reference.md

layout
reference

{% include base_path.html %}

Посилання

[Введення в R та RStudio]({{ relative_root_path }}/{% link _episodes/01-rstudio-intro.md %})

• Використовуйте клавішу Esc для скасування незавершених команд або запущеного коду (Ctrl+C), якщо ви використовуєте R з терміналу.
• Базові арифметичні операції виконуються в стандартному порядку пріоритетів:
• Дужки: (, )
• Експоненти: ^ або **
• Ділення: /
• Множення: *
• Додавання: +
• Віднімання: -.
• Можна використовувати наукове позначення, наприклад: 2e-3.
• Все, що знаходиться праворуч від # є коментарем, R ігнорує його!
• Функції позначаються через ім'я_функції(). Вирази всередині дужок обчислюються перед передачею у функцію, а функції можуть бути вкладеними.
• Оператори порівняння: <, <=, >, >=, ==, !=
• Використовуйте all.equal для порівняння чисел!
• <- - оператор присвоювання. Все, що знаходиться праворуч, обчислюється, а потім зберігається у змінній, названій ліворуч.
• ls виводить список усіх створених вами змінних і функцій
• rm можна використовувати для їх видалення
• При присвоюванні значень аргументам функції ви обов'язково повинні використовувати =.

[Управління проєктами в RStudio]({{ relative_root_path }}/{% link _episodes/02-project-intro.md %})

• Для створення нового проєкту виберіть File -> New Project (Файл -> Новий проєкт)
• Деякі найкращі практики:

• Розглядайте дані як доступні лише для читання
• Зберігайте очищені дані окремо від необроблених брудних даних
• Розглядайте згенероване виведення як одноразове
• Зберігайте пов'язані дані разом
• Використовуйте послідовну схему іменування

[Структури даних]({{ relative_root_path }}/{% link _episodes/03-data-structures-part1.md %})

• Використовуйте read.csv() для імпорту даних в пам'ять
• class() надає вам клас даних вашого об'єкту
• R автоматично перетворює типи даних
• Функції length(), nrow(), head(), tail() та str() можуть бути корисними для перегляду даних.
• Фактори - це спеціальний клас для роботи з категоріальними даними.
• Списки забезпечують гнучкий тип даних.
• Фрейми даних є окремим випадком списків.

[Вивчення фреймів даних]({{ relative_root_path }}/{% link _episodes/04-data-structures-part2.md %})

• R дозволяє легко імпортувати набори даних, що зберігаються віддалено
• [Фрейми даних]({{ relative_root_path }}/05-data-structures-part2/)

• ?data.frame is a key data structure. It is a list of vectors.
• cbind() will add a column (vector) to a data.frame.
• rbind() will add a row (list) to a data.frame.

**Корисні функції для запиту структур даних

• структура ?str, виводить короткий опис всієї структури даних
• ?class що це за структура даних?
• ?head вивести перші n елементів (рядки для двовимірних об'єктів)
• ?tail вивести останні n елементів (рядки для двовимірних об'єктів)
• ?rownames, ?colnames, ?dimnames отримують або змінюють назви рядків та імена стовпців об'єкта.
• ?length отримують кількість елементів в атомарному векторі
• ?nrow, ?ncol, ?dim отримують розмірність n-вимірного об'єкта (Не працює для атомарних векторів та списків).

• Якщо ваш фрейм даних містить фактори, вам потрібно виконати додаткові кроки, щоб додати рядки, які містять нові значення рівнів.

• read.csv зчитати дані у звичайній структурі
  • sep аргумент для вказівки розділювача
    • "," for comma separated
    • "\t" for tab separated
  • Other arguments:
    • header=TRUE if there is a header row

[Subsetting data]({{ relative_root_path }}/{% link _episodes/05-data-subsetting.md %})

• Elements can be accessed by:

  • Index
  • Name
  • Logical vectors

• [ single square brackets:

  • extract single elements or subset vectors
  • e.g.x[1] extracts the first item from vector x.
  • extract single elements of a list. The returned value will be another list().
  • extract columns from a data.frame

• [ with two arguments to:

  • extract rows and/or columns of
    • matrices
    • data.frames
    • e.g. x[1,2] will extract the value in row 1, column 2.
    • e.g. x[2,:] will extract the entire second column of values.

• [[ double square brackets to extract items from lists.

• $ to access columns or list elements by name

• negative indices skip elements

[Data frame manipulation with dplyr]({{ relative_root_path }}/{% link _episodes/06-dplyr.md %})

• ?select to extract variables by name.
• ?filter return rows with matching conditions.
• ?group_by group data by one of more variables.
• ?summarize summarize multiple values to a single value.
• ?mutate add new variables to a data.frame.
• ?count and ?n to tally values in the data frame.
• Combine operations using the ?"%>%" pipe operator.

[Control flow]({{ relative_root_path }}/{% link _episodes/07-plot-ggplot2.md %})

• figures can be created with the grammar of graphics:
  • library(ggplot2)
  • ggplot to create the base figure
  • aesthetics specify the data axes, shape, color, and data size
  • geometry functions specify the type of plot, e.g. point, line, density, box
  • geometry functions also add statistical transforms, e.g. geom_smooth
  • scale functions change the mapping from data to aesthetics
  • facet functions stratify the figure into panels
  • aesthetics apply to individual layers, or can be set for the whole plot inside ggplot.
  • theme functions change the overall look of the plot
  • order of layers matters!
  • ggsave to save a figure.

[Writing data]({{ relative_root_path }}/{% link _episodes/08-writing-data.md %})

• write.table to write out objects in regular format

Glossary

{:auto_ids} argument : A value given to a function or program when it runs. The term is often used interchangeably (and inconsistently) with parameter.

assign : To give a value a name by associating a variable with it.

body : (of a function): the statements that are executed when a function runs.

comment : A remark in a program that is intended to help human readers understand what is going on, but is ignored by the computer. Comments in Python, R, and the Unix shell start with a # character and run to the end of the line; comments in SQL start with --, and other languages have other conventions.

comma-separated values : (CSV) A common textual representation for tables in which the values in each row are separated by commas.

delimiter : A character or characters used to separate individual values, such as the commas between columns in a CSV file.

documentation : Human-language text written to explain what software does, how it works, or how to use it.

floating-point number : A number containing a fractional part and an exponent. See also: integer.

for loop : A loop that is executed once for each value in some kind of set, list, or range. See also: while loop.

index : A subscript that specifies the location of a single value in a collection, such as a single pixel in an image.

integer : A whole number, such as -12343. See also: floating-point number.

library : In R, the directory(ies) where packages are stored.

package : A collection of R functions, data and compiled code in a well-defined format. Packages are stored in a library and loaded using the library() function.

parameter : A variable named in the function's declaration that is used to hold a value passed into the call. The term is often used interchangeably (and inconsistently) with argument.

return statement : A statement that causes a function to stop executing and return a value to its caller immediately.

sequence : A collection of information that is presented in a specific order.

shape : An array's dimensions, represented as a vector. For example, a 5×3 array's shape is (5,3).

string : Short for "character string", a sequence of zero or more characters.

syntax error : A programming error that occurs when statements are in an order or contain characters not expected by the programming language.

type : The classification of something in a program (for example, the contents of a variable) as a kind of number (e.g. floating-point, integer), string, or something else. In R the command typeof() is used to query a variables type.

while loop : A loop that keeps executing as long as some condition is true. See also: for loop.