-fg{color:#ddb62b}.ansi-yellow-bg{background-color:#ddb62b}.ansi-yellow-intense-yellow,.ansi-bright-yellow-fg{color:#b27d12}.ansi-yellow-intense-yellow,.ansi-bright-yellow-bg{background-color:#b27d12}.ansi-blue-fg{color:#208ffb}.ansi-blue-bg{background-color:#208ffb}.ansi-blue-intense-blue,.ansi-bright-blue-fg{color:#0065ca}.ansi-blue-intense-blue,.ansi-bright-blue-bg{background-color:#0065ca}.ansi-magenta-fg{color:#d160c4}.ansi-magenta-bg{background-color:#d160c4}.ansi-magenta-intense-magenta,.ansi-bright-magenta-fg{color:#a03196}.ansi-magenta-intense-magenta,.ansi-bright-magenta-bg{background-color:#a03196}.ansi-cyan-fg{color:#60c6c8}.ansi-cyan-bg{background-color:#60c6c8}.ansi-cyan-intense-cyan,.ansi-bright-cyan-fg{color:#258f8f}.ansi-cyan-intense-cyan,.ansi-bright-cyan-bg{background-color:#258f8f}.ansi-white-fg{color:#c5c1b4}.ansi-white-bg{background-color:#c5c1b4}.ansi-white-intense-white,.ansi-bright-white-fg{color:#a1a6b2}.ansi-white-intense-white,.ansi-bright-white-bg{background-color:#a1a6b2}.ansi-default-inverse-fg{color:#fff}.ansi-default-inverse-bg{background-color:#000}.ansi-bold{font-weight:bold}.ansi-underline{text-decoration:underline}:root{--quarto-body-bg: #01364C;--quarto-body-color: #F7F8F9;--quarto-text-muted: white;--quarto-border-color: white;--quarto-border-width: 1px;--quarto-border-radius: 4px}table.gt_table{color:var(--quarto-body-color);font-size:1em;width:100%;background-color:rgba(0,0,0,0);border-top-width:inherit;border-bottom-width:inherit;border-color:var(--quarto-border-color)}table.gt_table th.gt_column_spanner_outer{color:var(--quarto-body-color);background-color:rgba(0,0,0,0);border-top-width:inherit;border-bottom-width:inherit;border-color:var(--quarto-border-color)}table.gt_table th.gt_col_heading{color:var(--quarto-body-color);font-weight:bold;background-color:rgba(0,0,0,0)}table.gt_table thead.gt_col_headings{border-bottom:1px solid currentColor;border-top-width:inherit;border-top-color:var(--quarto-border-color)}table.gt_table thead.gt_col_headings:not(:first-child){border-top-width:1px;border-top-color:var(--quarto-border-color)}table.gt_table td.gt_row{border-bottom-width:1px;border-bottom-color:var(--quarto-border-color);border-top-width:0px}table.gt_table tbody.gt_table_body{border-top-width:1px;border-bottom-width:1px;border-bottom-color:var(--quarto-border-color);border-top-color:currentColor}div.columns{display:initial;gap:initial}div.column{display:inline-block;overflow-x:initial;vertical-align:top;width:50%}.code-annotation-tip-content{word-wrap:break-word}.code-annotation-container-hidden{display:none !important}dl.code-annotation-container-grid{display:grid;grid-template-columns:min-content auto}dl.code-annotation-container-grid dt{grid-column:1}dl.code-annotation-container-grid dd{grid-column:2}pre.sourceCode.code-annotation-code{padding-right:0}code.sourceCode .code-annotation-anchor{z-index:100;position:relative;float:right;background-color:rgba(0,0,0,0)}input[type=checkbox]{margin-right:.5ch}:root{--mermaid-bg-color: #01364C;--mermaid-edge-color: #F4BA02;--mermaid-node-fg-color: #99D9DD;--mermaid-fg-color: #F7F8F9;--mermaid-fg-color--lighter: white;--mermaid-fg-color--lightest: white;--mermaid-font-family: Roboto, sans-serif;--mermaid-label-bg-color: #01364C;--mermaid-label-fg-color: #F7F8F9;--mermaid-node-bg-color: rgba(153, 217, 221, 0.1);--mermaid-node-fg-color: #99D9DD}@media print{:root{font-size:11pt}#quarto-sidebar,#TOC,.nav-page{display:none}.page-columns .content{grid-column-start:page-start}.fixed-top{position:relative}.panel-caption,.figure-caption,figcaption{color:#666}}.code-copy-button{position:absolute;top:0;right:0;border:0;margin-top:5px;margin-right:5px;background-color:rgba(0,0,0,0);z-index:3}.code-copy-button:focus{outline:none}.code-copy-button-tooltip{font-size:.75em}pre.sourceCode:hover>.code-copy-button>.bi::before{display:inline-block;height:1rem;width:1rem;content:"";vertical-align:-0.125em;background-image:url('data:image/svg+xml,');background-repeat:no-repeat;background-size:1rem 1rem}pre.sourceCode:hover>.code-copy-button-checked>.bi::before{background-image:url('data:image/svg+xml,')}pre.sourceCode:hover>.code-copy-button:hover>.bi::before{background-image:url('data:image/svg+xml,')}pre.sourceCode:hover>.code-copy-button-checked:hover>.bi::before{background-image:url('data:image/svg+xml,')}.panel-tabset [role=tablist]{border-bottom:1px solid #fff;list-style:none;margin:0;padding:0;width:100%}.panel-tabset [role=tablist] *{-webkit-box-sizing:border-box;box-sizing:border-box}@media(min-width: 30em){.panel-tabset [role=tablist] li{display:inline-block}}.panel-tabset [role=tab]{border:1px solid rgba(0,0,0,0);border-top-color:#fff;display:block;padding:.5em 1em;text-decoration:none}@media(min-width: 30em){.panel-tabset [role=tab]{border-top-color:rgba(0,0,0,0);display:inline-block;margin-bottom:-1px}}.panel-tabset [role=tab][aria-selected=true]{background-color:#fff}@media(min-width: 30em){.panel-tabset [role=tab][aria-selected=true]{background-color:rgba(0,0,0,0);border:1px solid #fff;border-bottom-color:#01364c}}@media(min-width: 30em){.panel-tabset [role=tab]:hover:not([aria-selected=true]){border:1px solid #fff}}.code-with-filename .code-with-filename-file{margin-bottom:0;padding-bottom:2px;padding-top:2px;padding-left:.7em;border:var(--quarto-border-width) solid var(--quarto-border-color);border-radius:var(--quarto-border-radius);border-bottom:0;border-bottom-left-radius:0%;border-bottom-right-radius:0%}.code-with-filename div.sourceCode,.reveal .code-with-filename div.sourceCode{margin-top:0;border-top-left-radius:0%;border-top-right-radius:0%}.code-with-filename .code-with-filename-file