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>Peno-pyk(Tsc)
GGAAATATTAAAATGGAAATGTTGAAAAAATGTTTTAAGATGGGTCATTATGGATAAAAT
ATACTATGGTTTTGCAATAAATGCTTTCTATTAATTGGACTTTGTGGTAATATGGTAGAA
GGATGCAGTGTTAATTTTTTAACATATAAAAATAAGCTATATGAAGGGAGAATGGAGAAT
GCGTAGAACTAAGATAATATGCACGATTGGTCCTGCCAGTGAAAAATATGAGATATTGAA
AGAGCTTATAGAAAGCGGTCTTAATATTTGCAGGTTGAATTTTTCACATGGGGATCATGA
AGAGCATGGAAGCAGAATAGACAATATTATAAAGATTAGAGAAGAACTTAAGCTGCCTAT
TGCAATTATGCTTGATACAAAAGGGCCTGAAATAAGGACTGGCAGATTTAAAGGCGGTGT
TGCAGAGCTTAAAGAAGGCCAGACATTTACGATAACATCAAGGGAAATTGAAGGAGATAA
CACTATTTGTTCTGTTTCATACAAGGGGCTTCCTCAAGATGTGGAGAGAGGTTCTCGCAT
ATTGATTGATGACGGATTAGTATCATTGAAAGTCAATGACGTAAAAGGTGAAGATATAGT
ATGCACTGTGGAGAATTCTGGTACAATAGGTGATCACAAAGGTGTAAATGTACCTGGTAC
AAAGCTTAATTTGCCTGCCATAACGCAAAAAGACGTGGATGATATAGAGTTTGGAATAAA
AAAAGGAATCGACATGATTGCAGCGTCTTTTGTCAGAAAAGCAGCAGATGTAATTGCCAT
AAGGAGATTGTTAGAAGACAATGACGCTGGCCATATACTTATCATATCAAAAATTGAAAA
TCGCGAAGGCGTAGAAAATATTGACGAAATAATCAAAGTCTCTGATGGCATAATGGTAGC
CCGCGGCGATTTGGGTGTCGAAATTCCTATAGAGGAAATACCTATCGTTCAGAAAAGGAT
AATTGAAAAATGCAACAAAGCAGGTAAACCAGTAGTTACTGCTACACAGATGCTTGACTC
TATGATAAGAAATCCAAGGCCAACAAGGGCAGAAGTAACAGATGTAGCCAATGCTATATT
GGATGGCACTGATGCGATAATGTTGTCTGGTGAAACAGCGCAAGGCAAATATCCTGTAGA
GGCTTTTAAGACGATGTCAAAGATAGCTGAAAAGATTGAGACGTATATAAATTACAAAGA
AAATTTAGATAAAAATGTGGATTACAATATTTCTATGACAAATGCCATAAGCCATGCTAC
GTGCACTACCGCGAGAGATATAGGCGCAACTGCCATTATTACATCTACAATATCAGGTTA
TACTGCGAGAATGGTGTCTAAGTATAGACCGTCAGCACCTATAATAGCAGTGACGCCAAA
CAAAGATGTTGCAAGAAGGCTTAGCATCGTGTGGGGTGTACATCCATTGATATCACAGGA
AGTCAATTCTACAGATGAAATGATAGAAGTATCAGTAAATACGGCTTTAAATGAAGGATT
AATTCGAAATGGCGATATTGTAGTAATATCGGCAGGAATACCTGTCGCGACTACAGGCAC
AACAAATATGTTGAAGGTTCATATTGTGGGAGATGTAATAGTAAAAGGCACAGGCATAGG
CACTAAATCCATAAGTGGTGTTGTTTCCATCATAAGAGATCCATACAAGGACAAAGATAA
GTTCAGAGAAGGAGATATCATCGTTGCTCAAAAAACTGAAAGGGATTATATGCCTATAAT
TGAGAAGGCTTCAGCTATCATAACAGAAGAAGGTGGACTAACGTCCCATGCTGCAATAGT
TGGATTGAACTATGGATTACCTGTCATTGTAGGCTGTGAAGGAGTAACTTCAAAGCTTAA
AGATGGAATGACGGTAACTCTCGATACTGCCAGAGGATTGGTCTACAAAGGTATAGTGAA
TATAAAATAG
>pSH074_region Clostridium thermocellum DSM 1313, complete genome. NC_017304.1
ATGTGGGAAACAAAAGTAAATCCTAGCAAAATTTTTGAACTTCGCTGTAAAAATACGACT
TATTTTGGTGTTGGCAGTATACATAAGATAAAGGATATATTAGAAAATCTAAAAATTAAT
GGCATTAATAATGTTATTTTTATAACAGGCAAAGGTTCGTATAAGACTAGCGGAGCTTGG
GATGTTGTAAGGCCTGTATTGGAAGAGCTTGATTTAAAATATTCACTTTACGATAAAGTT
GGTCCAAATCCTACCGTTGATATGATAGACGAAGCGGCAAAAATTGGACGAGAATCTGGA
GCGAAAGCCGTAATTGGAATTGGCGGTGGTAGCCCTATAGATACTGCAAAAAGTGTAGCT
GTGCTATTAAAGTATACTGATAAAAATGCACGAGAGCTTTATAAGCAAAAATTTATTCCT
GATGATGCTGTTCCTATAATAGCTATAAATCTTACACATGGTACAGGAACAGAGGTAGAT
AGATTTGCAGTGGCTACTATACCTGAGAAAAATTATAAACCAGCTATAGCTTATGATTGC
TTATATCCTATGTTTGCTATAGATGACCCTTCGCTTATGACAAAGCTTGATAAAAAACAG
ACTATAGCCGTTACTGTTGATGCTTTAAATCACATTACAGAAGCTGCTACGACACTTGTT
GCATCTCCATATAGTATTCTTACGGCTAAGGAAACAGTAAGATTGATTGTTCGATATCTT
CCCGCTGCTGTAAATGATCCTTTAAATATAGTGGCAAGATATTACCTTCTGTATGCTTCT
GCATTAGCTGGCATATCTTTTGACAATGGTCTTTTGCATCTTACTCATGCTTTAGAGCAT
CCTTTAAGTGCTGTAAAACCTGAAATAGCTCATGGTTTAGGGCTTGGTGCAATATTGCCA
GCAGTTATAAAAGCTATTTATCCAGCTACAGCAGAAGTATTGGCTGATGTATATAGTCCT
ATAGTTCCTGGTTTAAAAGGACTGCCTGTTGAGGCGGAGTATGTAGCAGAAAAAGTTCAA
GAATGGCTTTTTAGTGTGGGGTGCATTCAAAAGTTATCTGATTTTGGGTTTACGAAAGAT
GATATTCCTAATCTTGTAAAACTTGCTAAAACAACTCCTTCCCTTGATGGGTTGTTATCT
ATTGCACCTGTTGAAGCTACTGAATCTGTCATTGAAAAGATTTATTTAAAATCTCTTTAA
TAAAGGAGGTTATAAAAATGAACGAGATTTTAGAGAAGAAGCAATTGAATCCCACTGTCA
AAATGATGGTTATAAACGCTCCACTAATGGCGAAAAAGGCGAAACCTGGACAGTTTGTCA
TAGTAAGAGTAGATGAAAAGGGTGAACGCATTCCTTTGACAATAGCGGATTACGACAGAA
ACAAAGGCACGATTACTATAATATTTCAAGAAGTCGGCATGAGCACCAAGAAGTTAGGTA
CGTTAAACGTAGGCGATAGATTGCATGACTTCGTAGGACCTTTAGGAAAACCTGTTGAAT
TTTCAAAAGATACGAAGAGAGTTTTAGCAATCGGCGGAGGTGTTGGAGTTGCGCCGCTTT
ATCCAAAAGTAAAAATGCTAAATGAGATGAAAGTACCAGTGGATAGTATAATAGGCGGCA
GAAGTGCAGAGTACGTCATATTAGAAGATGAAATGAAAAAAGTCAGTGAAAACCTTTATA
TAACGACGGATGACGGCACAAAAGGCCGTAAAGGCTTTGTAACAGATGTATTAAAAGAAT
TGATAGAAAAAGACAACAAATACGATGAAGTAATTGCAATTGGGCCACTGATAATGATGA
AGATGGTATGCAATATAACAAAAGAATACAACATACCAACTATGGTCAGCATGAACCCGA
TAATGATAGACGGAACTGGAATGTGCGGAGGATGCAGAGTCACAGTTGGAGGAGAGACAA
AATTTGCATGTGTCGATGGTCCAGCATTTGACGGGCTTAAAGTAGACTTTGATGAAGCAA
TGAGAAGGCAGAATATGTATAAAGATATGGAGAGGAAAGTATTAGAAAATTATGAGCACG
AATGCAAGTTAGGGGGCATCTTAAATGGCTAACATGTCGTTAAAAAAAGTACCAATGCCT
GAACAGGAACCAGATCAGCGGAACAAAAATTTCAAAGAAGTTGCATTAGGGTATGAAGAA
AACATGGCTGTTGAAGAAGCCGAAAGATGTATTCAATGTAAGAATCAGCCATGTGTTGAA
GGTTGCCCTGTTCACGTAAAAATACCTGAGTTCATCAAGCTGATAGCAAACAGGGACTTT
GAAGGAGCATATCAAAAGATAAAAGAAACGAATAATCTACCTGCAATATGTGGAAGAGTA
TGTCCACAGGAAAGCCAGTGTGAATCAGTATGCACAAGAGGCAAAAAAGGAGAACCTGTA
GCTATAGGCAGACTGGAGAGATTTACAGCAGATTGGCATATGAAAAATAATGAAGATAAA
ATAGAAAAACCAGAGACGAATGGCAGAAAAGTTGCTGTTATAGGATCTGGGCCTGCAGGA
CTATCGTGTGCAGGTGATCTTGCAAAAATGGGATATGACACAACCATCTTTGAAGCATTT
CATACACCAGGCGGTGTTTTAATGTACGGTATCCCAGAGTTTAGACTTCCAAAAGAAATA
GTGCAAAAAGAAATTGATTCGTTGAAAAAATTGGGAGTAAAAATAGAAACCAACATGGTC
