plink无法使用

[f-c-f]

../../LDBlockShow/bin/LDBlockShow -InVCF chr3.sv.edited.filter.recode.vcf -OutPut hapl_block -Region 3:1-100000 -OutPng -SeleVar 1
#Warning skip non bi-allelic(Singleton/ThreeMulti allelic) site, and total skip allelic sites number is :20
#Warning skip low Minor Allele Frequency site, and total skip allelic sites number is :41
##Start Region Cal... :3 1 100000; In This Region TotalSNP Number is 34
find blocks...
Segmentation fault
mv: cannot stat 'hapl_block.plink.blocks.det': No such file or directory
gzip: hapl_block.blocks: No such file or directory
Warining: SVG module in Perl is missing, trying to loading the built-in [SVG.pm]...
Loading SVG module done
Start draw... SVG info: SNPNumber :34 , SVG (width,height) = (1955,1445)
convert SVG ---> PNG ...
ALL done

[hewm2008]

若是mac 下载对应的plink放在bin里面 755一下

[f-c-f]

不是mac，Ubuntu，原因是我原来安装过plink，我把bin里面的plink删除就好了

[hewm2008]

好的 解决了就行 当是plink的版本的影响

[McCord000]

如果plink1.9就会有这样的影响吗？

[hewm2008]

plink 1.9 版本 对应你所以的系统

[McCord000]

还是会报错，mv: 无法获取'out.plink.blocks.det' 的文件状态(stat): 没有那个文件或目录

[hewm2008]

whiich plink 一下 可能要把你的其它地方的plink替换一下为 我bin里面的