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#!/usr/bin/env python
#Este programa ejecuta SG2K y permite crear archivos .pick para un conjunto de carpetas
#de nombre aammdd_hhmm (si es otra la configuracion, ir a las partes comentadas con #CAMBIAR y modificar segun formato).
#Dentro de estas carpetas, que representan distintos eventos, hay archivos MSEED o para distintas estaciones (tambien ir a #CAMBIAR y cambiar si es necesario).
#Setear numero minimo de estaciones a leer por evento en la variable nstamin.
#IMPORTANTE: ESTA MODIFICACION PERMITE OBTENER LA LOCALIZACION A MEDIDA QUE SE LEE CADA CARPETA (EVENTO). TAMBIEN ES POSIBLE CORREGIR ESTACIONES QUE ENTREGUEN
#UN RMS ALTO. ESTE PROGRAMA FUNCIONA TENIENDO UNA CARPETA LLAMADA "LOC" EN EL MISMO LUGAR DONDE SE ENCUENTRAN LAS CARPETAS CON LOS EVENTOS QUE EN SU INTERIOR
#CONTENGA LAS CARPETAS "TIME" Y "GRIDMODEL" YA GENERADAS CON EL PROGRAMA NONLINLOC (comandos Vel2Grid y Grid2Time), LA CARPETA "FINAL" CREADA Y VACIA Y EL
#ARCHIVO DE CONFIGURACION "NLLOC.IN".
import re,os,time,datetime,glob,subprocess,numpy
from obspy.core import read, UTCDateTime
from pylab import *
###########################################################################
#numero minimo de estaciones que se leeran por evento
nstamin = 3
path = os.getcwd()+'/'
#path = "%s/NLL/" % os.getenv("HOME")
#loc = path+'LOC'
loc = '%s/NLL/LOC' % os.getenv("HOME")
###########################################################################
# loop por los directorios
for dire in sorted(glob.glob('????-??-??-??????/')):
os.chdir(path+dire)
#CAMBIAR AQUI SEGUN EL TIPO DE ARCHIVOS
listfiles = sorted(glob.glob('*.sac'))
sta = []
for file in listfiles:
st = read(file)
tr = st[0]
stac = tr.stats.station
sta.append(stac)
uniq = []
for staelem in sta:
if staelem not in uniq:
uniq.append(staelem)
largo = len(uniq)
if largo >= nstamin:
print( 'Trabajando en el directorio '+dire+'\n')
print( '\nLA ULTIMA ESTACION PARA ESTE EVENTO ES '+uniq[largo-1]+'\n')
print( 'EL NUMERO DE ESTACIONES ES: '+str(largo)+'\n')
time.sleep(2)
#CAMBIAR AQUI SEGUN EL TIPO DE COMPONENTE
for stuni in uniq:
filez = glob.glob('*'+stuni+'*?HZ*.sac')
if not filez:
filez = ' '
else:
filez = filez[0]
filen = glob.glob('*'+stuni+'*.?HN.*.sac')
if not filen:
filen = glob.glob('*'+stuni+'*.?H1.*.sac')
if not filen:
filen = ' '
else:
filen = filen[0]
filee = glob.glob('*'+stuni+'*.?HE.*.sac')
if not filee:
filee = glob.glob('*'+stuni+'*.?H2.*.sac')
if not filee:
filee = ' '
else:
filee = filee[0]
subprocess.call(['java net.alomax.seisgram2k.SeisGram2K -binarytype=SUN_UNIX '+filez+' '+filen+' '+filee+' -pick.file='+dire[0:len(dire)-1]+'.pick'],shell=True)
#TERMINA EL LOOP
print( '\n\nSE HA LEIDO LA TOTALIDAD DE ESTACIONES DISPONIBLES PARA EL EVENTO '+dire+'\n\n')
time.sleep(2)
with open(dire[0:len(dire)-1]+'.pick','r') as fichero:
arreglo = []
for lin in fichero:
arreglo.append(lin)
