diff --git a/Darwin-core-LNP.html b/Darwin-core-LNP.html index 1401850..720011d 100644 --- a/Darwin-core-LNP.html +++ b/Darwin-core-LNP.html @@ -11,7 +11,7 @@ - + Metadata com Living Norway package @@ -549,7 +549,7 @@

Metadata com Living Norway package

Gabriel Nakamura

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2024-07-09

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2024-07-11

diff --git a/Organizacao_dir_local.html b/Organizacao_dir_local.html index dfdc51b..d3d8e3d 100644 --- a/Organizacao_dir_local.html +++ b/Organizacao_dir_local.html @@ -11,7 +11,7 @@ - + Organizando o seu trabalho localmente @@ -545,7 +545,7 @@

Organizando o seu trabalho localmente

Gabriel Nakamura

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diff --git a/basics_git.html b/basics_git.html index 6e35ff8..440dc98 100644 --- a/basics_git.html +++ b/basics_git.html @@ -11,7 +11,7 @@ - + Controle de versão @@ -550,7 +550,7 @@

Controle de versão

Gabriel Nakamura

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diff --git a/colabs_github.html b/colabs_github.html index c3c6f39..cb0444e 100644 --- a/colabs_github.html +++ b/colabs_github.html @@ -11,7 +11,7 @@ - + Trabalho em colaboração @@ -549,7 +549,7 @@

Trabalho em colaboração

Gabriel Nakamura

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diff --git a/commits-travel.html b/commits-travel.html index e882f1f..85146ed 100644 --- a/commits-travel.html +++ b/commits-travel.html @@ -11,7 +11,7 @@ - + Explorando melhor os commits @@ -549,7 +549,7 @@

Explorando melhor os commits

Gabriel Nakamura

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diff --git a/conflitos.html b/conflitos.html index 0354174..d2fb5c1 100644 --- a/conflitos.html +++ b/conflitos.html @@ -11,7 +11,7 @@ - + Resolução de conflitos de versão @@ -448,7 +448,7 @@

Resolução de conflitos de versão

Gabriel Nakamura

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2024-07-09

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diff --git a/dados_abertos.html b/dados_abertos.html index 56cfb57..bfbcff9 100644 --- a/dados_abertos.html +++ b/dados_abertos.html @@ -11,7 +11,7 @@ - + Dados abertos @@ -445,7 +445,7 @@