pre{margin-bottom:0}.code-with-filename .code-with-filename-file{background-color:rgba(219,219,219,.8)}.quarto-dark .code-with-filename .code-with-filename-file{background-color:#555}.code-with-filename .code-with-filename-file strong{font-weight:400}.reveal.center .slide aside,.reveal.center .slide div.aside{position:initial}section.has-light-background,section.has-light-background h1,section.has-light-background h2,section.has-light-background h3,section.has-light-background h4,section.has-light-background h5,section.has-light-background h6{color:#222}section.has-light-background a,section.has-light-background a:hover{color:#2a76dd}section.has-light-background code{color:#4758ab}section.has-dark-background,section.has-dark-background h1,section.has-dark-background h2,section.has-dark-background h3,section.has-dark-background h4,section.has-dark-background h5,section.has-dark-background h6{color:#fff}section.has-dark-background a,section.has-dark-background a:hover{color:#42affa}section.has-dark-background code{color:#ffa07a}#title-slide,div.reveal div.slides section.quarto-title-block{text-align:center}#title-slide .subtitle,div.reveal div.slides section.quarto-title-block .subtitle{margin-bottom:2.5rem}.reveal .slides{text-align:left}.reveal .title-slide h1{font-size:1.6em}.reveal[data-navigation-mode=linear] .title-slide h1{font-size:2.5em}.reveal div.sourceCode{border:1px solid #fff;border-radius:4px}.reveal pre{width:100%;box-shadow:none;background-color:#01364c;border:none;margin:0;font-size:.55em}.reveal code{color:var(--quarto-hl-fu-color);background-color:rgba(0,0,0,0);white-space:pre-wrap}.reveal pre.sourceCode code{background-color:#01364c;padding:6px 9px;max-height:500px;white-space:pre}.reveal pre code{background-color:#01364c;color:#f7f8f9}.reveal .column-output-location{display:flex;align-items:stretch}.reveal .column-output-location .column:first-of-type div.sourceCode{height:100%;background-color:#01364c}.reveal blockquote{display:block;position:relative;color:#fff;width:unset;margin:var(--r-block-margin) auto;padding:.625rem 1.75rem;border-left:.25rem solid #fff;font-style:normal;background:none;box-shadow:none}.reveal blockquote p:first-child,.reveal blockquote p:last-child{display:block}.reveal .slide aside,.reveal .slide div.aside{position:absolute;bottom:20px;font-size:0.7em;color:#fff}.reveal .slide sup{font-size:0.7em}.reveal .slide.scrollable aside,.reveal .slide.scrollable div.aside{position:relative;margin-top:1em}.reveal .slide aside .aside-footnotes{margin-bottom:0}.reveal .slide aside .aside-footnotes li:first-of-type{margin-top:0}.reveal .layout-sidebar{display:flex;width:100%;margin-top:.8em}.reveal .layout-sidebar .panel-sidebar{width:270px}.reveal .layout-sidebar-left .panel-sidebar{margin-right:calc(0.5em*2)}.reveal .layout-sidebar-right .panel-sidebar{margin-left:calc(0.5em*2)}.reveal .layout-sidebar .panel-fill,.reveal .layout-sidebar .panel-center,.reveal .layout-sidebar .panel-tabset{flex:1}.reveal .panel-input,.reveal .panel-sidebar{font-size:.5em;padding:.5em;border-style:solid;border-color:#fff;border-width:1px;border-radius:4px;background-color:#f8f9fa}.reveal .panel-sidebar :first-child,.reveal .panel-fill :first-child{margin-top:0}.reveal .panel-sidebar :last-child,.reveal .panel-fill :last-child{margin-bottom:0}.panel-input>div,.panel-input>div>div{vertical-align:middle;padding-right:1em}.reveal p,.reveal .slides section,.reveal .slides section>section{line-height:1.3}.reveal.smaller .slides section,.reveal .slides section.smaller,.reveal .slides section .callout{font-size:0.7em}.reveal.smaller .slides section section{font-size:inherit}.reveal.smaller .slides h1,.reveal .slides section.smaller h1{font-size:calc(2.5em/0.7)}.reveal.smaller .slides h2,.reveal .slides section.smaller h2{font-size:calc(1.6em/0.7)}.reveal.smaller .slides h3,.reveal .slides section.smaller h3{font-size:calc(1.3em/0.7)}.reveal .columns>.column>:not(ul,ol){margin-left:.25em;margin-right:.25em}.reveal .columns>.column:first-child>:not(ul,ol){margin-right:.5em;margin-left:0}.reveal .columns>.column:last-child>:not(ul,ol){margin-right:0;margin-left:.5em}.reveal .slide-number{color:#bfe7ea;background-color:#01364c}.reveal .footer{color:#fff}.reveal .footer a{color:#99d9dd}.reveal .footer.has-dark-background{color:#fff}.reveal .footer.has-dark-background a{color:#7bc6fa}.reveal .footer.has-light-background{color:#505050}.reveal .footer.has-light-background a{color:#6a9bdd}.reveal .slide-number{color:#fff}.reveal .slide-number.has-dark-background{color:#fff}.reveal .slide-number.has-light-background{color:#505050}.reveal .slide figure>figcaption,.reveal .slide img.stretch+p.caption,.reveal .slide img.r-stretch+p.caption{font-size:0.7em}@media screen and (min-width: 500px){.reveal .controls[data-controls-layout=edges] .navigate-left{left:.2em}.reveal .controls[data-controls-layout=edges] .navigate-right{right:.2em}.reveal .controls[data-controls-layout=edges] .navigate-up{top:.4em}.reveal .controls[data-controls-layout=edges] .navigate-down{bottom:2.3em}}.tippy-box[data-theme~=light-border]{background-color:#01364c;color:#f7f8f9;border-radius:4px;border:solid 1px #fff;font-size:.6em}.tippy-box[data-theme~=light-border] .tippy-arrow{color:#fff}.tippy-box[data-placement^=bottom]>.tippy-content{padding:7px 10px;z-index:1}.reveal .callout.callout-style-simple .callout-body,.reveal .callout.callout-style-default .callout-body,.reveal .callout.callout-style-simple div.callout-title,.reveal .callout.callout-style-default div.callout-title{font-size:inherit}.reveal .callout.callout-style-default .callout-icon::before,.reveal .callout.callout-style-simple .callout-icon::before{height:2rem;width:2rem;background-size:2rem 2rem}.reveal .callout.callout-titled .callout-title p{margin-top:.5em}.reveal .callout.callout-titled .callout-icon::before{margin-top:1rem}.reveal .callout.callout-titled .callout-body>.callout-content>:last-child{margin-bottom:1rem}.reveal .panel-tabset [role=tab]{padding:.25em .7em}.reveal .slide-menu-button .fa-bars::before{background-image:url('data:image/svg+xml,')}.reveal .slide-chalkboard-buttons .fa-easel2::before{background-image:url('data:image/svg+xml,')}.reveal .slide-chalkboard-buttons .fa-brush::before{background-image:url('data:image/svg+xml,')}/*! dark */.reveal div.callout.callout-style-default .callout-title{color:#222}.reveal ol[type=a]{list-style-type:lower-alpha}.reveal ol[type=a s]{list-style-type:lower-alpha}.reveal ol[type=A s]{list-style-type:upper-alpha}.reveal ol[type=i]{list-style-type:lower-roman}.reveal ol[type=i s]{list-style-type:lower-roman}.reveal ol[type=I s]{list-style-type:upper-roman}.reveal ol[type="1"]{list-style-type:decimal}.reveal ul.task-list{list-style:none}.reveal ul.task-list li input[type=checkbox]{width:2em;height:2em;margin:0 1em .5em -1.6em;vertical-align:middle}div.cell-output-display div.pagedtable-wrapper table.table{font-size:.6em}.reveal .code-annotation-container-hidden{display:none}.reveal code.sourceCode button.code-annotation-anchor,.reveal code.sourceCode .code-annotation-anchor{font-family:SFMono-Regular,Menlo,Monaco,Consolas,"Liberation Mono","Courier New",monospace;color:var(--quarto-hl-co-color);border:solid var(--quarto-hl-co-color) 1px;border-radius:50%;font-size:.7em;line-height:1.2em;margin-top:2px;user-select:none;-webkit-user-select:none;-moz-user-select:none;-ms-user-select:none;-o-user-select:none}.reveal code.sourceCode button.code-annotation-anchor{cursor:pointer}.reveal code.sourceCode a.code-annotation-anchor{text-align:center;vertical-align:middle;text-decoration:none;cursor:default;height:1.2em;width:1.2em}.reveal code.sourceCode.fragment a.code-annotation-anchor{left:auto}.reveal #code-annotation-line-highlight-gutter{width:100%;border-top:solid var(--quarto-hl-co-color) 1px;border-bottom:solid var(--quarto-hl-co-color) 1px;z-index:2}.reveal #code-annotation-line-highlight{margin-left:-8em;width:calc(100% + 4em);border-top:solid var(--quarto-hl-co-color) 1px;border-bottom:solid var(--quarto-hl-co-color) 1px;z-index:2;margin-bottom:-2px}.reveal code.sourceCode .code-annotation-anchor.code-annotation-active{background-color:var(--quarto-hl-normal-color, #aaaaaa);border:solid var(--quarto-hl-normal-color, #aaaaaa) 1px;color:#01364c;font-weight:bolder}.reveal pre.code-annotation-code{padding-top:0;padding-bottom:0}.reveal pre.code-annotation-code code{z-index:3;padding-left:0px}.reveal dl.code-annotation-container-grid{margin-left:.1em}.reveal dl.code-annotation-container-grid dt{margin-top:.65rem;font-family:SFMono-Regular,Menlo,Monaco,Consolas,"Liberation Mono","Courier New",monospace;border:solid #f7f8f9 1px;border-radius:50%;height:1.3em;width:1.3em;line-height:1.3em;font-size:.5em;text-align:center;vertical-align:middle;text-decoration:none}.reveal dl.code-annotation-container-grid dd{margin-left:.25em}.reveal .scrollable ol li:first-child:nth-last-child(n+10),.reveal .scrollable ol li:first-child:nth-last-child(n+10)~li{margin-left:1em}html.print-pdf .reveal .slides .pdf-page:last-child{page-break-after:avoid}.reveal .quarto-title-block .quarto-title-authors{display:flex;justify-content:center}.reveal .quarto-title-block .quarto-title-authors .quarto-title-author{padding-left:.5em;padding-right:.5em}.reveal .quarto-title-block .quarto-title-authors .quarto-title-author a,.reveal .quarto-title-block .quarto-title-authors .quarto-title-author a:hover,.reveal .quarto-title-block .quarto-title-authors .quarto-title-author a:visited,.reveal .quarto-title-block .quarto-title-authors .quarto-title-author a:active{color:inherit;text-decoration:none}.reveal .quarto-title-block .quarto-title-authors .quarto-title-author .quarto-title-author-name{margin-bottom:.1rem}.reveal .quarto-title-block .quarto-title-authors .quarto-title-author .quarto-title-author-email{margin-top:0px;margin-bottom:.4em;font-size:.6em}.reveal .quarto-title-block .quarto-title-authors .quarto-title-author .quarto-title-author-orcid img{margin-bottom:4px}.reveal .quarto-title-block .quarto-title-authors .quarto-title-author .quarto-title-affiliation{font-size:.7em;margin-top:0px;margin-bottom:8px}.reveal .quarto-title-block .quarto-title-authors .quarto-title-author .quarto-title-affiliation:first{margin-top:12px}.blue{color:#99d9dd;font-weight:bold}.yellow{color:#f4ba02;font-weight:bold}.green{color:#005221;font-weight:bold}.reveal .slide a{text-decoration:underline}.reveal section div.center-h{text-align:center}.variant-one{color:#d6d6d6}.variant-one h1,.variant-one h2,.variant-one h3{color:#f3f3f3}.variant-one a{color:#00e0e0}.variant-one p code{color:gold}.variant-two{color:#a6a6d6}.variant-two h1,.variant-two h2,.variant-two h3{color:#222}.variant-two a{color:#f22341}.variant-two p code{color:#f0f}/*# sourceMappingURL=f95d2bded9c28492b788fe14c3e9f347.css.map */ +*/.ansi-black-fg{color:#3e424d}.ansi-black-bg{background-color:#3e424d}.ansi-black-intense-black,.ansi-bright-black-fg{color:#282c36}.ansi-black-intense-black,.ansi-bright-black-bg{background-color:#282c36}.ansi-red-fg{color:#e75c58}.ansi-red-bg{background-color:#e75c58}.ansi-red-intense-red,.ansi-bright-red-fg{color:#b22b31}.ansi-red-intense-red,.ansi-bright-red-bg{background-color:#b22b31}.ansi-green-fg{color:#00a250}.ansi-green-bg{background-color:#00a250}.ansi-green-intense-green,.ansi-bright-green-fg{color:#007427}.ansi-green-intense-green,.ansi-bright-green-bg{background-color:#007427}.ansi-yellow-fg{color:#ddb62b}.ansi-yellow-bg{background-color:#ddb62b}.ansi-yellow-intense-yellow,.ansi-bright-yellow-fg{color:#b27d12}.ansi-yellow-intense-yellow,.ansi-bright-yellow-bg{background-color:#b27d12}.ansi-blue-fg{color:#208ffb}.ansi-blue-bg{background-color:#208ffb}.ansi-blue-intense-blue,.ansi-bright-blue-fg{color:#0065ca}.ansi-blue-intense-blue,.ansi-bright-blue-bg{background-color:#0065ca}.ansi-magenta-fg{color:#d160c4}.ansi-magenta-bg{background-color:#d160c4}.ansi-magenta-intense-magenta,.ansi-bright-magenta-fg{color:#a03196}.ansi-magenta-intense-magenta,.ansi-bright-magenta-bg{background-color:#a03196}.ansi-cyan-fg{color:#60c6c8}.ansi-cyan-bg{background-color:#60c6c8}.ansi-cyan-intense-cyan,.ansi-bright-cyan-fg{color:#258f8f}.ansi-cyan-intense-cyan,.ansi-bright-cyan-bg{background-color:#258f8f}.ansi-white-fg{color:#c5c1b4}.ansi-white-bg{background-color:#c5c1b4}.ansi-white-intense-white,.ansi-bright-white-fg{color:#a1a6b2}.ansi-white-intense-white,.ansi-bright-white-bg{background-color:#a1a6b2}.ansi-default-inverse-fg{color:#fff}.ansi-default-inverse-bg{background-color:#000}.ansi-bold{font-weight:bold}.ansi-underline{text-decoration:underline}:root{--quarto-body-bg: #01364C;--quarto-body-color: #F7F8F9;--quarto-text-muted: white;--quarto-border-color: white;--quarto-border-width: 1px;--quarto-border-radius: 4px}table.gt_table{color:var(--quarto-body-color);font-size:1em;width:100%;background-color:rgba(0,0,0,0);border-top-width:inherit;border-bottom-width:inherit;border-color:var(--quarto-border-color)}table.gt_table th.gt_column_spanner_outer{color:var(--quarto-body-color);background-color:rgba(0,0,0,0);border-top-width:inherit;border-bottom-width:inherit;border-color:var(--quarto-border-color)}table.gt_table th.gt_col_heading{color:var(--quarto-body-color);font-weight:bold;background-color:rgba(0,0,0,0)}table.gt_table thead.gt_col_headings{border-bottom:1px solid currentColor;border-top-width:inherit;border-top-color:var(--quarto-border-color)}table.gt_table thead.gt_col_headings:not(:first-child){border-top-width:1px;border-top-color:var(--quarto-border-color)}table.gt_table td.gt_row{border-bottom-width:1px;border-bottom-color:var(--quarto-border-color);border-top-width:0px}table.gt_table tbody.gt_table_body{border-top-width:1px;border-bottom-width:1px;border-bottom-color:var(--quarto-border-color);border-top-color:currentColor}div.columns{display:initial;gap:initial}div.column{display:inline-block;overflow-x:initial;vertical-align:top;width:50%}.code-annotation-tip-content{word-wrap:break-word}.code-annotation-container-hidden{display:none !important}dl.code-annotation-container-grid{display:grid;grid-template-columns:min-content auto}dl.code-annotation-container-grid dt{grid-column:1}dl.code-annotation-container-grid dd{grid-column:2}pre.sourceCode.code-annotation-code{padding-right:0}code.sourceCode .code-annotation-anchor{z-index:100;position:relative;float:right;background-color:rgba(0,0,0,0)}input[type=checkbox]{margin-right:.5ch}:root{--mermaid-bg-color: #01364C;--mermaid-edge-color: #F4BA02;--mermaid-node-fg-color: #99D9DD;--mermaid-fg-color: #F7F8F9;--mermaid-fg-color--lighter: white;--mermaid-fg-color--lightest: white;--mermaid-font-family: Roboto, sans-serif;--mermaid-label-bg-color: #01364C;--mermaid-label-fg-color: #F7F8F9;--mermaid-node-bg-color: rgba(153, 217, 221, 0.1);--mermaid-node-fg-color: #99D9DD}@media print{:root{font-size:11pt}#quarto-sidebar,#TOC,.nav-page{display:none}.page-columns .content{grid-column-start:page-start}.fixed-top{position:relative}.panel-caption,.figure-caption,figcaption{color:#666}}.code-copy-button{position:absolute;top:0;right:0;border:0;margin-top:5px;margin-right:5px;background-color:rgba(0,0,0,0);z-index:3}.code-copy-button:focus{outline:none}.code-copy-button-tooltip{font-size:.75em}pre.sourceCode:hover>.code-copy-button>.bi::before{display:inline-block;height:1rem;width:1rem;content:"";vertical-align:-0.125em;background-image:url('data:image/svg+xml,');background-repeat:no-repeat;background-size:1rem 1rem}pre.sourceCode:hover>.code-copy-button-checked>.bi::before{background-image:url('data:image/svg+xml,')}pre.sourceCode:hover>.code-copy-button:hover>.bi::before{background-image:url('data:image/svg+xml,')}pre.sourceCode:hover>.code-copy-button-checked:hover>.bi::before{background-image:url('data:image/svg+xml,')}.panel-tabset [role=tablist]{border-bottom:1px solid #fff;list-style:none;margin:0;padding:0;width:100%}.panel-tabset [role=tablist] *{-webkit-box-sizing:border-box;box-sizing:border-box}@media(min-width: 30em){.panel-tabset [role=tablist] li{display:inline-block}}.panel-tabset [role=tab]{border:1px solid rgba(0,0,0,0);border-top-color:#fff;display:block;padding:.5em 1em;text-decoration:none}@media(min-width: 30em){.panel-tabset [role=tab]{border-top-color:rgba(0,0,0,0);display:inline-block;margin-bottom:-1px}}.panel-tabset [role=tab][aria-selected=true]{background-color:#fff}@media(min-width: 30em){.panel-tabset [role=tab][aria-selected=true]{background-color:rgba(0,0,0,0);border:1px solid #fff;border-bottom-color:#01364c}}@media(min-width: 30em){.panel-tabset [role=tab]:hover:not([aria-selected=true]){border:1px solid #fff}}.code-with-filename .code-with-filename-file{margin-bottom:0;padding-bottom:2px;padding-top:2px;padding-left:.7em;border:var(--quarto-border-width) solid var(--quarto-border-color);border-radius:var(--quarto-border-radius);border-bottom:0;border-bottom-left-radius:0%;border-bottom-right-radius:0%}.code-with-filename div.sourceCode,.reveal .code-with-filename