ATAGGCAAGATACTTACAATCGATGATTTATTCGACATGGGGTATGAAGCAGTGTTCATA
GGGACAGGCGCAGGATTGCCTAAATTTATGAATATACCTGGAGAAAACTTAAATGGAGTT
TACTCAGCAAATGAATTTTTGACGAGGATTAATTTGATGAAAGCTTATGATTTCCCTAAC
AGTCCCACTCCTGTAAAAGTAGGCAAGAAAGTTGCTGTTGTTGGCGGTGGAAACGTGGCG
ATGGATGCAGCAAGATCCGCAAAGCGCATGGGAGCAGAAGAAGTGTACATCGTATATAGA
AGGTCAGAGGAAGAAATGCCTGCAAGGCTTGAGGAAATACACCACGCAAAAGAAGAAGGA
ATCATATTTAAGTTATTGACAAACCCTGTAAGAATCATTGGTGATGAAAGTGGCAGTGTA
AAAGGAATCGAATGTGTTAACATGGTTTTAGGCGATGTAGACGAATCAGGTAGAAGAAGA
CCTGTAGAAGAAAAAGGCTCAGAGCATGTAATAGATGTAGATACAGTTATTATAGCAATA
GGACAAAGTCCAAATCCGCTTATAACATCCACAACAGAAGGTTTAGAAAAGCAAAGATGG
GGTGGAATAATAGTCAACGAAGAAACATTGGAGACAAGCCGCAGAGGAGTTTTTGCGGGC
GGTGATGCTGTGACAGGTGCAGCTACAGTAATACTTGCAATGGGAGCTGGTAAAAAAGCT
GCAGCTTCTATACACAAATATTTAAGCGAAAAGTGATAAAGGAGGTCGACGTCATGGCAA
CGACAAAAACGGAATTAGACGTTCAGAAGCAGATAGATCTACTTGTGTCAAGAGCACAAG
AGGCTCAGAAAAAATTCATGTCTTACACGCAAGAGCAAATCGACGCAATAGTTAAGGCAA
TGGCTTTAGCAGGCGTTGACAAACACGTAGAGCTGGCAAAGATGGCGTACGAAGAGACAA
AAATGGGTGTATACGAAGATAAGATAACAAAAAATCTCTTCGCAACAGAGTACGTGTACC
ACGACATAAAAAATGAAAAGACTGTAGGAATCATAAACGAGAACATAGAAGAAAACTACA
TGGAAGTGGCAGAACCGATAGGCGTAATTGCCGGTGTCACACCTGTCACAAACCCAACAT
CTACCACGATGTTTAAATGCTTAATATCCATAAAGACGCGAAATCCTATAATATTCAGCT
TCCATCCAAAGGCAATAAAGTGCAGCATCGCAGCAGCCAAAGTGATGTATGAAGCTGCAC
TAAAGGCAGGCGCACCTGAAGGATGCATAGGATGGATAGAAACGCCATCAATTGAGGCCA
CACAGCTTCTCATGACACATCCAGGCGTATCGCTGATCCTTGCAACGGGCGGTGCAGGAA
TGGTAAAAGCGGCATACAGCTCAGGAAAACCGGCATTAGGCGTAGGTCCTGGCAATGTGC
CATGCTACATCGAAAAATCAGCAAACATAAAGAGGGCTGTATCGGATCTCATACTAAGCA
AGACATTTGACAATGGAGTAATATGCGCATCAGAGCAGGCCGTAATAATAGACGAGGAAA
TAGCAGATGAAGTCAAAAAGCTTATGAAAGAATACGGCTGCTACTTCTTAAACAAAGATG
AAATAAAGAAGCTTGAGAAATTTGCAATTGATGAGCAAAGCTGCGCCATGAGCCCTGCAG
TGGTAGGTCAGCCAGCGGCGAAGATTGCTGAAATGGCAGGCTTCAAAGTCCCCGAAGGCA
CAAAGATATTAGTGGCAGAGTACGAAGGAGTAGGTCCAAAATATCCTCTATCAAGGGAGA
AACTAAGCCCGATTCTTGCTTGCTACACCGTCAAAGACTACAATGAAGGAATCAAAAAGT
GCGAGGAAATGACTGAATTCGGAGGTTTAGGCCACTCTGCTGTAATACACTCTGAAAATC
AAAACGTCATAAATGAATTTGCAAGGCGAGTCCGCACAGGAAGACTTATCGTAAATTCAC
CATCATCACAGGGAGCAATAGGAGATATATACAATACAAACACGCCATCACTTACATTAG
GCTGTGGTTCTATGGGAAGAAACTCAACGACAGACAATGTAAGCGTCAAGAACCTTTTGA
ATATTAAGCGTGTCGTGATAAGGAAGGATAGAATGAAATGGTTCAAGATTCCACCGAAGA
TTTACTTTGAAAGCGGGTCACTCCAGTACCTGTGCAAAGTCAAAAGAAAAAAAGCGTTTA
TCGTCACAGATCCATTCATGGTTAAGCTTGGCTTCGTAGACAAAGTGACATATCAATTAG
ACAAAGCAAACATCGAATACGAAATATTCTCAGAAGTAGAGCCAGATCCATCTGTTGACA
CAGTCATGAACGGCGTAAAAATAATGAATTCGTACAATCCTGACTTAATAATCGCTGTAG
GCGATGGCTCTGCAATAGACGCAGCAAAGGGAATGTGGCTTTTCTACGAATATCCTGATA
CAGAGTTTGAAACATTGAGGCTTAAATTTGCAGACATCAGAAAAAGGGCATTTAAGTTCC
CAGAACTTGGCAAAAAAGCGCTATTCATCGCAATACCGACAACAAGCGGCACAGGCTCAG
AAGTGACAGCATTTGCCGTAATAACCGACAAAAAGAGAAACATCAAGTATCCACTGGCAG
ACTACGAACTTACACCTGACATAGCCATAATAGATCCTGACCTTACAAAGACTGTACCGC
CATCTGTAACAGCAGACACAGGCATGGATGTGCTGACACACGCCATAGAAGCATACGTAT
CAGTAATGGCATCAGACTACACAGATGCACTGGCGGAAAAGGCTATAAAGATCGTATTTG
AATACCTGCCAAGGGCTTATAAAAACGGCAATGATGAAGAAGCCCGCGAAAAGATGCACA
ATGCTTCCTGCATGGCTGGTATGGCATTCACAAATGCATTCTTAGGAATAAACCACAGCA
TGGCACACATACTGGGCGGAAAGTTCCACATACCACACGGAAGAGCAAATGCAATACTTC
TGCCGTATGTAATAAGGTACAATGCAGAAAAACCTACAAAGTTTGTGGCATTCCCACAAT
ACGAATATCCAAAAGCAGCAGAAAGATATGCGGAAATCGCCAAATTCTTAGGACTGCCTG
CTTCAACTGTTGAAGAAGGCGTAGAAAGCTTAATAGAAGCTATAAAGAACCTCATGAAAG
AGCTTAACATTCCGCTTACACTTAAAGACGCCGGCATCAACAAAGAACAGTTTGAAAAAG
AAATAGAGGAAATGTCAGACATCGCCTTCAACGATCAGTGCACAGGGACAAACCCGAGAA
TGCCTCTCACAAAAGAAATTGCAGAGATCTACAGAAAAGCATACGGTGCATAGTAAAGGA
GGCGATATTA
>PgapDH-cat insertion sequence for deletion of hfs by Shital Tripathi in strain LL1048
GTATTTCTTTTCCGAAAGAGAGGAAAAGATTCTAAAGAGTTTTGGAAATACTGATGAATA
TTGTGTGCAGAGTACAATTCTATGGACAAGAAAAGAGGCTTTGTCAAAACTTTTTCGTCT
GGGAATGAGGATGGATTTTAAAAAGCTGGATACTTTGGAGGACGAGGTGGTTTTTCAGGA
AACAAACAGGGCGCGTCTGTTTTCTTTTATATGCAATAATTACTGTATCTCTCTGGCATT
GCCAGGTTTTAATAAAGATTAAAATTATTGACTAGAAATAAAAAAATTGTCCATAATATT
AATGGACAAAAAAACAAAGAATTACATCAAAGGAAGATAAAAATACTTTGTTAAAAAATT
AATTATTTTTTATCTAAACTATTGAAAATGAAAATAAAATAATATAAAATGAATCATAGT
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AGAGGCATTAAATTAAATTTTAATTTACAATAGGAGGCGATATTAATGATGAACTTTAAT
AAAATTGATTTAGACAATTGGAAGAGAAAAGAGATATTTAATCATTATTTGAACCAACAA
ACGACTTTTAGTATAACCACAGAAATTGATATTAGTGTTTTATACCGAAACATAAAACAA
GAAGGATATAAATTTTACCCTGCATTTATTTTCTTAGTGACAAGGGTGATAAACTCAAAT
ACAGCTTTTAGAACTGGTTACAATAGCGACGGAGAGTTAGGTTATTGGGATAAGTTAGAG
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AAGAATGACTTCAAAGAGTTTTATGATTTATACCTTTCTGATGTAGAGAAATATAATGGT
TCGGGGAAATTGTTTCCCAAAACACCTATACCTGAAAATGCTTTTTCTCTTTCTATTATT
CCATGGACTTCATTTACTGGGTTTAACTTAAATATCAATAATAATAGTAATTACCTTCTA
CCCATTATTACAGCAGGAAAATTCATTAATAAAGGTAATTCAATATATTTACCGCTATCT
TTACAGGTACATCATTCTGTTTGTGATGGTTATCATGCAGGATTGTTTATGAACTCTATT
CAGGAATTGTCAGATAGGCCTAATGACTGGCTTTTATAATATGAGATAATGCCGACTGTA
CTTTTTACAGTCGGTTTTCTAATGTCACTAGGGCTCGCCTTTGGGAAGTTTGAAGGGCT
>pMU1817_mero_region Clostridium thermocellum DSM 1313, complete genome.