Dados abertos

Melina Leite

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2024-07-09

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2024-07-11

diff --git a/figs/template_gitignore.png b/figs/template_gitignore.png new file mode 100644 index 0000000..79a5e58 Binary files /dev/null and b/figs/template_gitignore.png differ diff --git a/gitgnore.Rmd b/gitgnore.Rmd index 61b6a7d..0356e37 100644 --- a/gitgnore.Rmd +++ b/gitgnore.Rmd @@ -15,3 +15,51 @@ klippy::klippy() # Apresentação +Nem sempre queremos que o git monitore todos os arquivos presentes no nosso diretório. Isso pode se dar por alguns motivos. O arquivo pode conter informações que você não queira que seja pública, ou ainda, uma pasta inteira contém dados que são pesados demais para serem versionados, as razões para escapar do monitoramento do versionamento podem ser muitas. A questão é, como podemos evitar com que estes arquivos, ou pastas inteiras, sejam versionados pelo git? + +Para isso usaremos um arquivo especial chamado **.gitignore´**. Você deve se lembrar que já vimos brevemente este arquivo quando criamos o repositório. Ao iniciar o repositório remoto, o próprio Github nos dá a opção de criar um arquivo do tipo .gitignore a partir de um modelo pré definido, como mostrado na imagem abaixo. + +```{r echo=FALSE, eval=TRUE, fig.cap="Página inicial para criação de repositórios no github.com seta destacando o local de escolher o gitignore"} +knitr::include_graphics("figs/template_gitignore.png") + +``` + +# Editando o .gitignore + +Cada linha no .gitignore indica um arquivo que será ignorado. Linhas em branco não indicam arquivo algum, e são usadas para separar arquivos que serão ignorados no .gitignore, facilitando sua leitura. + +Existem maneiras diferentes de indicar os arquivos que serão ignorados pelo git. Podemos ignorar arquivos individualmente, simplesmente colocando o caminho relativo do arquivo, juntamente com o nome do arquivo acompanhado de sua extensão. Por exemplo, se quisermos ignorar o arquivo chamado `meignore.doc` que se encontra na raiz do projeto, devemos apenas acrescentar em uma linha no gitignore contendo `meignore.doc`. + +O .gitignore também nos possibilita a utilização de padrões para ignorar um conjunto de arquivos. Por exemplo, digamos que queremos ignorar todos os arquivos que tem extensão .jpeg em um subdiretório do seu working directory. Para tanto podemos inserir no arquivo .gitignore uma linha contendo `pasta/*.jpeg`. + +# Alguns exemplos + +Existem uma série de padrões. Assumindo que seu .gitignore vai estar na raiz do diretório (top-level) podemos listar alguns padrões úteis e como eles se aplicam aos arquivos de um dado diretório. Esta tabela é uma adaptação [desta versão original](https://gist.github.com/jstnlvns/ebaa046fae16543cc9efc7f24bcd0e31) + +|Padrão|Exemplos que são detectados|Explicação| +|-------|----------------|------------| +|**/logs|logs/debug.log
logs/monday/foo.bar
build/logs/debug.log|Acrescentar dois asteriscos para detectar qualquer diretório no seu repositório.| +|**/logs/debug.log|logs/debug.log
build/logs/debug.log
_mas não_
logs/build/debug.log|Detecta qualquer arquivo baseado em seu nome e o nome do diretório pai.| +|*.log|debug.log
foo.log
.log
logs/debug.log|Detecta qualquer (ou zero) caracteres de arquivos que tenha a extensão .log. +|*.log
!important.log|debug.log
trace.log
_mas não_
important.log
logs/important.log|Nega (não ignora) o padrão informado. Se um arquivo corresponde ao padrão, mas também corresponde ao padrão para não ser ignorado, este arquivo não vai ser ignorado.| +|/debug.log|debug.log
_but not_
logs/debug.log|Usando o slash faz correspondencia apenas a arquivos na raiz do repositório.| +|debug.log|debug.log
logs/debug.log|Corresponde ao padrão em qualquer repositório| +|debug?.log|debug0.log
debugg.log
_mas não_
debug10.log|Uma interrogação vai corresponder exatamente a um caracter.| +|debug[0-9].log|debug0.log
debug1.log
_mas não_
debug10.log|Colchetes podem ser usados para correponder a qualquer caracter dentro de um limite especificado.| +|debug[!01].log|debug2.log
_mas não_
debug0.log
debug1.log
debug01.log|Ponto de exclamação também pode ser usado para ignorar um caracter específico.| +|debug[a-z].log|debuga.log
debugb.log
_mas não_
debug1.log|Os limites dentro dos colchetes podem ser numéricos ou alfabéticos.| +|logs|logs
logs/debug.log
logs/latest/foo.bar
build/logs
build/logs/debug.log|Se não for inserida uma barra, o padrão irá corresponder tanto a pastas quanto os arquivos dentro das pastas que correspondem ao padrão indicado.| +|logs/|logs/debug.log
logs/latest/foo.bar
build/logs/foo.bar
build/logs/latest/debug.log|A barra indica que o padrão corresponde a um diretório específico. Todo conteúdo de qualquer diretório no repositório que corresponda ao padrão, e todos os arquivos dentro dele, serão ignorados.| +|logs/*day/debug.log|logs/monday/debug.log
logs/tuesday/debug.log
_but not_
logs/latest/debug.log|Wildcards podem ser usados em qualquer diretório dentro do repositório.| +|logs/debug.log|logs/debug.log
_mas não_
debug.log
build/logs/debug.log|Padrões especificando um arquivo em um diretório particular correspondem apenas ao caminho a partir da raiz.| + +# Outras referências úteis + +Para mais referências sobre padrões e como montar o arquivo .gitignore, consulte estas fontes + +- [Documentação do Github](https://docs.github.com/pt/get-started/getting-started-with-git/ignoring-files) + +- [Documentação do Git](https://git-scm.com/docs/gitignore) + +- [Alguns modelos de arquivos .gitignore](https://github.com/github/gitignore) + diff --git a/gitgnore.html b/gitgnore.html index b9b792e..a3d3173 100644 --- a/gitgnore.html +++ b/gitgnore.html @@ -11,7 +11,7 @@ - + Utilizando o gitignore @@ -448,7 +448,7 @@

Utilizando o gitignore

Gabriel Nakamura

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2024-07-09

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2024-07-11

@@ -459,9 +459,176 @@

2024-07-09

Apresentação

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Nem sempre queremos que o git monitore todos os arquivos presentes no +nosso diretório. Isso pode se dar por alguns motivos. O arquivo pode +conter informações que você não queira que seja pública, ou ainda, uma +pasta inteira contém dados que são pesados demais para serem +versionados, as razões para escapar do monitoramento do versionamento +podem ser muitas. A questão é, como podemos evitar com que estes +arquivos, ou pastas inteiras, sejam versionados pelo git?

+

Para isso usaremos um arquivo especial chamado +.gitignore´. Você deve se lembrar que já vimos +brevemente este arquivo quando criamos o repositório. Ao iniciar o +repositório remoto, o próprio Github nos dá a opção de criar um arquivo +do tipo .gitignore a partir de um modelo pré definido, como mostrado na +imagem abaixo.

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+Página inicial para criação de repositórios no github.com seta destacando o local de escolher o gitignore +

+Página inicial para criação de repositórios no github.com seta +destacando o local de escolher o gitignore +

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Editando o .gitignore

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Cada linha no .gitignore indica um arquivo que será ignorado. Linhas +em branco não indicam arquivo algum, e são usadas para separar arquivos +que serão ignorados no .gitignore, facilitando sua leitura.