div.sourceCode{margin-top:0;border-top-left-radius:0%;border-top-right-radius:0%}.code-with-filename .code-with-filename-file pre{margin-bottom:0}.code-with-filename .code-with-filename-file{background-color:rgba(219,219,219,.8)}.quarto-dark .code-with-filename .code-with-filename-file{background-color:#555}.code-with-filename .code-with-filename-file strong{font-weight:400}.reveal.center .slide aside,.reveal.center .slide div.aside{position:initial}section.has-light-background,section.has-light-background h1,section.has-light-background h2,section.has-light-background h3,section.has-light-background h4,section.has-light-background h5,section.has-light-background h6{color:#222}section.has-light-background a,section.has-light-background a:hover{color:#2a76dd}section.has-light-background code{color:#4758ab}section.has-dark-background,section.has-dark-background h1,section.has-dark-background h2,section.has-dark-background h3,section.has-dark-background h4,section.has-dark-background h5,section.has-dark-background h6{color:#fff}section.has-dark-background a,section.has-dark-background a:hover{color:#42affa}section.has-dark-background code{color:#ffa07a}#title-slide,div.reveal div.slides section.quarto-title-block{text-align:center}#title-slide .subtitle,div.reveal div.slides section.quarto-title-block .subtitle{margin-bottom:2.5rem}.reveal .slides{text-align:left}.reveal .title-slide h1{font-size:1.6em}.reveal[data-navigation-mode=linear] .title-slide h1{font-size:2.5em}.reveal div.sourceCode{border:1px solid #fff;border-radius:4px}.reveal pre{width:100%;box-shadow:none;background-color:#01364c;border:none;margin:0;font-size:.55em}.reveal .code-with-filename .code-with-filename-file pre{background-color:unset}.reveal code{color:var(--quarto-hl-fu-color);background-color:rgba(0,0,0,0);white-space:pre-wrap}.reveal pre.sourceCode code{background-color:#01364c;padding:6px 9px;max-height:500px;white-space:pre}.reveal pre code{background-color:#01364c;color:#f7f8f9}.reveal .column-output-location{display:flex;align-items:stretch}.reveal .column-output-location .column:first-of-type div.sourceCode{height:100%;background-color:#01364c}.reveal blockquote{display:block;position:relative;color:#fff;width:unset;margin:var(--r-block-margin) auto;padding:.625rem 1.75rem;border-left:.25rem solid #fff;font-style:normal;background:none;box-shadow:none}.reveal blockquote p:first-child,.reveal blockquote p:last-child{display:block}.reveal .slide aside,.reveal .slide div.aside{position:absolute;bottom:20px;font-size:0.7em;color:#fff}.reveal .slide sup{font-size:0.7em}.reveal .slide.scrollable aside,.reveal .slide.scrollable div.aside{position:relative;margin-top:1em}.reveal .slide aside .aside-footnotes{margin-bottom:0}.reveal .slide aside .aside-footnotes li:first-of-type{margin-top:0}.reveal .layout-sidebar{display:flex;width:100%;margin-top:.8em}.reveal .layout-sidebar .panel-sidebar{width:270px}.reveal .layout-sidebar-left .panel-sidebar{margin-right:calc(0.5em*2)}.reveal .layout-sidebar-right .panel-sidebar{margin-left:calc(0.5em*2)}.reveal .layout-sidebar .panel-fill,.reveal .layout-sidebar .panel-center,.reveal .layout-sidebar .panel-tabset{flex:1}.reveal .panel-input,.reveal .panel-sidebar{font-size:.5em;padding:.5em;border-style:solid;border-color:#fff;border-width:1px;border-radius:4px;background-color:#f8f9fa}.reveal .panel-sidebar :first-child,.reveal .panel-fill :first-child{margin-top:0}.reveal .panel-sidebar :last-child,.reveal .panel-fill :last-child{margin-bottom:0}.panel-input>div,.panel-input>div>div{vertical-align:middle;padding-right:1em}.reveal p,.reveal .slides section,.reveal .slides section>section{line-height:1.3}.reveal.smaller .slides section,.reveal .slides section.smaller,.reveal .slides section .callout{font-size:0.7em}.reveal.smaller .slides section section{font-size:inherit}.reveal.smaller .slides h1,.reveal .slides section.smaller h1{font-size:calc(2.5em/0.7)}.reveal.smaller .slides h2,.reveal .slides section.smaller h2{font-size:calc(1.6em/0.7)}.reveal.smaller .slides h3,.reveal .slides section.smaller h3{font-size:calc(1.3em/0.7)}.reveal .columns>.column>:not(ul,ol){margin-left:.25em;margin-right:.25em}.reveal .columns>.column:first-child>:not(ul,ol){margin-right:.5em;margin-left:0}.reveal .columns>.column:last-child>:not(ul,ol){margin-right:0;margin-left:.5em}.reveal .slide-number{color:#bfe7ea;background-color:#01364c}.reveal .footer{color:#fff}.reveal .footer a{color:#99d9dd}.reveal .footer.has-dark-background{color:#fff}.reveal .footer.has-dark-background a{color:#7bc6fa}.reveal .footer.has-light-background{color:#505050}.reveal .footer.has-light-background a{color:#6a9bdd}.reveal .slide-number{color:#fff}.reveal .slide-number.has-dark-background{color:#fff}.reveal .slide-number.has-light-background{color:#505050}.reveal .slide figure>figcaption,.reveal .slide img.stretch+p.caption,.reveal .slide img.r-stretch+p.caption{font-size:0.7em}@media screen and (min-width: 500px){.reveal .controls[data-controls-layout=edges] .navigate-left{left:.2em}.reveal .controls[data-controls-layout=edges] .navigate-right{right:.2em}.reveal .controls[data-controls-layout=edges] .navigate-up{top:.4em}.reveal .controls[data-controls-layout=edges] .navigate-down{bottom:2.3em}}.tippy-box[data-theme~=light-border]{background-color:#01364c;color:#f7f8f9;border-radius:4px;border:solid 1px #fff;font-size:.6em}.tippy-box[data-theme~=light-border] .tippy-arrow{color:#fff}.tippy-box[data-placement^=bottom]>.tippy-content{padding:7px 10px;z-index:1}.reveal .callout.callout-style-simple .callout-body,.reveal .callout.callout-style-default .callout-body,.reveal .callout.callout-style-simple div.callout-title,.reveal .callout.callout-style-default div.callout-title{font-size:inherit}.reveal .callout.callout-style-default .callout-icon::before,.reveal .callout.callout-style-simple .callout-icon::before{height:2rem;width:2rem;background-size:2rem 2rem}.reveal .callout.callout-titled .callout-title p{margin-top:.5em}.reveal .callout.callout-titled .callout-icon::before{margin-top:1rem}.reveal .callout.callout-titled .callout-body>.callout-content>:last-child{margin-bottom:1rem}.reveal .panel-tabset [role=tab]{padding:.25em .7em}.reveal .slide-menu-button .fa-bars::before{background-image:url('data:image/svg+xml,')}.reveal .slide-chalkboard-buttons .fa-easel2::before{background-image:url('data:image/svg+xml,')}.reveal .slide-chalkboard-buttons .fa-brush::before{background-image:url('data:image/svg+xml,')}/*! dark */.reveal div.callout.callout-style-default .callout-title{color:#222}.reveal ol[type=a]{list-style-type:lower-alpha}.reveal ol[type=a s]{list-style-type:lower-alpha}.reveal ol[type=A s]{list-style-type:upper-alpha}.reveal ol[type=i]{list-style-type:lower-roman}.reveal ol[type=i s]{list-style-type:lower-roman}.reveal ol[type=I s]{list-style-type:upper-roman}.reveal ol[type="1"]{list-style-type:decimal}.reveal ul.task-list{list-style:none}.reveal ul.task-list li input[type=checkbox]{width:2em;height:2em;margin:0 1em .5em -1.6em;vertical-align:middle}div.cell-output-display div.pagedtable-wrapper table.table{font-size:.6em}.reveal .code-annotation-container-hidden{display:none}.reveal code.sourceCode button.code-annotation-anchor,.reveal code.sourceCode .code-annotation-anchor{font-family:SFMono-Regular,Menlo,Monaco,Consolas,"Liberation Mono","Courier New",monospace;color:var(--quarto-hl-co-color);border:solid var(--quarto-hl-co-color) 1px;border-radius:50%;font-size:.7em;line-height:1.2em;margin-top:2px;user-select:none;-webkit-user-select:none;-moz-user-select:none;-ms-user-select:none;-o-user-select:none}.reveal code.sourceCode button.code-annotation-anchor{cursor:pointer}.reveal code.sourceCode a.code-annotation-anchor{text-align:center;vertical-align:middle;text-decoration:none;cursor:default;height:1.2em;width:1.2em}.reveal code.sourceCode.fragment a.code-annotation-anchor{left:auto}.reveal #code-annotation-line-highlight-gutter{width:100%;border-top:solid var(--quarto-hl-co-color) 1px;border-bottom:solid var(--quarto-hl-co-color) 1px;z-index:2}.reveal #code-annotation-line-highlight{margin-left:-8em;width:calc(100% + 4em);border-top:solid var(--quarto-hl-co-color) 1px;border-bottom:solid var(--quarto-hl-co-color) 1px;z-index:2;margin-bottom:-2px}.reveal code.sourceCode .code-annotation-anchor.code-annotation-active{background-color:var(--quarto-hl-normal-color, #aaaaaa);border:solid var(--quarto-hl-normal-color, #aaaaaa) 1px;color:#01364c;font-weight:bolder}.reveal pre.code-annotation-code{padding-top:0;padding-bottom:0}.reveal pre.code-annotation-code code{z-index:3;padding-left:0px}.reveal dl.code-annotation-container-grid{margin-left:.1em}.reveal dl.code-annotation-container-grid dt{margin-top:.65rem;font-family:SFMono-Regular,Menlo,Monaco,Consolas,"Liberation Mono","Courier New",monospace;border:solid #f7f8f9 1px;border-radius:50%;height:1.3em;width:1.3em;line-height:1.3em;font-size:.5em;text-align:center;vertical-align:middle;text-decoration:none}.reveal dl.code-annotation-container-grid dd{margin-left:.25em}.reveal .scrollable ol li:first-child:nth-last-child(n+10),.reveal .scrollable ol li:first-child:nth-last-child(n+10)~li{margin-left:1em}html.print-pdf .reveal .slides .pdf-page:last-child{page-break-after:avoid}.reveal .quarto-title-block .quarto-title-authors{display:flex;justify-content:center}.reveal .quarto-title-block .quarto-title-authors .quarto-title-author{padding-left:.5em;padding-right:.5em}.reveal .quarto-title-block .quarto-title-authors .quarto-title-author a,.reveal .quarto-title-block .quarto-title-authors .quarto-title-author a:hover,.reveal .quarto-title-block .quarto-title-authors .quarto-title-author a:visited,.reveal .quarto-title-block .quarto-title-authors .quarto-title-author a:active{color:inherit;text-decoration:none}.reveal .quarto-title-block .quarto-title-authors .quarto-title-author .quarto-title-author-name{margin-bottom:.1rem}.reveal .quarto-title-block .quarto-title-authors .quarto-title-author .quarto-title-author-email{margin-top:0px;margin-bottom:.4em;font-size:.6em}.reveal .quarto-title-block .quarto-title-authors .quarto-title-author .quarto-title-author-orcid img{margin-bottom:4px}.reveal .quarto-title-block .quarto-title-authors .quarto-title-author .quarto-title-affiliation{font-size:.7em;margin-top:0px;margin-bottom:8px}.reveal .quarto-title-block .quarto-title-authors .quarto-title-author .quarto-title-affiliation:first{margin-top:12px}.blue{color:#99d9dd;font-weight:bold}.yellow{color:#f4ba02;font-weight:bold}.green{color:#005221;font-weight:bold}.reveal .slide a{text-decoration:underline}.reveal section div.center-h{text-align:center}.variant-one{color:#d6d6d6}.variant-one h1,.variant-one h2,.variant-one h3{color:#f3f3f3}.variant-one a{color:#00e0e0}.variant-one p code{color:gold}.variant-two{color:#a6a6d6}.variant-two h1,.variant-two h2,.variant-two h3{color:#222}.variant-two a{color:#f22341}.variant-two p code{color:#f0f}/*# sourceMappingURL=f95d2bded9c28492b788fe14c3e9f347.css.map */ diff --git a/docs/slides/01_uvod/pres.html b/docs/slides/01_uvod/pres.html index e408fe9..6b322e9 100644 --- a/docs/slides/01_uvod/pres.html +++ b/docs/slides/01_uvod/pres.html @@ -8,11 +8,11 @@ - + - - Medicinska statistika i informatika - Introduction to Statistics + + Medicinska statistika i informatika – Introduction to Statistics @@ -340,7 +340,7 @@