GTATTTCTTTTCCGAAAGAGAGGAAAAGATTCTAAAGAGTTTTGGAAATACTGATGAATA
TTGTGTGCAGAGTACAATTCTATGGACAAGAAAAGAGGCTTTGTCAAAACTTTTTCGTCT
GGGAATGAGGATGGATTTTAAAAAGCTGGATACTTTGGAGGACGAGGTGGTTTTTCAGGA
AACAAACAGGGCGCGTCTGTTTTCTTTTATATGCAATAATTACTGTATCTCTCTGGCATT
GCCAGGTTTTAATAAAGATTAAAATTATTGACTAGAAATAAAAAAATTGTCCATAATATT
AATGGACAAAAAAACAAAGAATTACATCAAAGGAAGATAAAAATACTTTGTTAAAAAATT
AATTATTTTTTATCTAAACTATTGAAAATGAAAATAAAATAATATAAAATGAATCATAGT
GCAAGAGATACTTGCCAGAGGATGAATATTTTACTGCATTCATGCTTTATGGCAGCTAAT
AGAGGCATTAAATTAAATTTTAATTTACAATAGGAGGCGATATTAATGATGAACTTTAAT
AAAATTGATTTAGACAATTGGAAGAGAAAAGAGATATTTAATCATTATTTGAACCAACAA
ACGACTTTTAGTATAACCACAGAAATTGATATTAGTGTTTTATACCGAAACATAAAACAA
GAAGGATATAAATTTTACCCTGCATTTATTTTCTTAGTGACAAGGGTGATAAACTCAAAT
ACAGCTTTTAGAACTGGTTACAATAGCGACGGAGAGTTAGGTTATTGGGATAAGTTAGAG
CCACTTTATACAATTTTTGATGGTGTATCTAAAACATTCTCTGGTATTTGGACTCCTGTA
AAGAATGACTTCAAAGAGTTTTATGATTTATACCTTTCTGATGTAGAGAAATATAATGGT
TCGGGGAAATTGTTTCCCAAAACACCTATACCTGAAAATGCTTTTTCTCTTTCTATTATT
CCATGGACTTCATTTACTGGGTTTAACTTAAATATCAATAATAATAGTAATTACCTTCTA
CCCATTATTACAGCAGGAAAATTCATTAATAAAGGTAATTCAATATATTTACCGCTATCT
TTACAGGTACATCATTCTGTTTGTGATGGTTATCATGCAGGATTGTTTATGAACTCTATT
CAGGAATTGTCAGATAGGCCTAATGACTGGCTTTTATAAACAAGATTAAGGAGGAAATTT
GATGGAAAATTTATCAAAAGACATCGATGAAATTTTGATCACAGAAGAAGAACTTAAGGA
AAAGATAAAAGAGCTTGGGAGGCAAATCACAAAAGACTACAAAGGGAAAAATTTGATGTT
GGTAGGAGTTTTAAAAGGTGCTTTAATGTTTATGGCTGATTTGTCAAGACACATAGATTT
GCCTTTATCACTTGATTTTATGGCTGTTTCCAGCTATGGAAGCTCAACTCATTCATCAGG
AATAGTAAAGATAATCAAAGATCTTGATATAAGCATAGAAGGCAAAGATGTTCTGATTGT
GGAAGACATAATTGACAGCGGTTTGACTTTGTCTTACTTAAGGGAAACTTTACTTGGAAG
GAAGCCAAAAAGCCTGAAAATATGCACAATATTAGACAAACCGGAGAGAAGAGAAGCATC
TGTAAAAGTCGATTATGTAGGATTTAAGATACCTGATAAGTTTGTCGTGGGTTATGGATT
GGACTTTGATGAAAAGTACAGGAACCTTCCTTTTATAGGCGTTTTGAAACCTGAAATGTA
CAGCTAAAATTTGTTTTTTTATATGGTATATGTTATTATAAATTAAGTGATACGGCTTTG
AAGGGAGGGCCATATTTGAATAAAACGATCAGAGGTATCGTTATATGGATACTGATAATT
ATCGCCAGGCAAAGTCCAACTATGCATTGGTGCTTTGGAAAAAGGGACAGTTGAAAGATG
GCATAAAAATGCTGGAGGATGTGTTTTCAAACTATAAGAATACAACCATATACGGAAGTC
TCGGATATCTTCTTATTCTGGACGGGGATATGAACAAAGCTTTAAATTTCAATAAGGAGG
CGTATGAGTATAACAGCTCTGATCCTGTCATACTTGACAATTTAGGCTATACCTATTACA
AAATCGGTAACATTAAAAAGGCCGAGGAAATATATCGAAAGCTTATAGGTCTTAATCCAA
ATTTTCCTGAGGCATACTATAACTATAGCTGTGTTTTGAAAGATTTGGGAATGACGGAGA
GTGCGCTAGAGATGGCCAAAAAGGCTAAAAATTACAGATTGTCATATCTCAGCAATCTTA
AAGAAGAGGAGCTGGACAACTATTTGGAGGAGCTGCAAAGTTTAATTGCCACAAAATCTG
AATAATTAAGAAGACTAATAAAAAGTTTCTAAAAGCATGAAATATCCTGTATTTTGGAGT
TACTTGCCGTTATTTATGGCTAAAGCCGAAAAAAAGATAAGGAGGGTGTTGTATACAAAA
AACATTTTGTATATAATTAGAGTTGCTTGGAACCCAGTAAAATAGCTGTTTATAGTGAGT
AGGTATTATTACCTGGTGATAATATATAGTTATAAGTATTACAAATACAGTTTTTATGAT
AACAGTTTTGGGATTATGAAAGGAGAAGAATTTATGAGTTTTTTGGAACAAATAATTGAA
AGGGCGAAATCAGACGTAAAAACCATAGTTTTGCCGGAAAGTACGGATCTGAGGGTTATT
AAAGCCGC
>pYD14_mero_region Clostridium thermocellum DSM 1313, complete genome. NC_017304.1
ATCGTGGGAATAGGCATGGAAAAGATTTTTTTGCCCGAGGATGCATTGATAAAGTATTTC
TTTTCCGAAAGAGAGGAAAAGATTCTAAAGAGTTTTGGAAATACTGATGAATATTGTGTG
CAGAGTACAATTCTATGGACAAGAAAAGAGGCTTTGTCAAAACTTTTTCGTCTGGGAATG
AGGATGGATTTTAAAAAGCTGGATACTTTGGAGGGCGAGGTGGTTTTTCAGGAAACAAAC
AGGGCGCGTCTGTTTTCTTTTATATGCAATAATTACTGTATCTCTCTGGCATTGCCAGGT
TTTAATAAAGATTAAAATTATTGACTAGAAATAAAAAAATTGTCCATAATATTAATGGAC
AAAAAAACAAAGAATTACATCAAAGGAAGATAAAAATACTTTGTTAAAAAATTAATTATT
TTTTATCTAAACTATTGAAAATGAAAATAAAATAATATAAAATGAATCATAGTGCAAGAG
ATACTTGCCAGAGGATGAATATTTTACTGCATTCATGCTTTATGGCAGCTAATAGAGGCA
TTAAATTAAATTTTAATTTACAATAGGAGGCGATATTAATGAACTTTAATAAAATTGATT
TAGACAATTGGAAGAGAAAAGAGATATTTAATCATTATTTGAACCAACAAACGACTTTTA
GTATAACCACAGAAATTGATATTAGTGTTTTATACCGAAACATAAAACAAGAAGGATATA
AATTTTACCCTGCATTTATTTTCTTAGTGACAAGGGTGATAAACTCAAATACAGCTTTTA
GAACTGGTTACAATAGCGACGGAGAGTTAGGTTATTGGGATAAGTTAGAGCCACTTTATA
CAATTTTTGATGGTGTATCTAAAACATTCTCTGGTATTTGGACTCCTGTAAAGAATGACT
TCAAAGAGTTTTATGATTTATACCTTTCTGATGTAGAGAAATATAATGGTTCGGGGAAAT
TGTTTCCCAAAACACCTATACCTGAAAATGCTTTTTCTCTTTCTATTATTCCATGGACTT