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Existem maneiras diferentes de indicar os arquivos que serão +ignorados pelo git. Podemos ignorar arquivos individualmente, +simplesmente colocando o caminho relativo do arquivo, juntamente com o +nome do arquivo acompanhado de sua extensão. Por exemplo, se quisermos +ignorar o arquivo chamado meignore.doc que se encontra na +raiz do projeto, devemos apenas acrescentar em uma linha no gitignore +contendo meignore.doc.

+

O .gitignore também nos possibilita a utilização de padrões para +ignorar um conjunto de arquivos. Por exemplo, digamos que queremos +ignorar todos os arquivos que tem extensão .jpeg em um subdiretório do +seu working directory. Para tanto podemos inserir no arquivo .gitignore +uma linha contendo pasta/*.jpeg.

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Alguns exemplos

+

Existem uma série de padrões. Assumindo que seu .gitignore vai estar +na raiz do diretório (top-level) podemos listar alguns padrões úteis e +como eles se aplicam aos arquivos de um dado diretório. Esta tabela é +uma adaptação desta +versão original

+ +++++ + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + +
PadrãoExemplos que são detectadosExplicação
**/logslogs/debug.log
logs/monday/foo.bar
build/logs/debug.log		Acrescentar dois asteriscos para detectar qualquer diretório no seu +repositório.
**/logs/debug.loglogs/debug.log
build/logs/debug.log
mas +não
logs/build/debug.log		Detecta qualquer arquivo baseado em seu nome e o nome do diretório +pai.
*.logdebug.log
foo.log
.log
logs/debug.log		Detecta qualquer (ou zero) caracteres de arquivos que tenha a +extensão .log.
*.log
!important.log		debug.log
trace.log
mas +não
important.log
logs/important.log		Nega (não ignora) o padrão informado. Se um arquivo corresponde ao +padrão, mas também corresponde ao padrão para não ser ignorado, este +arquivo não vai ser ignorado.
/debug.logdebug.log
but not
logs/debug.log		Usando o slash faz correspondencia apenas a arquivos na raiz do +repositório.
debug.logdebug.log
logs/debug.log		Corresponde ao padrão em qualquer repositório
debug?.logdebug0.log
debugg.log
mas não
debug10.log		Uma interrogação vai corresponder exatamente a um caracter.
debug[0-9].logdebug0.log
debug1.log
mas não
debug10.log		Colchetes podem ser usados para correponder a qualquer caracter +dentro de um limite especificado.
debug[!01].logdebug2.log
mas +não
debug0.log
debug1.log
debug01.log		Ponto de exclamação também pode ser usado para ignorar um caracter +específico.
debug[a-z].logdebuga.log
debugb.log
mas não
debug1.log		Os limites dentro dos colchetes podem ser numéricos ou +alfabéticos.
logslogs
logs/debug.log
logs/latest/foo.bar
build/logs
build/logs/debug.log		Se não for inserida uma barra, o padrão irá corresponder tanto a +pastas quanto os arquivos dentro das pastas que correspondem ao padrão +indicado.
logs/logs/debug.log
logs/latest/foo.bar
build/logs/foo.bar
build/logs/latest/debug.log		A barra indica que o padrão corresponde a um diretório específico. +Todo conteúdo de qualquer diretório no repositório que corresponda ao +padrão, e todos os arquivos dentro dele, serão ignorados.
logs/*day/debug.loglogs/monday/debug.log
logs/tuesday/debug.log
but +not
logs/latest/debug.log		Wildcards podem ser usados em qualquer diretório dentro do +repositório.
logs/debug.loglogs/debug.log
mas +não
debug.log
build/logs/debug.log		Padrões especificando um arquivo em um diretório particular +correspondem apenas ao caminho a partir da raiz.
+
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Outras referências úteis

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Para mais referências sobre padrões e como montar o arquivo +.gitignore, consulte estas fontes

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LS0tCnRpdGxlOiAnVXRpbGl6YW5kbyBvIGdpdGlnbm9yZScKYXV0aG9yOiAiR2FicmllbCBOYWthbXVyYSIKZGF0ZTogImByIFN5cy5EYXRlKClgIgpvdXRwdXQ6IGh0bWxfZG9jdW1lbnQKLS0tCgpgYGB7ciBzZXR1cCwgaW5jbHVkZT1GQUxTRX0Ka25pdHI6Om9wdHNfY2h1bmskc2V0KGVjaG8gPSBUUlVFLCBmaWcuYWxpZ24gPSAiY2VudGVyIikKYGBgCgpgYGB7ciBrbGlwcHksIGVjaG89RkFMU0UsIGluY2x1ZGU9VFJVRX0Ka2xpcHB5OjprbGlwcHkoKQpgYGAKCiMgQXByZXNlbnRhw6fDo28KCg==
+
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O que é Ciência Aberta?

Melina Leite

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Metadados

Gabriel Nakamura

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Pré-registro de projetos científicos

Melina Leite

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Acesso aberto a publicações científicas

Melina Leite

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Releasing

Gabriel Nakamura

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Ambiente reprodutível com ‘Renv’

Melina Leite

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R markdown

Gabriel Nakamura

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Containers

Gabriel Nakamura

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R markdown

Gabriel Nakamura

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Pipelines com targets

Gabriel Nakamura

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