Introduction to Statistics

-

2024-10-03

+

2024-10-13

What is statistics for?

@@ -380,8 +380,7 @@

How much better is ultrasound at detecting gallstones than CT?

-
- +

Laboratory values

@@ -390,8 +389,7 @@

Laboratory values

Does this patient with this lab value have a disease risk that requires further investigation?

-
- +

Course

@@ -410,10 +408,10 @@

Course structure

- tinytable_jmrsixs6l1i2f94r829s + tinytable_73e5d3o1vjyta4o5ltmq @@ -431,7 +429,7 @@

Course structure

- +
@@ -506,12 +504,12 @@

Course structure

@@ -603,8 +601,7 @@

Critical state of science in medicine

“The case against science is straightforward: much of the scientific literature, perhaps half, may simply be untrue. Afflicted by studies with small sample sizes, tiny effects, invalid exploratory analyses, and flagrant conflicts of interest, together with an obsession for pursuing fashionable trends of dubious importance, science has taken a turn towards darkness.”

- - +

1,693,059 publications on PubMed in 2023!

@@ -696,8 +693,7 @@

The research question

- - +
+
@@ -940,12 +941,12 @@

The first medical database

@@ -1136,10 +1137,10 @@

Qualitative data

- tinytable_uc1s4tjldm6w79hlt827 + tinytable_a31l1a10ppxhjkvtb14v @@ -1157,7 +1158,7 @@

Qualitative data

-
+
@@ -1184,12 +1185,12 @@

Qualitative data

@@ -1290,7 +1291,7 @@

Discontinuous (discrete) and continuous measurements

Example

-

When we measure weight in \(kg\) we usually round up, but it makes sense to talk about more precise measurements (\(70 \; \text{kg}\), \(70.3467 \; \text{kg}\)).

+

When we measure weight in \(kg\) we usually round the numbers so they look whole, but it sill makes sense to talk about more precise measurements (\(70 \; \text{kg}\), \(70.3467 \; \text{kg}\)).

@@ -1347,10 +1348,10 @@

Measurement scales (2)

- tinytable_dr4ru9aqilbtxqq8z3uo + tinytable_d1hfsbasgqlpkwxk4afs @@ -1368,7 +1369,7 @@

Measurement scales (2)

-
+
@@ -1414,12 +1415,12 @@

Measurement scales (2)

@@ -1595,8 +1596,7 @@

Guess the data type?

  • Numerical (discrete)*
  • Numerical (cont.)
    • - - +

    What about time?