CATTTACTGGGTTTAACTTAAATATCAATAATAATAGTAATTACCTTCTACCCATTATTA
CAGCAGGAAAATTCATTAATAAAGGTAATTCAATATATTTACCGCTATCTTTACAGGTAC
ATCATTCTGTTTGTGATGGTTATCATGCAGGATTGTTTATGAACTCTATTCAGGAATTGT
CAGATAGGCCTAATGACTGGCTTTTATAATAAAGGAGGTCGACGTCATGGAAAATTTATC
AAAAGACATCGATGAAATTTTGATCACAGAAGAAGAACTTAAGGAAAAGATAAAAGAGCT
TGGGAGGCAAATCACAAAAGACTACAAAGGGAAAAATTTGATGTTGGTAGGAGTTTTAAA
AGGTGCTTTAATGTTTATGGCTGATTTGTCAAGACACATAGATTTGCCTTTATCACTTGA
TTTTATGGCTGTTTCCAGCTATGGAAGCTCAACTCATTCATCAGGAATAGTAAAGATAAT
CAAAGATCTTGATATAAGCATAGAAGGCAAAGATGTTCTGATTGTGGAAGACATAATTGA
CAGCGGTTTGACTTTGTCTTACTTAAGGGAAACTTTACTTGGAAGGAAGCCAAAAAGCCT
GAAAATATGCACAATATTAGACAAACCGGAGAGAAGAGAAGCATCTGTAAAAGTCGATTA
TGTAGGATTTAAGATACCTGATAAGTTTGTCGTGGGTTATGGATTGGACTTTGATGAAAA
GTACAGGAACCTTCCTTTTATAGGCGTTTTGAAACCTGAAATGTACAGCTAAGCCCGGGC
CTCGAGAAAACAAAAGGCTCAGTCGGAAGACTGGGCCTTTTGTTTTGGTACCGAATTCGG
CGCGCCTCAGCGTTTAAACCCGCTGATCCTAGAGGGCCGCATCATGTAATTAGTTATGTC
ACGCTTACATTCACGCCCTCCCCATGCTTTAATACATACCTGGCCCAGTAGTTCAGGCTA
CATAATAGGCGAACACGGTGATTCACAGCTTCCGTTGTGGAGCTGCACACATATCGCCGG
TAAAAATATCAACGAATATATCGATGATCCGAAATGCAATTTCACAGAAGAAGACAAGAA
AAAAATCGCTGAAGATGTTAAAACTGCGGGTGCAACCATTATCAAGAACAAAGGTGCAAC
ATACTATGGTATTGCAGTTTCAATCAACACAATAGTTGAAACACTCCTTAAGAATCAGAA
TACAATAAGAACCGTAGGAACCGTTATAAACGGCATGTATGGAATAGAAGATGTTGCAAT
AAGCCTTCCATCCATCGTAAATTCCGAAGGTGTTCAGGAAGTTCTCCAATTTAATCTGAC
TCCTGAAGAAGAAGAAGCTTTAAGATTCTCAGCGGAGC
>pZJ03_backbone_region Clostridium thermocellum DSM 1313, complete genome. NC_017304.1
GTATCATGCTCTCCGTTCCGTGTGCCGATTGCAAGGCTTGCAGCGGCTCAGGCAAGAGTA
AATGAAATAAAAGGTACAAAGGATTTGGGACAGAAATAATAAGGACAGAAATAATAAAAA
AATAATAAATAGCAAAAGGTATATATTAACACCCTATCATGTAAAAGTGGTAGGGTGTTT
TTTTAAATACATATTTTTTATGAATATTAAAAGCTTAAGAAGTGTTTGGTAGCAGGAAAA
AGCAATAACAAAAATATTAAAAAATATTTGACTCAATCTCAAGCATTTTTTACGTTTTTT
TGCCTGACGGGGGAAGAATTTTTACGCTTTTGCTGGGACTGTTTTTTTACCTTGCCAAGT
ATATATAAAATAAATTAATAAAAGTTGTTATAAACAGTTTATCTAAAAATAGGGAAAGTC
AGCTTCCTTATCTTAAGACCTTTTGAGATTTACATTGAATGATAGAAATGTTATAATTTA
TTTGTATTCTGTCAATTTTAACGTCCAGGTTGCATGGCTTCTGCAGGTCGACTCTAGAGG
ATCCCCGGGTACCGCGGCCGCGATCGCTTGCCTGTAACTTACACGCGCCTCGTATCTTTT
AATGATGGAATAATTTGGGAATTTACTCTGTGTTTATTTATTTTTATGTTTTGTATTTGG
ATTTTAGAAAGTAAATAAAGAAGGTAGAAGAGTTACGGAATGAAGAAAAAAAAATAAACA
AAGGTTTAAAAAATTTCAACAAAAAGCGTACTTTACATATATATTTATTAGACAAGAAAA
GCAGATTAAATAGATATACATTCGATTAACGATAAGTAAAATGTAAAATCACAGGATTTT
CGTGTGTGGTCTTCTACACAGACAAGATGAAACAATTCGGCATTAATACCTGAGAGCAGG
AAGAGCAAGATAAAAGGTAGTATTTGTTGGCGATCCCCCTAGAGTCTTTTACATCTTCGG
AAAACAAAAACTATTTTTTCTTTAATTTCTTTTTTTACTTTCTATTTTTAATTTATATAT
TTATATTAAAAAATTTAAATTATAATTATTTTTATAGCACGTGATGAAAAGGACCCATCG
ATAAGCTAGCTTTTCAATTCAATTCATCATTTTTTTTTTATTCTTTTTTTTGATTTCGGT
TTCTTTGAAATTTTTTTGATTCGGTAATCTCCGAACAGAAGGAAGAACGAAGGAAGGAGC
ACAGACTTAGATTGGTATATATACGCATATGTAGTGTTGAAGAAACATGAAATTGCCCAG
TATTCTTAACCCAACTGCACAGAACAAAAACCTGCAGGAAACGAAGATAAATCATGTCGA
AAGCTACATATAAGGAACGTGCTGCTACTCATCCTAGTCCTGTTGCTGCCAAGCTATTTA
ATATCATGCACGAAAAGCAAACAAACTTGTGTGCTTCATTGGATGTTCGTACCACCAAGG
AATTACTGGAGTTAGTTGAAGCATTAGGTCCCAAAATTTGTTTACTAAAAACACATGTGG
ATATCTTGACTGATTTTTCCATGGAGGGCACAGTTAAGCCGCTAAAGGCATTATCCGCCA
AGTACAATTTTTTACTCTTCGAAGACAGAAAATTTGCTGACATTGGTAATACAGTCAAAT
TGCAGTACTCTGCGGGTGTATACAGAATAGCAGAATGGGCAGACATTACGAATGCACACG
GTGTGGTGGGCCCAGGTATTGTTAGCGGTTTGAAGCAGGCGGCAGAAGAAGTAACAAAGG
AACCTAGAGGCCTTTTGATGTTAGCAGAATTGTCATGCAAGGGCTCCCTATCTACTGGAG
AATATACTAAGGGTACTGTTGACATTGCGAAGAGCGACAAAGATTTTGTTATCGGCTTTA
TTGCTCAAAGAGACATGGGTGGAAGAGATGAAGGTTACGATTGGTTGATTATGACACCCG
GTGTGGGTTTAGATGACAAGGGAGACGCATTGGGTCAACAGTATAGAACCGTGGATGATG
TGGTCTCTACAGGATCTGACATTATTATTGTTGGAAGAGGACTATTTGCAAAGGGAAGGG
ATGCTAAGGTAGAGGGTGAACGTTACAGAAAAGCAGGCTGGGAAGCATATTTGAGAAGAT
GCGGCCAGCAAAACTAAAAAACTGTATTATAAGTAAATGCATGTATACTAAACTCACAAA
TTAGAGCTTCAATTTAATTATATCAGTTATTACCCACTTTTCGGCGGCCGCGAATTGACA
GATCGCTGAGATAGGTGCCTCACTGATTAAGCATTGGTAACTGTCAGACCAAGTTTACTC
ATATATACTTTAGATTGATTTAAAACTTCATTTTTAATTTAAAAGGATCTAGGTGAAGAT
CCTTTTTGATAATCTCATGACCAAAATCCCTTAACGTGAGTTTTCGTTCCACTGAGCGTC