if len(arreglo) > 2:
#MOSTRAR PICKFILE EN PANTALLA
print( '\n\nARCHIVO PEAKS:\n\n')
cmd = 'more '+dire[0:len(dire)-1]+'.pick'
os.system(cmd)
time.sleep(2)
#COMIENZA LA LOCALIZACION INDIVIDUAL
print( '\n\nCOMIENZO DE LOCALIZACION NLLOC PARA EL EVENTO '+dire+'\n\n')
time.sleep(2)
cmd = 'cp '+dire[0:len(dire)-1]+'.pick '+loc
os.system(cmd)
os.chdir(loc)
cmd = 'mv '+dire[0:len(dire)-1]+'.pick gatherpickfiles.dat'
os.system(cmd)
cmd = 'rm '+loc+'/final/*'
os.system(cmd)
subprocess.call(['NLLoc nlloc.in'],shell=True)
os.chdir(loc+'/final')
#CAMBIAR AQUI SEGUN LA CONFIGURACION DE LA CARPETA
#hypfile = glob.glob('Iquique.'+dire.split('_')[0][0:4]+'*.hyp')[0]
hypfile = glob.glob('GEMA.'+dire.split('-')[0]+'*.hyp')[0]
time.sleep(3)
print( '\n\nRESULTADOS DE LA LOCALIZACION:\n\n')
i = 1
with open(hypfile,'r') as hyp:
infoxsta = []
for lin in hyp:
line = lin.rstrip()
if line:
if lin.split()[0] == 'GEOGRAPHIC':
fechahora = lin.split()[2]+' '+ lin.split()[3] +' '+lin.split()[4]+' ' +lin.split()[5] +' ' + lin.split()[6] +' '+lin.split()[7]
hipo = lin.split()[9]+' '+ lin.split()[11] +' '+lin.split()[13]
evtime = UTCDateTime("%s-%s-%sT%s:%s:%sZ" % (lin.split()[2], lin.split()[3], lin.split()[4], lin.split()[5], lin.split()[6], lin.split()[7]) )
evlat = float(lin.split()[9])
evlon = float(lin.split()[11])
evdepth = float(lin.split()[13])
if lin.split()[0] == 'QUALITY':
rms = lin.split()[8]
evrms = float(lin.split()[8])
if lin.split()[0] == 'STATISTICS':
err = str(sqrt(3.53*float(lin.split()[8]))) + ' '+str(sqrt(3.53*float(lin.split()[14]))) + ' '+ str(sqrt(3.53*float(lin.split()[18])))
everrx = sqrt(3.53*float(lin.split()[8]))
everry = sqrt(3.53*float(lin.split()[14]))
everrz = sqrt(3.53*float(lin.split()[18]))
if i > 14 and len(lin.split()) > 1:
infoxsta.append(lin.split()[0]+' '+lin.split()[2]+' '+lin.split()[4]+' '+lin.split()[6]+' '+lin.split()[7]+' '+lin.split()[8]+' '+lin.split()[16])
i = i+1
print( 'yyyy mm dd hh mm ss.ssss lat long depth RMS Dx Dy Dz')
print( fechahora+' '+hipo+' '+rms+' '+err+'\n')
print( 'sta comp fase yyyymmdd hhmm ss rms')
for info in infoxsta:
print( info)
locfile = "%s%s%s.loc" % (path, dire, dire[0:len(dire)-1])
savetxt(locfile, np.array([evtime, evlon, evlat, evdepth, evrms, everrx, everry, everrz]), fmt='%s' )
resp = input('\n+ Do you want to modify any pick [yes/no]?: ')
while resp != 'yes' and resp != 'no':
resp = input('\n+ Do you want to modify any pick [yes/no]?: ')
if resp == 'yes' or resp == 'no':
break
while resp == 'yes':
corrsta = input('\n+ Which station do you want to check?: ')
while corrsta not in sta:
corrsta = input('\n+ Which station do you want to check?: ')
#CAMBIAR AQUI SEGUN TIPO DE ARCHIVOS
os.chdir(path+dire)
filez = glob.glob('*'+corrsta+'*.?HZ.*.sac')
#filez = glob.glob('*'+corrsta+'..*HZ')
if not filez:
filez = ' '
else:
filez = filez[0]
filen = glob.glob('*'+corrsta+'*.?HN.*.sac')