    @@ -1719,10 +1719,10 @@

    Solution: diabetics and healthy people

    - tinytable_rxy6t6182tqpcclmfuse + tinytable_awnqmmxybhlb3tswdo7q @@ -1740,7 +1740,7 @@

    Solution: diabetics and healthy people

    -
    Allowed operations based on data scale
    +
    @@ -1775,12 +1775,12 @@

    Solution: diabetics and healthy people

    @@ -1845,10 +1845,10 @@

    Solution: before and after

    - tinytable_43w87wyfttb3icw07h56 + tinytable_0duqiqexugsgoosgpgmr @@ -1866,7 +1866,7 @@

    Solution: before and after

    -
    +
    @@ -1901,12 +1901,12 @@

    Solution: before and after

    @@ -1972,10 +1972,10 @@

    Solution: measurement series

    - tinytable_1aq1gr8i7z73vzj9a48d + tinytable_eipoe94xpr3evcau67tu @@ -1993,7 +1993,7 @@

    Solution: measurement series

    -
    +
    @@ -2034,12 +2034,12 @@

    Solution: measurement series

    @@ -2108,10 +2108,10 @@

    Solution: measurement series

    - tinytable_tn1eo1sfuct4mlpidxj7 + tinytable_qn56ewilg4ht0ye3lz5t @@ -2129,7 +2129,7 @@

    Solution: measurement series

    -
    +
    @@ -2164,12 +2164,12 @@

    Solution: measurement series

    @@ -2238,10 +2238,10 @@

    Missing data

    - tinytable_3zrz9bijcly8cnj2yte5 + tinytable_nglif5ht8zz3fubll4v9 @@ -2259,7 +2259,7 @@

    Missing data

    -
    +
    @@ -2295,12 +2295,12 @@

    Missing data

    @@ -2585,81 +2585,43 @@

    Missing data

    }); - - - @@ -431,7 +429,7 @@

    Struktura kursa

    -
    +
    @@ -506,12 +504,12 @@

    Struktura kursa

    @@ -603,8 +601,7 @@

    Kritično stanje nauke u medicini

    “The case against science is straightforward: much of the scientific literature, perhaps half, may simply be untrue. Afflicted by studies with small sample sizes, tiny effects, invalid exploratory analyses, and flagrant conflicts of interest, together with an obsession for pursuing fashionable trends of dubious importance, science has taken a turn towards darkness.”

    - - +

    1,693,059 publikacija na PubMed-u u 2023. god!

    @@ -696,8 +693,7 @@

    Istraživačko pitanje

    - - +
    +
    @@ -940,12 +941,12 @@

    Prva medicinska baza podataka

    @@ -1136,10 +1137,10 @@

    Kvalitativni podaci

    - tinytable_4m3zxnw3c7yam7a7tus0 + tinytable_88wjmcxjn9ilkoduadvx @@ -1157,7 +1158,7 @@

    Kvalitativni podaci

    -
    +
    @@ -1184,12 +1185,12 @@

    Kvalitativni podaci

    @@ -1331,10 +1332,10 @@

    Merne skale (2)

    - tinytable_e2jbypy449cpzlh048s2 + tinytable_h8yr8lsxbmd2w0qalzvh @@ -1352,7 +1353,7 @@

    Merne skale (2)

    -
    +
    @@ -1398,12 +1399,12 @@

    Merne skale (2)

    @@ -1579,8 +1580,7 @@

    Ko zna zna (tip podatka)?

  • Numerički (diskretni)*
  • Numerički (kont.)
    • - - +

    Šta ćemo sa vremenom?

    @@ -1704,10 +1704,10 @@

    Rešenje: dijabetičari i zdravi ljudi

    - tinytable_iw9771m8f97urj50ic58 + tinytable_blzzpqz5ricqjd2e1yfw @@ -1725,7 +1725,7 @@

    Rešenje: dijabetičari i zdravi ljudi

    -
    Dozvoljene operacije u odnosu na skalu
    +
    @@ -1760,12 +1760,12 @@

    Rešenje: dijabetičari i zdravi ljudi

    @@ -1830,10 +1830,10 @@

    Rešenje: pre i posle

    - tinytable_cn0y4xwmw9sl49cn021t + tinytable_1s81ylkcrlqm06qg6h8u @@ -1851,7 +1851,7 @@

    Rešenje: pre i posle

    -
    +
    @@ -1886,12 +1886,12 @@

    Rešenje: pre i posle

    @@ -1957,10 +1957,10 @@

    Rešenje: serija merenja

    - tinytable_5uqlz37va2px91divh5f + tinytable_u1rwj6cwso8k1ep3y0l1 @@ -1978,7 +1978,7 @@

    Rešenje: serija merenja

    -
    +
    @@ -2019,12 +2019,12 @@

    Rešenje: serija merenja

    @@ -2093,10 +2093,10 @@

    Rešenje: serija merenja

    - tinytable_zqzul4rv6fquhfg3zat1 + tinytable_62i3292krumjnisqsx87 @@ -2114,7 +2114,7 @@

    Rešenje: serija merenja

    -
    +
    @@ -2149,12 +2149,12 @@

    Rešenje: serija merenja

    @@ -2223,10 +2223,10 @@

    Podaci koji nedostaju

    - tinytable_qk6gklhvssi9wk89b5px + tinytable_wnkttp048lusrpp64oym @@ -2244,7 +2244,7 @@

    Podaci koji nedostaju

    -
    +
    @@ -2280,12 +2280,12 @@

    Podaci koji nedostaju

    @@ -2572,81 +2572,43 @@

    Podaci koji nedostaju

    }); - - - - -
    @@ -342,7 +340,7 @@

    Sređivanje podataka

    -

    2024-10-12

    +

    2024-10-13

    @@ -366,8 +364,7 @@

    Formalna definicija

    Tabelarno prikazivanje aps. i rel. podataka

    -
    -
    +
    @@ -381,11 +378,11 @@

    Tabelarno prikazivanje aps. i rel. podataka

    - + - + @@ -397,7 +394,6 @@

    Tabelarno prikazivanje aps. i rel. podataka

    Varijabla
    Nepusac51 (51%)54 (54%)
    Pusač49 (49%)46 (46%)
    -
    @@ -409,6 +405,9 @@

    Apsolutni jeleni i relativne ajkule

  • Loši za javno zdravlje, naučni progres
  • Ali potrebni za kauzalno tumačenje
    • +
    + +
    @@ -464,8 +463,7 @@

    Komunikacija rizika

    -
    -
    +