AGACCCCGTAGAAAAGATCAAAGGATCTTCTTGAGATCCTTTTTTTCTGCGCGTAATCTG
CTGCTTGCAAACAAAAAAACCACCGCTACCAGCGGTGGTTTGTTTGCCGGATCAAGAGCT
ACCAACTCTTTTTCCGAAGGTAACTGGCTTCAGCAGAGCGCAGATACCAAATACTGTTCT
TCTAGTGTAGCCGTAGTTAGGCCACCACTTCAAGAACTCTGTAGCACCGCCTACATACCT
CGCTCTGCTAATCCTGTTACCAGTGGCTGCTGCCAGTGGCGATAAGTCGTGTCTTACCGG
GTTGGACTCAAGACGATAGTTACCGGATAAGGCGCAGCGGTCGGGCTGAACGGGGGGTTC
GTGCACACAGCCCAGCTTGGAGCGAACGACCTACACCGAACTGAGATACCTACAGCGTGA
GCTATGAGAAAGCGCCACGCTTCCCGAAGGGAGAAAGGCGGACAGGTATCCGGTAAGCGG
CAGGGTCGGAACAGGAGAGCGCACGAGGGAGCTTCCAGGGGGAAACGCCTGGTATCTTTA
TAGTCCTGTCGGGTTTCGCCACCTCTGACTTGAGCGTCGATTTTTGTGATGCTCGTCAGG
GGGGCGGAGCCTATGGAAAAACGCCAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTG
CTGGCCTTTTGCTCACATGTTCTTTCCTGCGTTATCCCCTGATTCTGTGGATAACCGTAT
TACCGCCTTTGAGTGAGCTGATACCGCTCGCCGCAGCCGAACGACCGAGCGCAGCGAGTC
AGTGAGCGAGGAAGCGGAAGAGCGCCCAATACGCAAACCGCCTCTCCCCGCGCGTTGGCC
GATTCATTAATGCAGTATGGGAAACAAAATATTGCGTATGCGACTGTTCACATGGACGAG
AAAACCCCTCACATGCATTTAGGAGTTGTTCCTATGCGCCTAGAGGGCTTTTCGTGCGTC
AGCATGAGCGATCGGAAGAAAAGAAGAATACTTTTTCGCTTCAAGATGTTTTGCAGCGTG
ATCGAGAACTTCGTGAGCAAAGAAAAGCAAAGAGGAAAAAATCGCATGATTTGGAGCGAT
AAGAAAAAGCACTCGAATGAGTGCTTTTTTTGCGTTTTGAGCGTAGCGAAAAACGAGTTC
TTTCTATTCTTGATACATATAGAAATAACGTCATTTTTATTTTAGTTGCTGAAAGGTGCG
TTGAAGTGTTGGTATGTATGTGTTTTAAAGTATTGAAAACCCTTAAAATTGGTTGCACAG
AAAAACCCCATCTGTTAAAGTTATAAGTGACCAAACAAATAACTAAATAGATGGGGGTTT
CTTTTAATATTATGTGTCCTAATAGTAGCATTTATTCAGATGAAAAATCAAGGGTTTTAG
TGGACAAGACAAAAAGTGGAAAAGTGAGACCATGGAGAGAAAAGAAAATCGCTAATGTTG
ATTACTTTGAACTTCTGCATATTCTTGAATTTAAAAAGGCTGAAAGAGTAAAAGATTGTG
CTGAAATATTAGAGTATAAACAAAATCGTGAAACAGGCGAAAGAAAGTTGTATCGAGTGT
GGTTTTGTAAATCCAGGCTTTGTCCAATGTGCAACTGGAGGAGAGCAATGAAACATGGCA
TTCAGTCACAAAAGGTTGTTGCTGAAGTTATTAAACAAAAGCCAACAGTTCGTTGGTTGT
TTCTCACATTAACAGTTAAAAATGTTTATGATGGCGAAGAATTAAATAAGAGTTTGTCAG
ATATGGCTCAAGGATTTCGCCGAATGATGCAATATAAAAAAATTAATAAAAATCTTGTTG
GTTTTATGCGTGCAACGGAAGTGACAATAAATAATAAAGATAATTCTTATAATCAGCACA
TGCATGTATTGGTATGTGTGGAACCAACTTATTTTAAGAATACAGAAAACTACGTGAATC
AAAAACAATGGATTCAATTTTGGAAAAAGGCAATGAAATTAGACTATGATCCAAATGTAA
AAGTTCAAATGATTCGACCGAAAAATAAATATAAATCGGATATACAATCGGCAATTGACG
AAACTGCAAAATATCCTGTAAAGGATACGGATTTTATGACCGATGATGAAGAAAAGAATT
TGAAACGTTTGTCTGATTTGGAGGAAGGTTTACACCGTAAAAGGTTAATCTCCTATGGTG
GTTTGTTAAAAGAAATACATAAAAAATTAAACCTTGATGACACAGAAGAAGGCGATTTGA
TTCATACAGATGATGACGAAAAAGCCGATGAAGATGGATTTTCTATTATTGCAATGTGGA
ATTGGGAACGGAAAAATTATTTTATTAAAGAGTAGTTCAACAAACGGGATTGACTTTTAA
AAAAGGATTGATTCTAATGAAGAAAGCAGACAAGTAAGCCTCCTAAATTCACTTTAGATA
AAAATTTAGGAGGCATATCAAGAGTCGTGACTAAGAACGTCAAAGTAATTAACAATACAG
CTATTTTTCTCATGCTTTTACCCCTTTCATAAAATTTAATTTTATCGTTATCATAAAAAA
TTATAGACGTTATATTGCTTGCCGGGATATAGTGCTGGGCATTCGTTGGTGCAAAATGTT
CGGAGTAAGGTGGATATTGATTTGCATGTTGATCTATTGCATTGAAATGATTAGTTATCC
GTAAATATTAATTAATCATATCATAAATTAATTATATCATAATTGTTTTGACGAATGAAG
GTTTTTGGATAAATTATCAAGTAAAGGAACGCTAAAAATTTTGGCGTAAAATATCAAAAT
GACCACTTGAATTAATATGGTAAAGTAGATATAATATTTTGGTAAACATGCCTTCAGCAA
GGTTAGATTAGCTGTTTCCGTATAAATTAACCGTATGGTAAAACGGCAGTCAGAAAAATA
AGTCATAAGATTCCGTTATGAAAATATACTTCGGTAGTTAATAATAAGAGATATGAGGTA
AGAGATACAAGATAAGAGATATAAGGTACGAATGTATAAGATGGTGCTTTTAGGCACACT
AAATAAAAAACAAATAAACGAAAATTTTAAGGAGGACGAAAGATGTATGGGCCTAAAGAC
CACGGGTACATAGAAGTTGTAACTGGTCCCATGTTCAGTGGAAAAAGTGAGGAACTTATA
AGAAGGATAAAGAGAGCTAAGATTGCCAGGCAAAAAGTTCAGGTTTTCAAACCGGCTATA
GACGATAGGTATTCCATAGACAAAGTCGTATCTCATAACGGCGACAACATGCACGCCATT
GCCATAGTAAAGGCTTCTGACATATTGGCTTATGCTGAAGAAGATACGGATGTATTTGCT
ATAGATGAAGTTCAATTTTTTGATTCTGAAATAGTCGACATCGTAAAAGAGATTGCCGAT
AGCGGGAAAAGAGTCATATGTGCAGGGCTTGACATGGACTTTAGAGGTGAACCATTTGGT
CCGACTCCAGAATTGATGGCCATAGCTGAATTTGTCGATAAGCTTACTGCTATATGCATG
AAGTGTGGCAATCCTGCTACTCGCACGCAAAGGCTTATAAATGGGAAGCCTGCCAATTAC
GACGATCCCATTATAATGGTTGGAGCAAAGGAGTCTTATGAAGCAAGGTGTAGAAAGTGC
CATGAAGTCCCGCGGACTTAA
>P0966_bad NE_pSH041_RNF, from pSM001. Note, this is missing 7 bp just upstream of the 0966 start codon, due to a cloning error, so this promoter is probably non-functional.