#filen = glob.glob('*'+corrsta+'..*HN')
if not filen:
filen = ' '
else:
filen = filen[0]
filee = glob.glob('*'+corrsta+'*.?HE.*.sac')
#filee = glob.glob('*'+corrsta+'..*HE')
if not filee:
filee = ' '
else:
filee = filee[0]
subprocess.call(['java net.alomax.seisgram2k.SeisGram2K -binarytype=SUN_UNIX '+filez+' '+filen+' '+filee+' -pick.file='+dire[0:len(dire)-1]+'.pick'],shell=True)
cmd = 'cp '+dire[0:len(dire)-1]+'.pick '+loc
os.system(cmd)
os.chdir(loc)
cmd = 'mv '+dire[0:len(dire)-1]+'.pick gatherpickfiles.dat'
os.system(cmd)
cmd = 'rm '+loc+'/final/*'
os.system(cmd)
subprocess.call(['NLLoc nlloc.in'],shell=True)
os.chdir(loc+'/final')
print( '\n\nRESULTADOS DE LA LOCALIZACION:\n\n')
i = 1
with open(hypfile,'r') as hyp:
infoxsta = []
for lin in hyp:
line = lin.rstrip()
if line:
if lin.split()[0] == 'GEOGRAPHIC':
fechahorap = fechahora
fechahora = lin.split()[2]+' '+ lin.split()[3] +' '+lin.split()[4]+' ' +lin.split()[5] +' ' + lin.split()[6] +' '+lin.split()[7]
hipop = hipo
hipo = lin.split()[9]+' '+ lin.split()[11] +' '+lin.split()[13]
evtime = UTCDateTime("%s-%s-%sT%s:%s:%sZ" % (lin.split()[2], lin.split()[3], lin.split()[4], lin.split()[5], lin.split()[6], lin.split()[7]) )
evlat = float(lin.split()[9])
evlon = float(lin.split()[11])
evdepth = float(lin.split()[13])
if lin.split()[0] == 'QUALITY':
rmsp = rms
rms = lin.split()[8]
evrms = float(lin.split()[8])
if lin.split()[0] == 'STATISTICS':
errp = err
err = str(sqrt(3.53*float(lin.split()[8]))) + ' '+str(sqrt(3.53*float(lin.split()[14]))) + ' '+ str(sqrt(3.53*float(lin.split()[18])))
everrx = sqrt(3.53*float(lin.split()[8]))
everry = sqrt(3.53*float(lin.split()[14]))
everrz = sqrt(3.53*float(lin.split()[18]))
if i > 14 and len(lin.split()) > 1:
infoxsta.append(lin.split()[0]+' '+lin.split()[2]+' '+lin.split()[4]+' '+lin.split()[6]+' '+lin.split()[7]+' '+lin.split()[8]+' '+lin.split()[16])
i = i+1
print( '\nRESULTADO PREVIO' )
print( 'yyyy mm dd hh mm ss.ssss lat long depth RMS Dx Dy Dz')
print( fechahorap+' '+hipop+' '+rmsp+' '+errp+'\n')
print( '\nRESULTADO ACTUAL')
print( 'yyyy mm dd hh mm ss.ssss lat long depth RMS Dx Dy Dz')
print( fechahora+' '+hipo+' '+rms+' '+err+'\n')
print( 'sta comp fase fecha hora rms')
for info in infoxsta:
print( info)
locfile = "%s%s%s.loc" % (path, dire, dire[0:len(dire)-1])
savetxt(locfile, np.array([evtime, evlon, evlat, evdepth, evrms, everrx, everry, everrz]), fmt='%s' )
resp = input('\n+ Do you want to modify any pick [yes/no]?: ')
while resp != 'yes' and resp != 'no':
resp = input('\n+ Do you want to modify any pick [yes/no]?: ')
if resp == 'yes' or resp == 'no':
break
else:
cmd = 'rm '+dire[0:len(dire)-1]+'.pick'
os.system(cmd)
print( '\nArchivo pick no tiene lecturas y serA borrado...\n')
time.sleep(2)
else:
print( 'Trabajando en el directorio '+dire+'\n')
print( 'EL NUMERO DE ESTACIONES ES: '+str(largo)+', MENOR AL MINIMO REQUERIDO PARA LOCALIZAR\n')
break