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Curso: Boas Práticas e Ferramentas da Ciência Aberta na Ecologia

Este curso tratará de conceitos e ferramentas computacionais utilizadas para garantir a execução de projetos reprodutíveis em Ecologia e Evolução. Nele trataremos dos seguintes tópicos:

  • Ciência aberta: motivação, tendências e razões para práticas científicas abertas.

  • A importância dos dados em ecologia: valorização, organização e publicação.

  • Reprodutibilidade científica e reprodutibilidade computacional como fundamento básico de qualquer investigação científica.

  • Ferramentas de controle de versão para código de análises de dados (git, GitHub) e ferramentas para escrita de relatórios (material suplementar, websites, livros, vinhetas) e códigos em R (Rmarkdown/Quarto).

  • Outras ferramentas para assegurar reprodutibilidade computacional das análises: dockers/containers, e pacotes em R.

  • Repositórios online e o DOI (Digital Object Identifier): tipos de repositórios para dados, análises e manuscritos (PrePrints).

  • Outras tendências em ecologia e ciência aberta: ética em publicação científica, pré-registro de projetos, entre outros

Este repositório contém o códigos fonte e dados que serão utilizados durante o curso. As atividades práticas e exercícios de apoio podem ser encontradas neste sítio

Slides de aulas teóricas podem ser acessados aqui

Responsáveis pela disciplina

Melina Leite e Gabriel Nakamura