TTCTTACTACTCCCTTTGCATCTACAGACAAATTTTTCTCTTTAACTTTTCTTGTAACCG
TATCCGCATACTTTTGTCATAAAGTAATTATAGATTATTATTACCGTCAAATCAAATAAT
AAATTTTATATCGCCAATTCTTTGCATCCGCTTTAAAGTCTGTGCTATAATTATATGGTT
AAAATATCATAAAAAAATAAAATAAAAGTTAAAAGGAAC
>P2638 NE_pSH043_RNF, from pSM003
GATAAACAAAGGACGGTTCAGGGCTTCTGCTCATCCTACTCTGCATTGTAAAAAGGTAGG
ATGAATTTTTATTTTTAATCTTATTGAAAAAAATTTTTGAAAATCGGTTTTATTAAAAAA
AAGTGGGTATATTTATAATAGTCAATTGATTGGTTAAAAAAATTTAAATAAGCAAACAGA
ATAATAACAAAAGTAAGGAGGAATTTGTT
>P0815 NE_pSH044_RNF, from pSM004
ATAATATATATCCGTATTTTACAATATCCATACGAATATGGATTATTTTATTTTGTTATA
TTTTTAACAAAAAAATTATTTAAACTTTTTCAATGGTGGTATTATATATATTGGTCACAG
TTTCAATGAATCAAAAAATAAAGAGGTGTTTAAT
>pSH007_plasmid_region
CAGATGACGAAAATAGCGAATAAATACGAAGTTATTGATAATGTTGAAAAGCTTGAAAAG
GCTTTGAAACGTTTAAGAGAAGCTCAAAGTGTTTATGCAACCTATACACAGGAGCAGGTT
GACAAAATTTTCTTTGAGGCGGCAATGGCGGCCAATAAAATGAGAATTCCTCTTGCCAAA
ATGGCTGTGGAGGAAACAGGCATGGGAGTGGTTGAAGACAAGGTTATCAAAAACCACTAT
GCTTCTGAGTATATCTATAATGCGTACAAAAACACTAAAACCTGCGGTGTTATTGAAGAG
GACCCTGCTTTCGGTATTAAAAAAATAGCAGAGCCTTTGGGGGTTATTGCGGCGGTTATA
CCTACTACGAATCCGACATCGACAGCAATCTTTAAGACTCTTATTGCATTAAAGACGAGA
AATGCAATTATTATAAGCCCACACCCCAGGGCAAAAAACTCAACGATAGAAGCGGCGAAA
ATTGTTTTGGAGGCGGCCGTTAAAGCCGGTGCTCCGGAAGGCATCATTGGCTGGATTGAT
GTGCCGAGCCTTGAACTTACCAACCTGGTAATGAGAGAAGCAGATGTGATTCTCGCAACA
GGCGGTCCCGGACTGGTTAAAGCAGCTTACTCTTCGGGCAAACCGGCTATTGGTGTCGGA
GCGGGCAATACTCCTGCAATTATTGATGATTCGGCCGACATTGTCTTGGCAGTGAACTCA
ATAATACATTCAAAAACTTTCGACAACGGTATGATTTGTGCTTCAGAGCAATCGGTCATT
GTTCTGGACGGGGTATATAAAGAGGTAAAAAAAGAATTTGAAAAAAGAGGATGCTATTTC
TTAAATGAAGATGAAACTGAAAAGGTAAGAAAAACAATTATAATAAACGGTGCGTTAAAT
GCCAAGATAGTAGGTCAGAAAGCTCACACAATTGCAAACCTTGCAGGTTTTGAGGTACCC
GAGACTACAAAAATTCTGATAGGCGAAGTTACCAGCGTGGATATTTCCGAAGAATTTGCC
CACGAAAAGTTGTGCCCGGTACTGGCAATGTACAGGGCAAAGGATTTTGACGATGCCCTT
GATAAAGCAGAAAGGTTGGTAGCTGACGGTGGATTTGGCCATACTTCGTCACTTTATATA
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>pDGO113_plasmid_region
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GGAGGAAATTCAGTTTCCGACAATGTGGGAGTCAAGCATTTGTTAAACATTAAAACAGTT
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GATGAAATGGGAATTGTGCACAAGACCTTCTTTGATGTGTCTCCAGACCCATCCCTTGCA
TCTGCCAAAGCCGGTGCGGCAGAAATGCTGGCTTTCCAGCCTGACACCATAATTGCGGTC
GGCGGCGGATCTGCCATGGACGCGGCCAAAATCATGTGGGTGATGTATGAACATCCGGAA
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GAATATCTCCCGAGAGCCTATGAAAACGGTGCAAGTGACCCGGTTGCAAGAGAGAAAATG
GCCAATGCCGCAACAATAGCCGGAATGGCTTTTGCCAATGCCTTTTTGGGTGTATGCCAT
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TACTTTGAACTTCTGCATATTCTTGAATTTAAAAAGGCTGAAAGAGTAAAAGATTGTGCT
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TTTTGTAAATCCAGGCTTTGTCCAATGTGCAACTGGAGGAGAGCAATGAAACATGGCATT
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ACGCTCGTCGTTTGGTATGGCTTCATTCAGCTCCGGTTCCCAACGATCAAGGCGAGTTAC
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AAGTAAGTTGGCCGCAGTGTTATCACTCATGGTTATGGCAGCACTGCATAATTCTCTTAC
TGTCATGCCATCCGTAAGATGCTTTTCTGTGACTGGTGAGTACTCAACCAAGTCATTCTG
AGAATAGTGTATGCGGCGACCGAGTTGCTCTTGCCCGGCGTCAACACGGGATAATACCGC
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ATCTTCAGCATCTTTTACTTTCACCAGCGTTTCTGGGTGAGCAAAAACAGGAAGGCAAAA
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TCAATATTATTGAAGCATTTATCAGGGTTATTGTCTCATGAGCGGATACATATTTGAATG
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CCTTCTGCTTAATTTGATGCCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTGCCCGCCACCCTCCGG
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>pSH064_plasmid_region Clostridium thermocellum DSM 1313, complete genome.
ATGAACGAGATTTTAGAGAAGAAGCAATTGAATCCCACTGTCAAAATGATGGTTATAAAC
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AAGGGTGAACGCATTCCTTTGACAATAGCGGATTACGACAGAAACAAAGGCACGATTACT
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AGATTGCATGACTTCGTAGGACCTTTAGGAAAACCTGTTGAATTTTCAAAAGATACGAAG
AGAGTTTTAGCAATCGGCGGAGGTGTTGGAGTTGCGCCGCTTTATCCAAAAGTAAAAATG
CTAAATGAGATGAAAGTACCAGTGGATAGTATAATAGGCGGCAGAAGTGCAGAGTACGTC
ATATTAGAAGATGAAATGAAAAAAGTCAGTGAAAACCTTTATATAACGACGGATGACGGC
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GGTCCAGCATTTGACGGGCTTAAAGTAGACTTTGATGAAGCAATGAGAAGGCAGAATATG
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TTCGTTGAAAAAATTGGGAGTAAAAATAGAAACCAACATGGTCATAGGCAAGATACTTAC
AATCGATGATTTATTCGACATGGGGTATGAAGCAGTGTTCATAGGGACAGGCGCAGGATT
GCCTAAATTTATGAATATACCTGGAGAAAACTTAAATGGAGTTTACTCAGCAAATGAATT
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TGTTGAATACTCATACTCTTCCTTTTTCAATATTATTGAAGCATTTATCAGGGTTATTGT
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TTCAAGACTAACTCCTCTAAATCAATTACCAGTGGCTGCTGCCAGTGGTGCTTTTGCATG
TCTTTCCGGGTTGGACTCAAGACGATAGTTACCGGATAAGGCGCAGCGGTCGGACTGAAC
GGGGGGTTCGTGCATACAGTCCAGCTTGGAGCGAACTGCCTACCCGGAACTGAGTGTCAG
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GCCTATGGAAAAACGGCTTTGCCGCGGCCCTCTCACTTCCCTGTTAAGTATCTTCCTGGC
ATCTTCCAGGAAATCTCCGCCCCGTTCGTAAGCCATTTCCGCTCGCCGCAGTCGAACGAC
CGAGCGTAGCGAGTCAGTGAGCGAGGAAGCGGAATATATCCTGTATCACATATTCTGCTG
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TGAAAGGTGCGTTGAAGTGTTGGTATGTATGTGTTTTAAAGTATTGAAAACCCTTAAAAT
TGGTTGCACAGAAAAACCCCATCTGTTAAAGTTATAAGTGACCAAACAAATAACTAAATA
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GTATCGAGTGTGGTTTTGTAAATCCAGGCTTTGTCCAATGTGCAACTGGAGGAGAGCAAT
GAAACATGGCATTCAGTCACAAAAGGTTGTTGCTGAAGTTATTAAACAAAAGCCAACAGT
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TGCAATGTGGAATTGGGAACGGAAAAATTATTTTATTAAAGAGTAGTTCAACCCGGGGAT
CCTCTAGAGTCGACCTGCAGGCATGCAAGCT
>kor_plasmid_region .
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GTCTGGGAATGAGGATGGATTTTAAAAAGCTGGATACTTTGGAGGACGAGGTGGTTTTTC
AGGAAACAAACAGGGCGCGTCTGTTTTCTTTTATATGCAATAATTACTGTATCTCTCTGG
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TACAGCTTTTAGAACTGGTTACAATAGCGACGGAGAGTTAGGTTATTGGGATAAGTTAGA
GCCACTTTATACAATTTTTGATGGTGTATCTAAAACATTCTCTGGTATTTGGACTCCTGT
AAAGAATGACTTCAAAGAGTTTTATGATTTATACCTTTCTGATGTAGAGAAATATAATGG
TTCGGGGAAATTGTTTCCCAAAACACCTATACCTGAAAATGCTTTTTCTCTTTCTATTAT
TCCATGGACTTCATTTACTGGGTTTAACTTAAATATCAATAATAATAGTAATTACCTTCT
ACCCATTATTACAGCAGGAAAATTCATTAATAAAGGTAATTCAATATATTTACCGCTATC
TTTACAGGTACATCATTCTGTTTGTGATGGTTATCATGCAGGATTGTTTATGAACTCTAT
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TTATACGAACGGTAAAAACACGATGATAATACACC
>pSH062_plasmid_region Clostridium thermocellum DSM 1313, complete genome.
ATGGCAACGACAAAAACGGAATTAGACGTTCAGAAGCAGATAGATCTACTTGTGTCAAGA
GCACAAGAGGCTCAGAAAAAATTCATGTCTTACACGCAAGAGCAAATCGACGCAATAGTT
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CCAACATCTACCACGATGTTTAAATGCTTAATATCCATAAAGACGCGAAATCCTATAATA
TTCAGCTTCCATCCAAAGGCAATAAAGTGCAGCATCGCAGCAGCCAAAGTGATGTATGAA
GCTGCACTAAAGGCAGGCGCACCTGAAGGATGCATAGGATGGATAGAAACGCCATCAATT
GAGGCCACACAGCTTCTCATGACACATCCAGGCGTATCGCTGATCCTTGCAACGGGCGGT
GCAGGAATGGTAAAAGCGGCATACAGCTCAGGAAAACCGGCATTAGGCGTAGGTCCTGGC
AATGTGCCATGCTACATCGAAAAATCAGCAAACATAAAGAGGGCTGTATCGGATCTCATA
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AAAGATGAAATAAAGAAGCTTGAGAAATTTGCAATTGATGAGCAAAGCTGCGCCATGAGC
CCTGCAGTGGTAGGTCAGCCAGCGGCGAAGATTGCTGAAATGGCAGGCTTCAAAGTCCCC
GAAGGCACAAAGATATTAGTGGCAGAGTACGAAGGAGTAGGTCCAAAATATCCTCTATCA
AGGGAGAAACTAAGCCCGATTCTTGCTTGCTACACCGTCAAAGACTACAATGAAGGAATC
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GAAAATCAAAACGTCATAAATGAATTTGCAAGGCGAGTCCGCACAGGAAGACTTATCGTA
AATTCACCATCATCACAGGGAGCAATAGGAGATATATACAATACAAACACGCCATCACTT
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GCGTTTATCGTCACAGATCCATTCATGGTTAAGCTTGGCTTCGTAGACAAAGTGACATAT
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GCTGTAGGCGATGGCTCTGCAATAGACGCAGCAAAGGGAATGTGGCTTTTCTACGAATAT
CCTGATACAGAGTTTGAAACATTGAGGCTTAAATTTGCAGACATCAGAAAAAGGGCATTT
AAGTTCCCAGAACTTGGCAAAAAAGCGCTATTCATCGCAATACCGACAACAAGCGGCACA
GGCTCAGAAGTGACAGCATTTGCCGTAATAACCGACAAAAAGAGAAACATCAAGTATCCA
CTGGCAGACTACGAACTTACACCTGACATAGCCATAATAGATCCTGACCTTACAAAGACT
GTACCGCCATCTGTAACAGCAGACACAGGCATGGATGTGCTGACACACGCCATAGAAGCA
TACGTATCAGTAATGGCATCAGACTACACAGATGCACTGGCGGAAAAGGCTATAAAGATC
GTATTTGAATACCTGCCAAGGGCTTATAAAAACGGCAATGATGAAGAAGCCCGCGAAAAG
ATGCACAATGCTTCCTGCATGGCTGGTATGGCATTCACAAATGCATTCTTAGGAATAAAC
CACAGCATGGCACACATACTGGGCGGAAAGTTCCACATACCACACGGAAGAGCAAATGCA
ATACTTCTGCCGTATGTAATAAGGTACAATGCAGAAAAACCTACAAAGTTTGTGGCATTC
CCACAATACGAATATCCAAAAGCAGCAGAAAGATATGCGGAAATCGCCAAATTCTTAGGA
CTGCCTGCTTCAACTGTTGAAGAAGGCGTAGAAAGCTTAATAGAAGCTATAAAGAACCTC
ATGAAAGAGCTTAACATTCCGCTTACACTTAAAGACGCCGGCATCAACAAAGAACAGTTT
GAAAAAGAAATAGAGGAAATGTCAGACATCGCCTTCAACGATCAGTGCACAGGGACAAAC
CCGAGAATGCCTCTCACAAAAGAAATTGCAGAGATCTACAGAAAAGCATACGGTGCATAG
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AAATGATGGTTATAAACGCTCCACTAATGGCGAAAAAGGCGAAACCTGGACAGTTTGTCA
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ACAAAGGCACGATTACTATAATATTTCAAGAAGTCGGCATGAGCACCAAGAAGTTAGGTA
CGTTAAACGTAGGCGATAGATTGCATGACTTCGTAGGACCTTTAGGAAAACCTGTTGAAT
TTTCAAAAGATACGAAGAGAGTTTTAGCAATCGGCGGAGGTGTTGGAGTTGCGCCGCTTT
ATCCAAAAGTAAAAATGCTAAATGAGATGAAAGTACCAGTGGATAGTATAATAGGCGGCA
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TAACGACGGATGACGGCACAAAAGGCCGTAAAGGCTTTGTAACAGATGTATTAAAAGAAT
TGATAGAAAAAGACAACAAATACGATGAAGTAATTGCAATTGGGCCACTGATAATGATGA
AGATGGTATGCAATATAACAAAAGAATACAACATACCAACTATGGTCAGCATGAACCCGA
TAATGATAGACGGAACTGGAATGTGCGGAGGATGCAGAGTCACAGTTGGAGGAGAGACAA
AATTTGCATGTGTCGATGGTCCAGCATTTGACGGGCTTAAAGTAGACTTTGATGAAGCAA
TGAGAAGGCAGAATATGTATAAAGATATGGAGAGGAAAGTATTAGAAAATTATGAGCACG
AATGCAAGTTAGGGGGCATCTTAAATGGCTAACATGTCGTTAAAAAAAGTACCAATGCCT
GAACAGGAACCAGATCAGCGGAACAAAAATTTCAAAGAAGTTGCATTAGGGTATGAAGAA
AACATGGCTGTTGAAGAAGCCGAAAGATGTATTCAATGTAAGAATCAGCCATGTGTTGAA
GGTTGCCCTGTTCACGTAAAAATACCTGAGTTCATCAAGCTGATAGCAAACAGGGACTTT
GAAGGAGCATATCAAAAGATAAAAGAAACGAATAATCTACCTGCAATATGTGGAAGAGTA
TGTCCACAGGAAAGCCAGTGTGAATCAGTATGCACAAGAGGCAAAAAAGGAGAACCTGTA
GCTATAGGCAGACTGGAGAGATTTACAGCAGATTGGCATATGAAAAATAATGAAGATAAA
ATAGAAAAACCAGAGACGAATGGCAGAAAAGTTGCTGTTATAGGATCTGGGCCTGCAGGA
CTATCGTGTGCAGGTGATCTTGCAAAAATGGGATATGACACAACCATCTTTGAAGCATTT
CATACACCAGGCGGTGTTTTAATGTACGGTATCCCAGAGTTTAGACTTCCAAAAGAAATA
GTGCAAAAAGAAATTGATTCGTTGAAAAAATTGGGAGTAAAAATAGAAACCAACATGGTC
ATAGGCAAGATACTTACAATCGATGATTTATTCGACATGGGGTATGAAGCAGTGTTCATA
GGGACAGGCGCAGGATTGCCTAAATTTATGAATATACCTGGAGAAAACTTAAATGGAGTT
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AGTCCCACTCCTGTAAAAGTAGGCAAGAAAGTTGCTGTTGTTGGCGGTGGAAACGTGGCG
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GGTGGAATAATAGTCAACGAAGAAACATTGGAGACAAGCCGCAGAGGAGTTTTTGCGGGC
GGTGATGCTGTGACAGGTGCAGCTACAGTAATACTTGCAATGGGAGCTGGTAAAAAAGCT
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GTGTTGGCAGTATACATAAGATAAAGGATATATTAGAAAATCTAAAAATTAATGGCATTA
ATAATGTTATTTTTATAACAGGCAAAGGTTCGTATAAGACTAGCGGAGCTTGGGATGTTG
TAAGGCCTGTATTGGAAGAGCTTGATTTAAAATATTCACTTTACGATAAAGTTGGTCCAA
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CCGTAATTGGAATTGGCGGTGGTAGCCCTATAGATACTGCAAAAAGTGTAGCTGTGCTAT
TAAAGTATACTGATAAAAATGCACGAGAGCTTTATAAGCAAAAATTTATTCCTGATGATG
CTGTTCCTATAATAGCTATAAATCTTACACATGGTACAGGAACAGAGGTAGATAGATTTG
CAGTGGCTACTATACCTGAGAAAAATTATAAACCAGCTATAGCTTATGATTGCTTATATC
CTATGTTTGCTATAGATGACCCTTCGCTTATGACAAAGCTTGATAAAAAACAGACTATAG
CCGTTACTGTTGATGCTTTAAATCACATTACAGAAGCTGCTACGACACTTGTTGCATCTC
CATATAGTATTCTTACGGCTAAGGAAACAGTAAGATTGATTGTTCGATATCTTCCCGCTG
CTGTAAATGATCCTTTAAATATAGTGGCAAGATATTACCTTCTGTATGCTTCTGCATTAG
CTGGCATATCTTTTGACAATGGTCTTTTGCATCTTACTCATGCTTTAGAGCATCCTTTAA
GTGCTGTAAAACCTGAAATAGCTCATGGTTTAGGGCTTGGTGCAATATTGCCAGCAGTTA
TAAAAGCTATTTATCCAGCTACAGCAGAAGTATTGGCTGATGTATATAGTCCTATAGTTC
CTGGTTTAAAAGGACTGCCTGTTGAGGCGGAGTATGTAGCAGAAAAAGTTCAAGAATGGC
TTTTTAGTGTGGGGTGCATTCAAAAGTTATCTGATTTTGGGTTTACGAAAGATGATATTC
CTAATCTTGTAAAACTTGCTAAAACAACTCCTTCCCTTGATGGGTTGTTATCTATTGCAC
CTGTTGAAGCTACTGAATCTGTCATTGAAAAGATTTATTTAAAATCTCTTTAATTAATAG
AAATAATTTTGTTTAACTTTACAAACGGGATTGACTTTTAAAAAAGGATTGATTCTAATG
AAGAAAGCAGACAAGTAAGCCTCCTAAATTCACTTTAGATAAAAATTTAGGAGGCATATC
AAATGAACTTTAATAAAATTGATTTAGACAATTGGAAGAGAAAAGAGATATTTAATCATT
ATTTGAACCAACAAACGACTTTTAGTATAACCACAGAAATTGATATTAGTGTTTTATACC
GAAACATAAAACAAGAAGGATATAAATTTTACCCTGCATTTATTTTCTTAGTGACAAGGG
TGATAAACTCAAATACAGCTTTTAGAACTGGTTACAATAGCGACGGAGAGTTAGGTTATT
GGGATAAGTTAGAGCCACTTTATACAATTTTTGATGGTGTATCTAAAACATTCTCTGGTA
TTTGGACTCCTGTAAAGAATGACTTCAAAGAGTTTTATGATTTATACCTTTCTGATGTAG
AGAAATATAATGGTTCGGGGAAATTGTTTCCCAAAACACCTATACCTGAAAATGCTTTTT
CTCTTTCTATTATTCCATGGACTTCATTTACTGGGTTTAACTTAAATATCAATAATAATA
GTAATTACCTTCTACCCATTATTACAGCAGGAAAATTCATTAATAAAGGTAATTCAATAT
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TAATGCCGACTGTACTTTTTACAGTCGGTTTTCTAATGTCACTAGGGCTCGCCTTTGGGA
AGTTTGAAGGTTACCAATGCTTAATCAGTGAGGCACCTATCTCAGCGATCTGTCTATTTC
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CATCTGGCCCCAGTGCTGCAATGATACCGCGAGACCCACGCTCACCGGCTCCAGATTTAT
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TGGCTTCATTCAGCTCCGGTTCCCAACGATCAAGGCGAGTTACATGATCCCCCATGTTGT
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GACCGAGTTGCTCTTGCCCGGCGTCAACACGGGATAATACCGCGCCACATAGCAGAACTT
TAAAAGTGCTCATCATTGGAAAACGTTCTTCGGGGCGAAAACTCTCAAGGATCTTACCGC
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TAAATGATAAAAAGTGATATAATAGGGTCAGGCGTACAGAAGCCTGACCTTTTTGCAAAA
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ATTGTTGATACAATCGAATTATGCGGCTAAAAATTTGCTCATGAGCCTAGAAATATTTTA
TCTGATTAATAAGATGATCTTCTTGAGATCGTTTTGGTCTGCGCGTAATCTCTTGCTCTG
AAAACGAAAAAACCGCCTTGCAGGGCGGTTTTTCGAAGGTTCTCTGAGCTACCAACTCTT
TGAACCGAGGTAACTGGCTTGGAGGAGCGCAGTCACCAAAACTTGTCCTTTCAGTTTAGC
CTTAACCGGCGCATGACTTCAAGACTAACTCCTCTAAATCAATTACCAGTGGCTGCTGCC
AGTGGTGCTTTTGCATGTCTTTCCGGGTTGGACTCAAGACGATAGTTACCGGATAAGGCG
CAGCGGTCGGACTGAACGGGGGGTTCGTGCATACAGTCCAGCTTGGAGCGAACTGCCTAC
CCGGAACTGAGTGTCAGGCGTGGAATGAGACAAACGCGGCCATAACAGCGGAATGACACC
GGTAAACCGAAAGGCAGGAACAGGAGAGCGCACGAGGGAGCCGCCAGGGGGAAACGCCTG
GTATCTTTATAGTCCTGTCGGGTTTCGCCACCACTGATTTGAGCGTCAGATTTCGTGATG
CTTGTCAGGGGGGCGGAGCCTATGGAAAAACGGCTTTGCCGCGGCCCTCTCACTTCCCTG
TTAAGTATCTTCCTGGCATCTTCCAGGAAATCTCCGCCCCGTTCGTAAGCCATTTCCGCT
CGCCGCAGTCGAACGACCGAGCGTAGCGAGTCAGTGAGCGAGGAAGCGGAATATATCCTG
TATCACATATTCTGCTGACGCACCGGTGCAGCCTTTTTTCTCCTGCCACATGAAGCACTT
CACTGACACCCTCATCAGTGCCAACATAGTAAGCCAGTATACAAATGAGTGCTTTTTTTG
CGTTTTGAGCGTAGCGAAAAACGAGTTCTTTCTATTCTTGATACATATAGAAATAACGTC
ATTTTTATTTTAGTTGCTGAAAGGTGCGTTGAAGTGTTGGTATGTATGTGTTTTAAAGTA
TTGAAAACCCTTAAAATTGGTTGCACAGAAAAACCCCATCTGTTAAAGTTATAAGTGACC
AAACAAATAACTAAATAGATGGGGGTTTCTTTTAATATTATGTGTCCTAATAGTAGCATT
TATTCAGATGAAAAATCAAGGGTTTTAGTGGACAAGACAAAAAGTGGAAAAGTGAGACCA
TGGAGAGAAAAGAAAATCGCTAATGTTGATTACTTTGAACTTCTGCATATTCTTGAATTT
AAAAAGGCTGAAAGAGTAAAAGATTGTGCTGAAATATTAGAGTATAAACAAAATCGTGAA
ACAGGCGAAAGAAAGTTGTATCGAGTGTGGTTTTGTAAATCCAGGCTTTGTCCAATGTGC
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AAACAAAAGCCAACAGTTCGTTGGTTGTTTCTCACATTAACAGTTAAAAATGTTTATGAT
GGCGAAGAATTAAATAAGAGTTTGTCAGATATGGCTCAAGGATTTCGCCGAATGATGCAA
TATAAAAAAATTAATAAAAATCTTGTTGGTTTTATGCGTGCAACGGAAGTGACAATAAAT
AATAAAGATAATTCTTATAATCAGCACATGCATGTATTGGTATGTGTGGAACCAACTTAT
TTTAAGAATACAGAAAACTACGTGAATCAAAAACAATGGATTCAATTTTGGAAAAAGGCA
ATGAAATTAGACTATGATCCAAATGTAAAAGTTCAAATGATTCGACCGAAAAATAAATAT
AAATCGGATATACAATCGGCAATTGACGAAACTGCAAAATATCCTGTAAAGGATACGGAT
TTTATGACCGATGATGAAGAAAAGAATTTGAAACGTTTGTCTGATTTGGAGGAAGGTTTA
CACCGTAAAAGGTTAATCTCCTATGGTGGTTTGTTAAAAGAAATACATAAAAAATTAAAC
CTTGATGACACAGAAGAAGGCGATTTGATTCATACAGATGATGACGAAAAAGCCGATGAA
GATGGATTTTCTATTATTGCAATGTGGAATTGGGAACGGAAAAATTATTTTATTAAAGAG
TAGTTCAACCCGGGGATCCTCTAGAGTCGACCTGCAGGCATGCAAGCT
>pSH023_plasmid_region ATCC 37254: very usable general purpose vector.
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